More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_B1752 on replicon NC_007952
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007952  Bxe_B1752  oxidoreductase, molybdopterin-binding protein  100 
 
 
258 aa  537  9.999999999999999e-153  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.175218  normal  0.213675 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4930  oxidoreductase molybdopterin binding  96.51 
 
 
258 aa  517  1e-146  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.73484  normal  0.226199 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3725  oxidoreductase molybdopterin binding  71.89 
 
 
255 aa  386  1e-106  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1495  oxidoreductase molybdopterin binding  74.06 
 
 
255 aa  380  1e-104  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3371  oxidoreductase, molybdopterin binding  70.33 
 
 
256 aa  374  1e-103  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0860075  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0541  oxidoreductase, molybdopterin binding  63.49 
 
 
263 aa  346  2e-94  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3600  oxidoreductase, molybdopterin-binding protein  72.56 
 
 
215 aa  345  3e-94  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2730  oxidoreductase, molybdopterin binding  63.49 
 
 
263 aa  345  4e-94  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.195614 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64540  hypothetical protein  71.76 
 
 
255 aa  345  4e-94  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5604  hypothetical protein  71.3 
 
 
255 aa  343  2e-93  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1201  oxidoreductase molybdopterin binding protein  60.41 
 
 
259 aa  338  4e-92  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1510  oxidoreductase molybdopterin binding  59.53 
 
 
262 aa  329  3e-89  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.832441  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2177  putative oxidoreductase, molybdopterin binding  62.76 
 
 
258 aa  327  2.0000000000000001e-88  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.60597 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2666  oxidoreductase molybdopterin binding  60 
 
 
263 aa  325  4.0000000000000003e-88  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1518  oxidoreductase, molybdopterin binding  62.55 
 
 
263 aa  322  5e-87  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0744  oxidoreductase, molybdopterin binding  59.7 
 
 
262 aa  319  3e-86  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1225  oxidoreductase, molybdopterin binding  59.7 
 
 
262 aa  319  3e-86  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1108  oxidoreductase molybdopterin binding  59 
 
 
262 aa  317  9e-86  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.255199  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3085  oxidoreductase, molybdopterin-binding  59.16 
 
 
263 aa  317  1e-85  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0486  oxidoreductase, molybdopterin-binding  59.16 
 
 
263 aa  317  2e-85  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1400  oxidoreductase, molybdopterin-binding  59.16 
 
 
263 aa  317  2e-85  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1201  oxidoreductase, molybdopterin-binding  59.16 
 
 
263 aa  317  2e-85  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.463291  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0666  oxidoreductase, molybdopterin-binding  59.16 
 
 
263 aa  317  2e-85  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.540729  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1198  oxidoreductase molybdopterin binding  58.94 
 
 
262 aa  316  3e-85  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0452128  normal  0.688101 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1405  oxidoreductase, molybdopterin-binding  58.78 
 
 
263 aa  315  4e-85  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1533  oxidoreductase, molybdopterin-binding  58.78 
 
 
263 aa  315  4e-85  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5020  oxidoreductase molybdopterin binding  62.81 
 
 
258 aa  314  7e-85  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.159564 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2840  oxidoreductase, molybdopterin-binding  57.47 
 
 
263 aa  311  5.999999999999999e-84  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4334  oxidoreductase, molybdopterin binding  56.7 
 
 
262 aa  310  1e-83  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.868418  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0620  hypothetical protein  59.84 
 
 
257 aa  310  2e-83  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1108  oxidoreductase, molybdopterin binding  57.03 
 
 
262 aa  309  2e-83  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.906624  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2592  oxidoreductase, molybdopterin binding  62.75 
 
 
262 aa  309  2.9999999999999997e-83  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.938521  normal  0.743537 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6422  oxidoreductase molybdopterin binding  57.66 
 
 
263 aa  305  3e-82  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.603539  normal  0.600006 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1697  oxidoreductase molybdopterin binding  58.9 
 
