81 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_B1939 on replicon NC_007952
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007953  Bxe_C0976  hypothetical protein  84.62 
 
 		 442 aa  743    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.0000000643753  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1939  hypothetical protein  100 
 
 		 445 aa  894    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  unclonable  1.28662e-16  normal  0.114888 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0192  protein of unknown function DUF1446  78.88 
 
 		 445 aa  711    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00000279886  decreased coverage  0.000101954 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1227  hypothetical protein  50 
 
 		 448 aa  438  9.999999999999999e-123  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4171  hypothetical protein  50.56 
 
 		 445 aa  437  1e-121  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4091  protein of unknown function DUF1446  52.3 
 
 		 452 aa  430  1e-119  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3167  protein of unknown function DUF1446  48.08 
 
 		 446 aa  425  1e-118  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0474207  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1164  hypothetical protein  47.86 
 
 		 446 aa  419  1e-116  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.301898  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3292  hypothetical protein  51.14 
 
 		 452 aa  412  1e-114  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18500  Protein of unknown function (DUF1446)  51.13 
 
 		 441 aa  410  1e-113  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3735  protein of unknown function DUF1446  49.22 
 
 		 451 aa  411  1e-113  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4812  protein of unknown function DUF1446  49.22 
 
 		 451 aa  411  1e-113  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.532923  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6706  hypothetical protein  49.66 
 
 		 444 aa  411  1e-113  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0392889 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0825  hypothetical protein  47.97 
 
 		 445 aa  406  1.0000000000000001e-112  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.372095 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6325  hypothetical protein  48.98 
 
 		 452 aa  405  1.0000000000000001e-112  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.877291 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1495  hypothetical protein  46.74 
 
 		 454 aa  402  1e-111  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.123064  normal  0.999066 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1928  hypothetical protein  51.95 
 
 		 453 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0148071 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3689  protein of unknown function DUF1446  51.51 
 
 		 444 aa  398  1e-109  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.539292  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4147  protein of unknown function DUF1446  45.74 
 
 		 445 aa  397  1e-109  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1474  hypothetical protein  51.81 
 
 		 445 aa  398  1e-109  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.274913  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4048  hypothetical protein  49.77 
 
 		 445 aa  392  1e-108  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.905115 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1271  hypothetical protein  51.61 
 
 		 453 aa  392  1e-108  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.11625 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0886  hypothetical protein  50.92 
 
 		 461 aa  389  1e-107  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1368  hypothetical protein  50.92 
 
 		 461 aa  389  1e-107  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2673  hypothetical protein  47.23 
 
 		 454 aa  386  1e-106  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0708192  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1346  hypothetical protein  50.69 
 
 		 461 aa  382  1e-105  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0284571 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1245  hypothetical protein  51.26 
 
 		 453 aa  382  1e-105  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4511  hypothetical protein  49.77 
 
 		 452 aa  380  1e-104  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.697863 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5610  hypothetical protein  48.89 
 
 		 445 aa  373  1e-102  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5398  hypothetical protein  48.87 
 
 		 453 aa  366  1e-100  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3666  protein of unknown function DUF1446  49.77 
 
 		 443 aa  356  5e-97  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2761  hypothetical protein  45.93 
 
 		 458 aa  355  1e-96  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  decreased coverage  0.0046084  normal  0.122953 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1910  protein of unknown function DUF1446  46.05 
 
 		 450 aa  354  2e-96  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2040  protein of unknown function DUF1446  46.05 
 
 		 473 aa  348  8e-95  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.378243  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1818  hypothetical protein  45.6 
 
 		 450 aa  348  9e-95  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.991899 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3392  hypothetical protein  45.17 
 
 		 450 aa  348  1e-94  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.703348  normal  0.110524 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5880  hypothetical protein  48.65 
 
 		 466 aa  345  7e-94  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2111  hypothetical protein  45.54 
 
 		 451 aa  337  1.9999999999999998e-91  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.310455  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4610  hypothetical protein  44.31 
 
 		 451 aa  334  2e-90  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4625  hypothetical protein  43.96 
 
 		 451 aa  330  4e-89  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.245969  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0713  hypothetical protein  44.82 
 
