134 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_B1271 on replicon NC_007952
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007952  Bxe_B1271  hypothetical protein  100 
 
 
314 aa  644    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.657925  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5326  metallophosphoesterase  94.59 
 
 
314 aa  612  9.999999999999999e-175  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.146746  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0969  metallophosphoesterase  75.72 
 
 
314 aa  497  1e-140  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.636109  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4141  metallophosphoesterase  76.04 
 
 
314 aa  494  1e-139  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.506676 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4607  metallophosphoesterase  75.72 
 
 
314 aa  494  1e-139  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.913305 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3608  metallophosphoesterase  74.76 
 
 
314 aa  491  9.999999999999999e-139  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.18641  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4759  metallophosphoesterase  74.76 
 
 
314 aa  491  9.999999999999999e-139  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.218607 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5524  metallophosphoesterase  74.12 
 
 
314 aa  487  1e-136  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.809123 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3898  metallophosphoesterase  74.33 
 
 
312 aa  467  9.999999999999999e-131  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.5708  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2979  hypothetical protein  53.48 
 
 
314 aa  340  2e-92  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.619955  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4689  metallophosphoesterase  53.44 
 
 
319 aa  338  7e-92  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.596745  normal  0.125787 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0392  metallophosphoesterase  51.8 
 
 
313 aa  324  1e-87  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.775359 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0783  metallophosphoesterase  52.6 
 
 
320 aa  323  2e-87  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2672  metallophosphoesterase  50.99 
 
 
313 aa  308  6.999999999999999e-83  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0337269  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4791  metallophosphoesterase  52.41 
 
 
319 aa  306  3e-82  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.444638  normal  0.138362 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0341  metallophosphoesterase  53.18 
 
 
335 aa  306  3e-82  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0479119 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0974  metallophosphoesterase  55.97 
 
 
318 aa  303  2.0000000000000002e-81  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2524  metallophosphoesterase  42.41 
 
 
314 aa  247  2e-64  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.135144  normal  0.43864 
 
 
-
 
NC_003296  RS02211  hypothetical protein  36.82 
 
 
309 aa  172  3.9999999999999995e-42  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.372489  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3409  Ser/Thr protein phosphatase family protein  38.52 
 
 
299 aa  166  4e-40  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.520768  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1171  Ser/Thr protein phosphatase family protein  38.52 
 
 
299 aa  166  4e-40  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  decreased coverage  0.0049646  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1407  Ser/Thr protein phosphatase family protein  37.37 
 
 
306 aa  166  5e-40  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0774357  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2421  Ser/Thr protein phosphatase family protein family  37.37 
 
 
306 aa  166  5e-40  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1898  Ser/Thr protein phosphatase family protein  37.37 
 
 
306 aa  166  5e-40  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2256  Ser/Thr protein phosphatase family protein  37.37 
 
 
306 aa  166  5e-40  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0412874  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2295  Ser/Thr protein phosphatase family protein  37.37 
 
 
306 aa  166  5e-40  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2176  Ser/Thr protein phosphatase family protein  38.4 
 
 
306 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0598  twin-arginine translocation pathway signal  36.84 
 
 
296 aa  157  3e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.676514 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4252  twin-arginine translocation pathway signal  35.74 
 
 
295 aa  154  2e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.726059  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4329  metallophosphoesterase  34.14 
 
 
374 aa  139  6e-32  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1617  Ser/Thr protein phosphatase family protein  35.58 
 
 
229 aa  129  9.000000000000001e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.392588 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2854  metallophosphoesterase  28.81 
 
 
382 aa  106  5e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.806939  decreased coverage  0.00466142 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3458  metallophosphoesterase  29.74 
 
 
285 aa  71.6  0.00000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3120  metallophosphoesterase  29 
 
 
286 aa  68.9  0.0000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1269  metallophosphoesterase  27.03 
 
 
275 aa  63.5  0.000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0548527  normal  0.294504 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1664  metallophosphoesterase  25.7 
 
 
252 aa  62  0.00000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.334361  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1593  metallophosphoesterase  24.21 
 
 
611 aa  61.2  0.00000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.245606 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0869  purple acid phosphatase/fibronectin domain protein  26.95 
 
 
819 aa  60.8  0.00000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1878  metallophosphoesterase  25.89 
 
 
313 aa  60.1  0.00000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0173468 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3063  metallophosphoesterase  34.62 
 
 
307 aa  59.3  0.00000009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.312394 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0712  phosphohydrolase  26.34 
 
 
824 aa  58.2  0.0000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0726  metallophosphoesterase  26.17 
 
 
820 aa  58.2  0.0000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.972215  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1109  metallophosphoesterase  29.35 
 
 
343 aa  57.8  0.0000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4674  metallophosphoesterase  24.73 
 
 
303 aa  57.8  0.0000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.801154  hitchhiker  0.0000113913 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4466  purple acid phosphatase/fibronectin domain protein  26.27 
 
 
820 aa  57.4  0.0000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.812219 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0906  purple acid phosphatase/fibronectin domain-containing protein  26.17 
 
 
819 aa  57  0.0000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0777  purple acid phosphatase/fibronectin domain-containing protein  25.95 
 
 
824 aa  57.4  0.0000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0726  purple acid phosphatase/fibronectin domain-containing protein  25.95 
 
 
824 aa  57  0.0000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0911  purple acid phosphatase/fibronectin domain protein  26.07 
 