 
249 aa  305  6e-82  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6764  oxidoreductase molybdopterin binding  59.92 
 
 
257 aa  305  6e-82  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0309  oxidoreductase molybdopterin binding  63.76 
 
 
263 aa  303  2.0000000000000002e-81  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.261244  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2990  oxidoreductase molybdopterin binding  56.81 
 
 
263 aa  303  2.0000000000000002e-81  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.587027  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0297  oxidoreductase molybdopterin binding  60 
 
 
263 aa  301  6.000000000000001e-81  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3134  oxidoreductase molybdopterin binding  60 
 
 
263 aa  300  1e-80  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.219177 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0333  twin-arginine translocation pathway signal  57.38 
 
 
259 aa  298  6e-80  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0338  putative oxidoreductase molybdopterin binding  55.69 
 
 
260 aa  298  6e-80  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  decreased coverage  0.0092485  normal  0.0273242 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0242  twin-arginine translocation pathway signal  56.97 
 
 
259 aa  298  8e-80  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.297118  normal  0.0333661 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0487  twin-arginine translocation pathway signal  59.83 
 
 
259 aa  297  1e-79  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.254321  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3598  oxidoreductase, molybdopterin binding  58.62 
 
 
261 aa  296  3e-79  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0223  oxidoreductase molybdopterin binding  55.51 
 
 
259 aa  295  4e-79  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.613741  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2751  oxidoreductase molybdopterin binding  57.2 
 
 
249 aa  291  6e-78  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0587289 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2994  oxidoreductase, molybdopterin binding  58.72 
 
 
239 aa  278  6e-74  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3286  oxidoreductase molybdopterin binding  52.74 
 
 
241 aa  275  4e-73  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.18954  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4897  oxidoreductase molybdopterin binding  55.7 
 
 
241 aa  270  2e-71  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  decreased coverage  0.00490947  decreased coverage  0.000741335 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0961  oxidoreductase molybdopterin binding  48.83 
 
 
263 aa  260  1e-68  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2349  hypothetical protein  39.76 
 
 
256 aa  172  5e-42  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.672728  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1812  oxidoreductase, molybdopterin binding  39.27 
 
 
249 aa  159  5e-38  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.218509  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0563  oxidoreductase, molybdopterin binding  39.92 
 
 
251 aa  157  1e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.276964  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1625  oxidoreductase molybdopterin binding  37.65 
 
 
256 aa  155  4e-37  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.464814  normal  0.872759 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0864  oxidoreductase molybdopterin binding  36.36 
 
 
259 aa  154  1e-36  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4816  oxidoreductase molybdopterin binding  35.97 
 
 
258 aa  154  1e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.553663  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0958  oxidoreductase, molybdopterin binding  37.55 
 
 
240 aa  152  4e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4106  oxidoreductase molybdopterin binding  36.68 
 
 
262 aa  152  5.9999999999999996e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2568  oxidoreductase molybdopterin binding  35.18 
 
 
258 aa  152  5.9999999999999996e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0385834  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3628  oxidoreductase molybdopterin binding  37.5 
 
 
234 aa  148  8e-35  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0640094 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1638  oxidoreductase molybdopterin binding  37.66 
 
 
234 aa  148  1.0000000000000001e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.934019  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1560  oxidoreductase molybdopterin binding  36.8 
 
 
234 aa  147  2.0000000000000003e-34  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2311  molybdopterin-binding oxidoreductase  37.66 
 
 
234 aa  145  5e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0018  oxidoreductase, molybdopterin-binding  35.27 
 
 
262 aa  143  2e-33  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0015  oxidoreductase, molybdopterin-binding  35.27 
 
 
262 aa  144  2e-33  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.642429  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0491  oxidoreductase, molybdopterin binding  35.74 
 
 
256 aa  143  3e-33  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.727181  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4346  oxidoreductase, molybdopterin binding  40.58 
 
