More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_B2729 on replicon NC_007952
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007952  Bxe_B2729  electron transfer flavoprotein subunit alpha  100 
 
 
314 aa  619  1e-176  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1297  electron transfer flavoprotein alpha-subunit  76.87 
 
 
309 aa  455  1e-127  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0755964 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3142  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  74.03 
 
 
313 aa  451  1e-125  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.372397  normal  0.0252106 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2391  electron transfer flavoprotein alpha subunit  74.27 
 
 
310 aa  442  1e-123  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.41107  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1403  electron transfer flavoprotein alpha subunit  74.92 
 
 
310 aa  438  1e-122  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2809  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  74.03 
 
 
310 aa  437  1e-121  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.22973  normal  0.220187 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4692  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  72.31 
 
 
310 aa  431  1e-120  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.412407  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2298  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  74.03 
 
 
310 aa  429  1e-119  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2927  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  71.75 
 
 
311 aa  427  1e-119  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3569  putative electron transfer flavoprotein, alpha subunit  73.38 
 
 
311 aa  429  1e-119  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2539  electron transfer flavoprotein alpha subunit  72.73 
 
 
308 aa  428  1e-119  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000608168 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0930  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  71.75 
 
 
311 aa  427  1e-119  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2554  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  71.75 
 
 
311 aa  427  1e-119  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1654  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  71.75 
 
 
311 aa  427  1e-119  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2976  electron transfer flavoprotein alpha-subunit  71.75 
 
 
311 aa  427  1e-119  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2132  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  73.29 
 
 
310 aa  429  1e-119  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0421992 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0410  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  71.75 
 
 
311 aa  427  1e-119  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3373  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  73.62 
 
 
310 aa  430  1e-119  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.252862  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1224  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  74.27 
 
 
310 aa  429  1e-119  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.168923  normal  0.242812 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0219  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  71.75 
 
 
311 aa  427  1e-119  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2866  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  71.43 
 
 
311 aa  426  1e-118  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.786227  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4189  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  70.68 
 
 
310 aa  424  1e-118  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000806502 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3730  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  74.01 
 
 
310 aa  424  1e-118  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0763  electron transfer flavoprotein alpha subunit  70.45 
 
 
311 aa  422  1e-117  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1063  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  70.45 
 
 
311 aa  422  1e-117  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.760076  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1195  electron transfer flavoprotein alpha subunit  72.73 
 
 
308 aa  422  1e-117  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0939  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  70.78 
 
 
311 aa  422  1e-117  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1022  electron transfer flavoprotein alpha subunit  70.78 
 
 
311 aa  424  1e-117  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3599  electron transfer flavoprotein alpha subunit  72.96 
 
 
308 aa  423  1e-117  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.460785 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0584  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  70.45 
 
 
311 aa  422  1e-117  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.292903  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2169  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  74.27 
 
 
310 aa  421  1e-117  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0328573  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3011  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  73.68 
 
 
310 aa  422  1e-117  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2984  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  70.72 
 
 
311 aa  420  1e-116  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0824213  decreased coverage  0.00070323 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1958  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  71.99 
 
 
310 aa  419  1e-116  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.76693  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4165  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  71.99 
 
 
310 aa  419  1e-116  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4176  electron transfer flavoprotein alpha and beta-subunits  70.82 
 
 
311 aa  418  1e-116  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0387842  normal  0.412867 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7299  electron transfer flavoprotein subunit alpha/beta  70.19 
 
 
314 aa  419  1e-116  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0555297  normal  0.847795 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0999  electron transfer flavoprotein subunit alpha  70.74 
 
 
315 aa  421  1e-116  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0943  electron transfer flavoprotein alpha subunit  70.45 
 
 
311 aa  419  1e-116  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.94647  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2241  electron transfer flavoprotein alpha subunit  70.78 
 
 
311 aa  421  1e-116  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2640  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  74.76 
 
 
310 aa  410  1e-113  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.89185  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4306  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  75.33 
 
 
310 aa  409  1e-113  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2092  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  74.76 
 
 
315 aa  410  1e-113  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.518456 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0858  electron transfer flavoprotein alpha subunit  68.83 
 
 
309 aa  410  1e-113  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0251  electron transfer flavoprotein, alpha subunit, EtfA  66.56 
 
 
327 aa  399  1e-110  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1466  electron transfer flavoprotein subunit alpha/beta  69.06 
 
 
314 aa  392  1e-108  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.180547  normal  0.50057 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0738  electron transfer flavoprotein, subunit alpha  71.34 
 
 
311 aa  390  1e-107  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0170682  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3525  electron transfer flavoprotein alpha subunit  66.78 
 
 
309 aa  388  1e-107  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5518  electron transfer flavoprotein subunit alpha  70.68 
 
 
310 aa  387  1e-106  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0513  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  68.73 
 
 
311 aa  386  1e-106  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16420  Electron transfer flavoprotein, alpha subunit  65.91 
 
 
309 aa  385  1e-106  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0845524  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4201  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  66.78 
 