 		 482 aa  330  4e-89  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17100  hypothetical protein  46.92 
 
 		 449 aa  328  1.0000000000000001e-88  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.550956  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2268  hypothetical protein  35.56 
 
 		 600 aa  242  7.999999999999999e-63  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26750  hypothetical protein  34.2 
 
 		 600 aa  240  4e-62  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0040  protein of unknown function DUF1446  34.85 
 
 		 616 aa  237  2e-61  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.479807  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0110  protein of unknown function DUF1446  33.99 
 
 		 590 aa  232  8.000000000000001e-60  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2689  hypothetical protein  32.75 
 
 		 612 aa  228  1e-58  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.217964  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2802  hypothetical protein  39.89 
 
 		 598 aa  229  1e-58  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.780991  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3945  hypothetical protein  32.96 
 
 		 596 aa  228  2e-58  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3627  hypothetical protein  37.92 
 
 		 607 aa  219  7.999999999999999e-56  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0103  protein of unknown function DUF1446  33.05 
 
 		 590 aa  219  1e-55  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0320  hypothetical protein  29.89 
 
 		 603 aa  218  1e-55  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4188  hypothetical protein  33.33 
 
 		 608 aa  219  1e-55  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.217981  normal  0.463566 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6360  hypothetical protein  39.08 
 
 		 619 aa  210  3e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00827876  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16490  Protein of unknown function (DUF1446)  40.12 
 
 		 561 aa  205  1e-51  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4459  hypothetical protein  32.96 
 
 		 599 aa  203  5e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.286851  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2416  hypothetical protein  35.98 
 
 		 571 aa  202  7e-51  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.011341  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4325  hypothetical protein  38.75 
 
 		 562 aa  199  6e-50  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0144573 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1725  hypothetical protein  31.72 
 
 		 627 aa  196  8.000000000000001e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0106987  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4598  hypothetical protein  38.05 
 
 		 578 aa  195  1e-48  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4431  protein of unknown function DUF1446  38.39 
 
 		 581 aa  194  2e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0308789 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3831  protein of unknown function DUF1446  39.62 
 
 		 587 aa  194  3e-48  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0438804  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3206  hypothetical protein  40.45 
 
 		 574 aa  193  4e-48  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.136417  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3217  hypothetical protein  40.45 
 
 		 574 aa  193  4e-48  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.784644  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3268  hypothetical protein  40.45 
 
 		 574 aa  193  4e-48  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.133796  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4846  hypothetical protein  37.61 
 
 		 570 aa  192  1e-47  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.726466  normal  0.275126 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4684  hypothetical protein  38.46 
 
 		 575 aa  190  5.999999999999999e-47  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.667747 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4304  hypothetical protein  38.46 
 
 		 575 aa  189  1e-46  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.488796  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4390  hypothetical protein  38.46 
 
 		 575 aa  189  1e-46  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.392949  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4765  hypothetical protein  39.07 
 
 		 562 aa  188  1e-46  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000030187 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2176  hypothetical protein  34.08 
 
 		 596 aa  187  3e-46  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4555  hypothetical protein  38.55 
 
 		 584 aa  185  2.0000000000000003e-45  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.655173  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1033  protein of unknown function DUF1446  36.74 
 
 		 588 aa  180  4e-44  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.62804  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0342  hypothetical protein  34.94 
 
 		 587 aa  178  2e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10994  hypothetical protein  36.84 
 
 		 560 aa  177  3e-43  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  1.59299e-17  normal  0.631418 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6153  protein of unknown function DUF1446  36.76 
 
 		 594 aa  173  5e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.723364  normal  0.255067 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3231  protein of unknown function DUF1446  36.64 
 
 		 596 aa  167  2.9999999999999998e-40  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.113119  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1885  hypothetical protein  37.2 
 
 		 578 aa  160  4e-38  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.181463 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2826  protein of unknown function DUF1446  34.95 
 
 		 580 aa  159  7e-38  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.125317  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06205  conserved hypothetical protein  26.11 
 
 		 654 aa  130  3e-29  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_10086  DUF1446 domain protein (AFU_orthologue; AFUA_6G11420)  29.47 
 
 		 587 aa  117  6e-25  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.483728  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>