More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_C0151 on replicon NC_007953
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007951  Bxe_A2166  putative sulfite oxidase, dehydrogenase subunit(SoxC)  91.02 
 
 
424 aa  746  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0151  putative sulfite oxidase  100 
 
 
419 aa  845  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.702355 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7230  oxidoreductase molybdopterin binding  78.92 
 
 
406 aa  649  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1238  oxidoreductase, molybdopterin binding  72.46 
 
 
418 aa  603  1e-171  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6594  oxidoreductase, molybdopterin binding  72.46 
 
 
418 aa  603  1e-171  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0853456 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6198  oxidoreductase molybdopterin binding  71.91 
 
 
418 aa  595  1e-169  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4886  putative sulfite oxidase (soxC)  61.74 
 
 
409 aa  461  1e-128  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.592405 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8677  oxidoreductase molybdopterin binding  57.49 
 
 
429 aa  430  1e-119  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.12671  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3664  oxidoreductase molybdopterin binding  58.22 
 
 
402 aa  422  1e-117  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.185653  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3339  oxidoreductase molybdopterin binding  58.49 
 
 
406 aa  424  1e-117  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.617225  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5873  oxidoreductase molybdopterin binding  56.95 
 
 
414 aa  418  1e-116  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.342004  normal  0.20315 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0148  oxidoreductase molybdopterin binding  54.38 
 
 
437 aa  411  1e-114  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4957  oxidoreductase molybdopterin binding  50.83 
 
 
431 aa  411  1e-113  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1504  sulfite oxidase SoxC, putative  53 
 
 
419 aa  402  1e-111  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.545192  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0156  Mo-Co oxidoreductase dimerisation subunit  48.95 
 
 
453 aa  403  1e-111  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  4.33271e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4161  oxidoreductase molybdopterin binding  50.82 
 
 
430 aa  401  1e-110  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1093  twin-arginine translocation pathway signal  53.39 
 
 
425 aa  398  1e-109  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3676  sulfur dehydrogenase subunit SoxC  52.2 
 
 
427 aa  397  1e-109  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.229371  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0911  putative sulfite oxidase  51.73 
 
 
437 aa  397  1e-109  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.911487  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2086  sulfite oxidase SoxC, putative  53.14 
 
 
431 aa  395  1e-109  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.29998  normal  0.615224 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3258  oxidoreductase molybdopterin binding subunit  52.08 
 
 
449 aa  394  1e-108  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1665  oxidoreductase molybdopterin binding  53.39 
 
 
449 aa  394  1e-108  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.879866  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0801  oxidoreductase, molybdopterin binding  50.12 
 
 
451 aa  392  1e-108  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.325021  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4368  twin-arginine translocation pathway signal  50.26 
 
 
425 aa  392  1e-108  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2286  molybdopterin-binding oxidoreductase  53.12 
 
 
451 aa  392  1e-108  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0386813  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1589  oxidoreductase molybdopterin binding  53.39 
 
 
445 aa  394  1e-108  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.45002  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4252  twin-arginine translocation pathway signal  50 
 
 
425 aa  389  1e-107  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.82541  normal  0.253409 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0587  oxidoreductase molybdopterin binding protein  46.87 
 
 
456 aa  389  1e-107  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.271361  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3134  oxidoreductase molybdopterin binding subunit  51.97 
 
 
448 aa  388  1e-107  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0673188  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2988  oxidoreductase, molybdopterin binding  51.83 
 
 
425 aa  385  1e-106  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.548293  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1518  oxidoreductase molybdopterin binding  51.45 
 
 
440 aa  382  1e-105  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.883795  normal  0.831721 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3212  oxidoreductase molybdopterin binding  51.81 
 
 
423 aa  383  1e-105  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3041  oxidoreductase, molybdopterin binding  49.88 
 
 
414 aa  380  1e-104  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1615  oxidoreductase molybdopterin binding  49.76 
 
 
414 aa  372  1e-102  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2631  Mo-Co oxidoreductase dimerisation subunit  50.52 
 
 
443 aa  369  1e-101  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.492263  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3784  oxidoreductase molybdopterin binding  50.51 
 
 
457 aa  369  1e-101  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2802  oxidoreductase  50 
 
 
425 aa  365  1e-99  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.207777 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3913  hypothetical protein  49.35 
 
 
420 aa  363  4e-99  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.44156 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0340  oxidoreductase molybdopterin binding  47.48 
 
 
405 aa  361  1e-98  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2438  putative sulfite oxidase molybdopterin subunit  49.36 
 
 
457 aa  361  1e-98  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0561  sulfite dehydrogenase  47.34 
 
 
414 aa  355  7e-97  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.974393 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2735  oxidoreductase molybdopterin binding protein  46.49 
 
 
415 aa  351  1e-95  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.313353  hitchhiker  5.68946e-05 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2867  Nitrate reductase (NADH)  44.61 
 
 
431 aa  348  1e-94  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1894  twin-arginine translocation pathway signal precursor  51.46 
 
 
427 aa  346  4e-94  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3445  cytochrome c class I  46.12 
 
 
428 aa  343  2e-93  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.456547  normal 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3202  LigA protein  46.12 
 
 
428 aa  343  2e-93  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.152966  unclonable  5.38057e-06 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2060  twin-arginine translocation pathway signal  42.12 
 
 
445 aa  343  3e-93  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  decreased coverage  3.89133e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4155  oxidoreductase, molybdopterin binding  47.34 
 
 
430 aa  343  4e-93  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.405582  normal  0.90981 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2351  oxidoreductase, molybdopterin binding protein  37.38 
 
