More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_B2816 on replicon NC_007952
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007952  Bxe_B2816  major facilitator superfamily aromatic acid/H(+) symporter  100 
 
 		 422 aa  815    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0452  major facilitator transporter  37.5 
 
 		 467 aa  265  1e-69  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1447  major facilitator superfamily MFS_1  38.16 
 
 		 445 aa  241  2e-62  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.110143  normal  0.563871 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1383  major facilitator superfamily MFS_1  38.16 
 
 		 445 aa  240  2.9999999999999997e-62  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.277441  normal  0.495047 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1611  major facilitator transporter  36.38 
 
 		 449 aa  229  9e-59  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000248187 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5703  major facilitator transporter  36.2 
 
 		 451 aa  228  1e-58  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0181429  decreased coverage  0.00162775 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1921  major facilitator transporter  36.2 
 
 		 451 aa  228  2e-58  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2777  major facilitator superfamily MFS_1  33.47 
 
 		 451 aa  202  9.999999999999999e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.976479  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1460  major facilitator superfamily MFS_1  30.87 
 
 		 406 aa  181  2.9999999999999997e-44  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1684  major facilitator transporter  33.33 
 
 		 434 aa  180  4.999999999999999e-44  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.266569  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4898  major facilitator superfamily MFS_1  31.14 
 
 		 468 aa  174  3.9999999999999995e-42  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.724169  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0319  major facilitator superfamily MFS_1  30.48 
 
 		 474 aa  169  6e-41  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.230741  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5089  major facilitator transporter  33.17 
 
 		 435 aa  164  3e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.177988  normal  0.026694 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2998  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  34.02 
 
 		 442 aa  162  1e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.793355  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4100  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  32.84 
 
 		 427 aa  160  5e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.41549  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4038  major facilitator transporter  31.53 
 
 		 440 aa  159  8e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1842  major facilitator superfamily transporter metabolite/H(+) symporter  32.27 
 
 		 432 aa  159  1e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.144231 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4823  major facilitator superfamily MFS_1  32.02 
 
 		 432 aa  158  2e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00322501  normal  0.0186272 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0898  major facilitator transporter  31.53 
 
 		 440 aa  157  2e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.885104  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0457  major facilitator transporter  31.72 
 
 		 440 aa  157  3e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0936  major facilitator transporter  31.72 
 
 		 440 aa  157  3e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2632  major facilitator transporter  31.77 
 
 		 402 aa  157  5.0000000000000005e-37  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.127081  normal  0.954997 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6215  major facilitator superfamily MFS_1  32.59 
 
 		 427 aa  155  1e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0265  major facilitator superfamily permease  30.45 
 
 		 418 aa  150  4e-35  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0214342  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5124  major facilitator transporter  31.15 
 
 		 432 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0473861 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7578  major facilitator transporter  30.71 
 
 		 415 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1418  major facilitator transporter  30.77 
 
 		 406 aa  140  3e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.471824  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3551  major facilitator transporter  29.86 
 
 		 432 aa  139  8.999999999999999e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.629931  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1458  major facilitator transporter  30.26 
 
 		 406 aa  139  1e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.34861  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2575  major facilitator transporter  29.59 
 
 		 432 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.491999 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3968  major facilitator transporter  29.59 
 
 		 432 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0624321 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0282  major facilitator transporter  30.55 
 
 		 410 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00202623 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1512  major facilitator transporter  29.67 
 
 		 406 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00075206 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1056  major facilitator transporter  29.67 
 
 		 406 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1536  major facilitator transporter  29.67 
 
 		 406 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3460  major facilitator transporter  29.73 
 
 		 434 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.42938  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6043  major facilitator transporter  30.09 
 
 		 415 aa  135  1.9999999999999998e-30  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.100748 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2363  major facilitator transporter  29.7 
 
 		 435 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5283  major facilitator transporter  29.73 
 
 		 434 aa  134  3e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0529847  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1718  major facilitator transporter  30 
 
 		 406 aa  134  3.9999999999999996e-30  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.658229  hitchhiker  0.000872615 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2870  major facilitator transporter  30.26 
 
 		 410 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000255107 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7074  major facilitator transporter  32.35 
 
 		 436 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.884668 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4676  major facilitator transporter  28.87 
 
 		 420 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.573448  normal  0.215223 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1882  major facilitator superfamily MFS_1  30.68 
 
 		 439 aa  132  2.0000000000000002e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0481298  normal  0.608146 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37250  major facilitator transporter  30.96 
 
 		 423 aa  132  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1553  major facilitator superfamily MFS_1  30.68 
 
 		 439 aa  132  2.0000000000000002e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.161151  normal  0.262246 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5624  major facilitator family transporter  29.32 
 
 		 433 aa  130  4.0000000000000003e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1281  major facilitator superfamily MFS_1  32.08 
 
 		 436 aa  130  5.0000000000000004e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.901209  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3675  major facilitator superfamily MFS_1  30.79 
 
 		 410 aa  130  5.0000000000000004e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0256962  hitchhiker  0.000000000790745 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3197  MFS family transporter  30.41 
 
