More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_B1693 on replicon NC_007952
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007952  Bxe_B1693  putative hydrolase  100 
 
 		 272 aa  556  1e-157  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.800205 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4957  alpha/beta hydrolase fold  94.85 
 
 		 272 aa  526  1e-148  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.174321  normal  0.0565751 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3261  alpha/beta hydrolase fold protein  76.75 
 
 		 272 aa  435  1e-121  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.767293  normal  0.718789 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6254  alpha/beta hydrolase fold protein  59.47 
 
 		 277 aa  325  4.0000000000000003e-88  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3137  alpha/beta hydrolase fold  58.94 
 
 		 271 aa  302  4.0000000000000003e-81  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2524  alpha/beta hydrolase fold  58.94 
 
 		 271 aa  302  5.000000000000001e-81  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.191212  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3153  alpha/beta hydrolase fold  59.32 
 
 		 271 aa  300  2e-80  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0769848 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6488  Alpha/beta hydrolase  57.79 
 
 		 271 aa  298  8e-80  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.642032 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3075  alpha/beta hydrolase fold  57.41 
 
 		 267 aa  296  2e-79  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.260909 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3192  alpha/beta hydrolase fold  57.41 
 
 		 267 aa  294  9e-79  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.421689  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2266  alpha/beta hydrolase fold protein  52.24 
 
 		 274 aa  276  3e-73  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.620512 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1418  alpha/beta hydrolase fold protein  50.38 
 
 		 276 aa  264  1e-69  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.961025  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1065  alpha/beta hydrolase fold  46.99 
 
 		 275 aa  251  9.000000000000001e-66  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.289777  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2806  alpha/beta hydrolase fold protein  44.36 
 
 		 284 aa  233  3e-60  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.645937  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0990  alpha/beta hydrolase fold  41.6 
 
 		 298 aa  194  1e-48  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15020  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  42.86 
 
 		 297 aa  185  5e-46  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.232435  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0074  alpha/beta hydrolase fold  25.49 
 
 		 275 aa  107  3e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.224768  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2354  alpha/beta hydrolase fold protein  30.8 
 
 		 279 aa  106  5e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0658883  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2899  alpha/beta hydrolase fold protein  30.8 
 
 		 283 aa  99  8e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1108  alpha/beta hydrolase fold  29.13 
 
 		 246 aa  94.7  2e-18  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.00367251  hitchhiker  0.00365287 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0627  Alpha/beta hydrolase  31.39 
 
 		 289 aa  91.7  1e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.355065 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4283  alpha/beta hydrolase fold  31.62 
 
 		 300 aa  89  8e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3235  alpha/beta hydrolase fold  26.02 
 
 		 316 aa  86.7  3e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.423188  normal  0.602457 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2200  alpha/beta hydrolase fold protein  25.75 
 
 		 278 aa  85.1  0.000000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5036  hydrolase, alpha/beta fold family  25.69 
 
 		 279 aa  81.3  0.00000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0234  hypothetical protein  27.43 
 
 		 330 aa  80.9  0.00000000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.833519 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5931  alpha/beta hydrolase fold  29.15 
 
 		 261 aa  80.5  0.00000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0123978 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3515  alpha/beta hydrolase fold  24.51 
 
 		 279 aa  80.5  0.00000000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4774  alpha/beta fold family hydrolase  25.3 
 
 		 279 aa  80.1  0.00000000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4614  alpha/beta hydrolase fold protein  25.3 
 
 		 279 aa  80.1  0.00000000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4636  alpha/beta hydrolase fold protein  25.3 
 
 		 279 aa  80.1  0.00000000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5136  alpha/beta fold family hydrolase  25.3 
 
 		 279 aa  80.1  0.00000000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5015  hydrolase, alpha/beta fold family  25.3 
 
 		 279 aa  80.1  0.00000000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09470  Alpha/beta hydrolase fold protein  29.01 
 
 		 290 aa  79.7  0.00000000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.688745  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2916  alpha/beta hydrolase fold protein  25.52 
 
 		 284 aa  80.1  0.00000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5043  alpha/beta fold family hydrolase  25.49 
 
 		 279 aa  79.7  0.00000000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0269  hypothetical protein  26.22 
 
 		 293 aa  79.3  0.00000000000006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4726  alpha/beta hydrolase fold  25.1 
 
 		 279 aa  79  0.00000000000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1052  alpha/beta fold family hydrolase  27.13 
 
 		 302 aa  78.2  0.0000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12729  hydrolase  26.64 
 
 		 341 aa  78.2  0.0000000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5048  hydrolase, alpha/beta fold family  25.3 
 
 		 279 aa  78.6  0.0000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0198  hydrolase, alpha/beta fold family  24.9 
 
 		 279 aa  78.6  0.0000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1023  alpha/beta hydrolase fold  29.08 
 
 		 284 aa  78.6  0.0000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0350  alpha/beta hydrolase fold protein  27.43 
 
 		 308 aa  78.6  0.0000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.931364 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1988  alpha/beta hydrolase superfamily protein  27.05 
 
 		 321 aa  77  0.0000000000003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.150126 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0672  alpha/beta hydrolase fold  26.84 
 
 		 315 aa  77  0.0000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.240082 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0321  alpha/beta hydrolase fold protein  27.05 
 
 		 312 aa  76.6  0.0000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1248  alpha/beta hydrolase fold-containing protein  26.57 
 
 		 311 aa  76.3  0.0000000000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2912  alpha/beta hydrolase fold  28.02 
 
 		 295 aa  75.9  0.0000000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00287314  normal  0.0690104 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2445  alpha/beta hydrolase fold  26.2 
 
