More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_C0231 on replicon NC_007953
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007953  Bxe_C0231  TonB-dependent siderophore receptor  100 
 
 		 771 aa  1570    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2663  TonB-dependent receptor  32.54 
 
 		 728 aa  338  2.9999999999999997e-91  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0150828  normal  0.481934 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1910  TonB-dependent receptor  30.04 
 
 		 736 aa  227  6e-58  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0730  TonB-dependent receptor  28.39 
 
 		 761 aa  219  2e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.455478  normal  0.0840976 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3147  TonB-dependent receptor  28.99 
 
 		 775 aa  218  2.9999999999999998e-55  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.774521  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2301  TonB-dependent receptor  29.65 
 
 		 730 aa  216  9.999999999999999e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00156441  decreased coverage  0.0000705013 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3336  TonB-dependent receptor  29.79 
 
 		 741 aa  215  2.9999999999999995e-54  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0286811 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1136  TonB-dependent receptor  29.18 
 
 		 765 aa  213  1e-53  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.438205  hitchhiker  0.000214411 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4257  TonB-dependent receptor  27.78 
 
 		 755 aa  205  2e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.737167 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1547  TonB-dependent receptor  27.12 
 
 		 794 aa  206  2e-51  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0831797 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0999  TonB-dependent receptor  27.48 
 
 		 722 aa  205  3e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.285089  normal  0.123899 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1436  TonB-dependent receptor  29.35 
 
 		 749 aa  202  1.9999999999999998e-50  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000358025  decreased coverage  0.0000102915 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4282  TonB-dependent receptor, plug  28.73 
 
 		 739 aa  200  1.0000000000000001e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.030658  normal  0.745652 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0964  TonB-dependent receptor  27.44 
 
 		 803 aa  199  2.0000000000000003e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.110635  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2433  TonB-dependent receptor  29.12 
 
 		 704 aa  197  5.000000000000001e-49  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.1738  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4274  TonB-dependent receptor  28.11 
 
 		 758 aa  196  2e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.021682  normal  0.456033 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0895  TonB-dependent receptor  27.35 
 
 		 769 aa  193  1e-47  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0618302  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3080  TonB-dependent receptor  30.17 
 
 		 710 aa  191  2.9999999999999997e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0765  TonB-dependent receptor  28.45 
 
 		 779 aa  191  5.999999999999999e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.305  normal  0.367736 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3348  TonB-dependent receptor  27.57 
 
 		 747 aa  188  4e-46  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3084  TonB-dependent receptor  27.25 
 
 		 730 aa  184  4.0000000000000006e-45  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1631  TonB-dependent receptor  28.19 
 
 		 766 aa  184  5.0000000000000004e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.888347  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1911  TonB-dependent receptor  29.61 
 
 		 817 aa  184  8.000000000000001e-45  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3458  TonB-dependent receptor  27.35 
 
 		 758 aa  182  2e-44  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.485472  normal  0.120897 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0936  TonB-dependent receptor  26.55 
 
 		 750 aa  181  2.9999999999999997e-44  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2057  TonB-dependent receptor  28.17 
 
 		 728 aa  181  4e-44  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.904465  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3857  TonB-dependent receptor  29.08 
 
 		 743 aa  181  4.999999999999999e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0250  TonB-dependent receptor  25.61 
 
 		 763 aa  181  5.999999999999999e-44  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3282  TonB-dependent receptor  28.2 
 
 		 758 aa  180  8e-44  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.166859 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0812  TonB-dependent receptor  26.2 
 
 		 780 aa  179  2e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.724428  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0665  TonB-dependent receptor  28.04 
 
 		 758 aa  177  5e-43  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.252208 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5001  TonB-dependent receptor  28.84 
 
 		 778 aa  177  9e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0280041  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0673  TonB-dependent receptor  25.39 
 
 		 761 aa  175  1.9999999999999998e-42  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3103  TonB-dependent receptor  27.53 
 
 		 725 aa  176  1.9999999999999998e-42  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.105862 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2300  TonB-dependent receptor  27.93 
 
 		 730 aa  174  5e-42  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000740519  hitchhiker  0.000350666 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0235  TonB-dependent receptor  28.8 
 
 		 778 aa  174  6.999999999999999e-42  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3981  TonB-dependent receptor  27.91 
 
 		 773 aa  173  1e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.139446 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3538  TonB-dependent receptor  27.95 
 
 		 771 aa  173  1e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.25784  normal  0.393051 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3744  TonB-dependent receptor  27.75 
 
 		 753 aa  172  3e-41  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0226  TonB-dependent receptor  28.91 
 
 		 745 aa  171  3e-41  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.385209  normal  0.613725 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2471  TonB-dependent receptor  26.43 
 
 		 732 aa  172  3e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1702  TonB-dependent receptor  26.33 
 
 		 788 aa  171  4e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0806074  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1063  TonB-dependent receptor  26.97 
 
 		 780 aa  171  4e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0659178 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0709  TonB-dependent receptor  26.68 
 
 		 790 aa  171  4e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.072981  hitchhiker  0.00423974 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2600  TonB-dependent receptor  27.97 
 
 		 773 aa  171  6e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.637909 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4826  TonB-dependent receptor:TonB box, N-terminal  26.75 
 
 		 755 aa  170  7e-41  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0478  TonB-dependent receptor  26.89 
 
 		 720 aa  170  9e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.742191  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1908  TonB-dependent receptor plug  26.62 
 
 		 755 aa  170  1e-40  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3171  TonB-dependent receptor  27 
 
 		 759 aa  170  1e-40  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0174506  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0760  TonB-dependent receptor  27.25 
 
