250 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_B1816 on replicon NC_007952
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003296  RS05823  hypothetical protein  48.04 
 
 		 1150 aa  1043    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.483181 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5219  glucose-methanol-choline oxidoreductase  47.36 
 
 		 1150 aa  1059    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000490282  unclonable  0.0000721023 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1816  hypothetical protein  100 
 
 		 1152 aa  2367    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.649165 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4847  glucose-methanol-choline oxidoreductase  88.98 
 
 		 1152 aa  2105    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.000971365  normal  0.0494922 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5113  glucose-methanol-choline oxidoreductase  67.13 
 
 		 1132 aa  1555    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.302627  hitchhiker  0.00736765 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_05037  conserved hypothetical protein  29.73 
 
 		 1146 aa  407  1.0000000000000001e-112  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0214915 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1996  glucose-methanol-choline oxidoreductase  31.35 
 
 		 786 aa  298  4e-79  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0521503  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5037  glucose-methanol-choline oxidoreductase  31.66 
 
 		 572 aa  213  2e-53  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.565725 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3191  cholesterol oxidase  30.94 
 
 		 533 aa  213  2e-53  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000455037 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1255  FAD dependent oxidoreductase  32.3 
 
 		 889 aa  206  2e-51  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4475  GMC oxidoreductase  29.5 
 
 		 554 aa  181  1e-43  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00299763 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3188  hypothetical protein  34.02 
 
 		 342 aa  156  2e-36  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00153473 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2022  putative cholesterol oxidase  28.72 
 
 		 552 aa  142  3e-32  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1417  GMC oxidoreductase family protein  28.72 
 
 		 632 aa  142  3e-32  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3075  GMC oxidoreductase  28.72 
 
 		 632 aa  142  3e-32  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1045  GMC oxidoreductase  28.72 
 
 		 653 aa  142  3.9999999999999997e-32  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.640476  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3202  GMC oxidoreductase  28.72 
 
 		 632 aa  142  3.9999999999999997e-32  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1332  putative cholesterol oxidase  28.72 
 
 		 632 aa  141  6e-32  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2312  GMC oxidoreductase  28.72 
 
 		 632 aa  141  6e-32  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.943263  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2309  iron-sulfur cluster-binding domain-containing protein  28.72 
 
 		 696 aa  139  3.0000000000000003e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0121  glucose-methanol-choline oxidoreductase  28.43 
 
 		 623 aa  139  4e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.412208  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3076  FAD dependent oxidoreductase  27.41 
 
 		 540 aa  137  9.999999999999999e-31  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  decreased coverage  0.00183108  normal  0.66494 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2199  FAD dependent oxidoreductase  29.71 
 
 		 567 aa  136  1.9999999999999998e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1170  FAD dependent oxidoreductase  27.52 
 
 		 591 aa  135  5e-30  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1187  FAD dependent oxidoreductase  27.52 
 
 		 591 aa  135  5e-30  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1197  FAD dependent oxidoreductase  27.52 
 
 		 591 aa  135  5e-30  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.030101 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1204  FAD dependent oxidoreductase  30.11 
 
 		 581 aa  134  1.0000000000000001e-29  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0651029  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1514  FAD dependent oxidoreductase  28.34 
 
 		 578 aa  129  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.384114  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0361  glucose-methanol-choline oxidoreductase  26.43 
 
 		 556 aa  129  3e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.252753 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2922  FAD dependent oxidoreductase  28.48 
 
 		 577 aa  129  4.0000000000000003e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000517221  hitchhiker  0.0000805295 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4906  FAD dependent oxidoreductase  27.3 
 
 		 578 aa  127  9e-28  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.238026  normal  0.475167 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13500  choline dehydrogenase-like flavoprotein  26.93 
 
 		 569 aa  126  3e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1253  esterase/lipase  30.09 
 
 		 354 aa  125  4e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.406302  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3274  glucose-methanol-choline oxidoreductase  33.12 
 
