More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_B2893 on replicon NC_007952
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009720  Xaut_1965  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  55.12 
 
 		 611 aa  644    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.181761 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1061  succinate dehydrogenase, flavoprotein subunit  78.38 
 
 		 592 aa  979    Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.760541  normal  0.0367901 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2332  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  92.22 
 
 		 591 aa  1147    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.790132  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0459  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  55.46 
 
 		 605 aa  650    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.414111  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0501  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  92.22 
 
 		 591 aa  1147    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.426579  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6854  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  98.31 
 
 		 591 aa  1210    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.232059 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4191  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  56.63 
 
 		 590 aa  640    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2704  succinate dehydrogenase, flavoprotein subunit  78.57 
 
 		 602 aa  972    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.017234 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1561  succinate dehydrogenase, flavoprotein subunit  54.61 
 
 		 587 aa  665    Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1994  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  85.64 
 
 		 592 aa  1038    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.398561  normal  0.821237 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2217  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  54.17 
 
 		 588 aa  635    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01353  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  54.68 
 
 		 588 aa  639    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3514  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  56.46 
 
 		 590 aa  640    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.22318  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1928  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  55.67 
 
 		 588 aa  637    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2197  succinate dehydrogenase, flavoprotein subunit  54.88 
 
 		 590 aa  654    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.223298  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1747  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  92.22 
 
 		 591 aa  1147    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0595  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  57.77 
 
 		 589 aa  704    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0576  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  57.77 
 
 		 589 aa  704    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1265  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  55.97 
 
 		 588 aa  642    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.648217  normal  0.132874 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2007  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  54.81 
 
 		 590 aa  652    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.82203  normal  0.426549 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0100  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  67.72 
 
 		 616 aa  859    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.576611  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2863  succinate dehydrogenase subunit A  66.1 
 
 		 594 aa  812    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2323  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  84.8 
 
 		 592 aa  1056    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0688  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  54.36 
 
 		 598 aa  640    Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1184  succinate dehydrogenase subunit A  61.58 
 
 		 584 aa  735    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2800  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  54.36 
 
 		 607 aa  635    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1881  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  56.92 
 
 		 603 aa  665    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0791  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  92.22 
 
 		 591 aa  1147    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.127831  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2471  succinate dehydrogenase or fumarate reductase, flavoprotein subunit  58.87 
 
 		 587 aa  705    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.926493  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1612  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  55.1 
 
 		 590 aa  644    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.244863 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2150  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  91.39 
 
 		 592 aa  1131    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4646  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  91.2 
 
 		 591 aa  1132    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.303055  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3592  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  91.37 
 
 		 591 aa  1134    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.322313  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1675  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  54.86 
 
 		 588 aa  640    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.506283  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2029  succinate dehydrogenase, flavoprotein subunit  56.54 
 
 		 596 aa  659    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.21  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1663  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  56.63 
 
 		 590 aa  640    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0861  succinate dehydrogenase, flavoprotein subunit  70.14 
 
 		 587 aa  828    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1204  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  59.04 
 
 		 594 aa  700    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.431605  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0662  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  92.39 
 
 		 591 aa  1150    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.536777  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2802  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  57.39 
 
 		 590 aa  656    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.35465  normal  0.79012 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2749  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  54.67 
 
 		 612 aa  638    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1746  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  57.19 
 
 		 604 aa  670    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.721199  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0380  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  59.09 
 
 		 596 aa  688    Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0315  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  55.2 
 
 		 598 aa  665    Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.62165  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3829  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  91.37 
 
 		 591 aa  1132    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.726427  normal  0.325233 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1799  succinate dehydrogenase, flavoprotein subunit  74.04 
 
 		 601 aa  932    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2108  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  57.07 
 
 		 590 aa  674    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.018563  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0344  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  58.92 
 
 		 596 aa  687    Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3602  succinate dehydrogenase subunit A  79.29 
 
 		 598 aa  978    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.229588 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2893  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  100 
 
 		 591 aa  1225    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00602  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  58.33 
 
 		 596 aa  691    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3602  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  56.31 
 
 		 605 aa  656    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.609874  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1215  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  54.98 
 
 		 590 aa  654    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4278  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  55.97 
 
 		 605 aa  655    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.954448 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0109  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  67.55 
 
 		 616 aa  857    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.461726  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2484  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  85.3 
 
 		 592 aa  1043    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.076646 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0263  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  68.33 
 
 		 616 aa  848    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1537  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  59.07 
 
 		 596 aa  690    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3032  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  57.84 
 
 		 604 aa  675    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4431  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  91.37 
 
 		 591 aa  1134    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5588  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  96.28 
 
 		 591 aa  1186    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1831  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  92.22 
 
 		 591 aa  1147    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.385612  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1797  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  56.2 
 
 		 589 aa  640    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000334447  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2630  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  56.01 
 
 		 588 aa  637    Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0015925  normal  0.0726397 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2865  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  55.69 
 
 		 600 aa  640    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4358  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  85.98 
 
 		 592 aa  1068    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1633  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  55.84 
 
 		 588 aa  639    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00339414  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1708  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  55.67 
 
 		 588 aa  637    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.563088  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1334  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  56.79 
 
 		 596 aa  646    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.356881  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2168  succinate dehydrogenase subunit A  80.03 
 
 		 596 aa  992    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.274751 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2149  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  85.98 
 
 		 592 aa  1068    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.44337  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5838  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  91.2 
 
 		 591 aa  1132    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2846  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  55.85 
 
 		 595 aa  647    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3313  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  91.37 
 
 		 591 aa  1132    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.775913 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44030  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  55.27 
 
 		 590 aa  663    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0592  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  54.61 
 
 		 587 aa  664    Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3936  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  91.37 
 
 		 591 aa  1134    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.373287  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1653  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  55.54 
 
 		 588 aa  640    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00109405  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2517  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  56.01 
 
 		 588 aa  637    Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000102318  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1310  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  56.41 
 
 		 595 aa  657    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.194206  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0230  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  54.8 
 
 		 611 aa  637    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.153031  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2425  succinate dehydrogenase, flavoprotein subunit  74.21 
 
 		 601 aa  936    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1708  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  55.84 
 
 		 588 aa  639    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0194037  normal  0.398143 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2271  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  55.84 
 
 		 588 aa  639    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0457279  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6040  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  56.31 
 
 		 608 aa  638    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.187811 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1425  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  55.71 
 
 		 588 aa  643    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00837732  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3691  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  55.27 
 
 		 590 aa  663    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4363  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  96.28 
 
 		 591 aa  1186    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2254  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  53.49 
 
 		 588 aa  646    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.453422  normal  0.274072 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0760  succinate dehydrogenase, flavoprotein subunit  78.04 
 
 		 592 aa  976    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2510  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  56.01 
 
 		 588 aa  639    Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000247676  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1152  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  56.4 
 
 		 590 aa  642    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2202  succinate dehydrogenase subunit A  76.74 
 
 		 602 aa  956    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.443729  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3034  succinate dehydrogenase, flavoprotein subunit  78.52 
 
 		 597 aa  965    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2795  succinate dehydrogenase subunit A  74.71 
 
 		 601 aa  939    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0609564 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3762  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  56.8 
 
 		 590 aa  641    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1623  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  92.22 
 
 		 591 aa  1147    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.829702  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4352  succinate dehydrogenase, flavoprotein subunit  74.71 
 
 		 601 aa  947    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.602613  normal  0.276031 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2470  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  92.22 
 
 		 591 aa  1147    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.328563  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0044  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  56.27 
 
 		 596 aa  641    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>