 		 746 aa  168  4e-40  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0213  TonB-dependent receptor plug  27.35 
 
 		 776 aa  168  4e-40  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000121403 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5129  TonB-dependent receptor  27.94 
 
 		 771 aa  167  5e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.283474  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2045  TonB-dependent receptor  26.49 
 
 		 787 aa  167  5e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.785428  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0725  TonB-dependent receptor  26.29 
 
 		 790 aa  167  5.9999999999999996e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0453465 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5045  TonB-dependent receptor  27.97 
 
 		 726 aa  167  5.9999999999999996e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0895856  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2882  TonB-dependent receptor  27.91 
 
 		 786 aa  167  8e-40  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0706  TonB-dependent receptor  27.13 
 
 		 792 aa  167  9e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00993483 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1980  TonB-dependent receptor  27.93 
 
 		 774 aa  166  1.0000000000000001e-39  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.228726  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0657  TonB-dependent receptor  26.32 
 
 		 666 aa  166  2.0000000000000002e-39  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2041  TonB-dependent receptor  27.82 
 
 		 784 aa  166  2.0000000000000002e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.573834  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2677  TonB-dependent receptor plug  26.13 
 
 		 759 aa  166  2.0000000000000002e-39  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.126717  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0521  TonB-dependent receptor  25.94 
 
 		 758 aa  166  2.0000000000000002e-39  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.466347  normal  0.153456 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1776  TonB-dependent receptor  27.49 
 
 		 734 aa  165  3e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.00365566  normal  1 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5256  TonB-dependent receptor  27.39 
 
 		 731 aa  163  1e-38  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.650389  hitchhiker  0.000349677 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0250  TonB-dependent receptor  26.61 
 
 		 741 aa  161  4e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.513773 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4214  TonB-dependent receptor  27.32 
 
 		 726 aa  160  6e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.760297  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2110  TonB-dependent receptor  26.65 
 
 		 765 aa  160  7e-38  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0914186  normal  0.510297 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4618  TonB-dependent receptor, plug  25.79 
 
 		 733 aa  160  1e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0845524  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08150  TonB-dependent receptor  26.86 
 
 		 803 aa  159  1e-37  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0505  TonB-dependent receptor  25.66 
 
 		 713 aa  159  2e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.742507 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3314  TonB-dependent receptor  26.48 
 
 		 804 aa  158  3e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.0000257561  unclonable  0.000000438861 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0185  TonB-dependent receptor  26.24 
 
 		 851 aa  158  4e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1672  TonB-dependent receptor  25.6 
 
 		 853 aa  158  4e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0105669  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3904  TonB-dependent receptor  25.64 
 
 		 762 aa  158  4e-37  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.5243  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1600  receptor precursor-mostly Fe transport  26.96 
 
 		 715 aa  157  6e-37  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.147311  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2075  TonB-dependent receptor, plug  26.03 
 
 		 759 aa  157  6e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2088  TonB-dependent receptor  27.29 
 
 		 764 aa  157  7e-37  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.976356  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0230  TonB-dependent receptor  26.91 
 
 		 729 aa  157  9e-37  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4129  TonB-dependent receptor  25.03 
 
 		 767 aa  155  2e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.108935  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2803  TonB-dependent receptor  25.72 
 
 		 796 aa  156  2e-36  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  decreased coverage  0.00000028196  n/a   
 
 
 
NC_009511  Swit_3256  TonB-dependent receptor  24.9 
 
 		 730 aa  155  4e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  unclonable  0.0000000000366625  decreased coverage  0.0000730384 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1534  TonB-dependent receptor  24.58 
 
 		 771 aa  154  7e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00336206 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0484  TonB-dependent receptor  25.5 
 
 		 723 aa  154  8e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3406  TonB-dependent receptor  26.3 
 
 		 722 aa  153  1e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0595288 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1656  TonB-dependent receptor  26.36 
 
 		 764 aa  152  2e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  unclonable  0.0000000000345148  decreased coverage  0.00188078 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1671  TonB-dependent receptor  26.4 
 
 		 732 aa  152  2e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2458  TonB-dependent receptor  25.3 
 
 		 758 aa  151  6e-35  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08200  TonB-dependent siderophore receptor  25.93 
 
 		 767 aa  150  8e-35  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3312  TonB-dependent receptor  27.16 
 
 		 784 aa  150  8e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  unclonable  0.0000000000345148  hitchhiker  0.0000067501 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2351  TonB-dependent receptor  25.4 
 
 		 761 aa  149  2.0000000000000003e-34  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.639687 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0680  TonB-dependent receptor  26.63 
 
 		 753 aa  149  2.0000000000000003e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.915685  normal  0.983563 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0504  TonB-dependent receptor  28.12 
 
 		 777 aa  148  4.0000000000000006e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0838  TonB-dependent receptor  26.77 
 
 		 784 aa  147  7.0000000000000006e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.543074 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02410  putative TonB-dependent receptor  25.92 
 
 		 790 aa  147  8.000000000000001e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.363923  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1901  TonB-dependent receptor  25.49 
 
 		 744 aa  147  9e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0216  TonB-dependent receptor  24.84 
 
 		 786 aa  146  1e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02261  putative TonB-dependent receptor  24.5 
 
 		 792 aa  146  2e-33  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.895044  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4350  TonB-dependent receptor  26.2 
 
 		 743 aa  146  2e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.425667 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3453  TonB-dependent receptor  24.05 
 
 		 856 aa  145  2e-33  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0426513  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2264  TonB-dependent receptor  24.85 
 
 		 825 aa  145  3e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.249992  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>