132 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_C0227 on replicon NC_007953
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007953  Bxe_C0227  TonB protein  100 
 
 		 275 aa  516  1.0000000000000001e-145  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2605  TonB-like protein  73.33 
 
 		 273 aa  145  1e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.430219  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3533  TonB family protein  72.22 
 
 		 266 aa  142  6e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0725055  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3986  TonB family protein  72.22 
 
 		 266 aa  142  6e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.152676 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1560  TonB-like protein  62.07 
 
 		 276 aa  125  1e-27  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000666739 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02490  hypothetical protein  60.47 
 
 		 270 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.104412  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0279  hypothetical protein  60.47 
 
 		 264 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1116  TonB, C-terminal  37.17 
 
 		 212 aa  114  1.0000000000000001e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.117664 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0218  TonB-like  55.81 
 
 		 285 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08080  TonB protein  56.52 
 
 		 274 aa  114  3e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2287  TonB, C-terminal  54.55 
 
 		 277 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00257812  decreased coverage  0.0000380211 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21710  TonB-like protein, ferric siderophore transporter  56.82 
 
 		 275 aa  110  2.0000000000000002e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2481  tonB protein  55.81 
 
 		 273 aa  109  5e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21840  TonB C-terminal domain protein, ferric siderophore transporter  58.14 
 
 		 286 aa  109  5e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0453954  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0668  TonB domain-containing protein  45.95 
 
 		 193 aa  103  2e-21  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4331  TonB family protein  47.46 
 
 		 288 aa  104  2e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.141316  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0146  TonB family protein  46.96 
 
 		 287 aa  102  9e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0135  TonB, C-terminal  57.14 
 
 		 274 aa  100  2e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0271  tonB protein, putative  57.14 
 
 		 273 aa  99.8  4e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2639  TonB family protein  52.81 
 
 		 285 aa  98.2  1e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0441  TonB domain-containing protein  41.26 
 
 		 248 aa  97.8  2e-19  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0295  TonB family protein  56.98 
 
 		 264 aa  95.9  7e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.14734 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3518  TonB family protein  56.47 
 
 		 253 aa  95.5  8e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.631261  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5227  TonB family protein  55.81 
 
 		 266 aa  95.1  1e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.631844  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0861  TonB family protein  48.48 
 
 		 244 aa  88.2  2e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.44406  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4480  TonB, C-terminal  57.3 
 
 		 269 aa  86.3  5e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4622  TonB family protein  45.16 
 
 		 233 aa  85.9  7e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.273599  hitchhiker  0.0000876595 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0674  tonB domain protein  56.32 
 
 		 267 aa  84  0.000000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4093  TonB, C-terminal  48.84 
 
 		 228 aa  84.3  0.000000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2568  TonB family protein  42.7 
 
 		 256 aa  83.6  0.000000000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.127416  hitchhiker  0.00103277 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3737  TonB-like  58.33 
 
 		 272 aa  83.2  0.000000000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3311  TonB family protein  46.24 
 
 		 232 aa  80.1  0.00000000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1202  TonB family protein  43.75 
 
 		 244 aa  79  0.00000000000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000141399 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1487  TonB family protein  43.75 
 
 		 244 aa  79  0.00000000000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1442  TonB family protein  42.7 
 
 		 233 aa  77.8  0.0000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2406  TonB family protein  42.7 
 
 		 233 aa  77.4  0.0000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.667004 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3076  TonB family protein  41.94 
 
 		 234 aa  76.6  0.0000000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  decreased coverage  0.00417889  normal  0.18008 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0713  periplasmic protein TonB  42.86 
 
 		 280 aa  70.5  0.00000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.015626 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0575  TonB family protein  45.68 
 
 		 270 aa  70.5  0.00000000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.10213  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1403  TonB family protein  37.23 
 
 		 231 aa  70.5  0.00000000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1478  TonB protein  37.23 
 
 		 231 aa  68.9  0.00000000009  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0453  TonB-like protein  44.05 
 
 		 289 aa  68.6  0.0000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000832201  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4496  TonB, C-terminal  42.17 
 
 		 237 aa  67.4  0.0000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2536  TonB family protein  42.5 
 
 		 212 aa  67.4  0.0000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.122323  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2905  TonB family protein  42.86 
 
 		 215 aa  66.2  0.0000000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.432378  normal  0.637635 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3561  TonB family protein  40.48 
 
 		 308 aa  65.9  0.0000000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3051  TonB-like  38.2 
 
 		 259 aa  65.1  0.000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2863  TonB family protein  43.59 
 
 		 390 aa  60.8  0.00000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0995  TonB family protein  33.88 
 
 		 208 aa  61.2  0.00000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5812  TonB family protein  42.27 
 
