More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_C0166 on replicon NC_007953
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010725  Mpop_2264  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  76.15 
 
 
390 aa  634    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2307  alcohol dehydrogenase  76.67 
 
 
390 aa  636    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0161452 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2482  putative zinc-containing dehydrogenase  84.58 
 
 
389 aa  701    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0166  putative glutathione-dependent formaldehyde dehydrogenase  100 
 
 
395 aa  816    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.912922  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4725  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  77.49 
 
 
391 aa  649    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.105849  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4801  alcohol dehydrogenase  85.35 
 
 
389 aa  707    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0751128 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4691  alcohol dehydrogenase  82.78 
 
 
389 aa  680    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4494  alcohol dehydrogenase  78.21 
 
 
390 aa  653    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.134818  normal  0.0652457 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5159  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  76.92 
 
 
390 aa  649    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.150662  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2582  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  76.15 
 
 
390 aa  632  1e-180  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.481198 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0110  alcohol dehydrogenase  73.85 
 
 
390 aa  625  1e-178  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4105  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  74.36 
 
 
390 aa  625  1e-178  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6253  alcohol dehydrogenase  75.45 
 
 
391 aa  623  1e-177  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.731237 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0531  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  73.85 
 
 
390 aa  621  1e-177  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2247  S-(hydroxymethyl)glutathione dehydrogenase  74.42 
 
 
391 aa  619  1e-176  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.644611  normal 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5822  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  69.67 
 
 
391 aa  585  1e-166  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3187  alcohol dehydrogenase  66.07 
 
 
389 aa  549  1e-155  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1223  zinc-binding alcohol dehydrogenase  65.13 
 
 
390 aa  544  1e-154  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000417243 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2370  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  64.78 
 
 
389 aa  547  1e-154  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.456638  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0573  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  63.08 
 
 
389 aa  528  1e-149  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5561  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  62.98 
 
 
389 aa  530  1e-149  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.210102  normal  0.0249106 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5582  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  64.01 
 
 
391 aa  522  1e-147  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.351593  normal  0.119261 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0065  alcohol dehydrogenase  62.4 
 
 
386 aa  518  1e-146  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.130136  normal  0.343389 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2860  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  62.98 
 
 
389 aa  515  1.0000000000000001e-145  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.489026  normal  0.707248 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1352  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  62.21 
 
 
388 aa  517  1.0000000000000001e-145  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4500  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  60.87 
 
 
392 aa  511  1e-144  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.658078  normal  0.320847 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5446  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  60.2 
 
 
392 aa  511  1e-144  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.715601  normal  0.534231 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4057  alcohol dehydrogenase  60.15 
 
 
433 aa  508  1e-143  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.788461  normal  0.848638 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0165  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  59.49 
 
 
389 aa  504  9.999999999999999e-143  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1366  glutathione-dependent formaldehyde dehydrogenase  61.18 
 
 
452 aa  498  1e-140  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.987055  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3017  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  61.44 
 
 
520 aa  499  1e-140  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.852283  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3146  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  61.44 
 
 
520 aa  499  1e-140  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.795973  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3010  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  57.14 
 
 
398 aa  482  1e-135  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.609837  decreased coverage  0.000185041 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3683  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  59.08 
 
 
397 aa  483  1e-135  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3396  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  58.97 
 
 
393 aa  481  1e-135  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4498  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  56.41 
 
 
389 aa  478  1e-134  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.709145 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3881  alcohol dehydrogenase  58.87 
 
 
391 aa  475  1e-133  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0212673 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0160  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  57 
 
 
392 aa  474  1e-132  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1016  alcohol dehydrogenase  57.91 
 
 
390 aa  471  1e-132  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.250583  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0764  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  57.65 
 
 
390 aa  470  1.0000000000000001e-131  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.732281  normal  0.967769 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1328  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  57.65 
 
 
390 aa  466  9.999999999999999e-131  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.975088  normal  0.273782 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0575  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  54.62 
 
 
389 aa  464  1e-129  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0041  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  55.13 
 
 
405 aa  462  1e-129  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.950338 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5460  alcohol dehydrogenase  60.15 
 
 
391 aa  461  1e-129  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0027604 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3104  putative glutathione-dependent formaldehyde dehydrogenase  57.29 
 
 
394 aa  459  9.999999999999999e-129  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.345929  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3663  hypothetical protein  56.78 
 
 
394 aa  458  9.999999999999999e-129  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.184617  normal  0.501234 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3833  alcohol dehydrogenase  57.03 
 
 
394 aa  457  1e-127  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.24597  normal  0.375314 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5445  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  53.71 
 
 
390 aa  450  1e-125  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.430041  normal  0.349478 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0122  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  53.33 
 
 
401 aa  444  1e-123  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.566245 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5345  alcohol dehydrogenase  53.65 
 
 
399 aa  442  1e-123  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.501465  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0139  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  52.56 
 
 
401 aa  435  1e-121  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0835  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  51.52 
 
 
396 aa  426  1e-118  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.202579 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6246  alcohol dehydrogenase  53.2 
 
