More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_B2323 on replicon NC_007952
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007952  Bxe_B2323  putative 2-hydroxy-6-ketonona-2,4-dienedioic acid hydrolase (MhpC)  100 
 
 
289 aa  597  1e-169  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0911  Alpha/beta hydrolase fold  82.35 
 
 
289 aa  518  1e-146  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0219257  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0274  Alpha/beta hydrolase fold  83.39 
 
 
289 aa  510  1e-143  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.642233  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1361  Alpha/beta hydrolase fold  79.72 
 
 
298 aa  496  1e-139  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00841082  hitchhiker  0.00000857461 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15080  2-hydroxy-6-ketonona-2,4-dienedioic acid hydrolase  77.35 
 
 
288 aa  483  1e-135  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.625795  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1981  alpha/beta hydrolase fold  76.33 
 
 
287 aa  470  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.578343 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4541  alpha/beta hydrolase fold protein  74.39 
 
 
288 aa  463  1e-129  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.707016  normal  0.231702 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0935  alpha/beta hydrolase fold  72.18 
 
 
288 aa  440  9.999999999999999e-123  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0423109  normal  0.641404 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3257  alpha/beta hydrolase fold protein  69.64 
 
 
288 aa  424  1e-118  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00303  2-hydroxy-6-ketonona-2,4-dienedioic acid hydrolase  69.29 
 
 
293 aa  424  1e-117  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0321266  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00307  hypothetical protein  69.29 
 
 
293 aa  424  1e-117  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0415585  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0380  2-hydroxy-6-ketonona-2,4-dienedioic acid hydrolase  69.29 
 
 
288 aa  423  1e-117  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.615144  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0413  2-hydroxy-6-ketonona-2,4-dienedioic acid hydrolase  69.29 
 
 
293 aa  424  1e-117  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0373  2-hydroxy-6-ketonona-2,4-dienedioic acid hydrolase  69.29 
 
 
293 aa  424  1e-117  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.170384  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0424  2-hydroxy-6-ketonona-2,4-dienedioic acid hydrolase  69.29 
 
 
288 aa  424  1e-117  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3276  alpha/beta hydrolase fold  69.29 
 
 
288 aa  423  1e-117  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.15708  normal 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4141  alpha/beta hydrolase fold  56.99 
 
 
286 aa  330  1e-89  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0556153  normal  0.121245 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1186  2-hydroxy-6-oxo-6-phenylhexa-2,4- dienoate hydrolase (BphD)  56.64 
 
 
286 aa  328  9e-89  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.644621  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4414  alpha/beta hydrolase fold  40.21 
 
 
277 aa  207  1e-52  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4183  alpha/beta hydrolase fold  40 
 
 
279 aa  202  7e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.221808 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1464  alpha/beta hydrolase fold  38.57 
 
 
294 aa  201  1.9999999999999998e-50  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3844  alpha/beta hydrolase fold protein  39.72 
 
 
289 aa  200  1.9999999999999998e-50  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.185404  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5307  alpha/beta hydrolase fold  38.83 
 
 
295 aa  199  3e-50  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.224347 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5093  alpha/beta hydrolase fold  38.72 
 
 
299 aa  198  7.999999999999999e-50  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.284245 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4708  alpha/beta hydrolase fold  38.72 
 
 
299 aa  198  7.999999999999999e-50  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4794  alpha/beta hydrolase fold  38.72 
 
 
299 aa  198  7.999999999999999e-50  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13602  2-hydroxy-6-oxo-6-phenylhexa-2,4-dienoate hydrolase bphD  38.33 
 
 
291 aa  195  8.000000000000001e-49  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.552922 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2894  alpha/beta hydrolase fold  38.83 
 
 
287 aa  195  8.000000000000001e-49  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1754  alpha/beta hydrolase fold  39.92 
 
 
277 aa  184  1.0000000000000001e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2141  alpha/beta hydrolase fold  36.99 
 
 
284 aa  178  1e-43  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2775  alpha/beta hydrolase fold  35.69 
 
 
302 aa  171  2e-41  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.562879  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3515  alpha/beta hydrolase fold protein  38.18 
 
 
293 aa  168  8e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2956  Alpha/beta hydrolase  37.41 
 
 
275 aa  165  6.9999999999999995e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.419373  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0312  alpha/beta hydrolase fold  37.78 
 
 
285 aa  164  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0221  alpha/beta hydrolase fold  36.71 
 
 
286 aa  164  2.0000000000000002e-39  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0323  alpha/beta hydrolase fold  37.41 
 
 
285 aa  164  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.619665  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0333  alpha/beta hydrolase fold  37.41 
 
 
285 aa  164  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.240836 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0592  alpha/beta hydrolase fold  36.73 
 
 
288 aa  161  1e-38  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1306  alpha/beta hydrolase fold  37.27 
 
 
276 aa  160  2e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.258208  normal  0.0573899 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4525  alpha/beta hydrolase fold  36.9 
 
 
290 aa  160  3e-38  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.212373  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3522  alpha/beta hydrolase fold protein  35.93 
 
 
289 aa  159  6e-38  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.328717  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42230  2-hydroxymuconic semialdehyde hydrolase  36.19 
 
 
271 aa  158  8e-38  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2670  alpha/beta hydrolase fold  37.82 
 
 
298 aa  158  1e-37  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  0.00899476  normal  0.0694304 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2878  alpha/beta hydrolase fold  35.9 
 
 
283 aa  157  2e-37  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2898  alpha/beta hydrolase fold  35.29 
 
 
291 aa  156  3e-37  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.14294 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3250  Alpha/beta hydrolase fold  35.06 
 
 
273 aa  156  4e-37  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.000000000180136  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4501  alpha/beta hydrolase fold protein  35.66 
 
