295 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_B2922 on replicon NC_007952
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007952  Bxe_B2922  putative type II secretion system protein F  100 
 
 
282 aa  560  1.0000000000000001e-159  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.840651  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6877  type II secretion system protein  88.3 
 
 
282 aa  496  1e-139  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.44202  normal  0.236488 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4347  type II secretion system protein  66.18 
 
 
275 aa  350  1e-95  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.277812  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0643  type II secretion system protein  39.93 
 
 
283 aa  203  3e-51  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2308  Type II secretion system F domain protein  39.64 
 
 
284 aa  202  4e-51  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0248  type II secretion system protein  42.05 
 
 
290 aa  202  4e-51  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.90531 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0747  type II secretion system protein  39.42 
 
 
283 aa  201  9.999999999999999e-51  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.725692  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2115  type II secretion system protein  45.64 
 
 
279 aa  189  4e-47  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0709  putative type II secretion system protein F  37.41 
 
 
283 aa  185  7e-46  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2695  type II secretion system protein  51.83 
 
 
289 aa  174  1.9999999999999998e-42  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0973564  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2926  type II secretion system protein  33.71 
 
 
316 aa  145  5e-34  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.194464  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4614  type II secretion system protein  31.68 
 
 
329 aa  144  2e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1018  type II secretion system protein  36.93 
 
 
336 aa  142  7e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2648  type II secretion system protein  36.29 
 
 
325 aa  141  9.999999999999999e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.846327  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6777  type II secretion system protein  34.69 
 
 
325 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.270969  normal  0.612228 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0651  putative tight adherence TadB-related transmembrane protein  34.54 
 
 
325 aa  140  1.9999999999999998e-32  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.280791 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3211  type II secretion system protein  38.27 
 
 
332 aa  140  3e-32  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.515921 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5491  type II secretion system protein  34.69 
 
 
325 aa  139  3.9999999999999997e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6365  type II secretion system protein  34.29 
 
 
325 aa  139  6e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2117  type II secretion system protein  34.98 
 
 
323 aa  138  7.999999999999999e-32  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.215511  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4618  type II secretion system protein  38.78 
 
 
325 aa  137  1e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.347884 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0640  type II secretion system protein  34.87 
 
 
325 aa  136  3.0000000000000003e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.295246 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0587  type II secretion system protein  33.61 
 
 
325 aa  135  9.999999999999999e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.292089  normal  0.415996 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1753  Flp pilus assembly protein TadB  37.5 
 
 
325 aa  134  9.999999999999999e-31  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7194  Flp pilus assembly protein TadB  33.75 
 
 
325 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0666217  normal  0.429019 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0544  type II secretion system protein  36.98 
 
 
325 aa  135  9.999999999999999e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.106661  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1275  type II secretion system protein  35.98 
 
 
327 aa  132  7.999999999999999e-30  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2556  type II secretion system protein  33.61 
 
 
325 aa  131  1.0000000000000001e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.460971  normal  0.349812 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0800  type II secretion system protein  37.57 
 
 
322 aa  130  2.0000000000000002e-29  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2275  Flp pilus assembly protein TadB  34.18 
 
 
325 aa  130  3e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1042  Type II secretion system F domain protein  37.86 
 
 
313 aa  130  3e-29  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.205171  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1681  type II secretion system protein  35.05 
 
 
327 aa  129  4.0000000000000003e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000554602 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1317  Flp pilus assembly protein TadB  36.46 
 
 
325 aa  129  4.0000000000000003e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4445  type II secretion system protein  35.29 
 
 
309 aa  129  4.0000000000000003e-29  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00467148 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3092  type II secretion system protein  36.46 
 
 
325 aa  129  4.0000000000000003e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2967  type II secretion system protein  36.46 
 
 
325 aa  129  4.0000000000000003e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.350744  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2353  type II secretion system protein  34.72 
 
 
323 aa  127  2.0000000000000002e-28  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.173092  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5325  type II secretion system protein  35.12 
 
 
326 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.61312  hitchhiker  0.00813406 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1529  type II secretion system protein  32.29 
 
 
330 aa  127  2.0000000000000002e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1851  type II secretion system protein  29.92 
 
 
660 aa  126  3e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00122698  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2737  type II secretion system protein  33.33 
 
 
321 aa  125  1e-27  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6299  type II secretion system protein  37.23 
 
 
325 aa  123  4e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1917  type II secretion system protein  34.9 
 
 
321 aa  122  6e-27  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.258716  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2934  type II secretion system protein  31.65 
 
 
310 aa  122  7e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.898697  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6003  type II secretion system protein  36.79 
 
 
325 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1499  type II secretion system protein  33.33 
 
 
321 aa  120  1.9999999999999998e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.698875  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1108  type II secretion system protein  32.7 
 
 
321 aa  120  1.9999999999999998e-26  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.143075  normal  0.274836 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3117  type II secretion system protein  36.13 
 
 
326 aa  120  3e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.193846  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2649  type II secretion system protein  33.52 
 
