More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_B3007 on replicon NC_007952
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007952  Bxe_B3007  response regulator receiver protein  100 
 
 
121 aa  237  5e-62  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.82691  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6982  response regulator receiver protein  100 
 
 
121 aa  235  1e-61  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.543891  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3754  response regulator receiver protein  93.39 
 
 
121 aa  225  1e-58  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.422416  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4831  response regulator receiver protein  93.39 
 
 
121 aa  225  1e-58  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3587  response regulator receiver protein  91.67 
 
 
121 aa  225  2e-58  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.794363  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1975  response regulator receiver protein  87.6 
 
 
121 aa  214  2e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3451  response regulator receiver protein  86.78 
 
 
121 aa  213  9e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.390224  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4294  response regulator receiver protein  86.78 
 
 
121 aa  213  9e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4072  response regulator receiver protein  86.78 
 
 
121 aa  213  9e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.696475  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3973  response regulator receiver protein  85.95 
 
 
121 aa  212  9.999999999999999e-55  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.915611  normal  0.249812 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3466  response regulator receiver protein  85.95 
 
 
121 aa  212  9.999999999999999e-55  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4506  response regulator receiver protein  85 
 
 
121 aa  209  2e-53  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.242512  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1955  response regulator receiver protein  85 
 
 
121 aa  207  3e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.275329  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2121  response regulator receiver protein  73.33 
 
 
121 aa  183  9e-46  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.317416  normal  0.525904 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2168  response regulator receiver protein  52.1 
 
 
120 aa  121  3e-27  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.747517  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0631  response regulator receiver protein  52.54 
 
 
121 aa  118  3e-26  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1541  response regulator receiver protein  51.64 
 
 
120 aa  116  7.999999999999999e-26  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2107  response regulator receiver domain-containing protein  50 
 
 
120 aa  115  1.9999999999999998e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02260  putative two-component response regulator  48.28 
 
 
121 aa  115  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.797803  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0259  putative two-component response regulator  48.28 
 
 
121 aa  114  3e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.40567  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2428  response regulator receiver domain-containing protein  50.85 
 
 
128 aa  114  5e-25  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0310268  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1289  chemotaxis protein CheY  48.31 
 
 
121 aa  113  6.9999999999999995e-25  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0725  response regulator receiver  48.31 
 
 
121 aa  113  7.999999999999999e-25  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.537285 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0468  response regulator receiver protein  49.18 
 
 
120 aa  112  1.0000000000000001e-24  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.156981 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1739  response regulator receiver protein  47.46 
 
 
121 aa  112  2.0000000000000002e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0375564  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1417  response regulator receiver protein  50.83 
 
 
120 aa  111  3e-24  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.212789  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0915  chemotaxis protein CheY  50.86 
 
 
122 aa  111  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1378  response regulator receiver domain-containing protein  47.46 
 
 
122 aa  110  5e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.207936  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0788  response regulator receiver  50.86 
 
 
122 aa  110  6e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1606  response regulator receiver protein  45.76 
 
 
121 aa  108  3e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2575  response regulator receiver protein  47.46 
 
 
122 aa  107  5e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0149684  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0147  chemotaxis protein CheY  42.86 
 
 
119 aa  106  9.000000000000001e-23  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0167  response regulator receiver protein  50.41 
 
 
120 aa  106  1e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1593  response regulator receiver protein  45.76 
 
 
121 aa  106  1e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2994  response regulator receiver protein  45.76 
 
 
121 aa  106  1e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2620  response regulator receiver protein  45.76 
 
 
121 aa  106  1e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2479  response regulator receiver protein  46.61 
 
 
122 aa  105  2e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.591075  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2142  chemotaxis protein cheY  46.61 
 
 
121 aa  104  3e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2650  response regulator receiver protein  45.69 
 
 
120 aa  104  4e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4317  chemotaxis receiver protein  45.83 
 
 
122 aa  104  4e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.257676  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2318  chemotaxis protein CheY  46.67 
 
 
121 aa  104  5e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3494  response regulator receiver protein  47.93 
 
 
120 aa  103  5e-22  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.313433 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3294  response regulator receiver  46.67 
 
 
120 aa  103  5e-22  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22620  response regulator receiver protein  44.63 
 
 
124 aa  104  5e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3207  response regulator receiver protein  39.17 
 
 
124 aa  103  7e-22  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.138724  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1625  response regulator receiver domain-containing protein  47.11 
 
 
120 aa  103  1e-21  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.608115 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0187  response regulator receiver protein  47.93 
 
 
120 aa  103  1e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0114  response regulator receiver protein  47.06 
 
 
120 aa  102  2e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3108  response regulator receiver domain-containing protein  47.06 
 
 
120 aa  102  2e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0584  chemotaxis signal transduction protein CheY  44.54 
 
 
120 aa  102  3e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00411  chemotaxis protein CheY  46.72 
 