 		 423 aa  130  6e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5236  major facilitator transporter  29.5 
 
 		 433 aa  129  7.000000000000001e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2152  major facilitator transporter  29.3 
 
 		 409 aa  129  7.000000000000001e-29  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.291  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2122  major facilitator transporter  29.3 
 
 		 409 aa  129  7.000000000000001e-29  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.113023 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3774  major facilitator transporter  30.75 
 
 		 428 aa  129  9.000000000000001e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.108427 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1524  major facilitator transporter  27.68 
 
 		 491 aa  129  1.0000000000000001e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.400505  normal  0.0396773 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11931  sialic acid transport integral membrane protein nanT  29.89 
 
 		 422 aa  129  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5297  major facilitator family transporter  29.5 
 
 		 432 aa  129  1.0000000000000001e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5139  major facilitator transporter  29.5 
 
 		 432 aa  129  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3013  major facilitator transporter  31.55 
 
 		 408 aa  129  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0393248 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5693  major facilitator family transporter  29.5 
 
 		 433 aa  129  1.0000000000000001e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5124  major facilitator transporter  29.5 
 
 		 432 aa  128  2.0000000000000002e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5576  major facilitator family transporter  29.5 
 
 		 432 aa  127  3e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2527  major facilitator family transporter  28.35 
 
 		 408 aa  127  3e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.039546  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1072  major facilitator transporter  31.02 
 
 		 434 aa  127  3e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5538  major facilitator family transporter  29.24 
 
 		 433 aa  127  4.0000000000000003e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3351  major facilitator transporter  29.32 
 
 		 423 aa  127  5e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.233758  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3960  major facilitator transporter  29.24 
 
 		 425 aa  127  5e-28  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1274  major facilitator family transporter  28.21 
 
 		 406 aa  126  6e-28  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0116564  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5568  transporter, MFS superfamily  28.98 
 
 		 432 aa  126  7e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3514  major facilitator superfamily transporter  30.19 
 
 		 429 aa  126  7e-28  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.522107  normal  0.962202 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1761  major facilitator superfamily transporter sialate:H(+) symporter  28.21 
 
 		 408 aa  126  8.000000000000001e-28  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.160668  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1959  major facilitator family transporter  28.21 
 
 		 408 aa  126  8.000000000000001e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00107928  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1806  major facilitator superfamily transporter sialate:H(+) symporter  28.21 
 
 		 408 aa  126  8.000000000000001e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0134  major facilitator superfamily transporter sialate:H(+) symporter  28.21 
 
 		 408 aa  126  8.000000000000001e-28  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.792019  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1785  major facilitator superfamily transporter sialate:H(+) symporter  28.61 
 
 		 408 aa  126  8.000000000000001e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.669865  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1032  major facilitator superfamily transporter sialate:H(+) symporter  28.21 
 
 		 408 aa  126  8.000000000000001e-28  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.113868  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1404  general substrate transporter  30.03 
 
 		 428 aa  124  2e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1030  major facilitator transporter  31.3 
 
 		 437 aa  125  2e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0545376  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3798  major facilitator transporter  29.19 
 
 		 412 aa  125  2e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000146089 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5519  major facilitator transporter  28.32 
 
 		 425 aa  124  3e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.524338  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2559  major facilitator transporter  30.45 
 
 		 407 aa  124  3e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5752  major facilitator transporter  28.57 
 
 		 425 aa  124  3e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.968797 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5742  major facilitator transporter  31.33 
 
 		 415 aa  124  4e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6106  major facilitator transporter  31.33 
 
 		 415 aa  124  4e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4099  major facilitator transporter  29.67 
 
 		 428 aa  123  7e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.594069  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4743  major facilitator transporter  28.61 
 
 		 411 aa  123  8e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.524316  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1311  major facilitator transporter  29.67 
 
 		 428 aa  122  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00188583  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4578  major facilitator family transporter  29.67 
 
 		 428 aa  122  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1504  major facilitator transporter  26.72 
 
 		 428 aa  122  9.999999999999999e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.0043837  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01910  transport transmembrane protein  29.37 
 
 		 418 aa  121  1.9999999999999998e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0394187 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6588  major facilitator transporter  31.57 
 
 		 415 aa  122  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0439245 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04141  predicted transporter  23.55 
 
 		 405 aa  120  3e-26  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3722  General substrate transporter  23.55 
 
 		 405 aa  120  3e-26  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4700  major facilitator transporter  26.4 
 
 		 426 aa  120  3e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.164238  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04104  hypothetical protein  23.55 
 
 		 405 aa  120  3e-26  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3878  major facilitator transporter  29 
 
 		 428 aa  120  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.957409 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2448  major facilitator transporter  28.42 
 
 		 429 aa  120  4.9999999999999996e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6033  major facilitator transporter  27.67 
 
 		 426 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0486241  normal  0.0413157 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1962  major facilitator transporter  31.32 
 
 		 427 aa  118  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0235717  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0386  major facilitator transporter  30.87 
 
 		 420 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>