80 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_B1339 on replicon NC_007952
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010676  Bphyt_5278  major facilitator superfamily MFS_1  96.36 
 
 		 444 aa  797    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.804388  normal  0.835878 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1339  major facilitator superfamily sugar efflux pump  100 
 
 		 456 aa  900    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0241988 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4174  major facilitator transporter  68.13 
 
 		 433 aa  473  1e-132  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6028  major facilitator transporter  57.89 
 
 		 431 aa  377  1e-103  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.320097  normal  0.669923 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3289  major facilitator transporter  58.27 
 
 		 431 aa  373  1e-102  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6328  major facilitator transporter  58.27 
 
 		 431 aa  373  1e-102  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.769672  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4876  major facilitator transporter  58.27 
 
 		 431 aa  373  1e-102  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1163  major facilitator transporter  31.71 
 
 		 415 aa  157  4e-37  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.235509 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0194  major facilitator transporter  31.27 
 
 		 405 aa  154  2e-36  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3234  sugar efflux transporter  30.33 
 
 		 409 aa  147  4.0000000000000006e-34  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000446244 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2537  major facilitator superfamily MFS_1  29.71 
 
 		 411 aa  146  8.000000000000001e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.224335  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4014  sugar efflux transporter C  29.57 
 
 		 394 aa  145  2e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0046  sugar efflux transporter  29.84 
 
 		 394 aa  144  2e-33  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4166  sugar efflux transporter C  29.84 
 
 		 394 aa  144  3e-33  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3871  sugar efflux transporter C  29.84 
 
 		 394 aa  144  3e-33  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0041  sugar efflux transporter  29.84 
 
 		 394 aa  144  3e-33  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03542  predicted sugar efflux system  29.84 
 
 		 394 aa  144  3e-33  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03484  hypothetical protein  29.84 
 
 		 394 aa  144  3e-33  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0740  sugar efflux transporter  30.92 
 
 		 399 aa  142  9.999999999999999e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.797465  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2427  sugar efflux transporter  29.76 
 
 		 393 aa  139  7.999999999999999e-32  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4114  sugar efflux transporter C  29.97 
 
 		 344 aa  134  5e-30  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.741083  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3539  sugar efflux transporter  27.58 
 
 		 393 aa  130  6e-29  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2330  sugar efflux transporter  28.92 
 
 		 392 aa  129  8.000000000000001e-29  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.99673  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3409  sugar efflux transporter A  27.62 
 
 		 393 aa  129  8.000000000000001e-29  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2940  sugar efflux transporter A  27.62 
 
 		 393 aa  129  8.000000000000001e-29  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1651  sugar efflux transporter  30.08 
 
 		 392 aa  129  9.000000000000001e-29  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0566929  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0792  sugar efflux transporter B  28.47 
 
 		 393 aa  129  1.0000000000000001e-28  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000601589  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2319  sugar efflux transporter B  28.47 
 
 		 393 aa  129  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000297031  hitchhiker  0.00120871 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3308  sugar efflux transporter B  28.71 
 
 		 393 aa  129  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000181486  normal  0.0175789 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02058  hypothetical protein  28.47 
 
 		 393 aa  128  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.175397  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1478  sugar efflux transporter  28.47 
 
 		 393 aa  128  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.0000191341  hitchhiker  0.0000212529 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02099  lactose/glucose efflux system  28.47 
 
 		 393 aa  128  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.131835  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2468  sugar efflux transporter B  28.47 
 
 		 393 aa  128  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000203316  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2308  sugar efflux transporter B  28.47 
 
 		 393 aa  128  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000102092  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0618  sugar efflux transporter  27.39 
 
 		 392 aa  128  2.0000000000000002e-28  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.145544 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2356  sugar efflux transporter B  30.53 
 
 		 393 aa  127  3e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000027927  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1488  sugar efflux transporter  28.47 
 
 		 393 aa  128  3e-28  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000116753  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1922  sugar efflux transporter  29.37 
 
 		 392 aa  127  6e-28  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0164772  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1233  major facilitator transporter  27.27 
 
 		 381 aa  125  1e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0103633  normal  0.340559 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2559  sugar efflux transporter B  30 
 
 		 393 aa  125  2e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0168132  hitchhiker  0.000108533 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2447  sugar efflux transporter B  30 
 