 		 340 aa  75.5  0.0000000000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.54824  normal  0.191947 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4681  alpha/beta hydrolase fold protein  26.47 
 
 		 333 aa  73.9  0.000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3922  Alpha/beta hydrolase fold  27.21 
 
 		 291 aa  73.9  0.000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.505455  normal  1 
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_13371  predicted protein  26.89 
 
 		 323 aa  73.9  0.000000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.014385  normal  0.0363767 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1955  Alpha/beta hydrolase fold  25.29 
 
 		 339 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0521356  normal  0.151931 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1079  alpha/beta hydrolase fold  22.99 
 
 		 283 aa  74.7  0.000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.622662  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0726  Alpha/beta hydrolase fold  25.81 
 
 		 297 aa  73.6  0.000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.418477  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2302  alpha/beta hydrolase fold  24.42 
 
 		 329 aa  73.6  0.000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4608  alpha/beta hydrolase fold  41 
 
 		 301 aa  73.9  0.000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.692037  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4484  alpha/beta hydrolase fold  40 
 
 		 301 aa  73.9  0.000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2350  alpha/beta hydrolase fold  26.82 
 
 		 298 aa  73.6  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2964  alpha/beta hydrolase fold  26.82 
 
 		 298 aa  73.6  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.391734  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2565  alpha/beta hydrolase fold protein  26.47 
 
 		 287 aa  73.2  0.000000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0288912  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10077  oxidoreductase  26.52 
 
 		 276 aa  73.6  0.000000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.101689 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2985  alpha/beta hydrolase fold  26.82 
 
 		 298 aa  73.2  0.000000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1797  alpha/beta hydrolase fold  25.87 
 
 		 282 aa  72.8  0.000000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.696369  normal  0.363758 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2172  alpha/beta hydrolase fold  25.65 
 
 		 340 aa  72.8  0.000000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2161  alpha/beta hydrolase fold  25.65 
 
 		 340 aa  72.8  0.000000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.170083  hitchhiker  0.00519685 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2218  alpha/beta hydrolase fold  25.65 
 
 		 340 aa  72.8  0.000000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.158046  normal  0.0966577 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0102  alpha/beta hydrolase fold protein  26.64 
 
 		 289 aa  72.4  0.000000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4624  alpha/beta fold family hydrolase  39 
 
 		 299 aa  72.4  0.000000000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.186809  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0902  Alpha/beta hydrolase fold  25.27 
 
 		 300 aa  72.4  0.000000000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.685434 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6314  Alpha/beta hydrolase  26.82 
 
 		 298 aa  72  0.000000000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3237  alpha/beta hydrolase fold protein  24.83 
 
 		 284 aa  71.6  0.00000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2446  alpha/beta hydrolase fold protein  29.85 
 
 		 309 aa  72  0.00000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.969901  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0535  alpha/beta hydrolase fold  26.96 
 
 		 298 aa  72  0.00000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5789  alpha/beta hydrolase fold protein  29.74 
 
 		 306 aa  72  0.00000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.435373  normal  0.0718304 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1222  Alpha/beta hydrolase fold  21.18 
 
 		 262 aa  70.9  0.00000000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3600  alpha/beta hydrolase fold  25.88 
 
 		 333 aa  70.5  0.00000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3664  alpha/beta hydrolase fold protein  26.22 
 
 		 350 aa  70.1  0.00000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0814  alpha/beta hydrolase fold  38 
 
 		 301 aa  70.1  0.00000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4012  Alpha/beta hydrolase  28.06 
 
 		 296 aa  70.1  0.00000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0123555 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1114  alpha/beta hydrolase fold  38.18 
 
 		 405 aa  70.1  0.00000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.060895  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2443  alpha/beta hydrolase fold  28.51 
 
 		 275 aa  70.1  0.00000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.752916  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1408  alpha/beta hydrolase fold protein  25.97 
 
 		 421 aa  69.7  0.00000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.259617 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3767  alpha/beta hydrolase fold  27.9 
 
 		 296 aa  69.3  0.00000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0136912 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3014  alpha/beta hydrolase fold protein  24.62 
 
 		 340 aa  68.9  0.00000000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2960  alpha/beta hydrolase fold  26.82 
 
 		 298 aa  68.9  0.00000000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03823  Alpha/beta hydrolase fold protein  24.7 
 
 		 310 aa  68.9  0.00000000008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1637  alpha/beta hydrolase fold  24.61 
 
 		 287 aa  68.9  0.00000000008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1331  Alpha/beta hydrolase fold  25.1 
 
 		 278 aa  68.9  0.00000000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000258733 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2875  alpha/beta hydrolase fold  26.71 
 
 		 298 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_5003  hypothetical protein  24.73 
 
 		 305 aa  68.2  0.0000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.219261  hitchhiker  0.00420621 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0430  alpha/beta hydrolase fold protein  26.02 
 
 		 296 aa  68.6  0.0000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4298  alpha/beta hydrolase fold  27.17 
 
 		 288 aa  68.2  0.0000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3012  alpha/beta hydrolase fold  26.37 
 
 		 298 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3361  alpha/beta hydrolase fold  24.62 
 
 		 340 aa  68.6  0.0000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.013073  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1660  putative alpha/beta hydrolase  27 
 
 		 319 aa  67.4  0.0000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1611  haloalkane dehalogenase  25.27 
 
 		 301 aa  67.4  0.0000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2276  alpha/beta hydrolase fold protein  23.37 
 
 		 305 aa  67  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0552  alpha/beta hydrolase fold protein  26.07 
 
 		 294 aa  67  0.0000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>