260 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_B2443 on replicon NC_007952
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007952  Bxe_B2443  branched-chain amino acid exporter, LIV- E family  100 
 
 
246 aa  486  1e-136  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.324306 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3612  AzlC family protein  64.73 
 
 
244 aa  294  9e-79  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.271764  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3800  AzlC family protein  63.9 
 
 
244 aa  292  4e-78  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1356  AzlC family protein  59.57 
 
 
246 aa  265  4e-70  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38160  hypothetical protein  45.12 
 
 
252 aa  196  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0013657 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1459  AzlC family protein  44.69 
 
 
293 aa  192  6e-48  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.878975  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3248  hypothetical protein  46.29 
 
 
247 aa  191  1e-47  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.351031  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3139  AzlC family protein  44 
 
 
238 aa  191  1e-47  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.707917  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1598  AzlC family protein  42.68 
 
 
273 aa  189  4e-47  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.185514  normal  0.410872 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2782  AzlC family protein  42.68 
 
 
285 aa  189  5e-47  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.568271  normal  0.166375 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1567  AzlC family protein  42.68 
 
 
273 aa  189  5e-47  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2528  AzlC family protein  45.45 
 
 
255 aa  188  8e-47  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0235  AzlC family protein  45.45 
 
 
239 aa  187  1e-46  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1561  AzlC family protein  44.39 
 
 
273 aa  186  2e-46  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2694  AzlC family protein  45 
 
 
255 aa  186  3e-46  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06280  hypothetical protein  43.18 
 
 
247 aa  185  6e-46  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1188  putative branched-chain amino acid transport protein  45.37 
 
 
237 aa  185  7e-46  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2385  AzlC family protein  50 
 
 
230 aa  184  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3310  AzlC family protein  50 
 
 
230 aa  184  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.294738  normal  0.172837 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001440  AzlC family protein  42.2 
 
 
236 aa  184  2.0000000000000003e-45  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1991  AzlC family protein  50.48 
 
 
230 aa  183  3e-45  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.823633  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2595  AzlC family protein  44.86 
 
 
231 aa  183  3e-45  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2538  AzlC family protein  44.59 
 
 
245 aa  181  1e-44  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3237  AzlC family protein  42.6 
 
 
286 aa  176  2e-43  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000344272  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1760  AzlC family protein  42.72 
 
 
230 aa  176  3e-43  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3299  AzlC-like  46.4 
 
 
232 aa  176  4e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1897  AzlC family protein  50 
 
 
233 aa  176  4e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2854  putative branched-chain amino acid transport protein AzlC  38.83 
 
 
242 aa  134  9.999999999999999e-31  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.608526  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3295  AzlC family protein  38.86 
 
 
258 aa  132  6.999999999999999e-30  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0804  AzlC family protein  37.95 
 
 
255 aa  124  1e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0112465  normal  0.194655 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2936  AzlC family protein  35.38 
 
 
253 aa  118  7.999999999999999e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000187359  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1048  branched chain amino acid efflux pump LivE  36.99 
 
 
253 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0218893  normal  0.990506 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2207  AzlC family protein  36.99 
 
 
292 aa  113  3e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0109045  normal  0.696476 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0976  AzlC family protein  36.36 
 
 
257 aa  113  4.0000000000000004e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.0000153015  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2539  branched-chain amino acid transport protein AzlC  30.88 
 
 
250 aa  112  4.0000000000000004e-24  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0525733  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0972  AzlC family protein  36.36 
 
 
257 aa  112  4.0000000000000004e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00116086  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4209  branched chain amino acid efflux pump, AzlCD (extrudes azaleucine)  34.34 
 
 
255 aa  112  5e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0000558659  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1096  AzlC family protein  35.84 
 
 
255 aa  108  5e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000023066  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0617  AzlC-like  35.84 
 
 
280 aa  108  7.000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.152652  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0404  AzlC family protein  35.56 
 
 
242 aa  108  7.000000000000001e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.54377 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2107  AzlC family protein  34.29 
 
 
244 aa  108  8.000000000000001e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000413868 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1055  AzlC family protein  35.84 
 
 
250 aa  108  9.000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0170281  normal  0.980601 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0389  AzlC family protein  34.83 
 
 
242 aa  106  3e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1691  AzlC family protein  33.72 
 
 
249 aa  105  5e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0039071  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0434  AzlC-like protein  32.24 
 
 
265 aa  101  1e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.72937  normal  0.152736 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0513  hypothetical protein  32.58 
 
 
242 aa  100  3e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0568797 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1603  AzlC family protein  33.85 
 
 
238 aa  99  7e-20  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.315939  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0495  AzlC-like  32.78 
 
 
257 aa  97.8  2e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.294752  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0311  AzlC family protein  32.65 
 
 
238 aa  97.1  2e-19  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1025  AzlC family protein  33.33 
 
