More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_B2695 on replicon NC_007952
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007952  Bxe_B2695  LysR family transcriptional regulator  100 
 
 
313 aa  638  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1390  LysR family transcriptional regulator  91.03 
 
 
322 aa  577  1e-164  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1228  transcriptional regulator, LysR family  87.5 
 
 
305 aa  521  1e-147  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1083  transcriptional regulator, LysR family  88.08 
 
 
305 aa  515  1e-145  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0287  Carbonate dehydratase  46.69 
 
 
305 aa  268  1e-70  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1886  transcriptional regulator, LysR family  45 
 
 
299 aa  247  2e-64  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1041  LysR family transcriptional regulator  44.77 
 
 
306 aa  247  2e-64  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2951  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  40.86 
 
 
299 aa  243  3e-63  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.67844  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1123  LysR family transcriptional regulator  39.93 
 
 
303 aa  241  9e-63  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1132  LysR family transcriptional regulator  39.53 
 
 
303 aa  241  1e-62  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.0177356 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4204  LysR family transcriptional regulator  42.77 
 
 
322 aa  239  3e-62  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1272  LysR family transcriptional regulator  38.87 
 
 
303 aa  239  4e-62  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.066444  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2132  transcriptional regulator, LysR family  45.45 
 
 
298 aa  238  8e-62  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5143  transcriptional regulator, LysR family  46.18 
 
 
305 aa  238  9e-62  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0137  LysR family transcriptional regulator  42.48 
 
 
302 aa  238  1e-61  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2533  LysR family transcriptional regulator  44.03 
 
 
299 aa  236  3e-61  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2278  LysR family transcriptional regulator  40 
 
 
304 aa  236  3e-61  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.255279  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2671  LysR family transcriptional regulator  44.59 
 
 
295 aa  236  4e-61  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6129  LysR family transcriptional regulator  44.22 
 
 
305 aa  235  6e-61  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.111933 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1859  LysR family transcriptional regulator  42.38 
 
 
300 aa  234  1e-60  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.348315  normal  0.130903 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7201  transcriptional regulator  41.22 
 
 
297 aa  233  4e-60  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0783  LysR, substrate-binding  39.34 
 
 
303 aa  232  5e-60  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2085  transcriptional regulator, LysR family  43.88 
 
 
301 aa  230  2e-59  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.722074  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2133  transcriptional regulator, LysR family  39.41 
 
 
335 aa  231  2e-59  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.212126  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000784  transcriptional regulator  37.01 
 
 
307 aa  230  2e-59  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.340828  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3613  LysR family transcriptional regulator  40.88 
 
 
297 aa  228  1e-58  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.000514722  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02101  probable transcriptional regulator, LysR family protein  37.54 
 
 
301 aa  228  1e-58  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0550958  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4511  LysR family transcriptional regulator  44.19 
 
 
304 aa  227  2e-58  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1296  LysR family transcriptional regulator  34.88 
 
 
301 aa  226  3e-58  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06683  transcriptional regulator  37.09 
 
 
302 aa  225  9e-58  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1543  LysR family transcriptional regulator  41.67 
 
 
299 aa  224  1e-57  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31030  Transcriptional regulator, LysR family  43.29 
 
 
297 aa  225  1e-57  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2452  LysR family transcriptional regulator  35.22 
 
 
300 aa  224  2e-57  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1199  HTH-type transcriptional regulator, LysR-family  36.88 
 
 
300 aa  224  2e-57  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01682  transcription regulator protein  40.58 
 
 
309 aa  224  2e-57  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0393  LysR family transcriptional regulator  39.6 
 
 
298 aa  223  3e-57  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  decreased coverage  0.00156411  normal  0.514567 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2979  transcriptional regulator, LysR family  43.05 
 
 
306 aa  223  3e-57  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.438714  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2327  transcription regulator protein  39.86 
 
 
299 aa  222  6e-57  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.170216 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0833  transcriptional regulator, LysR family  40.73 
 
 
300 aa  222  7e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47830  transcription regulator pirR  40.48 
 
 
293 aa  222  8e-57  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.850432  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0388  LysR family transcriptional regulator  41.08 
 
 
304 aa  222  8e-57  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2456  LysR family transcriptional regulator  40.06 
 
 
313 aa  221  1e-56  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.161377  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0904  LysR family transcriptional regulator  36.96 
 
 
302 aa  221  1e-56  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0458  transcriptional regulator, LysR family  41.69 
 
 
309 aa  221  1e-56  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.512377  normal  0.930115 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3497  LysR family transcriptional regulator  35.23 
 
 
309 aa  221  1e-56  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0350832  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2297  LysR family transcriptional regulator  35.22 
 
 
304 aa  221  2e-56  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  2.12474e-05  hitchhiker  0.000857441 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1403  LysR family transcriptional regulator  42.3 
 
 
305 aa  221  2e-56  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.34329 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4540  transcriptional regulator, LysR family  43.19 
 
 
303 aa  220  3e-56  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.438902  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2989  LysR family transcriptional regulator  38.85 
 
 
301 aa  220  3e-56  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.061408 
 
 
-
 
NC_003296  RS05458  transcription regulator protein  40.88 
 
 
298 aa  219  5e-56  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.106527 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2002  LysR family transcriptional regulator  36.21 
 
