115 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_C0032 on replicon NC_007953
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007953  Bxe_C0032  putative carbon monoxide dehydrogenase, CoxG subunit  100 
 
 
206 aa  415  1e-115  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.262475 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2147  putative carbon monoxide dehydrogenase, CoxG subunit  84.62 
 
 
208 aa  354  5e-97  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.295033  normal  0.334057 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1564  carbon monoxide dehydrogenase, large subunit apoprotein  42.5 
 
 
1027 aa  151  6e-36  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.151361  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2767  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  36.24 
 
 
185 aa  114  1e-24  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0232  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  30.52 
 
 
198 aa  94  1e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0494  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  32.2 
 
 
222 aa  91.3  8e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.462994  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0505  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  32.2 
 
 
222 aa  91.3  8e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.746959  normal  0.248334 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0483  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  32.2 
 
 
222 aa  91.3  8e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.237703  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1636  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  30.77 
 
 
237 aa  89  4e-17  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10374  oxidoreductase  31.02 
 
 
200 aa  88.2  7e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00057735  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0120  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  31.25 
 
 
212 aa  88.2  8e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.391115  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2034  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  30.05 
 
 
241 aa  87.4  1e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0321774  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4922  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  29.86 
 
 
295 aa  86.7  2e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.102122  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5184  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  31.25 
 
 
232 aa  83.2  2e-15  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.184935 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4562  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  31.43 
 
 
306 aa  82  6e-15  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1865  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  27.12 
 
 
254 aa  82  6e-15  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0119  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  29.93 
 
 
147 aa  81.3  9e-15  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.128418  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4984  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  30.15 
 
 
240 aa  80.1  2e-14  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.990283 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3032  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  28.57 
 
 
225 aa  80.1  2e-14  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0343994  normal  0.0106587 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13140  hypothetical protein  32.28 
 
 
262 aa  80.1  2e-14  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4601  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  30.15 
 
 
240 aa  80.1  2e-14  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4689  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  30.15 
 
 
240 aa  80.1  2e-14  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.969168 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0642  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  30.22 
 
 
251 aa  78.6  6e-14  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4237  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  29.41 
 
 
469 aa  78.2  8e-14  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3967  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  29.12 
 
 
246 aa  77.4  1e-13  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1563  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  29.79 
 
 
234 aa  77.4  1e-13  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4106  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  28.64 
 
 
208 aa  77.4  1e-13  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.875742  normal  0.142553 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4709  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  29.17 
 
 
240 aa  77.8  1e-13  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.618001 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0072  putative carbon monoxide dehydrogenase subunit G  28.97 
 
 
246 aa  75.9  4e-13  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.766775  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1572  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  29.17 
 
 
241 aa  75.9  4e-13  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.615405  normal  0.536684 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1217  hypothetical protein  25.68 
 
 
289 aa  75.1  6e-13  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0793988 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3210  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  27.22 
 
 
237 aa  73.9  1e-12  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.924727  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2945  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  27.23 
 
 
182 aa  74.3  1e-12  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0435616  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0593  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  29.55 
 
 
244 aa  72.8  3e-12  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4318  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  27.27 
 
 
225 aa  69.3  3e-11  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.531167  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5312  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  26.9 
 
 
232 aa  68.9  4e-11  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3140  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  27.23 
 
 
182 aa  69.3  4e-11  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0169757  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0006  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  25.79 
 
 
156 aa  68.9  5e-11  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.35222  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3032  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  26.7 
 
 
182 aa  66.6  3e-10  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.128419  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1056  hypothetical protein  27.76 
 
 
241 aa  65.9  4e-10  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.184946  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5319  putative carbon monoxide dehydrogenase, coxG accessory protein  29.63 
 
 
148 aa  65.1  7e-10  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.500561 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0339  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  30.3 
 
 
241 aa  63.9  1e-09  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.30715 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3553  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  30.71 
 
 
157 aa  64.3  1e-09  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.530671  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2608  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  29.41 
 
 
148 aa  63.5  2e-09  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3792  ferredoxin:(2Fe-2S)-binding:carbon monoxide dehydrogenase subunit G  26.9 
 
 
390 aa  62  6e-09  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.100636  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0573  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  29.29 
 
 
197 aa  62  6e-09  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1377  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  27.27 
 
 
149 aa  61.6  8e-09  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.667187  normal  0.46376 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4285  (2Fe-2S)-binding domain protein  27.14 
 
 
405 aa  60.8  1e-08  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0056  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  30.56 
 
 
151 aa  61.2  1e-08  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.752516  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0844  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  27.66 
 
 
249 aa  60.5  2e-08  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.777561  hitchhiker  0.00161698 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5438  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  27.27 
 
 
154 aa  59.7  3e-08  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.304437 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1445  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  30.71 
 
 
158 aa  59.3  3e-08  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.101992  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5862  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  30.15 
 