 
238 aa  97.4  2e-19  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0979622  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3971  AzlC family protein  30.43 
 
 
244 aa  97.1  3e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.312774  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0429  AzlC family protein  32.14 
 
 
258 aa  92  7e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  decreased coverage  0.000397006  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0092  AzlC family protein  30 
 
 
228 aa  91.7  9e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2568  AzlC family protein  32.53 
 
 
233 aa  90.5  2e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0007  AzlC family protein  30.77 
 
 
246 aa  90.1  3e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3747  AzlC family protein  29.55 
 
 
245 aa  90.1  3e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.317407  normal  0.271114 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0256  AzlC family protein  31.18 
 
 
233 aa  89.7  4e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0306834  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3606  AzlC family protein  28.18 
 
 
228 aa  89  7e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.776584  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4071  AzlC family protein  30.48 
 
 
247 aa  88.6  9e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1955  AzlC-like protein  31.65 
 
 
242 aa  88.6  9e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.552602  normal  0.748996 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3053  AzlC family protein  29.81 
 
 
240 aa  88.2  1e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0922  AzlC-like protein  27.59 
 
 
229 aa  87.8  1e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.376984  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1381  AzlC family protein  30 
 
 
234 aa  87.4  2e-16  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.690005  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4125  AzlC-like  30.73 
 
 
233 aa  85.9  6e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1470  AzlC family protein  30.61 
 
 
247 aa  85.1  9e-16  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.555433  normal  0.0212209 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3946  AzlC family protein  29.33 
 
 
246 aa  83.6  0.000000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2851  AzlC-like protein  35.06 
 
 
243 aa  82.8  0.000000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.537039  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0350  AzlC family protein  31.82 
 
 
238 aa  81.6  0.00000000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.303967  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1598  AzlC family protein  31.71 
 
 
242 aa  80.1  0.00000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.829588  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1850  AzlC family protein  32.32 
 
 
241 aa  79.7  0.00000000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1599  AzlC family protein  32.32 
 
 
241 aa  79.7  0.00000000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.732241  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1562  branched-chain amino acid transport protein  32.32 
 
 
241 aa  79.7  0.00000000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1551  branched-chain amino acid transport protein  32.32 
 
 
241 aa  79.7  0.00000000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1722  AzlC family protein  32.32 
 
 
241 aa  79.7  0.00000000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1795  AzlC family protein  31.71 
 
 
241 aa  79.3  0.00000000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1741  AzlC family protein  31.71 
 
 
241 aa  79.3  0.00000000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3602  AzlC family protein  31.71 
 
 
241 aa  79.3  0.00000000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15010  predicted branched-chain amino acid permease (azaleucine resistance)  29.95 
 
 
256 aa  79.3  0.00000000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.509076  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1772  AzlC family protein  32.32 
 
 
241 aa  79.3  0.00000000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1962  AzlC family protein  30.86 
 
 
240 aa  79  0.00000000000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3535  AzlC family protein  30.46 
 
 
234 aa  78.6  0.00000000000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.485711  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02082  hypothetical protein  27.18 
 
 
250 aa  76.6  0.0000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4092  AzlC family protein  30.77 
 
 
242 aa  76.6  0.0000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0697  AzlC family protein  30.54 
 
 
256 aa  76.6  0.0000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0390  AzlC-like protein  33.63 
 
 
242 aa  76.6  0.0000000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.709784  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2569  AzlC family protein  30.69 
 
 
243 aa  76.3  0.0000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0461  AzlC-like  25.22 
 
 
240 aa  76.3  0.0000000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0774  AzlC family protein  27.57 
 
 
246 aa  76.3  0.0000000000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0353  AzlC family protein  31.25 
 
 
259 aa  75.9  0.0000000000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.16576 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0298  AzlC-like  36.81 
 
 
238 aa  75.5  0.0000000000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0377703  normal  0.243467 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1521  AzlC family protein  29.25 
 
 
240 aa  75.5  0.0000000000008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.160339  normal  0.0253198 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1996  AzlC-like  26.27 
 
 
241 aa  74.7  0.000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0552  azaleucine resistance protein AzlC  25.34 
 
 
242 aa  73.9  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2174  AzlC family protein  26.97 
 
 
282 aa  73.9  0.000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0362  AzlC family protein  25.34 
 
 
242 aa  73.9  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0375  AzlC family protein  25.34 
 
 
242 aa  73.9  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.946761  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1756  AzlC family protein  25.91 
 
 
240 aa  73.2  0.000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3169  AzlC family protein  26.07 
 
 
239 aa  72.8  0.000000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.545367  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1415  AzlC family protein  25.59 
 
 
240 aa  72.8  0.000000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.430613  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0732  AzlC family protein  30.06 
 
 
217 aa  73.2  0.000000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.100734  normal  0.28736 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>