 		 543 aa  124  7e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0584608  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13443  cholesterol oxidase precursor choD  27.8 
 
 		 578 aa  124  9.999999999999999e-27  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0394432  normal  0.107199 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0464  FAD dependent oxidoreductase  26.4 
 
 		 657 aa  123  1.9999999999999998e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.558205  normal  0.214983 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4446  glucose-methanol-choline oxidoreductase  27.63 
 
 		 583 aa  122  4.9999999999999996e-26  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4478  hypothetical protein  29.01 
 
 		 367 aa  122  4.9999999999999996e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.637104  hitchhiker  0.00262511 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3180  glucose-methanol-choline oxidoreductase  33.55 
 
 		 543 aa  121  6e-26  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.550088  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1382  glucose-methanol-choline oxidoreductase  28.97 
 
 		 582 aa  120  9.999999999999999e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.38855  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3081  FAD dependent oxidoreductase  32.59 
 
 		 547 aa  117  1.0000000000000001e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.590232  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1997  AB-hydrolase associated lipase region  30.06 
 
 		 364 aa  115  4.0000000000000004e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0140936  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0546  glucose-methanol-choline oxidoreductase  25.56 
 
 		 535 aa  115  5e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0457672  hitchhiker  0.00344637 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2332  putative cholesterol oxidase  29.54 
 
 		 622 aa  109  3e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6378  glucose-methanol-choline oxidoreductase  26.71 
 
 		 552 aa  108  6e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.216955 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6992  Choline dehydrogenase and related flavoprotein- like protein  24.65 
 
 		 551 aa  107  9e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.175561  normal  0.0479417 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3746  glucose-methanol-choline oxidoreductase  30.94 
 
 		 557 aa  104  1e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1728  FAD dependent oxidoreductase  29.87 
 
 		 587 aa  103  3e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.916893  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4774  Cholesterol oxidase  26.71 
 
 		 530 aa  101  9e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.57937  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3546  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  33.33 
 
 		 567 aa  101  9e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0166931 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2031  glucose-methanol-choline oxidoreductase  31.1 
 
 		 593 aa  101  9e-20  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.394863  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3834  FAD dependent oxidoreductase  29.26 
 
 		 563 aa  100  1e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.551048  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0994  glucose-methanol-choline oxidoreductase  26.29 
 
 		 505 aa  99.8  3e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0279763  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3632  glucose-methanol-choline oxidoreductase  29.9 
 
 		 570 aa  97.8  1e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0664  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  26.1 
 
 		 515 aa  95.5  5e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.414473  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0628  FAD dependent oxidoreductase  27.36 
 
 		 556 aa  94.4  1e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0069  cholesterol oxidase  22.95 
 
 		 534 aa  94.4  1e-17  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4224  FAD dependent oxidoreductase  29.53 
 
 		 564 aa  93.2  2e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.174352 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0908  FAD dependent oxidoreductase  29.41 
 
 		 577 aa  93.2  3e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.294321  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1176  hypothetical protein  32.31 
 
 		 563 aa  92.8  4e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3613  glucose-methanol-choline oxidoreductase  29.71 
 
 		 565 aa  92.4  5e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4246  Cholesterol oxidase  25.93 
 
 		 547 aa  92  6e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.191663 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4226  glucose-methanol-choline oxidoreductase  33.56 
 
 		 546 aa  86.7  0.000000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.130746  normal  0.16895 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3885  glucose-methanol-choline oxidoreductase  24.79 
 
 		 657 aa  83.2  0.00000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0361695  normal  0.12202 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2399  Cholesterol oxidase  31.97 
 
 		 513 aa  82.8  0.00000000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.220854  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2611  cholesterol oxidase  25.68 
 
 		 543 aa  82.4  0.00000000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4248  glucose-methanol-choline oxidoreductase  29.61 
 
 		 586 aa  82.4  0.00000000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00623  long chain fatty alcohol oxidase, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G17110)  24.57 
 