 
301 aa  219  5e-56  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00230596  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1266  LysR family transcriptional regulator  40.33 
 
 
299 aa  219  6e-56  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.50212  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1192  LysR family transcriptional regulator  40.33 
 
 
299 aa  218  8e-56  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2458  LysR family transcriptional regulator  40.33 
 
 
299 aa  218  8e-56  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.115527  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0359  LysR family transcriptional regulator  40 
 
 
299 aa  218  1e-55  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.475438  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0934  LysR family transcriptional regulator  40 
 
 
299 aa  218  1e-55  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0637  LysR family transcriptional regulator  40 
 
 
299 aa  218  1e-55  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0953  transcriptional regulator, LysR family  39.07 
 
 
300 aa  218  1e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.255638  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1373  LysR family transcriptional regulator  40 
 
 
299 aa  218  1e-55  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.260945  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0123  transcriptional regulator  39.19 
 
 
302 aa  217  2e-55  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0280  LysR family transcriptional regulator  37.5 
 
 
301 aa  217  2e-55  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.174455 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2875  transcriptional regulator, LysR family  34.65 
 
 
307 aa  216  3e-55  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.442056  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1434  LysR family transcriptional regulator  39.4 
 
 
301 aa  217  3e-55  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.325668  normal  0.787301 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2494  transcriptional regulator, LysR family  34.65 
 
 
307 aa  216  3e-55  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2460  LysR family transcriptional regulator  37.84 
 
 
301 aa  216  4e-55  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.367716 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0493  transcriptional regulator, LysR family  39.07 
 
 
298 aa  216  5e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.145809 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1959  LysR family transcriptional regulator  39.79 
 
 
313 aa  216  5e-55  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.070179  normal  0.335843 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2698  LysR family transcriptional regulator  37.87 
 
 
303 aa  216  5e-55  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3811  LysR family transcriptional regulator  39.79 
 
 
294 aa  216  6e-55  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.349623  normal  0.409757 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2545  LysR family transcriptional regulator  37.67 
 
 
303 aa  215  7e-55  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3170  LysR family transcriptional regulator  38 
 
 
303 aa  215  9e-55  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5764  LysR family transcriptional regulator  39.55 
 
 
305 aa  214  1e-54  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6129  LysR family transcriptional regulator  39.55 
 
 
305 aa  214  1e-54  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.414294 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2679  LysR family transcriptional regulator  37.33 
 
 
303 aa  214  1e-54  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0566483  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6611  LysR family transcriptional regulator  40.96 
 
 
305 aa  214  1e-54  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.541537 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4276  transcriptional regulator, LysR family  38.74 
 
 
307 aa  214  2e-54  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0461  LysR family transcriptional regulator  41.22 
 
 
297 aa  214  2e-54  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6055  LysR family transcriptional regulator  40.75 
 
 
294 aa  214  2e-54  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.031905  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2575  transcriptional regulator, LysR family  39.19 
 
 
301 aa  213  4e-54  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0931431  normal  0.61434 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7085  LysR family transcriptional regulator  38.64 
 
 
295 aa  213  4e-54  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0927  LysR family transcriptional regulator  39.59 
 
 
313 aa  213  4e-54  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.503807  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0031  LysR family transcriptional regulator  40.26 
 
 
362 aa  212  5e-54  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2586  LysR family transcriptional regulator  39.59 
 
 
301 aa  212  7e-54  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0277024  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0449  transcriptional regulator, LysR family  38.41 
 
 
298 aa  212  8e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.908719  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5843  LysR family transcriptional regulator  40.75 
 
 
294 aa  211  1e-53  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6079  LysR family transcriptional regulator  40.75 
 
 
294 aa  211  1e-53  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.929985  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7632  LysR family transcriptional regulator  41.18 
 
 
305 aa  211  2e-53  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.228485 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0124  LysR family transcriptional regulator  39.3 
 
 
351 aa  210  2e-53  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1688  LysR family transcriptional regulator  38.08 
 
 
312 aa  210  2e-53  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0669222  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1509  putative transcriptional regulator  38.91 
 
 
302 aa  210  3e-53  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1116  LysR family transcriptional regulator  40.14 
 
 
316 aa  210  3e-53  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0305  transcriptional regulator, LysR family  40.13 
 
 
367 aa  209  4e-53  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2289  transcriptional regulator, LysR family  40.62 
 
 
353 aa  209  4e-53  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17380  LysR family transcriptional regulator  38.57 
 
 
302 aa  209  4e-53  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.650762  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4420  LysR family transcriptional regulator  40.13 
 
 
367 aa  209  4e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0287989 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1670  LysR family transcriptional regulator  35.4 
 
 
295 aa  209  4e-53  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.969341  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3910  LysR family transcriptional regulator  34.68 
 
 
302 aa  209  4e-53  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.268348  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3607  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  38.83 
 
 
302 aa  209  4e-53  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.335248 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1541  LysR family transcriptional regulator  34.22 
 
 
301 aa  209  4e-53  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.827921  normal  0.805114 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5398  transcriptional regulator, LysR family  39.1 
 
 
295 aa  209  6e-53  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.187721  normal  0.0384441 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>