More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_B3002 on replicon NC_007952
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007952  Bxe_B3002  GntR family transcriptional regulator  100 
 
 		 241 aa  493  1e-139  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  2.78265e-16  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6960  transcriptional regulator, GntR family  92.95 
 
 		 241 aa  460  1e-129  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4252  GntR family transcriptional regulator  89.58 
 
 		 241 aa  447  1e-125  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5139  GntR family transcriptional regulator  76.27 
 
 		 242 aa  375  1e-103  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.911419  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3021  GntR family transcriptional regulator  73.5 
 
 		 234 aa  363  2e-99  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.222763 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4449  GntR family transcriptional regulator  69.47 
 
 		 241 aa  332  4e-90  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00199071  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5631  GntR family transcriptional regulator  53.88 
 
 		 229 aa  237  1e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3062  GntR family transcriptional regulator  50 
 
 		 228 aa  224  1e-57  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0583263  normal  0.817477 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2905  transcriptional regulator, GntR family  50.71 
 
 		 231 aa  222  3e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.839759  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3053  GntR family transcriptional regulator  49.76 
 
 		 229 aa  219  1.9999999999999999e-56  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.784851  normal  0.195009 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2754  GntR family transcriptional regulator  53.6 
 
 		 231 aa  214  9e-55  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.287594 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1256  transcriptional regulator, GntR family  46.01 
 
 		 231 aa  196  3e-49  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.586616  normal  0.233968 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0601  GntR family transcriptional regulator  44.7 
 
 		 227 aa  195  6e-49  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4718  transcriptional regulator, GntR family  49.75 
 
 		 274 aa  192  3e-48  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0061626 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5730  GntR family transcriptional regulator  44.91 
 
 		 251 aa  191  1e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.645386  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3199  GntR family transcriptional regulator  45.63 
 
 		 222 aa  189  4e-47  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.405937  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4571  transcriptional regulator, GntR family  48.77 
 
 		 263 aa  188  8e-47  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0294362 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4201  regulatory protein GntR HTH  49.24 
 
 		 263 aa  184  9e-46  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.316316 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3401  transcriptional regulator, GntR family  44.86 
 
 		 256 aa  177  9e-44  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3523  GntR family transcriptional regulator  45.91 
 
 		 275 aa  177  1e-43  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.33471  normal  0.169398 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4650  regulatory protein GntR HTH  41.1 
 
 		 230 aa  176  2e-43  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.272173  normal  0.380465 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3484  GntR family transcriptional regulator  42.33 
 
 		 224 aa  176  3e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.294371  normal  0.809242 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3323  transcriptional regulator  42.51 
 
 		 226 aa  175  6e-43  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5113  transcriptional regulator, GntR family  40.64 
 
 		 230 aa  175  7e-43  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0844169  normal  0.823532 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5191  transcriptional regulator, GntR family  40.93 
 
 		 225 aa  174  9.999999999999999e-43  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  decreased coverage  0.000155009  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2208  GntR family transcriptional regulator  41.55 
 
 		 223 aa  172  5e-42  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.223397  normal  0.583334 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1164  GntR family transcriptional regulator  42.51 
 
 		 218 aa  171  6.999999999999999e-42  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.720866  normal  0.242245 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2906  GntR family transcriptional regulator  40.58 
 
 		 226 aa  171  1e-41  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.359044  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4222  GntR family transcriptional regulator  42.79 
 
 		 254 aa  166  2.9999999999999998e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.993949  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3096  GntR family transcriptional regulator  42.93 
 
 		 255 aa  165  5.9999999999999996e-40  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2769  transcriptional regulator, GntR family  41.86 
 
 		 223 aa  164  8e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3422  GntR family transcriptional regulator  40.3 
 
 		 214 aa  158  9e-38  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1327  transcriptional regulator, GntR family  39.8 
 
 		 227 aa  155  4e-37  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.349018 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3139  GntR family transcriptional regulator  37.88 
 
 		 284 aa  150  2e-35  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.00307264  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3389  GntR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 223 aa  149  4e-35  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1377  transcriptional regulator, GntR family  43.27 
 
 		 225 aa  148  7e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.322083  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0466  GntR family transcriptional regulator  38.6 
 
 		 239 aa  133  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0135262 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6547  GntR family transcriptional regulator  36.74 
 
 		 246 aa  132  3.9999999999999996e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.485064 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7930  transcriptional regulator, GntR family  38.05 
 
 		 221 aa  130  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2755  GntR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 222 aa  127  2.0000000000000002e-28  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0339341 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4617  GntR family transcriptional regulator  37.11 
 
 		 239 aa  126  3e-28  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0049  GntR family transcriptional regulator  35.19 
 
 		 245 aa  125  5e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3487  transcriptional regulator, GntR family  34.27 
 
 		 223 aa  125  7e-28  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3889  putative transcriptional regulator  34.23 
 
 		 240 aa  124  2e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.570531  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4989  GntR family transcriptional regulator  34.02 
 
 		 232 aa  122  6e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.06037  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1245  GntR family transcriptional regulator  37.62 
 
 		 242 aa  121  9.999999999999999e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.65087  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2535  transcriptional regulator, GntR family  36.84 
 
 		 222 aa  121  9.999999999999999e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4024  GntR family transcriptional regulator  37.04 
 
 		 239 aa  120  3e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.466546  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4019  transcriptional regulator, GntR family  33.63 
 