 		 745 aa  82  0.00000000000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.345433  normal  0.817488 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0419  glucose-methanol-choline oxidoreductase  24.23 
 
 		 563 aa  80.9  0.0000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2097  glucose-methanol-choline oxidoreductase  24.01 
 
 		 470 aa  81.3  0.0000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  hitchhiker  0.00213522  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3356  cholesterol oxidase  25.57 
 
 		 544 aa  80.5  0.0000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0318  glucose-methanol-choline oxidoreductase  27.3 
 
 		 537 aa  79.7  0.0000000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4522  glucose-methanol-choline oxidoreductase  24.08 
 
 		 520 aa  78.6  0.0000000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.464516  normal  0.3464 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5469  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  23.56 
 
 		 526 aa  78.2  0.0000000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1198  glucose-methanol-choline oxidoreductase  28.68 
 
 		 506 aa  76.6  0.000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.016113  hitchhiker  0.00093802 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6104  dehydrogenase  24.55 
 
 		 521 aa  75.9  0.000000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1894  glucose-methanol-choline oxidoreductase  24.79 
 
 		 562 aa  74.7  0.000000000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.474294  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4350  glucose-methanol-choline oxidoreductase  24.31 
 
 		 526 aa  73.6  0.00000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4380  alpha/beta hydrolase fold  26.76 
 
 		 357 aa  73.2  0.00000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0826  cholesterol oxidase  24.13 
 
 		 502 aa  73.2  0.00000000003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.492238  unclonable  0.0000140216 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4247  Alpha/beta hydrolase fold-1  26.18 
 
 		 357 aa  73.2  0.00000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.724002  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2425  Cholesterol oxidase  24.32 
 
 		 543 aa  72.4  0.00000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.939121  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2810  cholesterol oxidase  25.04 
 
 		 543 aa  72.4  0.00000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00131697 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2398  Cholesterol oxidase  29.23 
 
 		 538 aa  72  0.00000000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0159697  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4403  alpha/beta hydrolase fold protein  26.76 
 
 		 357 aa  71.6  0.00000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.956683  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10500  oxidoreductase  31.91 
 
 		 629 aa  71.2  0.0000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  6.63635e-27  normal  1 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4037  hypothetical protein  25.17 
 
 		 549 aa  70.5  0.0000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.677701 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3189  hypothetical protein  29.9 
 
 		 210 aa  69.3  0.0000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00130632 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04760  choline dehydrogenase-like flavoprotein  30.77 
 
 		 562 aa  68.2  0.0000000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.633158  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0591  glucose-methanol-choline oxidoreductase  23.89 
 
 		 529 aa  67.8  0.000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.559544 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1208  glucose-methanol-choline oxidoreductase  25.8 
 
 		 559 aa  67  0.000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.397312  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1363  glucose-methanol-choline oxidoreductase  26.87 
 
 		 511 aa  66.2  0.000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0672  glucose-methanol-choline oxidoreductase  22.86 
 
 		 532 aa  65.9  0.000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.482202  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30650  choline dehydrogenase-like flavoprotein  31.65 
 
 		 534 aa  64.7  0.00000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.104777  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2704  glucose-methanol-choline oxidoreductase  29.43 
 
 		 550 aa  64.7  0.00000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.051308  normal  0.893433 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5509  glucose-methanol-choline oxidoreductase  26.12 
 
 		 556 aa  63.5  0.00000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0807117  normal  0.364058 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1064  glucose-methanol-choline oxidoreductase  24.69 
 
 		 525 aa  63.5  0.00000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.113781 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3542  glucose-methanol-choline oxidoreductase  23.22 
 
 		 563 aa  63.2  0.00000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2404  glucose-methanol-choline oxidoreductase  26.39 
 
 		 433 aa  62.8  0.00000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3577  glucose-methanol-choline oxidoreductase  24.59 
 
 		 506 aa  62  0.00000007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0954252  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>