More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_B2342 on replicon NC_007952
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007952  Bxe_B2342  CBS domain-containing protein  100 
 
 
150 aa  302  1.0000000000000001e-81  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.72552 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7035  CBS domain-containing protein  72.67 
 
 
150 aa  226  6e-59  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.819335  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3216  CBS domain-containing protein  50.67 
 
 
149 aa  156  1e-37  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2323  CBS domain-containing protein  50.67 
 
 
149 aa  155  2e-37  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.195763  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2033  CBS domain-containing protein  50.67 
 
 
149 aa  155  2e-37  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2317  CBS domain-containing protein  50.67 
 
 
149 aa  155  2e-37  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.754062  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1057  CBS domain-containing protein  50.67 
 
 
149 aa  155  2e-37  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.486416  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1343  CBS domain-containing protein  50.67 
 
 
149 aa  155  2e-37  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3091  CBS domain-containing protein  50 
 
 
291 aa  152  2e-36  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.105353  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1429  CBS domain-containing protein  49.33 
 
 
211 aa  150  7e-36  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5931  CBS domain-containing protein  52 
 
 
149 aa  144  4.0000000000000006e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6177  CBS domain-containing protein  52 
 
 
149 aa  136  1e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0583  CBS domain-containing protein  44.67 
 
 
150 aa  124  6e-28  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  hitchhiker  0.00772647  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0248  putative signal transduction protein with CBS domains  41.61 
 
 
149 aa  108  3e-23  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0067  putative inosine monophosphate dehydrogenase  44.97 
 
 
149 aa  106  1e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2557  hypothetical protein  37.33 
 
 
149 aa  103  1e-21  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1169  signal-transduction protein  41.61 
 
 
149 aa  101  4e-21  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1528  signal-transduction protein  42.45 
 
 
153 aa  97.4  6e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3850  signal-transduction protein  41.01 
 
 
153 aa  94  6e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1388  hypothetical protein  41.88 
 
 
149 aa  92  2e-18  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0920  CBS domain-containing protein  36.67 
 
 
149 aa  89.4  1e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5919  signal-transduction protein  35.33 
 
 
162 aa  88.6  3e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.512609  normal  0.346148 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1387  CBS domain containing protein  30.94 
 
 
148 aa  78.2  0.00000000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1141  signal-transduction protein  34.48 
 
 
150 aa  76.6  0.00000000000009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.403559  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08210  CBS domain-containing protein  38.98 
 
 
139 aa  75.5  0.0000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0345  signal-transduction protein  30.51 
 
 
150 aa  75.1  0.0000000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3235  hypothetical protein  40.95 
 
 
130 aa  74.7  0.0000000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1150  CBS  32.21 
 
 
154 aa  72.8  0.000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0527  CBS domain containing protein  30.25 
 
 
147 aa  71.2  0.000000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3773  putative signal transduction protein with CBS domains  32.41 
 
 
144 aa  70.9  0.000000000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0415  signal-transduction protein  36.99 
 
 
145 aa  69.7  0.00000000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.682078  normal  0.0782148 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7033  signal-transduction protein  31.75 
 
 
154 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.365249  normal  0.472984 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4477  signal-transduction protein  34.17 
 
 
145 aa  70.1  0.00000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.458256  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3679  signal-transduction protein  34.23 
 
 
150 aa  70.1  0.00000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1809  putative signal-transduction protein with CBS domains  32.23 
 
 
478 aa  68.9  0.00000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0695  putative signal-transduction protein with CBS domains  31.45 
 
 
140 aa  69.3  0.00000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0173289  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4418  putative signal-transduction protein with CBS domains  36 
 
 
154 aa  68.2  0.00000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.577015  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4551  putative signal transduction protein with CBS domains  36 
 
 
154 aa  68.2  0.00000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.610614  normal  0.0178706 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0305  signal-transduction protein  30 
 
 
185 aa  68.2  0.00000000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0743786  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2620  putative signal transduction protein with CBS domains  35 
 
 
480 aa  67.4  0.00000000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0774627  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2231  signal-transduction protein  29.75 
 
 
188 aa  67.4  0.00000000006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.943647  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3669  putative signal transduction protein with CBS domains  33.87 
 
 
141 aa  67  0.00000000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0338  signal-transduction protein  37.59 
 
 
145 aa  67  0.00000000009  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1229  signal-transduction protein  37.59 
 
 
136 aa  66.2  0.0000000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0389  signal-transduction protein  31.4 
 
 
150 aa  66.2  0.0000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0642  putative signal transduction protein with CBS domains  31.62 
 
 
140 aa  66.6  0.0000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.413978  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5203  CBS domain containing protein  29.84 
 
 
141 aa  66.6  0.0000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0914  putative signal transduction protein with CBS domains  33.82 
 
 
131 aa  65.9  0.0000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  hitchhiker  0.0000312526  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2035  CBS domain-containing protein  35.48 
 
 
143 aa  65.5  0.0000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1393  signal transduction protein  35.25 
 
 
136 aa  65.9  0.0000000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.137975 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2185  signal transduction protein  39.17 
 