 		 255 aa  120  3e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4132  transcriptional regulator, GntR family  33.63 
 
 		 295 aa  119  3e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1073  transcriptional regulator, GntR family  33.33 
 
 		 239 aa  118  7e-26  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2899  GntR family transcriptional regulator  39.46 
 
 		 226 aa  118  9.999999999999999e-26  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  decreased coverage  0.0000458154  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2509  GntR family transcriptional regulator  32.54 
 
 		 211 aa  117  1.9999999999999998e-25  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0825913 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4101  GntR family transcriptional regulator  34.13 
 
 		 247 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2090  GntR family transcriptional regulator  35.15 
 
 		 222 aa  113  3e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.047228  normal  0.700914 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1385  GntR domain-containing protein  36.49 
 
 		 223 aa  112  4.0000000000000004e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00179807 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1660  transcriptional regulator, GntR family  36.49 
 
 		 223 aa  112  4.0000000000000004e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0644  GntR family transcriptional regulator  34.08 
 
 		 244 aa  111  8.000000000000001e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.412108  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6216  transcriptional regulator, GntR family  34.69 
 
 		 249 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.468686  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2293  GntR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 228 aa  111  1.0000000000000001e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.235113  hitchhiker  0.00231289 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3148  transcriptional regulator, GntR family  35 
 
 		 222 aa  111  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3496  GntR family transcriptional regulator  33.48 
 
 		 237 aa  110  2.0000000000000002e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6860  GntR family transcriptional regulator  34.15 
 
 		 242 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1839  GntR family transcriptional regulator  37.37 
 
 		 220 aa  110  3e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  0.00000090483  n/a   
 
 
 
NC_011831  Cagg_3094  transcriptional regulator, GntR family  34.68 
 
 		 233 aa  109  3e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00936803  normal  0.247599 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1722  GntR family transcriptional regulator  36.51 
 
 		 218 aa  109  3e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.622001 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6029  GntR family transcriptional regulator  36.19 
 
 		 251 aa  109  4.0000000000000004e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.235411  normal  0.357721 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0992  transcriptional regulator, GntR family  33.99 
 
 		 223 aa  108  5e-23  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1076  GntR family transcriptional regulator  33.99 
 
 		 223 aa  108  5e-23  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0051  GntR family transcriptional regulator  35.07 
 
 		 227 aa  108  6e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.331225 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3711  GntR family transcriptional regulator  36.45 
 
 		 228 aa  108  6e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.572132  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0165  GntR family transcriptional regulator  32.67 
 
 		 222 aa  108  1e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.108309  decreased coverage  0.00499675 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2970  GntR family transcriptional regulator  30.39 
 
 		 229 aa  108  1e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2039  GntR family transcriptional regulator  35.38 
 
 		 211 aa  107  1e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4007  GntR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 233 aa  107  2e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1848  transcriptional regulator, GntR family  35.38 
 
 		 211 aa  107  2e-22  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2798  GntR family transcriptional regulator  32.54 
 
 		 233 aa  106  3e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.297778 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2404  GntR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 230 aa  106  4e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1149  GntR family transcriptional regulator  34.41 
 
 		 223 aa  105  5e-22  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0675802  normal  0.772542 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0022  GntR domain-containing protein  33.17 
 
 		 228 aa  105  5e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0023  transcriptional regulator, GntR family  33.17 
 
 		 230 aa  105  5e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.697058  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4283  GntR family transcriptional regulator  31.1 
 
 		 222 aa  105  6e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0724479  normal  0.899409 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2445  transcriptional regulator  36.87 
 
 		 237 aa  105  6e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.247601  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0043  transcriptional regulator, GntR family  33.66 
 
 		 231 aa  105  7e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0169991 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4139  transcriptional regulator, GntR family  29.5 
 
 		 238 aa  104  1e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.773243 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0081  GntR family transcriptional regulator  34.16 
 
 		 240 aa  104  1e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0384322 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1510  GntR family transcriptional regulator  33.66 
 
 		 222 aa  104  1e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.535687  normal  0.154359 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0874  transcriptional regulator, GntR family  27.32 
 
 		 226 aa  103  2e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.917982  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4046  GntR family transcriptional regulator  37.71 
 
 		 235 aa  102  6e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5133  GntR family transcriptional regulator  34.57 
 
 		 224 aa  102  6e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.319425 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1484  transcriptional regulator, GntR family  34.97 
 
 		 219 aa  102  7e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0023  transcriptional regulator, GntR family  29.13 
 
 		 228 aa  101  8e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3196  transcriptional regulator, GntR family  31.58 
 
 		 237 aa  101  8e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.594143 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1381  transcriptional regulator, GntR family  36.97 
 
 		 223 aa  101  9e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.526175  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0600  GntR family transcriptional regulator  32.24 
 
 		 225 aa  101  1e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3298  GntR family transcriptional regulator  34.74 
 
 		 226 aa  100  1e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.197273 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4161  GntR family transcriptional regulator  27.32 
 
 		 235 aa  100  2e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0062  GntR family transcriptional regulator  27.4 
 
 		 234 aa  100  2e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2445  transcriptional regulator, GntR family  35.84 
 
 		 230 aa  99.8  3e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1537  transcriptional regulator, GntR family  30 
 
 		 226 aa  99.8  4e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000150611  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>