 
819 aa  57  0.0000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.30065e-39 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0980  purple acid phosphatase/fibronectin domain protein  26.17 
 
 
819 aa  56.6  0.0000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0815  purple acid phosphatase/fibronectin domain-containing protein  26.17 
 
 
819 aa  56.2  0.0000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0042  metallophosphoesterase  32.67 
 
 
774 aa  56.2  0.0000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0825488 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1184  purple acid phosphatase family protein  26.64 
 
 
281 aa  55.5  0.000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0863816  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1087  purple acid phosphatase family protein  26.64 
 
 
281 aa  55.5  0.000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4297  metallophosphoesterase  26.36 
 
 
270 aa  54.7  0.000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1299  metallophosphoesterase  26.29 
 
 
606 aa  54.7  0.000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0615  metallophosphoesterase  30.77 
 
 
680 aa  54.7  0.000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5794  Exopolysaccharide biosynthesis protein related to N-acetylglucosamine-1-phosphodiester alpha-N- acetylglucosaminidase-like protein  26.1 
 
 
1138 aa  53.9  0.000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0776912 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3398  metallophosphoesterase  25.95 
 
 
304 aa  53.9  0.000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.11944 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1562  metallophosphoesterase  26.9 
 
 
369 aa  53.5  0.000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3152  metallophosphoesterase  26.96 
 
 
274 aa  53.5  0.000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.495281  normal  0.758441 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1048  metallophosphoesterase  27.84 
 
 
357 aa  53.1  0.000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00210125 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2148  metallophosphoesterase  25.11 
 
 
276 aa  52.8  0.000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.62403  normal  0.260034 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0264  metallophosphoesterase  25 
 
 
306 aa  52.8  0.000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.019445 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4746  metallophosphoesterase  27.14 
 
 
274 aa  52  0.00001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4339  metallophosphoesterase  25.85 
 
 
274 aa  51.2  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0172  metallophosphoesterase  27.49 
 
 
274 aa  51.6  0.00002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1464  putative cAMP phosphodiesterase  25.73 
 
 
275 aa  51.2  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.111678 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4158  metallophosphoesterase  26.56 
 
 
364 aa  51.6  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2835  Ser/Thr protein phosphatase family protein  25.96 
 
 
274 aa  50.8  0.00003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4844  putative metallophosphoesterase  25 
 
 
290 aa  50.8  0.00003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.667418  normal  0.111711 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1261  metallophosphoesterase  22.47 
 
 
286 aa  50.4  0.00004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.259337  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3391  metallophosphoesterase  27.97 
 
 
363 aa  50.4  0.00004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.119138  normal  0.040425 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5275  hypothetical protein  25.3 
 
 
496 aa  50.1  0.00005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0193632  normal  0.106396 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3384  metallophosphoesterase  24.48 
 
 
273 aa  50.1  0.00005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1208  Ser/Thr protein phosphatase family protein  25.86 
 
 
275 aa  50.1  0.00005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0659  3',5'-cyclic-nucleotide phosphodiesterase  25.86 
 
 
275 aa  50.1  0.00005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.226857  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1412  Ser/Thr protein phosphatase family protein  25.86 
 
 
275 aa  50.1  0.00005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.515047  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0494  Ser/Thr protein phosphatase family protein  25.86 
 
 
275 aa  50.1  0.00005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.447071  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0843  metallophosphoesterase  24.29 
 
 
274 aa  50.1  0.00005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1455  metallophosphoesterase  22.93 
 
 
284 aa  50.1  0.00005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0445506 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3077  Ser/Thr protein phosphatase family protein  25.86 
 
 
354 aa  49.7  0.00006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1667  metallophosphoesterase  26.42 
 
 
284 aa  49.7  0.00006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2545  metallophosphoesterase  21.66 
 
 
265 aa  49.7  0.00007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1539  Ser/Thr protein phosphatase family protein  25.86 
 
 
325 aa  49.3  0.00008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1670  metallophosphoesterase  27.31 
 
 
281 aa  49.3  0.00008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3797  metallophosphoesterase  26.11 
 
 
278 aa  48.5  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.842206 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1405  Ser/Thr protein phosphatase family protein  25.86 
 
 
275 aa  48.9  0.0001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3268  metallophosphoesterase  24.9 
 
 
274 aa  47.8  0.0002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2745  metallophosphoesterase  30.43 
 
 
332 aa  47.8  0.0002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.384672  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0570  Icc protein  23.85 
 
 
266 aa  48.1  0.0002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0493  metallophosphoesterase  28.57 
 
 
382 aa  48.1  0.0002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1302  metallophosphoesterase  28.12 
 
 
594 aa  47.4  0.0003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0587  metallophosphoesterase  26.82 
 
 
289 aa  47.4  0.0003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.994992  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0629  metallophosphoesterase  22.86 
 
 
274 aa  47.4  0.0004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1204  metallophosphoesterase  27.61 
 
 
274 aa  47  0.0004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.189904  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1505  metallophosphoesterase  24.27 
 
 
275 aa  47.4  0.0004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.847027  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0447  alkaline phosphatase  29.27 
 
 
299 aa  46.6  0.0005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.690696  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03771  Serine/threonine specific protein phosphatase  26.24 
 
 
263 aa  46.6  0.0005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.784269 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1362  metallophosphoesterase  25 
 
 
266 aa  46.6  0.0005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.7574e-16 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>