20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_B2991 on replicon NC_007952
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007952  Bxe_B2991  hypothetical protein  100 
 
 
85 aa  171  2.9999999999999996e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6950  hypothetical protein  97.65 
 
 
85 aa  168  3e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.194988  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4261  hypothetical protein  73.49 
 
 
84 aa  120  4e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.760383 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2116  hypothetical protein  70 
 
 
91 aa  105  2e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.346366  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2133  hypothetical protein  63.1 
 
 
91 aa  104  5e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.678846 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0946  hypothetical protein  63.16 
 
 
87 aa  99.4  1e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000169892  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1582  major surface protein 3  63.16 
 
 
87 aa  99.4  1e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  unclonable  0.00000000246807  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0853  hypothetical protein  63.16 
 
 
87 aa  99.4  1e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  hitchhiker  0.00439999  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0039  hypothetical protein  63.16 
 
 
87 aa  99.4  1e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000015275  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2199  hypothetical protein  63.16 
 
 
87 aa  99.4  1e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  unclonable  0.0000000000443154  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1770  major surface protein 3  63.16 
 
 
87 aa  99  2e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.014587  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5356  hypothetical protein  63.1 
 
 
82 aa  98.6  3e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000000567698  normal  0.0251464 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4931  hypothetical protein  60.71 
 
 
83 aa  95.1  3e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000000049187  normal  0.0166523 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4362  hypothetical protein  59.52 
 
 
83 aa  95.1  3e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.0000152629  hitchhiker  0.000377592 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3436  hypothetical protein  60.71 
 
 
83 aa  95.1  3e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000000000239099  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4879  hypothetical protein  59.52 
 
 
83 aa  95.1  3e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00123249  hitchhiker  0.000000000134527 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0760  hypothetical protein  58.75 
 
 
83 aa  93.2  1e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.110621  decreased coverage  0.00000850392 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3687  hypothetical protein  58.23 
 
 
83 aa  92  2e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000507992  normal  0.538527 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1208  hypothetical protein  60.66 
 
 
84 aa  81.6  0.000000000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0713  hypothetical protein  60.66 
 
 
85 aa  78.2  0.00000000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.593256 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>