 
309 aa  387  1e-106  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1652  electron transfer flavoprotein, alpha subunit-like protein  66.78 
 
 
309 aa  387  1e-106  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3773  electron transfer flavoprotein alpha subunit  65.79 
 
 
309 aa  382  1e-105  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0924  electron transfer flavoprotein subunit alpha  72.96 
 
 
311 aa  382  1e-105  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.443588  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0865  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  71.99 
 
 
311 aa  383  1e-105  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0314177  normal  0.611517 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0655  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  62.54 
 
 
309 aa  378  1e-104  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.304729  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0794  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  71.99 
 
 
311 aa  378  1e-104  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.180812  normal  0.516944 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1289  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  68.4 
 
 
311 aa  380  1e-104  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.398679  normal  0.0814706 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3562  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  64.94 
 
 
309 aa  375  1e-103  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.17521  normal  0.383199 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4916  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  64.94 
 
 
309 aa  375  1e-103  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2210  electron transfer flavoprotein alpha-subunit  65.26 
 
 
309 aa  374  1e-103  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2549  electron transfer flavoprotein beta-subunit:electron transfer flavoprotein, alpha subunit  71.34 
 
 
311 aa  377  1e-103  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4828  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  64.94 
 
 
309 aa  377  1e-103  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.142803  normal  0.92553 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5231  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  62.21 
 
 
314 aa  374  1e-102  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0165926  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0615  electron transfer flavoprotein, alpha subunit-like protein  61.04 
 
 
310 aa  372  1e-102  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0862731  normal  0.336717 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7803  electron transfer flavoprotein alpha subunit  63.52 
 
 
309 aa  369  1e-101  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1577  electron transfer flavoprotein alpha subunit  61.84 
 
 
309 aa  370  1e-101  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00519055 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2186  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  65.79 
 
 
309 aa  367  1e-100  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9248  electron transfer flavoprotein alpha subunit  63.31 
 
 
319 aa  365  1e-100  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0619808  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3078  electron transfer flavoprotein  63.96 
 
 
311 aa  365  1e-100  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25880  electron transfer flavoprotein alpha-subunit  65.58 
 
 
309 aa  364  1e-99  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.272339  normal  0.0503737 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3855  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  63.46 
 
 
313 aa  364  1e-99  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.350999 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0533  electron transportr flavoprotein, alpha subunit  62.01 
 
 
310 aa  363  2e-99  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4828  electron transfer flavoprotein alpha subunit  68.51 
 
 
312 aa  363  2e-99  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0422  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  67.1 
 
 
310 aa  363  2e-99  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1997  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  64.05 
 
 
312 aa  363  2e-99  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.11647  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0754  electron transfer flavoprotein alpha and beta-subunits  60.59 
 
 
314 aa  363  2e-99  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2533  electron transfer flavoprotein alpha subunit  61.69 
 
 
309 aa  362  5e-99  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1212  electron transfer flavoprotein beta-subunit:electron transfer flavoprotein, alpha subunit  66.88 
 
 
310 aa  362  6e-99  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0528  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  62.01 
 
 
310 aa  362  6e-99  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  decreased coverage  0.000381048  hitchhiker  0.00976807 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4012  electron transfer flavoprotein alpha subunit  64.61 
 
 
309 aa  360  1e-98  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1446  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  61.36 
 
 
307 aa  360  2e-98  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0198023  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1996  electron transfer flavoprotein subunit alpha  65.79 
 
 
309 aa  359  3e-98  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.569896  normal  0.163293 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2267  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  65.58 
 
 
310 aa  358  5e-98  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0336576  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6308  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  60.98 
 
 
310 aa  358  9e-98  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3688  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  59.87 
 
 
308 aa  357  2e-97  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2538  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  61.11 
 
 
307 aa  356  3e-97  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  4.12152e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2747  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  61.09 
 
 
307 aa  355  6e-97  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  4.76091e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2865  electron transfer flavoprotein alpha subunit  61.36 
 
 
308 aa  353  1e-96  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  1.68731e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3034  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  61.04 
 
 
309 aa  353  2e-96  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2158  electron transfer flavoprotein alpha subunit  63.37 
 
 
314 aa  353  2e-96  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.149461  normal  0.199933 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4879  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  62.78 
 
 
317 aa  353  2e-96  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14290  Electron transfer flavoprotein, alpha subunit  64.36 
 
 
310 aa  353  3e-96  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2846  electron transfer flavoprotein alpha subunit  61.36 
 
 
308 aa  353  3e-96  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  9.85781e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4116  electron transfer flavoprotein alpha and beta-subunits  65.46 
 
 
309 aa  352  4e-96  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.146576 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1512  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  61.36 
 
 
308 aa  352  4e-96  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000305192  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2854  electron transfer flavoprotein alpha subunit  60 
 
 
307 aa  352  6e-96  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3195  electron transfer flavoprotein, alpha subunit-like protein  59.55 
 
 
309 aa  352  6e-96  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.234178  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1170  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  64.38 
 
 
307 aa  352  6e-96  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000857296  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>