 
158 aa  60.1  3e-08  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0618522 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1283  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  30.71 
 
 
158 aa  59.3  3e-08  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.112632  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0848  carbon-monoxide dehydrogenase  28.12 
 
 
997 aa  59.7  3e-08  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.682595 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0213  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  29.2 
 
 
154 aa  59.3  4e-08  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4550  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  26.58 
 
 
227 aa  59.3  4e-08  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.735777  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0040  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  28.47 
 
 
151 aa  59.3  4e-08  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.269242 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1748  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  28.08 
 
 
154 aa  58.9  5e-08  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5890  xanthine dehydrogenase, molybdenum binding subunit apoprotein  27.61 
 
 
1012 aa  58.2  9e-08  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.614012  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1630  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  29.41 
 
 
155 aa  58.2  9e-08  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.442595  normal  0.5824 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5697  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  30.34 
 
 
400 aa  57.4  1e-07  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00407946 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3719  aldehyde oxidase and xanthine dehydrogenase molybdopterin binding  29.46 
 
 
983 aa  57.8  1e-07  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4535  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  28.27 
 
 
202 aa  57.8  1e-07  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1231  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  24.82 
 
 
150 aa  56.6  3e-07  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.99571  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2694  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  30.47 
 
 
153 aa  56.2  3e-07  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0998879  normal  0.661336 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0470  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  26.81 
 
 
213 aa  56.2  3e-07  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4415  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  27.97 
 
 
150 aa  55.8  4e-07  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4327  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  26.71 
 
 
154 aa  55.1  7e-07  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.510988  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1744  aldehyde oxidase and xanthine dehydrogenase molybdopterin binding  27.61 
 
 
1011 aa  55.1  8e-07  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.919932 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3679  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  27.21 
 
 
151 aa  55.1  8e-07  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2052  aldehyde oxidase and xanthine dehydrogenase molybdopterin binding  27.61 
 
 
1011 aa  54.7  9e-07  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.806962 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0971  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  25.14 
 
 
269 aa  54.7  1e-06  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00301105  normal  0.374469 
 
 
-
 
NC_004310  BR0284  hypothetical protein  28.47 
 
 
150 aa  54.3  1e-06  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.364944  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0298  hypothetical protein  28.47 
 
 
150 aa  54.7  1e-06  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.936429  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0569  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  23.97 
 
 
148 aa  54.3  1e-06  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.0217411 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3296  aldehyde oxidase and xanthine dehydrogenase molybdopterin binding  26.57 
 
 
987 aa  53.5  2e-06  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0204451  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2206  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  27.21 
 
 
148 aa  53.5  2e-06  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0292084  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2253  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  26.81 
 
 
243 aa  53.5  2e-06  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0481685 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6673  aldehyde oxidase and xanthine dehydrogenase molybdopterin binding  30.37 
 
 
1019 aa  53.5  2e-06  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.581747  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0023  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  27.74 
 
 
152 aa  53.5  2e-06  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000137248 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1598  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  26.21 
 
 
204 aa  53.1  3e-06  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3097  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  27.7 
 
 
147 aa  52.8  3e-06  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.889249  normal  0.544468 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4356  putative carbon monoxide dehydrogenase, CoxG subunit  25.34 
 
 
232 aa  52.8  3e-06  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1781  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  25.95 
 
 
153 aa  52.4  5e-06  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.378744 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3597  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  26.53 
 
 
254 aa  52.4  5e-06  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0237636  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2235  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  26.49 
 
 
152 aa  50.8  1e-05  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  6.88113e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2963  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  21.9 
 
 
216 aa  50.8  1e-05  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.748718  normal  0.0394978 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2185  aldehyde oxidase and xanthine dehydrogenase molybdopterin binding  27.61 
 
 
1012 aa  50.1  2e-05  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5832  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  30.14 
 
 
399 aa  50.8  2e-05  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.671661  hitchhiker  0.00379539 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2879  hypothetical protein  26.12 
 
 
176 aa  49.7  3e-05  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.434233  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1525  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  26.12 
 
 
176 aa  49.3  4e-05  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.187738  normal  0.0565449 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3377  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  26.62 
 
 
155 aa  48.9  5e-05  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.370754  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2073  xanthine dehydrogenase, molybdenum binding subunit apoprotein  28.03 
 
 
980 aa  48.9  5e-05  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.576081  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1464  hypothetical protein  25.56 
 
 
213 aa  48.9  6e-05  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.273128 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1141  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  26.87 
 
 
178 aa  48.9  6e-05  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.654627  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2531  hypothetical protein  26.06 
 
 
161 aa  47.8  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0528604 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1814  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  28.23 
 
 
208 aa  47  0.0002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.96745  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0360  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  27.13 
 
 
187 aa  46.6  0.0003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0420  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  26.32 
 
 
182 aa  45.8  0.0004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.110218  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>