More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_B2720 on replicon NC_007952
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007952  Bxe_B2720  OmpC family outer membrane porin  100 
 
 		 387 aa  792    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5110  porin Gram-negative type  61.5 
 
 		 371 aa  462  1e-129  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1963  porin  52.84 
 
 		 372 aa  373  1e-102  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.513284 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0148  outer membrane protein (porin)  35.96 
 
 		 350 aa  186  6e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.268856 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5351  porin  35.7 
 
 		 350 aa  183  4.0000000000000006e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5510  porin  35.7 
 
 		 350 aa  183  4.0000000000000006e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4762  porin  35.43 
 
 		 350 aa  183  5.0000000000000004e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.821427  normal  0.658294 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4328  porin  32.29 
 
 		 391 aa  139  1e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.428613  normal  0.0399975 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1592  outer membrane porin OpcP  31.98 
 
 		 379 aa  138  1e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000753079  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3043  outer membrane protein  31.98 
 
 		 379 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000337977  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2395  porin  31.13 
 
 		 379 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2089  outer membrane porin, putative  31.98 
 
 		 379 aa  134  3e-30  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3009  outer membrane porin  31.98 
 
 		 379 aa  134  3e-30  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.205234  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2943  outer membrane porin  31.98 
 
 		 379 aa  134  3e-30  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.0000414234  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1957  putative outer membrane porin  31.98 
 
 		 379 aa  134  3e-30  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0172  OmpC family outer membrane porin  33.17 
 
 		 357 aa  130  6e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7056  porin Gram-negative type  32.41 
 
 		 357 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.236319  normal  0.38539 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0524  porin  31.85 
 
 		 374 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000201406  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1003  porin  31.85 
 
 		 383 aa  127  3e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000241018  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0963  porin  32.02 
 
 		 383 aa  125  2e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000213989  normal  0.474423 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4385  porin  32.91 
 
 		 385 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.375427  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4111  outer membrane protein, (porin)  30.69 
 
 		 381 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0000000510275  normal  0.307303 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2739  OmpC family outer membrane porin  33.43 
 
 		 364 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0788528 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6031  porin  31.45 
 
 		 383 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.00960697  normal  0.0888656 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3981  porin  32.91 
 
 		 385 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.886193  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3547  porin  32.91 
 
 		 385 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.251126  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0875  outer membrane insertion C-terminal signal  29.41 
 
 		 380 aa  120  3e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.223148  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2846  outer membrane protein (porin)  30.63 
 
 		 383 aa  120  3.9999999999999996e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.42536 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0745  outer membrane porin  30.75 
 
 		 430 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.812329  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2416  outer membrane porin  30.75 
 
 		 430 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.163493  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3712  porin  30.93 
 
 		 350 aa  118  1.9999999999999998e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0718332  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3855  porin  29.77 
 
 		 388 aa  118  1.9999999999999998e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2277  outer membrane porin  30.75 
 
 		 384 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0620  OmpC family outer membrane porin  30.12 
 
 		 383 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0145861 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1157  porin  29.61 
 
 		 379 aa  117  3e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6482  porin  30.03 
 
 		 382 aa  116  6.9999999999999995e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0226396  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4702  porin  29.21 
 
 		 383 aa  116  6.9999999999999995e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.218408  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6717  porin  30.03 
 
 		 382 aa  116  6.9999999999999995e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.653963  normal  0.435902 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0863  porin  29.03 
 
 		 380 aa  116  7.999999999999999e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00000949722  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1674  putative outer membrane porin  30.49 
 
 		 411 aa  116  8.999999999999998e-25  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.264148  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1698  putative outer membrane porin  30.49 
 
 		 384 aa  115  8.999999999999998e-25  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5394  porin  30.47 
 
 		 383 aa  115  8.999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00342687 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5468  porin  30.47 
 
 		 383 aa  115  8.999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.00161783  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4594  porin  43.27 
 
 		 376 aa  115  8.999999999999998e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.561867 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1882  putative outer membrane porin  30.49 
 
 		 384 aa  115  8.999999999999998e-25  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.400971  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0554  putative outer membrane porin  30.49 
 
 		 384 aa  115  8.999999999999998e-25  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.830781  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4876  porin  30.47 
 
 		 383 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6299  porin Gram-negative type  31.25 
 
 		 369 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2385  outer membrane protein (porin)  29.98 
 
 		 375 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0702  outer membrane porin OpcP  30.18 
 