 
121 aa  101  4e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0899  response regulator receiver domain-containing protein  47.01 
 
 
122 aa  100  5e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1536  response regulator receiver protein  45.95 
 
 
122 aa  100  7e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0284047 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1937  response regulator receiver domain-containing protein  44.92 
 
 
121 aa  99.8  1e-20  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.644536  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1570  response regulator receiver protein  46.15 
 
 
121 aa  99.4  2e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.945276 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3564  response regulator receiver protein  44.17 
 
 
122 aa  99.4  2e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0923704 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1315  response regulator receiver protein  45 
 
 
121 aa  99.4  2e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0517324  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0566  response regulator receiver domain-containing protein  46.22 
 
 
120 aa  98.6  3e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4379  response regulator receiver protein  42.86 
 
 
120 aa  97.8  4e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0092  response regulator receiver protein  42.24 
 
 
122 aa  97.4  5e-20  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2177  response regulator receiver protein  44.54 
 
 
120 aa  97.1  7e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0278  response regulator receiver protein  41.18 
 
 
121 aa  96.7  9e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.143889  normal  0.948049 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1155  response regulator receiver protein  42.62 
 
 
122 aa  96.7  9e-20  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.22671  normal  0.144109 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3065  response regulator receiver protein  42.02 
 
 
120 aa  96.3  1e-19  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3791  response regulator receiver protein  42.02 
 
 
120 aa  96.3  1e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0775  response regulator receiver protein  42.62 
 
 
122 aa  95.5  2e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0246849 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1598  response regulator receiver protein  42.02 
 
 
120 aa  95.5  2e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00129925 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3298  response regulator receiver protein  44.44 
 
 
121 aa  95.5  2e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0155  chemotaxis response regulator  40.5 
 
 
120 aa  95.1  3e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2437  chemotaxis response regulator, CheY1  38.46 
 
 
122 aa  94.7  4e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.365798  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0754  response regulator receiver domain-containing protein  43.33 
 
 
120 aa  94.4  4e-19  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0880  response regulator receiver protein  43.1 
 
 
123 aa  94.7  4e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1095  response regulator receiver domain-containing protein  42.86 
 
 
118 aa  94.4  5e-19  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.344664  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1853  response regulator receiver protein  39.5 
 
 
122 aa  94.4  5e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.955028  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1101  response regulator receiver protein  38.46 
 
 
122 aa  94.4  5e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.956043  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2120  chemotaxis protein CheY  42.86 
 
 
121 aa  94  6e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0581  chemotaxis response regulator  40.16 
 
 
124 aa  94  6e-19  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0611  response regulator receiver protein  40.34 
 
 
121 aa  94  7e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1853  response regulator receiver protein  41.67 
 
 
121 aa  93.6  8e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.00571982  normal  0.853875 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1535  response regulator receiver protein  49.59 
 
 
121 aa  93.6  9e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0267991 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1398  response regulator receiver domain-containing protein  42.37 
 
 
123 aa  93.2  1e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.503734  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2842  response regulator receiver domain-containing protein  38.14 
 
 
126 aa  92.8  1e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.810937  normal  0.282987 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1793  response regulator receiver protein  39.5 
 
 
122 aa  92.8  1e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1456  response regulator receiver protein  39.83 
 
 
124 aa  93.2  1e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3265  response regulator receiver protein  41.67 
 
 
122 aa  92.4  2e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.571434  normal  0.349593 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0203  chemotaxis response regulator  40.34 
 
 
123 aa  92.8  2e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.989482  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0654  response regulator receiver protein  42.02 
 
 
120 aa  92.4  2e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.54464 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4812  response regulator receiver protein  42.02 
 
 
121 aa  91.7  3e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00197217 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1139  response regulator receiver  38.46 
 
 
121 aa  90.9  5e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2094  response regulator receiver protein  41.18 
 
 
121 aa  90.9  5e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.911812 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2219  response regulator receiver protein  41.18 
 
 
121 aa  90.5  7e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00031  chemotaxis response regulator  41.03 
 
 
116 aa  90.1  8e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.371607  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2111  Fis family transcriptional regulator  42.86 
 
 
121 aa  89.7  1e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3796  response regulator receiver protein  45.37 
 
 
109 aa  89.7  1e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1880  response regulator receiver protein  40.34 
 
 
121 aa  89.4  1e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.578036 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0263  response regulator receiver protein  38.98 
 
 
121 aa  89  2e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.419062 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1583  chemotaxis response regulator, CheY3  39.34 
 
 
121 aa  89.4  2e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  hitchhiker  0.00144899  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0146  response regulator receiver protein  40.34 
 
 
121 aa  89.4  2e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0235  response regulator receiver protein  39.34 
 
 
121 aa  89.4  2e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1007  chemotaxis protein CheY  41.59 
 
 
126 aa  89.4  2e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>