125 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_C0170 on replicon NC_007953
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007953  Bxe_C0170  hypothetical protein  100 
 
 		 332 aa  638    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4795  hypothetical protein  67.76 
 
 		 322 aa  369  1e-101  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.36342 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0701  hypothetical protein  54.89 
 
 		 318 aa  238  1e-61  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1445  hypothetical protein  45.09 
 
 		 300 aa  221  9.999999999999999e-57  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0680793  normal  0.372569 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4137  hypothetical protein  42.91 
 
 		 315 aa  211  1e-53  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0485856  normal  0.510961 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0093  hypothetical protein  42.62 
 
 		 316 aa  184  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.152001  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5241  membrane protein-like protein  40.77 
 
 		 300 aa  183  5.0000000000000004e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0567111  normal  0.512081 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6358  hypothetical protein  43.79 
 
 		 328 aa  181  1e-44  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2987  hypothetical protein  41.22 
 
 		 298 aa  179  5.999999999999999e-44  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.101551  normal  0.0487928 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2351  hypothetical protein  39.87 
 
 		 317 aa  170  4e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.50053  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2269  membrane protein-like protein  34.94 
 
 		 271 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.761855  hitchhiker  0.00192882 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3554  membrane protein-like protein  29.06 
 
 		 264 aa  104  2e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.149309 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4602  Cytochrome c oxidase caa3-type, assembly factor CtaG-related protein  30.94 
 
 		 309 aa  103  3e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01478  membrane protein-like protein  30.84 
 
 		 267 aa  103  3e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2267  membrane protein-like protein  28.57 
 
 		 265 aa  101  2e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0108  membrane protein-like protein  30 
 
 		 270 aa  94.4  2e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3384  hypothetical protein  37.99 
 
 		 266 aa  91.3  2e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.739679 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2401  Cytochrome c oxidase caa3-type, assembly factor CtaG-related protein  28.24 
 
 		 307 aa  89.4  8e-17  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5775  Cytochrome c oxidase caa3-type, assembly factor CtaG-related protein  34.5 
 
 		 283 aa  89  9e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.722612  normal  0.272447 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1345  Cytochrome c oxidase caa3-type, assembly factor CtaG-related protein  30.24 
 
 		 319 aa  88.6  1e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0477592  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11200  membrane-like protein  38.38 
 
 		 273 aa  87.4  3e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00435487  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2497  putative copper resistance protein D  29.35 
 
 		 394 aa  85.5  0.000000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.128305  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1122  copper resistance D domain protein  29.15 
 
 		 687 aa  84.7  0.000000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11750  predicted membrane protein  28.52 
 
 		 651 aa  84.3  0.000000000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.411615 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1238  putative inner membrane protein  28.3 
 
 		 294 aa  83.6  0.000000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1675  hypothetical protein  26.82 
 
 		 310 aa  82.4  0.00000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.247062 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1859  cytochrome c oxidase assembly factor CtaG  26.32 
 
 		 300 aa  82  0.00000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2884  putative inner membrane protein  28.3 
 
 		 289 aa  81.6  0.00000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.712749  normal  0.419558 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1473  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain- containing protein  27.94 
 
 		 327 aa  81.6  0.00000000000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0159  hypothetical protein  32.79 
 
 		 255 aa  80.5  0.00000000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.673519  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2485  Cytochrome c oxidase caa3-type, assembly factor CtaG-related protein  27.97 
 
 		 326 aa  80.1  0.00000000000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.583606  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1749  hypothetical protein  30.67 
 
 		 290 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.185499  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1898  Cytochrome c oxidase caa3-type, assembly factor CtaG-related protein  30.17 
 
 		 290 aa  78.2  0.0000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.903451  normal  1 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5665  hypothetical protein  28.99 
 
 		 331 aa  77.8  0.0000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5381  hypothetical protein  30 
 
 		 308 aa  77.8  0.0000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0562  hypothetical protein  30.25 
 
 		 266 aa  77.4  0.0000000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.522678  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2875  hypothetical protein  30.25 
 
 		 290 aa  77  0.0000000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.922757  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2447  hypothetical protein  30.25 
 
 		 290 aa  77  0.0000000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2834  hypothetical protein  30.25 
 
 		 290 aa  77  0.0000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.395343  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2760  hypothetical protein  30.25 
 
 		 290 aa  77  0.0000000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2819  hypothetical protein  30.25 
 
 		 290 aa  77  0.0000000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.286067  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1770  hypothetical protein  30.25 
 
 		 290 aa  77  0.0000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.440063  n/a   
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5346  hypothetical protein  28.99 
 
 		 331 aa  77  0.0000000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2068  membrane protein-like protein  28.63 
 
 		 273 aa  76.6  0.0000000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.334225 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3617  copper resistance D  29.69 
 
 		 665 aa  76.6  0.0000000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3690  copper resistance D domain-containing protein  29.69 
 
 		 665 aa  76.6  0.0000000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3709  hypothetical protein  28.99 
 
 		 326 aa  76.6  0.0000000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3622  copper resistance D domain-containing protein  29.69 
 
 		 665 aa  76.6  0.0000000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0855  putative inner membrane protein  29.43 
 