 
285 aa  155  9e-37  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.569639  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0531  alpha/beta hydrolase fold protein  34.83 
 
 
273 aa  154  1e-36  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1183  Alpha/beta hydrolase  35.64 
 
 
279 aa  154  2e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.330922  normal  0.0773535 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1827  alpha/beta hydrolase fold  37.31 
 
 
285 aa  153  2.9999999999999998e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3545  alpha/beta hydrolase fold protein  34.63 
 
 
283 aa  152  5e-36  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.158387  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4621  alpha/beta hydrolase fold  34.63 
 
 
283 aa  152  5e-36  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3786  Alpha/beta hydrolase fold  36.43 
 
 
274 aa  152  7e-36  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00563208  hitchhiker  0.00293132 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2882  alpha/beta hydrolase fold  34.81 
 
 
276 aa  150  2e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.035123 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2274  2-hydroxymuconic semialdehyde hydrolase  37.14 
 
 
291 aa  150  3e-35  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1513  Alpha/beta hydrolase fold  34.64 
 
 
293 aa  149  6e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2786  alpha/beta hydrolase fold  34.43 
 
 
283 aa  148  9e-35  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.200125 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1463  Alpha/beta hydrolase  34.7 
 
 
278 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.234917  normal  0.480235 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3858  alpha/beta hydrolase fold  34.67 
 
 
283 aa  148  1.0000000000000001e-34  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.167759  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3344  alpha/beta hydrolase fold  34.71 
 
 
289 aa  148  1.0000000000000001e-34  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3110  alpha/beta hydrolase fold protein  36.76 
 
 
304 aa  147  3e-34  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.228638  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2456  alpha/beta hydrolase fold  34.42 
 
 
278 aa  145  6e-34  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0153839  normal  0.505758 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0433  alpha/beta hydrolase fold protein  36.19 
 
 
282 aa  143  3e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0369165 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4111  alpha/beta hydrolase fold protein  32.58 
 
 
288 aa  142  5e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0346007  normal  0.0462514 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1331  Alpha/beta hydrolase fold  32.71 
 
 
278 aa  142  5e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000258733 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0210  alpha/beta hydrolase fold  36.46 
 
 
279 aa  142  5e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0888  alpha/beta hydrolase fold  32.33 
 
 
282 aa  140  3e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.797798 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2147  alpha/beta hydrolase fold  33.45 
 
 
278 aa  136  4e-31  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3338  alpha/beta hydrolase fold  33.58 
 
 
271 aa  131  1.0000000000000001e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0955603 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5690  Alpha/beta hydrolase fold  33.92 
 
 
283 aa  132  1.0000000000000001e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4719  alpha/beta hydrolase fold protein  33.59 
 
 
282 aa  125  1e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0208  alpha/beta hydrolase fold  30.94 
 
 
291 aa  121  9.999999999999999e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3690  alpha/beta hydrolase fold  33.33 
 
 
276 aa  119  3.9999999999999996e-26  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3228  alpha/beta hydrolase fold  30.88 
 
 
281 aa  117  1.9999999999999998e-25  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0809  alpha/beta hydrolase fold  28.52 
 
 
283 aa  116  5e-25  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3884  alpha/beta hydrolase fold  29.88 
 
 
286 aa  108  1e-22  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.330831  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1553  alpha/beta hydrolase fold protein  31.54 
 
 
286 aa  107  3e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000230075  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1464  alpha/beta hydrolase fold protein  28.57 
 
 
279 aa  105  6e-22  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2400  alpha/beta hydrolase fold  32.97 
 
 
288 aa  104  2e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2754  alpha/beta hydrolase fold protein  29.8 
 
 
284 aa  102  5e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3055  alpha/beta hydrolase fold  28.01 
 
 
277 aa  102  9e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0115287 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3689  alpha/beta hydrolase fold protein  28.32 
 
 
302 aa  100  2e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10240  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  32.48 
 
 
370 aa  100  3e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0379  alpha/beta hydrolase fold protein  30.32 
 
 
285 aa  100  4e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.36178  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2705  alpha/beta hydrolase fold  26.57 
 
 
309 aa  100  4e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.601677  normal  0.0914485 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4246  alpha/beta hydrolase fold  32.46 
 
 
288 aa  100  4e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.912428  normal 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5837  alpha/beta hydrolase fold  29.02 
 
 
316 aa  99  8e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.381935  normal 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5440  alpha/beta hydrolase fold  29.02 
 
 
299 aa  99  9e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  normal  0.341918 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0935  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  32.12 
 
 
370 aa  98.2  1e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3787  alpha/beta hydrolase fold  31.14 
 
 
287 aa  98.2  1e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.265139  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3791  alpha/beta hydrolase fold  31.14 
 
 
287 aa  98.6  1e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0672  alpha/beta hydrolase fold  29.72 
 
 
315 aa  98.2  1e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.240082 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3860  alpha/beta hydrolase fold  31.14 
 
 
287 aa  98.2  1e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0545  alpha/beta hydrolase fold  29.02 
 
 
299 aa  97.8  2e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1353  alpha/beta hydrolase fold  29.41 
 
 
339 aa  98.2  2e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.687878  normal  0.202512 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1652  alpha/beta hydrolase fold  29.02 
 
 
299 aa  97.8  2e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1679  alpha/beta hydrolase fold  29.02 
 
 
299 aa  97.8  2e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0993  alpha/beta hydrolase fold  29.41 
 
 
345 aa  97.4  2e-19  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.87511  unclonable  0.000000000579867 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5609  alpha/beta hydrolase fold  29.02 
 
 
299 aa  97.8  2e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.333622  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1708  alpha/beta hydrolase fold  29.02 
 
 
299 aa  97.8  2e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0456043  normal  0.790109 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>