More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_B1602 on replicon NC_007952
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010676  Bphyt_5046  transcriptional regulator, AraC family  97.5 
 
 		 360 aa  721    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.311453 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1602  transcriptional regulator  100 
 
 		 360 aa  738    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3335  AraC family transcriptional regulator  84.31 
 
 		 361 aa  625  1e-178  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.519645 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3502  AraC family transcriptional regulator  80.29 
 
 		 355 aa  577  1e-164  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5126  AraC family transcriptional regulator  80.99 
 
 		 357 aa  575  1.0000000000000001e-163  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5153  AraC family transcriptional regulator  81.29 
 
 		 360 aa  576  1.0000000000000001e-163  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5071  AraC family transcriptional regulator  81.55 
 
 		 357 aa  571  1.0000000000000001e-162  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.509382  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3214  AraC family transcriptional regulator  80.99 
 
 		 360 aa  573  1.0000000000000001e-162  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4548  AraC family transcriptional regulator  81.55 
 
 		 357 aa  571  1.0000000000000001e-162  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0484  transcriptional regulator  82.73 
 
 		 356 aa  570  1e-161  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4832  transcriptional regulator  79.76 
 
 		 393 aa  564  1e-160  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.304205  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1956  transcriptional regulator  82.92 
 
 		 396 aa  561  1.0000000000000001e-159  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.976768  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0397  AraC/XylS family transcription factor  82.92 
 
 		 396 aa  561  1.0000000000000001e-159  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1864  AraC family transcriptional regulator  82.92 
 
 		 410 aa  561  1.0000000000000001e-159  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.191613  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0994  AraC family transcriptional regulator  81.9 
 
 		 462 aa  560  1e-158  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1098  transcriptional regulatory DNA-binding transcription regulator protein  82.52 
 
 		 360 aa  557  1e-157  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.265022 
 
 
-
 
NC_003296  RS02019  transcription regulator protein  78.07 
 
 		 387 aa  557  1e-157  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6861  AraC family transcriptional regulator  74.92 
 
 		 350 aa  528  1e-149  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.133867  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6279  AraC family transcriptional regulator  71.09 
 
 		 338 aa  514  1.0000000000000001e-145  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.147886  normal  0.656807 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0872  AraC family transcriptional regulator  46.65 
 
 		 382 aa  290  3e-77  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2953  helix-turn-helix domain-containing protein  44.04 
 
 		 349 aa  286  4e-76  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.851486 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2118  HTH-type transcriptional regulator  42.86 
 
 		 328 aa  278  1e-73  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1004  AraC family transcriptional regulator  45.03 
 
 		 351 aa  272  7e-72  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.429935  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0590  transcriptional regulator  42.06 
 
 		 347 aa  266  5e-70  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8583  transcriptional regulator, AraC family  42.09 
 
 		 331 aa  253  4.0000000000000004e-66  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.834372  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3318  AraC family transcriptional regulator  39.34 
 
 		 345 aa  247  3e-64  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4842  transcriptional regulator, AraC family  40.19 
 
 		 337 aa  239  4e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.195064 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5286  transcriptional regulator, AraC family  39.2 
 
 		 337 aa  232  8.000000000000001e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.371656  normal  0.135191 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7250  transcriptional regulator AraC family  39.5 
 
 		 332 aa  222  7e-57  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.76914  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1392  transcriptional regulator  37.9 
 
 		 339 aa  215  9.999999999999999e-55  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.683187  normal  0.572085 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4230  transcriptional regulator, AraC family  34.51 
 
 		 363 aa  206  4e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3159  AraC family transcriptional regulator  35.15 
 
 		 334 aa  199  7e-50  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0609208 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4575  transcriptional regulator  37.08 
 
 		 326 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3514  transcriptional regulator  35.15 
 
 		 334 aa  197  3e-49  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.505982  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2210  AraC family transcriptional regulator  37.74 
 
 		 325 aa  193  4e-48  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3564  AraC family transcriptional regulator  37.42 
 
 		 325 aa  191  2e-47  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2481  AraC family transcriptional regulator  37.96 
 
 		 331 aa  191  2e-47  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.25538 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2357  AraC family transcriptional regulator  36.48 
 
 		 332 aa  189  5.999999999999999e-47  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.385281  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0814  AraC family transcriptional regulator  35.28 
 
 		 343 aa  186  4e-46  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4809  transcriptional regulator  35.51 
 
 		 331 aa  181  1e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.193614  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2455  transcriptional regulator, AraC family  33.23 
 
 		 351 aa  181  2.9999999999999997e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.979358  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0307  AraC family transcriptional regulator  33.02 
 
 		 338 aa  175  8e-43  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.96292  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0400  AraC family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 336 aa  175  8e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0116  transcriptional regulator, AraC family  32.92 
 
 		 351 aa  174  1.9999999999999998e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.615337  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0968  AraC family transcriptional regulator  33.75 
 
 		 332 aa  174  2.9999999999999996e-42  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0321  AraC family transcriptional regulator  32.82 
 
 		 336 aa  171  2e-41  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.5557  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0448  AraC family transcriptional regulator  33.12 
 
 		 332 aa  169  8e-41  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1931  AraC family transcriptional regulator  33.12 
 
