146 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_B1464 on replicon NC_007952
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007952  Bxe_B1464  putative globin  100 
 
 
139 aa  288  1e-77  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00251248 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2346  globin  76.8 
 
 
142 aa  204  3e-52  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.636016  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0132  globin  65 
 
 
144 aa  158  3e-38  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.823311 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3650  globin  60.77 
 
 
141 aa  157  5e-38  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.260647 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0410  globin  57.89 
 
 
144 aa  153  7e-37  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.236118 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5890  putative hemoglobin protein (truncated hemoglobin)  55.65 
 
 
152 aa  144  3e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.429127  normal  0.556027 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1767  globin  58.82 
 
 
137 aa  139  9.999999999999999e-33  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2090  putative oxygen-binding protein (globin)  51.24 
 
 
134 aa  126  1.0000000000000001e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0935  hypothetical protein  45.26 
 
 
139 aa  126  1.0000000000000001e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3955  globin  47.97 
 
 
128 aa  126  1.0000000000000001e-28  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.405628  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1355  globin  46.03 
 
 
129 aa  125  3e-28  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.610023  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1667  globin  47.97 
 
 
136 aa  124  4.0000000000000003e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.291446  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2279  globin  47.97 
 
 
136 aa  124  4.0000000000000003e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1030  hypothetical protein  48.78 
 
 
164 aa  124  6e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3254  globin  52.07 
 
 
134 aa  123  7e-28  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.512401  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0774  putative oxygen-binding protein (globin)  48.78 
 
 
126 aa  123  8.000000000000001e-28  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.207145 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2317  globin  47.97 
 
 
136 aa  122  1e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1917  globin  49.17 
 
 
134 aa  122  1e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.626219  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2018  globin  48.06 
 
 
133 aa  122  1e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0697  globin  50 
 
 
142 aa  123  1e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.462727 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2195  globin  47.97 
 
 
136 aa  122  1e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1867  hypothetical protein  48.78 
 
 
148 aa  122  2e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1401  hypothetical protein  48.78 
 
 
148 aa  122  2e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3244  putative oxygen-binding protein, globin-like  48.76 
 
 
137 aa  121  2e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1095  hypothetical protein  48.78 
 
 
136 aa  122  2e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0772  hypothetical protein  48.78 
 
 
136 aa  122  2e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1253  hypothetical protein  48.78 
 
 
136 aa  122  2e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1261  hypothetical protein  48.78 
 
 
136 aa  122  2e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.100755  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0378  hypothetical protein  48.78 
 
 
136 aa  122  2e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.746099  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2241  globin  49.17 
 
 
134 aa  122  2e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.723886  normal  0.694262 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5606  globin-like protein  47.15 
 
 
136 aa  121  3e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.62023  normal  0.960923 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2781  globin  46.27 
 
 
141 aa  121  3e-27  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.778315  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0999  globin  47.15 
 
 
136 aa  121  3e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0834187  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2302  globin  47.15 
 
 
136 aa  121  3e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3454  globin  48.36 
 
 
141 aa  121  4e-27  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.273084  normal  0.734777 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1316  globin  47.93 
 
 
137 aa  120  5e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.129637 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1997  hypothetical protein  45.08 
 
 
129 aa  120  6e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.174841  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2049  globin  45.38 
 
 
141 aa  119  9.999999999999999e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.366529  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0899  globin  43.88 
 
 
147 aa  118  1.9999999999999998e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0847  globin  48.06 
 
 
143 aa  117  3.9999999999999996e-26  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1800  globin family protein  47.93 
 
 
128 aa  117  4.9999999999999996e-26  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4036  globin  46.51 
 
 
139 aa  117  4.9999999999999996e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1256  globin  47.15 
 
 
137 aa  117  7e-26  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.331075 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1878  hypothetical protein  48.76 
 
 
131 aa  114  3.9999999999999997e-25  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2697  putative globin  43.38 
 
 
136 aa  112  1.0000000000000001e-24  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3147  conserved hypothetical globin-like protein  48.74 
 
 
129 aa  112  2.0000000000000002e-24  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0120923  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0945  globin  46.85 
 
 
166 aa  111  3e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.286317  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2330  globin  45.08 
 
 
130 aa  109  1.0000000000000001e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.260372  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1548  heme-binding protein, putative  45.6 
 
