200 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_B1910 on replicon NC_007952
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007952  Bxe_B1910  hypothetical protein  100 
 
 
451 aa  906    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1268  MmgE/PrpD family protein  37.78 
 
 
455 aa  284  2.0000000000000002e-75  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1360  MmgE/PrpD family protein  38.41 
 
 
483 aa  263  3e-69  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.737608  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0883  MmgE/PrpD family protein  38.18 
 
 
481 aa  263  4e-69  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.585439  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0482  MmgE/PrpD family protein  35 
 
 
457 aa  261  2e-68  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2745  hypothetical protein  36.1 
 
 
482 aa  258  1e-67  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.183054 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2141  MmgE/PrpD family protein  36.16 
 
 
488 aa  258  1e-67  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.628932 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1269  MmgE/PrpD  37.23 
 
 
463 aa  249  5e-65  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0407  MmgE/PrpD family protein  38.48 
 
 
456 aa  239  9e-62  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.544537 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0172  MmgE/PrpD family protein  33.86 
 
 
451 aa  222  8e-57  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0971  hypothetical protein  34.82 
 
 
471 aa  219  6e-56  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.226989  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0564  MmgE/PrpD family protein  37.39 
 
 
454 aa  210  4e-53  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.626803  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5792  MmgE/PrpD family protein  33.49 
 
 
461 aa  207  3e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.205473  normal  0.299026 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0016  hypothetical protein  39.47 
 
 
456 aa  206  5e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21260  MmgE/PrpD family protein  39.33 
 
 
456 aa  203  5e-51  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0146  MmgE/PrpD  37.28 
 
 
457 aa  202  9.999999999999999e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0705  MmgE/PrpD  36.83 
 
 
458 aa  199  1.0000000000000001e-49  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1585  MmgE/PrpD family protein  36.31 
 
 
482 aa  197  4.0000000000000005e-49  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0449825  hitchhiker  0.00338638 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1168  MmgE/PrpD family protein  31.51 
 
 
456 aa  193  5e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.171281 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3581  MmgE/PrpD family protein  35.18 
 
 
453 aa  187  2e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.604157  normal  0.0576732 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0367  MmgE/PrpD  37.19 
 
 
455 aa  187  3e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.559091  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3608  MmgE/PrpD family protein  31.01 
 
 
468 aa  187  3e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.351268  normal  0.839729 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1347  MmgE/PrpD family protein  41.29 
 
 
458 aa  185  1.0000000000000001e-45  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0284  putative MmgE/Prp family protein  34.27 
 
 
500 aa  182  7e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3582  MmgE/PrpD family protein  36.93 
 
 
451 aa  182  1e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0594439 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3457  MmgE/PrpD family protein  33.48 
 
 
462 aa  181  2e-44  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0718329  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6206  MmgE/PrpD family protein  32.75 
 
 
451 aa  179  9e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1004  putative MmgE/Prp family protein  31.55 
 
 
458 aa  179  1e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.451747 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3583  MmgE/PrpD family protein  37.83 
 
 
462 aa  177  3e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0329422 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3986  MmgE/PrpD family protein  31.44 
 
 
441 aa  176  8e-43  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3985  MmgE/PrpD family protein  30.61 
 
 
450 aa  176  9.999999999999999e-43  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4513  MmgE/PrpD family protein  30.75 
 
 
463 aa  174  2.9999999999999996e-42  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4177  MmgE/PrpD family protein  32.22 
 
 
441 aa  174  3.9999999999999995e-42  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1226  hypothetical protein  29.36 
 
 
490 aa  171  3e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52880  hypothetical protein  31.18 
 
 
450 aa  171  4e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4633  hypothetical protein  30.43 
 
 
450 aa  170  5e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.992935  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4091  hypothetical protein  31.99 
 
 
451 aa  170  6e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.42622  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2736  MmgE/PrpD  34.06 
 
 
460 aa  168  1e-40  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0206  MmgE/PrpD family protein  28.47 
 
 
449 aa  167  4e-40  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0200  MmgE/PrpD family protein  32.81 
 
 
454 aa  166  8e-40  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1394  MmgE/PrpD family protein  27.42 
 
 
446 aa  166  8e-40  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0615722  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1583  MmgE/PrpD family protein  27.19 
 
 
446 aa  165  1.0000000000000001e-39  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6170  MmgE/PrpD family protein  35.08 
 
 
458 aa  164  3e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6463  MmgE/PrpD family protein  34.85 
 
 
458 aa  163  5.0000000000000005e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.672209  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4268  MmgE/PrpD family protein  38.04 
 
 
454 aa  163  7e-39  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4176  MmgE/PrpD family protein  31.07 
 
 
450 aa  160  6e-38  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6148  MmgE/PrpD family protein  31.82 
 
 
442 aa  159  1e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.984063  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1204  MmgE/PrpD family protein  28.88 
 
 
449 aa  158  2e-37  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0281  MmgE/PrpD family protein  27.7 
 
 
446 aa  157  4e-37  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0113  MmgE/PrpD family protein  35.1 
 
 
465 aa  155  1e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2966  MmgE/PrpD  26.75 
 