 
310 aa  119  3.9999999999999996e-26  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2364  hypothetical protein  32.2 
 
 
321 aa  118  9.999999999999999e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.288668  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1160  Type II secretion system F domain protein  35.26 
 
 
323 aa  118  9.999999999999999e-26  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0654  TadB protein  34.29 
 
 
322 aa  117  1.9999999999999998e-25  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.179736 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3010  type II secretion system protein  35.87 
 
 
321 aa  115  6e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2640  type II secretion system protein  33.67 
 
 
316 aa  114  1.0000000000000001e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2762  type II secretion system protein  31.16 
 
 
333 aa  114  3e-24  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.58237 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2699  type II secretion system protein  31.07 
 
 
321 aa  114  3e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1832  type II secretion system protein  29.91 
 
 
316 aa  112  5e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0805  type II secretion system protein  34.48 
 
 
332 aa  112  8.000000000000001e-24  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3421  Type II secretion system F domain protein  33.7 
 
 
310 aa  110  2.0000000000000002e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.735611  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2487  type II secretion system protein  28.7 
 
 
306 aa  110  2.0000000000000002e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.744941  hitchhiker  0.000224716 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3965  type II secretion system protein  33.7 
 
 
320 aa  111  2.0000000000000002e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.264844 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2707  type II secretion system protein  29.1 
 
 
323 aa  109  5e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.608864  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2912  type II secretion system protein  34.24 
 
 
320 aa  109  6e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1205  type II secretion system protein  31.07 
 
 
535 aa  109  6e-23  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.499257  hitchhiker  0.000000000038758 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4395  type II secretion system protein  32.95 
 
 
317 aa  109  6e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.925008  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2484  type II secretion system protein  29.1 
 
 
323 aa  109  7.000000000000001e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2365  Flp pilus assembly protein TadB  29.22 
 
 
325 aa  107  2e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0315564  normal  0.0552567 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2824  type II secretion system protein  33.7 
 
 
320 aa  106  4e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1711  type II secretion system protein  30.2 
 
 
318 aa  106  5e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.806697  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0794  TadB protein  31.25 
 
 
322 aa  105  9e-22  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7219  type II secretion system protein  27.69 
 
 
287 aa  104  1e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.981655  normal  0.304711 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1054  type II secretion system protein  31.87 
 
 
320 aa  104  1e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3207  type II secretion system protein  31.32 
 
 
320 aa  103  2e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.19811 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5620  type II secretion system protein  27.31 
 
 
287 aa  103  3e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1125  type II secretion system protein  27.86 
 
 
322 aa  103  3e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0517135  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0881  type II secretion system protein  31.72 
 
 
296 aa  102  1e-20  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2350  type II secretion system protein  28.36 
 
 
322 aa  100  4e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.363474 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002650  flp pilus assembly protein TadB  30.49 
 
 
322 aa  99.8  5e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2570  type II secretion system protein  28.99 
 
 
314 aa  99  8e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0993  type II secretion system protein  32.02 
 
 
322 aa  98.2  1e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.146883  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2412  type II secretion system protein  26.64 
 
 
323 aa  96.7  4e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1523  type II secretion system protein  29.69 
 
 
328 aa  95.9  7e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0727  type II secretion system protein  25.83 
 
 
337 aa  95.1  1e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.352668  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0603  type II secretion system protein  25.28 
 
 
338 aa  95.1  1e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.512211  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1076  type II secretion system protein  27.6 
 
 
324 aa  94  2e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.195162  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1338  Flp pilus assembly protein TadB-like protein  25.3 
 
 
268 aa  94  3e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4001  type II secretion system protein  25.93 
 
 
337 aa  94  3e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1904  putative Flp pilus assembly protein TadB  28.02 
 
 
322 aa  93.2  5e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0239588  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0553  type II secretion system protein  28.02 
 
 
322 aa  93.2  5e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0301  type II secretion system protein  26.6 
 
 
322 aa  92  1e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.83716  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3794  type II secretion system protein  29.38 
 
 
327 aa  91.7  1e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.927579  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4156  type II secretion system protein  28.16 
 
 
323 aa  89.7  4e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.625918  normal  0.530435 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2020  type II secretion system protein  30.11 
 
 
325 aa  89.4  6e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.243296  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1126  type II secretion system protein  28.9 
 
 
310 aa  89.4  7e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0371029  normal  0.497639 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4865  type II secretion system protein  30.06 
 
 
324 aa  88.6  1e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4204  type II secretion system protein  26.74 
 
 
324 aa  87.4  2e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0804917  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0237  type II secretion system protein  26.14 
 
 
328 aa  85.9  7e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.383042  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0781  Type II secretion system F domain protein  32.65 
 
 
283 aa  85.5  0.000000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00253796  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1724  type II secretion system protein  28.83 
 
 
315 aa  85.5  0.000000000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5121  type II secretion system protein  25.77 
 
 
332 aa  84.3  0.000000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0725578 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>