 		 393 aa  125  2e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.018902  normal  0.791409 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2401  sugar efflux transporter B  30 
 
 		 393 aa  125  2e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0487824  hitchhiker  0.0000630797 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2445  sugar efflux transporter B  29.74 
 
 		 393 aa  123  6e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.190665  hitchhiker  0.000000169528 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3587  sugar efflux transporter  27.74 
 
 		 392 aa  122  9.999999999999999e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000416053 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00072  broad specificity sugar efflux system  27.74 
 
 		 392 aa  122  9.999999999999999e-27  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00071  hypothetical protein  27.74 
 
 		 392 aa  122  9.999999999999999e-27  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0075  sugar efflux transporter A  27.74 
 
 		 392 aa  122  9.999999999999999e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3528  sugar efflux transporter  27.48 
 
 		 392 aa  122  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0073  major facilitator superfamily sugar transporter  27.48 
 
 		 392 aa  121  3e-26  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0697  major facilitator transporter  25.27 
 
 		 404 aa  117  3e-25  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0713  major facilitator transporter  25.27 
 
 		 404 aa  117  3e-25  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000944208  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0329  sugar efflux transporter, putative  25.55 
 
 		 402 aa  114  3e-24  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2764  sugar efflux transporter  27.32 
 
 		 393 aa  109  8.000000000000001e-23  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.846637  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3834  sugar efflux transporter  26.42 
 
 		 371 aa  108  1e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2547  major facilitator transporter  26.56 
 
 		 402 aa  105  2e-21  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1027  hypothetical protein  39.46 
 
 		 160 aa  91.3  3e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0911644  hitchhiker  0.0000959225 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0880  hypothetical protein  27.56 
 
 		 404 aa  90.9  5e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00224194  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0064  sugar efflux transporter A  24.04 
 
 		 360 aa  90.5  6e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0783  major facilitator superfamily MFS_1  25.69 
 
 		 403 aa  89.4  1e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.374247  normal  0.125612 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6620  major facilitator superfamily MFS_1  25.24 
 
 		 399 aa  84.7  0.000000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.397819  normal  0.21382 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5677  major facilitator superfamily MFS_1  24.52 
 
 		 407 aa  84  0.000000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.813519  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0897  major facilitator superfamily MFS_1  25.27 
 
 		 403 aa  84  0.000000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.521313 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6253  MFS permease  25.77 
 
 		 402 aa  82.4  0.00000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.244233  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31250  Major Facilitator Superfamily transporter  29.65 
 
 		 392 aa  80.5  0.00000000000006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.229188  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00906  major facilitator family protein  24.93 
 
 		 359 aa  79.7  0.0000000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1192  MFS permease  23.99 
 
 		 445 aa  76.6  0.0000000000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.879235  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0009  major facilitator transporter  25.14 
 
 		 392 aa  73.9  0.000000000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.665186 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4655  major facilitator transporter  23.04 
 
 		 403 aa  72.8  0.00000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.347673  normal  0.129123 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2508  major facilitator superfamily MFS_1  25.85 
 
 		 388 aa  63.9  0.000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00018254  hitchhiker  0.00122667 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06960  major facilitator family transporter  21.04 
 
 		 396 aa  48.9  0.0002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4227  major facilitator transporter  26.75 
 
 		 425 aa  46.2  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0992586  normal  0.574471 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0397  major facilitator transporter  23.56 
 
 		 415 aa  46.2  0.001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0502  major facilitator transporter  27.67 
 
 		 387 aa  45.1  0.003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1763  major facilitator superfamily MFS_1  22.46 
 
 		 453 aa  44.7  0.004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000000455527  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6975  major facilitator superfamily MFS_1  31.25 
 
 		 443 aa  43.9  0.006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0212916  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2117  major facilitator superfamily MFS_1  28.02 
 
 		 391 aa  43.9  0.006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00000191868  normal  0.363164 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1316  general substrate transporter  27.68 
 
 		 443 aa  43.5  0.007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4251  major facilitator transporter  30.36 
 
 		 447 aa  43.9  0.007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0571  major facilitator superfamily MFS_1  24.06 
 
 		 388 aa  43.5  0.008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0835  major facilitator superfamily MFS_1  34.85 
 
 		 439 aa  43.1  0.009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.554079  normal  0.519033 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>