25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_B2422 on replicon NC_007952
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007952  Bxe_B2422  hypothetical protein  100 
 
 
198 aa  394  1e-109  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.53452  normal 
 
 
-
 
NC_011889  Mnod_7753  hypothetical protein  37.42 
 
 
166 aa  89.7  2e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3112  hypothetical protein  40.97 
 
 
189 aa  87.4  1e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5944  hypothetical protein  36.96 
 
 
171 aa  83.2  0.000000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4671  hypothetical protein  48.57 
 
 
163 aa  82.8  0.000000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0100  hypothetical protein  37.33 
 
 
170 aa  82.4  0.000000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0065  hypothetical protein  37.33 
 
 
170 aa  83.2  0.000000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6425  hypothetical protein  36.94 
 
 
161 aa  77.4  0.0000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3826  hypothetical protein  34.19 
 
 
176 aa  75.9  0.0000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.800886  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6516  hypothetical protein  68.63 
 
 
58 aa  72  0.000000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.705468  normal  0.131364 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2574  hypothetical protein  49.21 
 
 
163 aa  63.5  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1232  hypothetical protein  49.21 
 
 
163 aa  63.2  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3939  hypothetical protein  31.08 
 
 
169 aa  62  0.000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1949  hypothetical protein  34.85 
 
 
164 aa  61.6  0.000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0482  hypothetical protein  29.73 
 
 
161 aa  60.8  0.00000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.983656 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2722  hypothetical protein  28.35 
 
 
175 aa  58.2  0.00000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.902523  normal  0.131757 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0025  hypothetical protein  33.09 
 
 
185 aa  57.4  0.0000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0029  hypothetical protein  32.67 
 
 
191 aa  55.5  0.0000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.85026  normal  0.998134 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6073  hypothetical protein  30.15 
 
 
314 aa  54.7  0.000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5014  hypothetical protein  28.57 
 
 
170 aa  49.3  0.00003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.397057  normal  0.0131844 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1796  hypothetical protein  29.63 
 
 
177 aa  47  0.0002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.156293  normal  0.461474 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5318  hypothetical protein  26.67 
 
 
174 aa  47  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.184948  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2683  hypothetical protein  35.37 
 
 
141 aa  46.2  0.0003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2180  hypothetical protein  26.92 
 
 
177 aa  44.3  0.001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.35771 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1845  hypothetical protein  27.88 
 
 
177 aa  44.3  0.001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>