 
389 aa  418  9.999999999999999e-116  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.829786 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3665  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  51.03 
 
 
388 aa  410  1e-113  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.698913  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0748  alcohol dehydrogenase  48.72 
 
 
388 aa  398  1e-109  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.57534  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0754  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  48.72 
 
 
388 aa  398  1e-109  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0768  alcohol dehydrogenase  48.72 
 
 
388 aa  398  1e-109  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.87513  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4673  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  46.92 
 
 
389 aa  379  1e-104  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2149  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  47.06 
 
 
386 aa  367  1e-100  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.406335  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4359  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  48.08 
 
 
389 aa  362  4e-99  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0322  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  47.45 
 
 
387 aa  356  3.9999999999999996e-97  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0695  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  46.82 
 
 
412 aa  353  2e-96  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0774  S-(hydroxymethyl)glutathione dehydrogenase (glutathione-dependent formaldehyde dehydrogenase) (fdh) (faldh)  46.12 
 
 
412 aa  353  2.9999999999999997e-96  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0655  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  46.12 
 
 
412 aa  353  4e-96  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0669  alcohol dehydrogenase GroES-like domain protein  46.12 
 
 
412 aa  353  4e-96  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.432264  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0728  S-(hydroxymethyl)glutathione dehydrogenase (glutathione-dependent formaldehyde dehydrogenase) (fdh) (faldh)  46.12 
 
 
412 aa  353  4e-96  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00577  predicted oxidoreductase, Zn-dependent and NAD(P)-binding  46.56 
 
 
412 aa  352  5e-96  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00566  hypothetical protein  46.56 
 
 
412 aa  352  5e-96  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3016  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  46.31 
 
 
412 aa  352  7e-96  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00665749  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3035  alcohol dehydrogenase  46.31 
 
 
412 aa  352  7e-96  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0714  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  46.12 
 
 
412 aa  352  8e-96  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0660  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  46.31 
 
 
412 aa  351  1e-95  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2984  alcohol dehydrogenase  44.97 
 
 
400 aa  350  3e-95  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.29856  normal  0.505288 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0630  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  46.31 
 
 
412 aa  350  4e-95  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3437  alcohol dehydrogenase  48.14 
 
 
391 aa  348  7e-95  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007968  Pcryo_2481  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  45.15 
 
 
387 aa  347  3e-94  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2429  alcohol dehydrogenase  44.97 
 
 
400 aa  346  3e-94  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0410446  normal  0.763827 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0720  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  45.09 
 
 
389 aa  346  5e-94  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.00145968  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4200  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  47.06 
 
 
385 aa  345  6e-94  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3970  alcohol dehydrogenase GroES domain protein  44.72 
 
 
400 aa  344  1e-93  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.143776 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2636  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  47.19 
 
 
384 aa  343  2.9999999999999997e-93  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3527  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  46.06 
 
 
411 aa  342  5e-93  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.129082  normal  0.366185 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2300  alcohol dehydrogenase  46.56 
 
 
388 aa  342  5e-93  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.394357  hitchhiker  0.00000777829 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2255  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  45.91 
 
 
393 aa  342  9e-93  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000285596  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2540  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  46.68 
 
 
384 aa  341  1e-92  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.14774  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5415  alcohol dehydrogenase GroES domain protein  44.91 
 
 
393 aa  340  2.9999999999999998e-92  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3216  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  46.27 
 
 
393 aa  340  2.9999999999999998e-92  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1619  alcohol dehydrogenase  44.87 
 
 
384 aa  339  5e-92  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.682346 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5047  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  46.17 
 
 
385 aa  338  8e-92  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.557083  hitchhiker  0.00205277 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1875  glutathione-dependent formaldehyde dehydrogenase  45.04 
 
 
411 aa  337  1.9999999999999998e-91  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.231387  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1441  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  46.43 
 
 
390 aa  337  1.9999999999999998e-91  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.42991 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00340  theronine dehydrogenase-like Zn-dependent dehydrogenase  44.63 
 
 
403 aa  336  3.9999999999999995e-91  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.349198 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2641  alcohol dehydrogenase  43.94 
 
 
396 aa  331  1e-89  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0246923  normal  0.569601 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6610  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  42.89 
 
 
394 aa  331  1e-89  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.965415  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1320  zinc-binding alcohol dehydrogenase  46.84 
 
 
384 aa  331  2e-89  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.106118  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4749  alcohol dehydrogenase  44.31 
 
 
393 aa  330  3e-89  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.403113  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3112  Zn-dependent alcohol dehydrogenase  46.56 
 
 
388 aa  328  1.0000000000000001e-88  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.152698  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1803  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  43.89 
 
 
392 aa  328  1.0000000000000001e-88  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17150  theronine dehydrogenase-like Zn-dependent dehydrogenase  45.05 
 
 
415 aa  327  2.0000000000000001e-88  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.554879  normal  0.833214 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1281  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  43.99 
 
 
392 aa  327  3e-88  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.368078  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>