 		 296 aa  76.3  0.0000000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2813  hypothetical protein  27.71 
 
 		 331 aa  74.3  0.000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5833  hypothetical protein  28.39 
 
 		 235 aa  74.3  0.000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3528  hypothetical protein  27.21 
 
 		 322 aa  73.9  0.000000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000675219 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0675  membrane protein  31.36 
 
 		 289 aa  72.8  0.000000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1154  membrane protein  31.36 
 
 		 289 aa  72.8  0.000000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1036  membrane protein  31.65 
 
 		 290 aa  73.2  0.000000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.675997  normal  0.424179 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2311  hypothetical protein  31.8 
 
 		 254 aa  72.4  0.00000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.148749  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1130  membrane protein  30.93 
 
 		 289 aa  72  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.581641  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4266  membrane protein  31.36 
 
 		 289 aa  71.6  0.00000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.991106  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2617  Cytochrome c oxidase caa3-type, assembly factor CtaG-related protein  28.88 
 
 		 654 aa  71.2  0.00000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3133  hypothetical protein  28.25 
 
 		 328 aa  70.5  0.00000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1123  integral membrane protein  27.13 
 
 		 319 aa  70.5  0.00000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1032  membrane protein  31.39 
 
 		 290 aa  70.1  0.00000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0988  cytochrome c oxidase assembly factor CtaG  24.67 
 
 		 300 aa  69.3  0.00000000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3296  hypothetical protein  27.34 
 
 		 322 aa  68.6  0.0000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.252949  normal  0.179007 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2024  Cytochrome c oxidase caa3-type, assembly factor CtaG-related protein  29.62 
 
 		 675 aa  68.9  0.0000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2151  membrane protein  29.13 
 
 		 289 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.240263  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0455  hypothetical protein  29.03 
 
 		 274 aa  68.2  0.0000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3846  hypothetical protein  33.83 
 
 		 253 aa  67.8  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3120  hypothetical protein  33 
 
 		 209 aa  68.2  0.0000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00136448 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3124  copper resistance D domain protein  27.82 
 
 		 681 aa  67.4  0.0000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.638358  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4073  copper resistance D domain-containing protein  24.82 
 
 		 672 aa  67.4  0.0000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.794001  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4758  hypothetical protein  32.84 
 
 		 196 aa  67.4  0.0000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.343516  normal  0.0425976 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0963  hypothetical protein  27.8 
 
 		 692 aa  66.2  0.0000000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0463859  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1809  copper resistance D domain protein  26.55 
 
 		 686 aa  65.5  0.000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00146135  normal  0.0268044 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2770  copper resistance D domain protein  28.85 
 
 		 632 aa  65.5  0.000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00801139  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0855  hypothetical protein  33.33 
 
 		 214 aa  64.7  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0625  Cytochrome c oxidase caa3-type, assembly factor CtaG-related protein  26.48 
 
 		 731 aa  65.1  0.000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0427977  normal  0.664507 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19110  predicted membrane protein  28.43 
 
 		 752 aa  64.7  0.000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.00604286  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2514  hypothetical protein  33.49 
 
 		 214 aa  64.3  0.000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2572  membrane protein-like protein  28.57 
 
 		 678 aa  63.5  0.000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.886769 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2566  copper resistance D domain-containing protein  27.88 
 
 		 676 aa  63.5  0.000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.420884 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10103  integral membrane protein  24.91 
 
 		 661 aa  63.2  0.000000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3987  hypothetical protein  23.49 
 
 		 301 aa  62.4  0.00000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4275  copper resistance D domain protein  28.85 
 
 		 671 aa  61.2  0.00000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.978208  normal  0.70457 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1197  hypothetical protein  23.13 
 
 		 319 aa  61.6  0.00000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4058  hypothetical protein  23.84 
 
 		 301 aa  60.8  0.00000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0172  copper resistance D domain-containing protein  29.17 
 
 		 651 aa  60.5  0.00000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4042  hypothetical protein  23.13 
 
 		 301 aa  60.5  0.00000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.388035  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1244  copper resistance D domain-containing protein  29.1 
 
 		 664 aa  60.5  0.00000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.774538  normal  0.0784531 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21870  predicted membrane protein  29.41 
 
 		 671 aa  60.1  0.00000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3717  copper resistance D domain protein  25.89 
 
 		 718 aa  59.3  0.00000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3955  copper resistance D domain protein  29.06 
 
 		 722 aa  59.3  0.00000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.58708  normal  0.101965 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3816  copper resistance D domain protein  29.02 
 
 		 651 aa  57.8  0.0000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.733189  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0186  copper resistance D domain-containing protein  26.77 
 
 		 679 aa  57.8  0.0000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000295959 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1131  integral membrane protein  24.14 
 
 		 327 aa  58.5  0.0000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6178  copper resistance D domain-containing protein  28.97 
 
 		 691 aa  57  0.0000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3278  membrane protein  26.42 
 
 		 280 aa  56.2  0.0000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3683  hypothetical protein  23.13 
 
 		 301 aa  55.8  0.0000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3700  CtaG membrane protein  23.13 
 
 		 301 aa  55.8  0.0000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3955  hypothetical protein  23.13 
 
 		 301 aa  55.8  0.0000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>