 
469 aa  154  2.9999999999999998e-36  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4189  MmgE/PrpD  29.34 
 
 
481 aa  153  5.9999999999999996e-36  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.127966  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0581  MmgE/PrpD  32.86 
 
 
462 aa  153  5.9999999999999996e-36  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0134  MmgE/PrpD family protein  32.13 
 
 
454 aa  152  8e-36  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.99136  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2140  MmgE/PrpD family protein  33.55 
 
 
461 aa  152  1e-35  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00607749 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1760  MmgE/PrpD family protein  31.1 
 
 
445 aa  152  2e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0625  2-methylcitrate dehydratase  28.89 
 
 
453 aa  150  4e-35  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3047  MmgE/PrpD family protein  28.67 
 
 
449 aa  150  6e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.110565  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5368  hypothetical protein  30.95 
 
 
451 aa  149  7e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.775637  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0820  2-methylcitrate dehydratase  26.13 
 
 
457 aa  148  2.0000000000000003e-34  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6849  MmgE/PrpD family protein  28.84 
 
 
460 aa  147  3e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3898  hypothetical protein  30.07 
 
 
459 aa  146  7.0000000000000006e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.125384  normal  0.388647 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0040  MmgE/PrpD family protein  29.06 
 
 
453 aa  145  1e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1311  MmgE/PrpD family protein  31.85 
 
 
454 aa  145  2e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0368  MmgE/PrpD  32.98 
 
 
472 aa  145  2e-33  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.500426  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2858  MmgE/PrpD  31.05 
 
 
450 aa  144  3e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.428685 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6636  MmgE/PrpD family protein  29.52 
 
 
457 aa  143  6e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.29162 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4067  MmgE/PrpD family protein  33.33 
 
 
468 aa  140  3e-32  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.530176  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0116  MmgE/PrpD family protein  32.84 
 
 
454 aa  140  3e-32  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.697081 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5175  hypothetical protein  30.87 
 
 
453 aa  140  3.9999999999999997e-32  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6172  MmgE/PrpD family protein  32.45 
 
 
464 aa  139  7e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.661576  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4983  MmgE/PrpD family protein  32.3 
 
 
486 aa  139  7e-32  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.33687  normal  0.0207357 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5808  MmgE/PrpD  32.45 
 
 
463 aa  139  8.999999999999999e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1242  MmgE/PrpD family protein  28.7 
 
 
458 aa  139  8.999999999999999e-32  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.424636  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3540  MmgE/PrpD  28.88 
 
 
457 aa  138  2e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.10861  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0496  MmgE/PrpD family protein  29.1 
 
 
461 aa  138  2e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1882  MmgE/PrpD family protein  30.79 
 
 
443 aa  137  3.0000000000000003e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6810  MmgE/PrpD family protein  29.86 
 
 
460 aa  137  4e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4802  MmgE/PrpD family protein  32.96 
 
 
476 aa  137  4e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.157439 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1703  Fis family transcriptional regulator  27.66 
 
 
453 aa  135  9.999999999999999e-31  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.0229045 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0614  MmgE/PrpD family protein  29.64 
 
 
470 aa  135  1.9999999999999998e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.708965  normal  0.0263157 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01619  conserved hypothetical protein  27.57 
 
 
501 aa  134  3e-30  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.17235 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4086  hypothetical protein  30.48 
 
 
470 aa  133  5e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6601  MmgE/PrpD family protein  31.65 
 
 
462 aa  133  6e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.148689 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6625  MmgE/PrpD family protein  34.69 
 
 
447 aa  133  7.999999999999999e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.977782 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4085  MmgE/PrpD family protein  30.12 
 
 
476 aa  132  1.0000000000000001e-29  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0286  putative MmgE/PrpD family protein  28.57 
 
 
481 aa  130  4.0000000000000003e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.522372  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2225  MmgE/PrpD family protein  30.35 
 
 
503 aa  130  5.0000000000000004e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3094  MmgE/PrpD family protein  28.19 
 
 
453 aa  129  1.0000000000000001e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4133  2-methylcitrate dehydratase  28.66 
 
 
485 aa  129  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.598985  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18590  uncharacterized protein involved in propionate catabolism  31.1 
 
 
465 aa  128  2.0000000000000002e-28  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3512  MmgE/PrpD family protein  31.25 
 
 
453 aa  127  4.0000000000000003e-28  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.208219  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7303  MmgE/PrpD  27.87 
 
 
474 aa  125  2e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.148027  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2582  putative MmgE/Prp family protein  32.46 
 
 
494 aa  125  2e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.194391 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1932  MmgE/PrpD family protein  28.89 
 
 
467 aa  124  3e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6217  MmgE/PrpD family protein  30.81 
 
 
461 aa  124  3e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00176752  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1275  MmgE/PrpD family protein  28.08 
 
 
491 aa  124  4e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1228  MmgE/PrpD family protein  30.21 
 
 
485 aa  124  4e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.996251  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2918  MmgE/PrpD family protein  28.08 
 
 
491 aa  124  4e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2237  MmgE/PrpD family protein  28.23 
 
 
487 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>