77 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_B1841 on replicon NC_007952
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007952  Bxe_B1841  prevent-host-death protein  100 
 
 
97 aa  201  3e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.208689  normal  0.186119 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2940  hypothetical protein  65.43 
 
 
94 aa  108  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0337  prevent-host-death family protein  59.52 
 
 
92 aa  106  1e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.703493  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1927  prevent-host-death family protein  51.22 
 
 
83 aa  94.4  5e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00504779  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0247  prevent-host-death family protein  51.22 
 
 
83 aa  92.8  1e-18  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2293  prevent-host-death family protein  50 
 
 
83 aa  92  2e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0178348 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0794  prevent-host-death family protein  48.78 
 
 
83 aa  89.4  1e-17  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1845  hypothetical protein  51.85 
 
 
83 aa  89.7  1e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.745967  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4634  prevent-host-death protein  48.81 
 
 
107 aa  87  7e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.374921  normal  0.27831 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4023  prevent-host-death family protein  50 
 
 
84 aa  85.9  2e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0311  prevent-host-death family protein  47.56 
 
 
84 aa  84.7  4e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1939  prevent-host-death family protein  44.44 
 
 
83 aa  82.8  0.000000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4120  hypothetical protein  50.59 
 
 
89 aa  82.4  0.000000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3894  prevent-host-death family protein  48.84 
 
 
88 aa  79.7  0.00000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16280  Prevent-host-death protein  57.97 
 
 
69 aa  79  0.00000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009036  Sbal_4434  prevent-host-death family protein  45.68 
 
 
83 aa  79  0.00000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.318074  normal  0.388841 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1639  prevent-host-death family protein  43.9 
 
 
83 aa  77  0.00000000000008  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0329629  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1214  antitoxin YefM  43.9 
 
 
83 aa  77  0.00000000000008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2156  antitoxin YefM  43.9 
 
 
83 aa  77  0.00000000000008  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2309  antitoxin YefM  43.9 
 
 
83 aa  77  0.00000000000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.516264  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2089  RelB  44.05 
 
 
84 aa  75.5  0.0000000000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.674522  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0028  prevent-host-death protein  43.9 
 
 
86 aa  74.7  0.0000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0227799  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1752  prevent-host-death family protein  52.78 
 
 
121 aa  74.7  0.0000000000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.0588193 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1402  prevent-host-death family protein  42.68 
 
 
84 aa  73.6  0.0000000000008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.333938  normal  0.826973 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0351  prevent-host-death family protein  45 
 
 
84 aa  73.6  0.0000000000009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1751  prevent-host-death protein  43.9 
 
 
145 aa  72.8  0.000000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3814  putative YefM protein  42.68 
 
 
84 aa  72.4  0.000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000265887 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1208  prevent-host-death protein  43.9 
 
 
84 aa  69.7  0.00000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0554  antitoxin  42.68 
 
 
83 aa  68.9  0.00000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0694482  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01350  prevent-host-death family protein  40.24 
 
 
85 aa  68.9  0.00000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1308  prevent-host-death protein  42.5 
 
 
112 aa  68.2  0.00000000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3905  prevent-host-death family protein  53.09 
 
 
83 aa  67.4  0.00000000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.542624  normal  0.0844002 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0975  prevent-host-death protein  42.35 
 
 
85 aa  67.4  0.00000000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0832169  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0390  prevent-host-death family protein  36.9 
 
 
84 aa  63.5  0.0000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5458  prevent-host-death family protein  37.84 
 
 
74 aa  61.6  0.000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6160  Antitoxin of toxin-antitoxin stability system  39.19 
 
 
91 aa  61.6  0.000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0844  prevent-host-death protein  38.37 
 
 
86 aa  61.2  0.000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0811736 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5287  prevent-host-death family protein  31.71 
 
 
84 aa  61.2  0.000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0662178  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3489  prevent-host-death protein  37.21 
 
 
86 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.00502392  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5409  prevent-host-death family protein  37.21 
 
 
86 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4765  prevent-host-death family protein  37.21 
 
 
86 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4877  prevent-host-death family protein  37.21 
 
 
86 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0407  prevent-host-death family protein  40.62 
 
 
87 aa  59.3  0.00000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.951779  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2972  prevent-host-death family protein  37.18 
 
 
78 aa  57.8  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.297792 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3147  prevent-host-death family protein  37.18 
 
 
78 aa  57.8  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2555  prevent-host-death protein  40.79 
 
 
85 aa  57.4  0.00000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.29386  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2448  prevent-host-death family protein  38.1 
 
 
84 aa  57.4  0.00000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2433  prevent-host-death family protein  38.27 
 
 
83 aa  57  0.00000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.137149  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2481  prevent-host-death family protein  38.27 
 
 
83 aa  57  0.00000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.041466  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01044  Antitoxin of toxin-antitoxin stability system, StbD family protein  43.94 
 
 
68 aa  57  0.00000009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0433  prevent-host-death protein  35.29 
 
 
84 aa  56.2  0.0000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5485  prevent-host-death protein  40.85 
 
 
94 aa  54.3  0.0000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  normal  0.822453 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13393  hypothetical protein  42.25 
 
 
91 aa  54.7  0.0000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.046844 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5885  prevent-host-death family protein  40.85 
 
 
94 aa  54.3  0.0000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4301  prevent-host-death family protein  35.29 
 
 
84 aa  50.8  0.000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0123254  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0989  prevent-host-death family protein  32.93 
 
 
94 aa  50.8  0.000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2531  prevent-host-death family protein  32.47 
 
 
92 aa  50.4  0.000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2432  prevent-host-death family protein  34.62 
 
 
95 aa  48.9  0.00002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3298  hypothetical protein  34.57 
 
 
87 aa  49.3  0.00002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2039  prevent-host-death family protein  36.67 
 
 
95 aa  47.8  0.00006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.274153 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2678  prevent-host-death protein  35.14 
 
 
99 aa  47  0.00009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.00646262  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3587  prevent-host-death family protein  33.78 
 
 
96 aa  46.2  0.0001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.550844  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1663  prevent-host-death family protein  33.71 
 
 
92 aa  45.1  0.0003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.0199822 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0994  prevent-host-death family protein  42.86 
 
 
80 aa  45.1  0.0003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000587691 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0869  addiction module antitoxin, Axe family  42.86 
 
 
80 aa  45.1  0.0003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1787  prevent-host-death family protein  41.07 
 
 
80 aa  44.3  0.0005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2087  prevent-host-death protein  29.41 
 
 
95 aa  44.3  0.0006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000000757578  unclonable  0.0000000885843 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2964  prevent-host-death family protein  43.86 
 
 
80 aa  43.9  0.0007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2484  prevent-host-death family protein  36.21 
 
 
85 aa  43.9  0.0007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000000069999  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2533  prevent-host-death family protein  36.21 
 
 
85 aa  43.9  0.0007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.000000898748  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4120  prevent-host-death family protein  36.21 
 
 
72 aa  43.9  0.0008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4160  prevent-host-death family protein  36.21 
 
 
72 aa  43.9  0.0008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.505447 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0044  prevent-host-death family protein  41.07 
 
 
80 aa  42.4  0.002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2606  prevent-host-death family protein  37.5 
 
 
80 aa  42.7  0.002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1101  prevent-host-death protein  28.38 
 
 
90 aa  42.7  0.002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1443  prevent-host-death family protein  39.29 
 
 
80 aa  40.8  0.006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2263  prevent-host-death family protein  35.71 
 
 
85 aa  40.4  0.007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>