 
130 aa  108  3e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1263  globin  45.6 
 
 
129 aa  108  3e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.932923 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1243  globin  45 
 
 
133 aa  102  2e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0783  globin  44.17 
 
 
133 aa  100  8e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.259249 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3728  globin  39.1 
 
 
142 aa  99.4  1e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.325061  hitchhiker  0.00731261 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3010  globin  42.62 
 
 
136 aa  99.4  2e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3538  globin  44.27 
 
 
142 aa  97.8  4e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.637564  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1225  globin  44.83 
 
 
125 aa  98.2  4e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0341074  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0031  globin  37.4 
 
 
144 aa  97.1  7e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0030771  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4060  globin family  41.94 
 
 
145 aa  97.1  8e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.171574 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3913  globin  44.27 
 
 
142 aa  96.3  1e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.237071 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0031  globin  34.81 
 
 
156 aa  95.1  3e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000058274  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1626  globin  40.65 
 
 
137 aa  94.7  4e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5317  globin  41.73 
 
 
139 aa  94  5e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0702045  normal  0.216575 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3261  globin  40.16 
 
 
136 aa  94  6e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.4456 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0771  globin  39.02 
 
 
137 aa  94  7e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4636  globin  40.74 
 
 
150 aa  93.2  9e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0856308  normal  0.0106718 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3444  hypothetical protein  41.32 
 
 
130 aa  93.2  1e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.237349  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00030  putative hemoglobin-like oxygen-binding protein  37.69 
 
 
143 aa  92.4  2e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0488861  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3425  globin  41.94 
 
 
173 aa  91.3  4e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.646541 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18050  globin-like protein  38.71 
 
 
131 aa  90.5  7e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0868344  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1149  globin  39.06 
 
 
140 aa  90.1  8e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.572775  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1355  globin family protein  39.02 
 
 
132 aa  90.1  9e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2614  globin  41.13 
 
 
133 aa  90.1  1e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.307504  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0036  globin  30.83 
 
 
145 aa  89.4  2e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0572064  hitchhiker  0.00805011 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0034  globin  31.58 
 
 
145 aa  89  2e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0103941 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0051  globin  35.77 
 
 
143 aa  89.4  2e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.294967  normal  0.0701367 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0031  globin  35.29 
 
 
145 aa  89  2e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0800503  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4091  globin family protein  37.9 
 
 
132 aa  88.2  3e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1105  globin  37.9 
 
 
132 aa  88.2  3e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1250  globin family protein  37.1 
 
 
132 aa  87.4  5e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1317  hypothetical protein  37.9 
 
 
132 aa  87.8  5e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.997153  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1098  globin family protein  37.9 
 
 
132 aa  87.8  5e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1092  globin family protein  37.9 
 
 
132 aa  87.8  5e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.720422  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1279  globin family protein  37.9 
 
 
132 aa  87.8  5e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1116  hypothetical protein  37.9 
 
 
132 aa  87.4  6e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1209  hypothetical protein  37.9 
 
 
132 aa  87.4  6e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1333  globin  42.4 
 
 
127 aa  87  7e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.143229  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1823  globin  36.5 
 
 
145 aa  87  7e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000381812  normal  0.0630387 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7355  hypothetical protein  41.48 
 
 
132 aa  87  9e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0911  globin  35.77 
 
 
132 aa  86.3  1e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0039  globin  33.61 
 
 
145 aa  85.5  2e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3533  globin  39.84 
 
 
149 aa  85.9  2e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.841697 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0039  globin  32.52 
 
 
144 aa  85.5  2e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.102658  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4066  globin  38.73 
 
 
136 aa  85.1  3e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.667271 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2215  hypothetical protein  37.23 
 
 
188 aa  84.7  4e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.307711  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0042  globin  30.08 
 
 
145 aa  84.7  4e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0182573  hitchhiker  0.000000860997 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0039  globin  34.45 
 
 
145 aa  84.7  4e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.372259  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0038  globin  34.45 
 
 
145 aa  84.7  4e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0612769  unclonable  0.00000927103 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0038  globin  34.45 
 
 
145 aa  84.7  4e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000122438 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3074  globin  35.92 
 
 
138 aa  84.3  5e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0236905 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7353  globin  40.65 
 
 
129 aa  83.6  8e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.23037 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>