 
376 aa  153  7e-36  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0601778  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6301  oxidoreductase molybdopterin binding protein  33.54 
 
 
400 aa  145  1e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.386808  normal  0.124724 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4055  Nitrate reductase (NADH)  34.91 
 
 
414 aa  143  5e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4894  oxidoreductase molybdopterin binding  33.85 
 
 
369 aa  141  3e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.344343 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0432  Sulfite oxidase  31.92 
 
 
409 aa  140  3e-32  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.203271 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2626  Sulfite oxidase  35.8 
 
 
370 aa  138  1e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2981  oxidoreductase molybdopterin binding protein  33.33 
 
 
415 aa  137  3e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  1.98483e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0686  oxidoreductase molybdopterin binding  32.92 
 
 
369 aa  136  6e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.300119 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6027  oxidoreductase molybdopterin binding  33.85 
 
 
369 aa  134  2e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0144452 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2981  putative molydopterin binding oxidoreductase  33.13 
 
 
420 aa  131  2e-29  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3951  nitrate reductase (NADH)  33.65 
 
 
369 aa  130  6e-29  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0460  oxidoreductase molybdopterin binding protein  31.64 
 
 
415 aa  129  9e-29  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3748  oxidoreductase molybdopterin binding  31.9 
 
 
372 aa  125  1e-27  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4215  oxidoreductase molybdopterin binding  32.17 
 
 
402 aa  125  2e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.223271 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2781  sulfite dehydrogenase (cytochrome) subunit SorA apoprotein  32.93 
 
 
434 aa  124  4e-27  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.446362  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0035  sulfite dehydrogenase (cytochrome) subunit SorA apoprotein  33.13 
 
 
406 aa  124  4e-27  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.7902  normal  0.133868 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1599  oxidoreductase, molybdopterin binding  31.34 
 
 
409 aa  123  6e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.278899 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5264  sulfite oxidase  33.64 
 
 
361 aa  122  1e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.522428  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0055  oxidoreductase molybdopterin binding  33.33 
 
 
417 aa  121  2e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1455  oxidoreductase molybdopterin binding  30.15 
 
 
406 aa  120  4e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.431852  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3242  oxidoreductase molybdopterin binding  29.28 
 
 
410 aa  120  4e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.842559 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0916  twin-arginine translocation pathway signal  29.8 
 
 
461 aa  119  1e-25  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.470462  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6453  oxidoreductase molybdopterin binding  31.31 
 
 
401 aa  119  1e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.662727 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8369  oxidoreductase molybdopterin binding  32.38 
 
 
403 aa  118  2e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2704  oxidoreductase molybdopterin binding  32.38 
 
 
402 aa  118  2e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4081  twin-arginine translocation pathway signal  29.8 
 
 
461 aa  118  2e-25  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3624  oxidoreductase molybdopterin binding protein  29.15 
 
 
411 aa  118  2e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.564315  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2838  twin-arginine translocation pathway signal  32.1 
 
 
426 aa  117  3e-25  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3018  sulfite dehydrogenase (cytochrome) subunit SorA apoprotein  32.32 
 
 
405 aa  117  4e-25  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.576692 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5388  oxidoreductase molybdopterin binding  30.57 
 
 
403 aa  117  4e-25  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.359711  normal  0.947595 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4627  oxidoreductase molybdopterin binding  29.48 
 
 
414 aa  117  5e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8664  oxidoreductase molybdopterin binding  31.75 
 
 
401 aa  117  5e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0084  oxidoreductase molybdopterin binding  28.38 
 
 
412 aa  115  2e-24  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  unclonable  1.11038e-13  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1175  oxidoreductase molybdopterin binding  29.84 
 
 
408 aa  114  3e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  1.18836e-05 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3931  Sulfite oxidase  30.58 
 
 
407 aa  114  4e-24  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8530  oxidoreductase molybdopterin binding  31.27 
 
 
349 aa  114  4e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2864  sulfite oxidase  30.26 
 
 
363 aa  114  4e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3394  twin-arginine translocation pathway signal  27.47 
 
 
402 aa  113  7e-24  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.115416  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3098  sulfite oxidase and related enzyme  27.41 
 
 
451 aa  112  9e-24  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.57715  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3022  oxidoreductase, molybdopterin binding  28.95 
 
 
400 aa  112  1e-23  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0981  oxidoreductase molybdopterin binding  28.34 
 
 
408 aa  112  2e-23  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.036164  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0584  oxidoreductase molybdopterin binding protein  31.42 
 
 
501 aa  111  3e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2672  oxidoreductase molybdopterin binding  29.68 
 
 
405 aa  111  3e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.125752 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0255  oxidoreductase molybdopterin binding  29.68 
 
 
405 aa  111  3e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.112809  normal  0.0149347 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2874  twin-arginine translocation pathway signal  27.64 
 
 
457 aa  110  5e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5892  oxidoreductase, molybdopterin binding  29.81 
 
 
335 aa  110  5e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08449  nitrate reductase, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G10420)  31.29 
 
 
1016 aa  110  6e-23  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.92163  normal  0.772146 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5280  sulfite oxidase  31.48 
 
 
359 aa  109  1e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.591678  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1622  sulfite:cytochrome c oxidoreductase subunit A  31.03 
 
 
446 aa  109  1e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0949  sulfite dehydrogenase (cytochrome) subunit SorA apoprotein  30 
 
 
412 aa  109  1e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.443239  normal 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6939  oxidoreductase molybdopterin binding protein  27.7 
 
 
417 aa  109  1e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_37938  predicted protein  31.48 
 
 
866 aa  108  2e-22  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.590439  normal  0.879833 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>