 		 117 aa  61.2  0.00000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.686482  normal  0.162663 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2420  TonB family protein  33.79 
 
 		 443 aa  60.1  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0829396 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0327  tonB1 protein  30.73 
 
 		 249 aa  59.7  0.00000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000128507  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0009  TonB family protein  42.31 
 
 		 221 aa  59.3  0.00000006  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0009  TonB protein  42.31 
 
 		 221 aa  58.9  0.00000008  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01076  TonB protein  45.45 
 
 		 219 aa  58.5  0.0000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.147824  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06243  TonB protein  45.45 
 
 		 219 aa  58.5  0.0000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.442028  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01882  TonB family C-terminal domain protein  36.36 
 
 		 271 aa  58.2  0.0000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.162741  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0184  TonB family protein  43.08 
 
 		 267 aa  57  0.0000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.140188 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0077  TonB-like protein  37.97 
 
 		 150 aa  55.5  0.0000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3521  TonB family protein  29.22 
 
 		 212 aa  55.1  0.000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01522  TonB protein  39.76 
 
 		 140 aa  55.5  0.000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03476  TonB protein  40.51 
 
 		 184 aa  55.5  0.000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1862  TonB-like protein  35.37 
 
 		 332 aa  54.7  0.000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2156  TonB-like  28.21 
 
 		 219 aa  53.9  0.000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1049  TonB-like  37.04 
 
 		 223 aa  53.5  0.000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2306  TonB-like protein  46.94 
 
 		 246 aa  53.9  0.000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0143972 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1840  TonB family protein  41.46 
 
 		 138 aa  53.9  0.000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.259302 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0901  TonB3 protein  30.3 
 
 		 207 aa  53.5  0.000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.686601  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0636  TonB family protein  33.63 
 
 		 265 aa  53.5  0.000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3339  TonB family protein  43.1 
 
 		 284 aa  53.1  0.000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000004715  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0876  TonB-like protein  29.31 
 
 		 275 aa  53.1  0.000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000261877  normal  0.0876537 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1020  TonB-like protein  29.31 
 
 		 275 aa  53.1  0.000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000273603  normal  0.0339055 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1494  putative GAF sensor protein  33.12 
 
 		 582 aa  53.5  0.000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.980694  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0951  TonB family protein  43.1 
 
 		 295 aa  53.5  0.000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00168123  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1020  TonB family protein  43.1 
 
 		 290 aa  53.5  0.000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00268646  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0439  TonB domain-containing protein  36.36 
 
 		 215 aa  53.1  0.000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.31739  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2086  TonB family protein  38.27 
 
 		 137 aa  52.8  0.000006  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1008  TonB family protein  39.47 
 
 		 258 aa  52.4  0.000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.649476  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05244  hypothetical protein  35.29 
 
 		 243 aa  52.4  0.000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0245  TonB family protein  32.05 
 
 		 203 aa  52.4  0.000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4005  TonB family protein  42.86 
 
 		 248 aa  52.4  0.000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0591  TonB family protein  27.92 
 
 		 273 aa  52.4  0.000008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.664321  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0845  TonB domain-containing protein  29.87 
 
 		 259 aa  52  0.00001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.286568  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1053  TonB family protein  43.1 
 
 		 289 aa  52  0.00001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0250994  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4804  TonB domain-containing protein  35 
 
 		 349 aa  50.8  0.00002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1523  TonB family protein  29.87 
 
 		 228 aa  50.8  0.00002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1657  TonB family protein  37.66 
 
 		 237 aa  50.8  0.00002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.107478  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3957  TonB family protein  35.9 
 
 		 203 aa  50.8  0.00002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0186  TonB family protein  37.18 
 
 		 203 aa  51.2  0.00002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4148  TonB family protein  35.9 
 
 		 203 aa  50.8  0.00002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2174  TonB protein  38.27 
 
 		 137 aa  51.6  0.00002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3759  TonB family protein  35.9 
 
 		 203 aa  50.4  0.00003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3832  TonB family protein  35.9 
 
 		 203 aa  50.4  0.00003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3328  TonB family protein  41.07 
 
 		 252 aa  50.4  0.00003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.379143  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3224  TonB family protein  35.44 
 
 		 413 aa  50.1  0.00004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.222698  normal  0.927933 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2903  TonB family protein  35.14 
 
 		 218 aa  50.1  0.00004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2537  TonB family protein  35.8 
 
 		 190 aa  50.1  0.00004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0741915  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1960  TonB family protein  33.33 
 
 		 271 aa  50.1  0.00004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00999547  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4255  TonB family protein  38.46 
 
 		 441 aa  49.7  0.00005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.510243  normal  0.585691 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2085  TonB family protein  28.57 
 
 		 319 aa  49.3  0.00007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.744558  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>