 		 332 aa  169  8e-41  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.746291  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3921  transcriptional regulator, AraC family  32.2 
 
 		 327 aa  168  1e-40  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.441659  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0566  AraC family transcriptional regulator  33.12 
 
 		 332 aa  168  2e-40  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.207783  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2025  AraC family transcriptional regulator  33.12 
 
 		 332 aa  168  2e-40  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1687  AraC family transcriptional regulator  30.56 
 
 		 345 aa  168  2e-40  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0447832  normal  0.915417 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0901  AraC family transcriptional regulator  33.12 
 
 		 332 aa  168  2e-40  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1868  AraC family transcriptional regulator  33.12 
 
 		 332 aa  168  2e-40  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4565  AraC family transcriptional regulator  32.71 
 
 		 332 aa  166  4e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.644708 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5090  AraC family transcriptional regulator  32.71 
 
 		 332 aa  166  4e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.893585 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4021  AraC family transcriptional regulator  30 
 
 		 353 aa  164  2.0000000000000002e-39  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.322888  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3487  AraC family transcriptional regulator  32.4 
 
 		 332 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.1866 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0457  transcriptional regulator  33.13 
 
 		 332 aa  164  3e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.99008  normal  0.0292699 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3448  AraC family transcriptional regulator  33.86 
 
 		 325 aa  162  7e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5109  AraC family transcriptional regulator  33.13 
 
 		 332 aa  162  1e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.771046  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5170  AraC family transcriptional regulator  33.13 
 
 		 355 aa  162  1e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0119945  normal  0.398909 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5042  transcriptional regulator, AraC family  34.39 
 
 		 332 aa  162  1e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.363358  normal  0.505144 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3197  AraC family transcriptional regulator  33.13 
 
 		 355 aa  162  1e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1614  transcriptional regulator  34.18 
 
 		 332 aa  161  2e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02043  transcriptional regulator transcription regulator protein  32.8 
 
 		 334 aa  156  5.0000000000000005e-37  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02029  transcriptional regulator transcription regulator protein  33.75 
 
 		 343 aa  153  4e-36  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.130887 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1100  AraC family transcriptional regulator  31.87 
 
 		 334 aa  153  5e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0397278 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5199  AraC family transcriptional regulator  32.94 
 
 		 341 aa  152  8.999999999999999e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2664  AraC family transcriptional regulator  29.13 
 
 		 368 aa  150  2e-35  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0165303  normal  0.567946 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5086  AraC family transcriptional regulator  32.94 
 
 		 371 aa  150  2e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.754601 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3282  AraC family transcriptional regulator  32.94 
 
 		 371 aa  150  2e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1586  transcriptional regulator  32.81 
 
 		 333 aa  150  3e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4823  transcriptional regulator  32.93 
 
 		 338 aa  149  6e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0570  transcriptional regulator  32.74 
 
 		 371 aa  149  6e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5062  transcriptional regulator, AraC family  32.5 
 
 		 331 aa  149  6e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.652687  normal  0.0215007 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4498  AraC family transcriptional regulator  33.02 
 
 		 340 aa  149  7e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5023  AraC family transcriptional regulator  33.02 
 
 		 341 aa  149  1.0000000000000001e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3545  AraC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 341 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3767  transcriptional regulator  30 
 
 		 371 aa  149  1.0000000000000001e-34  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4290  AraC family transcriptional regulator  32.92 
 
 		 347 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1869  AraC family transcriptional regulator  33.02 
 
 		 341 aa  147  3e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0987  transcriptional regulator  30.79 
 
 		 375 aa  147  4.0000000000000006e-34  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1001  AraC family transcriptional regulator  31.87 
 
 		 324 aa  146  5e-34  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0569552  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1156  AraC family transcriptional regulator  32.62 
 
 		 346 aa  146  5e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.131612 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2849  AraC family transcription regulator  32.83 
 
 		 348 aa  146  5e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1178  AraC family transcriptional regulator  32.62 
 
 		 346 aa  146  5e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1774  AraC family transcriptional regulator  32.34 
 
 		 347 aa  146  5e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0699  AraC family transcriptional regulator  32.62 
 
 		 346 aa  146  5e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.577114  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2788  AraC family transcriptional regulator  32.83 
 
 		 345 aa  146  6e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2729  AraC family transcription regulator  32.83 
 
 		 345 aa  146  6e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1270  transcriptional regulator  28.74 
 
 		 334 aa  145  9e-34  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.314543  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1057  AraC family transcriptional regulator  32.31 
 
 		 346 aa  145  9e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0171524  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1980  AraC family transcriptional regulator  32.71 
 
 		 341 aa  145  1e-33  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.433985  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2238  AraC family transcriptional regulator  32.29 
 
 		 330 aa  145  1e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.390455  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0469  AraC family transcriptional regulator  32.71 
 
 		 369 aa  145  1e-33  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0490  transcriptional regulator  31.43 
 
 		 364 aa  145  1e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1007  AraC family transcriptional regulator  32.71 
 
 		 365 aa  145  1e-33  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.809611  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0711  AraC family transcriptional regulator  32.71 
 
 		 341 aa  145  1e-33  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0739  AraC family transcriptional regulator  32.71 
 
 		 365 aa  145  1e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>