 
233 aa  133  1.9999999999999998e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.315393  normal  0.221875 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4164  oxidoreductase molybdopterin binding  35.66 
 
 
234 aa  130  2.0000000000000002e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.430302 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4154  oxidoreductase molybdopterin binding  33.47 
 
 
247 aa  125  8.000000000000001e-28  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.177098  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3845  oxidoreductase molybdopterin binding  33.47 
 
 
247 aa  125  8.000000000000001e-28  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.624438  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3943  oxidoreductase, molybdopterin binding  36.79 
 
 
253 aa  121  9.999999999999999e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.646893 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4302  oxidoreductase molybdopterin binding  30.92 
 
 
247 aa  119  7e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2730  oxidoreductase, molybdopterin binding protein  36.41 
 
 
495 aa  107  2e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0908687  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4244  oxidoreductase molybdopterin binding protein  34.25 
 
 
266 aa  100  2e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.978688  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0650  oxidoreductase, molybdopterin binding  31.22 
 
 
237 aa  99  6e-20  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0972302  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0584  oxidoreductase molybdopterin binding protein  33.14 
 
 
501 aa  98.2  1e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3632  oxidoreductase molybdopterin binding  37.5 
 
 
315 aa  96.7  3e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.363586 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3309  oxidoreductase molybdopterin binding  37.5 
 
 
315 aa  96.7  3e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.62654 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5386  oxidoreductase molybdopterin binding protein  31.65 
 
 
243 aa  95.1  1e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.406653  normal  0.237779 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0316  oxidoreductase, molybdopterin binding  33.75 
 
 
517 aa  92.8  5e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0663  oxidoreductase, molybdopterin binding  34.84 
 
 
229 aa  91.3  1e-17  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000387868  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1008  oxidoreductase molybdopterin binding  36.97 
 
 
319 aa  90.9  2e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.700197  normal  0.289957 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3509  oxidoreductase molybdopterin binding  35.16 
 
 
318 aa  89.7  4e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0938  oxidoreductase molybdopterin binding protein  30.13 
 
 
199 aa  89.4  5e-17  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.378305  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1564  putative sulfite oxidase subunit YedY  33.51 
 
 
311 aa  89.7  5e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0532333  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0713  putative sulfite oxidase subunit YedY  31.82 
 
 
332 aa  88.6  9e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.348188 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3066  oxidoreductase molybdopterin binding protein  32.08 
 
 
465 aa  88.2  1e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.419919  normal  0.473348 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1013  putative sulfite oxidase subunit YedY  30.43 
 
 
313 aa  87.8  2e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.300604 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0693  putative sulfite oxidase subunit YedY  31.31 
 
 
332 aa  86.7  3e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2981  putative sulfite oxidase subunit YedY  32.32 
 
 
331 aa  86.7  3e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0987  putative sulfite oxidase subunit YedY  31.82 
 
 
331 aa  86.7  3e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.273453  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2817  putative sulfite oxidase subunit YedY  32.53 
 
 
301 aa  86.7  4e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.333802  normal  0.368407 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0157  putative sulfite oxidase subunit YedY  28.57 
 
 
321 aa  85.9  6e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.337145 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1410  putative sulfite oxidase subunit YedY  30.89 
 
 
301 aa  85.5  8e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0368  putative sulfite oxidase subunit YedY  31.63 
 
 
320 aa  84.7  0.000000000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0077  putative sulfite oxidase subunit YedY  31.11 
 
 
301 aa  84.3  0.000000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3571  oxidoreductase molybdopterin binding protein  30.67 
 
 
232 aa  84.3  0.000000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1007  putative sulfite oxidase subunit YedY  28.65 
 
 
318 aa  84  0.000000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0460692  normal  0.0531219 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3141  putative sulfite oxidase subunit YedY  30.37 
 
 
334 aa  83.6  0.000000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.258907  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1488  oxidoreductase molybdopterin binding  29.33 
 
 
218 aa  83.6  0.000000000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.725964  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>