 
170 aa  65.5  0.0000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.51071  normal  0.552255 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1762  signal-transduction protein  35.61 
 
 
139 aa  65.1  0.0000000003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1488  signal-transduction protein  34.27 
 
 
142 aa  64.7  0.0000000004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.661715 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2950  signal transduction protein  32.64 
 
 
141 aa  64.3  0.0000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.211508 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4568  putative signal transduction protein with CBS domains  28.67 
 
 
155 aa  64.7  0.0000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0446023  normal  0.17585 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4435  putative signal-transduction protein with CBS domains  28.67 
 
 
155 aa  64.7  0.0000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4760  CBS domain-containing protein  39.34 
 
 
141 aa  64.3  0.0000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.462026  normal  0.418108 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0364  signal-transduction protein  32.59 
 
 
139 aa  63.5  0.0000000009  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.612757 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3292  signal transduction protein  33.33 
 
 
142 aa  62.8  0.000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.792405 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2096  diguanylate cyclase with GAF sensor  29.71 
 
 
664 aa  62.4  0.000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.76184 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1217  CBS domain-containing protein  33.62 
 
 
143 aa  62.4  0.000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0673  signal-transduction protein  29.13 
 
 
165 aa  62.8  0.000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1474  signal transduction protein  31.93 
 
 
128 aa  62  0.000000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1885  signal-transduction protein  33.08 
 
 
145 aa  61.6  0.000000003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06340  putative signal-transduction protein with CBS domains  33.33 
 
 
141 aa  61.6  0.000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000465197  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1740  signal transduction protein  32.2 
 
 
138 aa  61.2  0.000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.247067 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5536  CBS domain-containing protein  36.13 
 
 
141 aa  61.2  0.000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0354137 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4391  CBS domain-containing protein  35.48 
 
 
204 aa  60.8  0.000000006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2352  signal-transduction protein  33.33 
 
 
142 aa  60.5  0.000000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.103406  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0447  signal-transduction protein  31.09 
 
 
145 aa  60.5  0.000000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.285729  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2051  putative signal transduction protein with CBS domains  31.09 
 
 
124 aa  60.1  0.000000009  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.787742  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4660  CBS domain-containing protein  29.05 
 
 
199 aa  60.1  0.000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6936  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  35.29 
 
 
490 aa  59.7  0.00000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.294111 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3565  CBS domain-containing protein  32.5 
 
 
138 aa  60.1  0.00000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0964  putative signal transduction protein with CBS domains  31.58 
 
 
132 aa  58.9  0.00000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1449  signal transduction protein  33.33 
 
 
153 aa  58.9  0.00000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1249  CBS domain-containing protein  35.25 
 
 
141 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0568  signal-transduction protein  31.4 
 
 
133 aa  59.3  0.00000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.706815 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6583  CBS domain-containing protein  35.25 
 
 
141 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.460187  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3944  signal-transduction protein  30.83 
 
 
138 aa  58.5  0.00000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.898238  normal  0.165624 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6186  CBS domain-containing protein  35.25 
 
 
141 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1863  putative signal transduction protein with CBS domains  38.66 
 
 
141 aa  58.5  0.00000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1143  signal-transduction protein  31.11 
 
 
138 aa  58.5  0.00000003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.430444 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3788  putative signal transduction protein with CBS domains  34.72 
 
 
139 aa  58.2  0.00000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.534948  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1780  putative signal transduction protein with CBS domains  33.33 
 
 
141 aa  57.8  0.00000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0417  signal transduction protein  34.96 
 
 
139 aa  57.8  0.00000005  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.694858  normal  0.0742839 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2219  CBS domain containing protein  33.06 
 
 
145 aa  57.8  0.00000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.338208  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2693  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.33 
 
 
873 aa  57.8  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0255  signal-transduction protein  34.81 
 
 
142 aa  57.8  0.00000005  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0155982  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2665  putative signal transduction protein with CBS domains  30.25 
 
 
187 aa  57  0.00000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  hitchhiker  0.000148572  normal  0.84733 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1852  putative signal transduction protein with CBS domains  31.15 
 
 
144 aa  57.4  0.00000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.260866  normal  0.0125119 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2052  putative signal transduction protein with CBS domains  30.33 
 
 
144 aa  57.4  0.00000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0198  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.96 
 
 
1344 aa  57  0.00000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.592297 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0239  signal transduction protein  30.71 
 
 
128 aa  57  0.00000008  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.371768 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0362  signal-transduction protein  28.89 
 
 
139 aa  57  0.00000009  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0183  hypothetical protein  26.19 
 
 
165 aa  56.2  0.0000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0517579 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0979  signal transduction protein  29.63 
 
 
139 aa  56.2  0.0000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  hitchhiker  0.000000114145 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1339  signal-transduction protein  35.46 
 
 
160 aa  56.2  0.0000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.44426 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1938  CBS domain-containing protein  31.9 
 
 
143 aa  55.5  0.0000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.704039  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2234  putative signal transduction protein with CBS domains  28.97 
 
 
139 aa  55.5  0.0000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>