49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_B1660 on replicon NC_007952
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007952  Bxe_B1660  putative peptidoglycan-binding LysM  100 
 
 		 484 aa  963    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0342216 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4992  putative peptidoglycan-binding LysM  85.54 
 
 		 484 aa  810    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.911035  normal  0.0172735 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2637  LysM domain-containing protein  52.97 
 
 		 454 aa  443  1e-123  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0923  LysM domain-containing protein  53.02 
 
 		 454 aa  440  9.999999999999999e-123  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0737  LysM domain-containing protein  53.02 
 
 		 448 aa  441  9.999999999999999e-123  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.990238  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1687  lysM domain-containing protein  53.02 
 
 		 454 aa  440  9.999999999999999e-123  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.482886  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1665  lysM domain-containing protein  53.02 
 
 		 454 aa  440  9.999999999999999e-123  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0426  LysM domain-containing protein  53.02 
 
 		 448 aa  441  9.999999999999999e-123  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.718442  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1456  LysM domain-containing protein  53.02 
 
 		 448 aa  441  9.999999999999999e-123  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1842  LysM domain-containing protein  52.79 
 
 		 454 aa  437  1e-121  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1878  peptidoglycan-binding LysM  52.58 
 
 		 446 aa  424  1e-117  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0622625 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1356  peptidoglycan-binding LysM  52.69 
 
 		 453 aa  423  1e-117  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.53849  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1317  peptidoglycan-binding LysM  52.69 
 
 		 453 aa  422  1e-117  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0955  peptidoglycan-binding LysM  53.05 
 
 		 453 aa  421  1e-116  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.310452  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1437  peptidoglycan-binding LysM  53.05 
 
 		 453 aa  421  1e-116  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4581  peptidoglycan-binding LysM  53.16 
 
 		 453 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0994346  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1415  peptidoglycan-binding LysM  52.58 
 
 		 453 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1074  signal peptide protein  31.85 
 
 		 568 aa  137  3.0000000000000003e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.107534  normal  0.60277 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4163  hypothetical protein  29.48 
 
 		 556 aa  133  6.999999999999999e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.868125  normal  0.304031 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0431  peptidoglycan-binding LysM  26.44 
 
 		 543 aa  130  7.000000000000001e-29  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000410197  normal  0.723763 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2531  peptidoglycan-binding LysM  28.7 
 
 		 548 aa  128  3e-28  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.796598  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2915  Peptidoglycan-binding LysM  29.27 
 
 		 566 aa  124  6e-27  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1169  peptidoglycan-binding LysM  30.88 
 
 		 554 aa  123  8e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.0000000824633  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4942  peptidoglycan-binding LysM  31.71 
 
 		 558 aa  120  3.9999999999999996e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1005  Peptidoglycan-binding LysM  29.71 
 
 		 559 aa  120  4.9999999999999996e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0784845  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4741  peptidoglycan-binding LysM  30.06 
 
 		 394 aa  120  6e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5417  peptidoglycan-binding LysM  29.36 
 
 		 591 aa  119  9e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0582  hypothetical protein  30.15 
 
 		 463 aa  117  6e-25  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000319564  normal  0.0200907 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0940  Peptidoglycan-binding LysM  29.51 
 
 		 559 aa  114  6e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.147374 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1070  hypothetical protein  34.51 
 
 		 335 aa  102  2e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11650  hypothetical protein  33.72 
 
 		 333 aa  100  5e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.220034  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0334  hypothetical protein  33.91 
 
 		 664 aa  64.3  0.000000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0038  putative periplasmic protein  33.05 
 
 		 290 aa  62.8  0.00000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0958409  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0282  anti-FecI sigma factor, FecR  38.89 
 
 		 1381 aa  61.2  0.00000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0299  anti-FecI sigma factor, FecR  35.83 
 
 		 1334 aa  58.2  0.0000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1970  hypothetical protein  26.09 
 
 		 348 aa  55.1  0.000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000904058  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18170  hypothetical protein  29.85 
 
 		 378 aa  52.8  0.00001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000581203  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0012  hypothetical protein  29.51 
 
 		 717 aa  51.6  0.00003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2166  Peptidoglycan-binding lysin domain protein  40.98 
 
 		 954 aa  50.8  0.00006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.16902  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1219  hypothetical protein  26.24 
 
 		 586 aa  50.4  0.00007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2196  hypothetical protein  29.17 
 
 		 213 aa  49.7  0.0001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.596477 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0378  hypothetical protein  30.71 
 
 		 292 aa  48.5  0.0002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1985  hypothetical protein  26.4 
 
 		 924 aa  48.5  0.0003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.063002  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2717  hypothetical protein  26.56 
 
 		 412 aa  48.5  0.0003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.920172  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0473  hypothetical protein  30.3 
 
 		 238 aa  47  0.0008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.408859  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1523  hypothetical protein  25.21 
 
 		 412 aa  47  0.0009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.03932e-19 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1557  peptidoglycan-binding LysM  37.5 
 
 		 517 aa  46.2  0.001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2621  hypothetical protein  29.63 
 
 		 287 aa  45.4  0.002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.829749  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3821  peptidoglycan-binding LysM  52.38 
 
 		 229 aa  43.9  0.006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.018492  normal  0.0696013 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>