 		 523 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.259508  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0935  OmpC family outer membrane porin  28.2 
 
 		 372 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.000000655737  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2206  outer membrane porin  32.03 
 
 		 387 aa  114  3e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0690503  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3241  porin  29.54 
 
 		 390 aa  114  3e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.535768 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4922  porin  29.54 
 
 		 390 aa  114  3e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1041  OmpC family outer membrane porin  28.75 
 
 		 358 aa  114  4.0000000000000004e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.000439487  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1231  OmpC family outer membrane porin  30.09 
 
 		 396 aa  114  4.0000000000000004e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00623674  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0061  OmpC family outer membrane porin  30.89 
 
 		 379 aa  113  5e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7493  porin  30.32 
 
 		 383 aa  113  5e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0254041  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6498  porin  29.3 
 
 		 390 aa  113  6e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0845493  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0322  putative outer membrane porin  30.75 
 
 		 383 aa  113  6e-24  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.12048  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1231  outer membrane porin  30.75 
 
 		 432 aa  113  6e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0598  putative outer membrane porin  30.75 
 
 		 383 aa  113  6e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00212421  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1339  putative outer membrane porin OpcP  30.75 
 
 		 362 aa  113  7.000000000000001e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.542311  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2491  outer membrane porin protein  30.75 
 
 		 362 aa  113  7.000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3709  porin Gram-negative type  29.29 
 
 		 383 aa  113  7.000000000000001e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0741295  hitchhiker  0.00542912 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1873  outer membrane protein (porin)  44.69 
 
 		 395 aa  112  8.000000000000001e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.000645139  normal  0.212155 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4766  porin  30.59 
 
 		 390 aa  112  9e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.38639  normal  0.209657 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3601  porin  30.59 
 
 		 390 aa  112  9e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4230  porin  28.64 
 
 		 357 aa  112  9e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3740  porin  29.52 
 
 		 389 aa  112  9e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0969  putative outer membrane porin  30.75 
 
 		 397 aa  112  9e-24  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4628  porin  29.52 
 
 		 389 aa  112  9e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5517  porin  30.59 
 
 		 390 aa  112  9e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5801  porin Gram-negative type  42.39 
 
 		 411 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00555584  normal  0.58755 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5676  porin  29.52 
 
 		 389 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.919602 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6666  outer membrane protein (porin)  32.81 
 
 		 373 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.16051  normal  0.0897495 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6063  porin  32.35 
 
 		 390 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4740  porin Gram-negative type  29.63 
 
 		 390 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.146924  normal  0.780423 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0155  porin  29.22 
 
 		 370 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1733  porin  29.91 
 
 		 398 aa  111  2.0000000000000002e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0848216  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3359  porin  45.51 
 
 		 394 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.00120299  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4515  porin  30.17 
 
 		 404 aa  110  3e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.808645  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2847  porin  29.23 
 
 		 389 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4209  porin  44.69 
 
 		 395 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0172598  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6734  outer membrane protein (porin)  30.1 
 
 		 394 aa  110  5e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0780973  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1454  outer membrane porin OpcP  29.67 
 
 		 414 aa  110  5e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.176502  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4157  porin  44.69 
 
 		 395 aa  110  5e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.142098  decreased coverage  0.00226863 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6078  porin  31.42 
 
 		 390 aa  110  5e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2933  putative porin signal peptide protein  30.42 
 
 		 379 aa  110  6e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5786  porin  29.09 
 
 		 358 aa  109  6e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.10486  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2273  outer membrane porin protein  29.44 
 
 		 449 aa  109  6e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1131  porin  29.18 
 
 		 363 aa  109  7.000000000000001e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6406  porin Gram-negative type  29.57 
 
 		 381 aa  109  7.000000000000001e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1505  putative outer membrane porin  29.18 
 
 		 363 aa  109  7.000000000000001e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0794813  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0109  putative outer membrane porin  29.18 
 
 		 363 aa  109  7.000000000000001e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1699  OmpC family outer membrane porin  28.21 
 
 		 386 aa  109  8.000000000000001e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0712335  normal  0.645361 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6321  porin  30.17 
 
 		 394 aa  109  9.000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00119227  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1303  outer membrane porin  30.27 
 
 		 362 aa  109  9.000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5897  outer membrane protein (porin)-like protein  31.09 
 
 		 390 aa  109  9.000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0466663 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0263  putative outer membrane porin  28.72 
 
 		 384 aa  109  9.000000000000001e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>