30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_B1762 on replicon NC_007952
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007952  Bxe_B1762  major facilitator superfamily (MFS)transporter  100 
 
 		 401 aa  783    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0112506  normal  0.0259533 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3472  major facilitator superfamily MFS_1  39.95 
 
 		 391 aa  259  6e-68  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.2382  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3249  major facilitator transporter  29.57 
 
 		 385 aa  96.7  6e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0872  major facilitator superfamily MFS_1  26.65 
 
 		 405 aa  76.3  0.000000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0910499  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4481  major facilitator superfamily MFS_1  29.1 
 
 		 391 aa  73.6  0.000000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0180737  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8922  Arabinose efflux permease-like protein  26.4 
 
 		 385 aa  69.7  0.00000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0309  major facilitator superfamily MFS_1  24.16 
 
 		 394 aa  69.7  0.00000000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.265647  normal  0.0116051 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0113  major facilitator transporter  24.18 
 
 		 405 aa  68.6  0.0000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1115  major facilitator superfamily MFS_1  25.31 
 
 		 393 aa  61.2  0.00000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.948444  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4585  major facilitator superfamily MFS_1  28.95 
 
 		 417 aa  58.2  0.0000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1304  major facilitator transporter  28.31 
 
 		 390 aa  55.5  0.000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1662  major facilitator superfamily MFS_1  24.03 
 
 		 388 aa  53.5  0.000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2115  major facilitator transporter  22 
 
 		 386 aa  52.8  0.00001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1174  major facilitator transporter  23.56 
 
 		 389 aa  52  0.00002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8086  major facilitator superfamily MFS_1  29.02 
 
 		 485 aa  51.6  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2967  major facilitator transporter  22.52 
 
 		 392 aa  50.1  0.00007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0299  fucose permease  24.34 
 
 		 408 aa  48.9  0.0001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.482849  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1293  major facilitator superfamily MFS_1  27.5 
 
 		 407 aa  49.3  0.0001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.180985  normal  0.234354 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_59900  predicted protein  26.56 
 
 		 274 aa  49.3  0.0001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.787504  normal  1 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_58946  predicted protein  26.79 
 
 		 419 aa  49.3  0.0001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.314593 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0694  transporter, major facilitator family protein  20.88 
 
 		 393 aa  48.1  0.0003  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2047  major facilitator superfamily MFS_1  27.71 
 
 		 414 aa  47.4  0.0005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1480  major facilitator transporter  24.4 
 
 		 395 aa  47  0.0006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0419  major facilitator transporter  21.32 
 
 		 394 aa  45.1  0.002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.664236  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05760  fucose permease  24.62 
 
 		 414 aa  45.1  0.002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0598938  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1336  major facilitator transporter  25.66 
 
 		 404 aa  44.3  0.003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.160012 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3689  major facilitator transporter  22.31 
 
 		 395 aa  44.3  0.004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.890108  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2533  hypothetical protein  25.61 
 
 		 398 aa  43.9  0.005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0651893  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0878  major facilitator transporter  25.18 
 
 		 401 aa  43.5  0.007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2005  major facilitator transporter  24.42 
 
 		 573 aa  43.5  0.007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.685164  hitchhiker  0.0000601576 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>