More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_B1231 on replicon NC_007952
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007952  Bxe_B1231  RND efflux system outer membrane lipoprotein  100 
 
 
486 aa  968    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0812696  normal  0.324306 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0649  RND efflux system outer membrane lipoprotein  67.76 
 
 
496 aa  609  1e-173  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.814679  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5505  RND efflux system outer membrane lipoprotein  67.76 
 
 
496 aa  609  1e-173  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.130053  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0851  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  56.3 
 
 
504 aa  519  1e-146  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4150  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  55.37 
 
 
472 aa  483  1e-135  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1703  RND efflux system outer membrane lipoprotein NodT  52.89 
 
 
486 aa  476  1e-133  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.416377  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2663  RND efflux system outer membrane lipoprotein  51.64 
 
 
496 aa  473  1e-132  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0412  RND efflux system outer membrane lipoprotein  52.2 
 
 
477 aa  456  1e-127  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1077  RND efflux system outer membrane lipoprotein  51.69 
 
 
496 aa  456  1e-127  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.512437  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1393  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  52.18 
 
 
461 aa  448  1.0000000000000001e-124  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3061  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  46.57 
 
 
482 aa  400  9.999999999999999e-111  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0327532  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4072  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  44.71 
 
 
464 aa  359  5e-98  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.153495 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2162  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  44.12 
 
 
489 aa  340  2e-92  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2899  RND efflux system outer membrane lipoprotein  42.95 
 
 
504 aa  335  1e-90  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0690  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  44.2 
 
 
474 aa  325  1e-87  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0583  RND efflux system outer membrane lipoprotein  42.67 
 
 
477 aa  319  9e-86  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.196176  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1456  RND efflux system outer membrane lipoprotein  41.81 
 
 
480 aa  313  4.999999999999999e-84  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000857275 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3925  multidrug efflux system protein  39.74 
 
 
499 aa  310  2.9999999999999997e-83  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000000707781  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0527  outer membrane protein OprM precursor  41.09 
 
 
485 aa  309  9e-83  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.71666  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05550  major intrinsic multiple antibiotic resistance efflux outer membrane protein OprM precursor  40.87 
 
 
485 aa  308  1.0000000000000001e-82  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.203755  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2606  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  40.48 
 
 
478 aa  303  5.000000000000001e-81  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.0037798  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4009  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  39.87 
 
 
486 aa  301  1e-80  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0874069  normal  0.0174443 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1278  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  40.31 
 
 
486 aa  299  9e-80  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00202436  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1919  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  38.06 
 
 
482 aa  298  2e-79  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.328582  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4305  outer membrane efflux protein  39.87 
 
 
486 aa  296  4e-79  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1591  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  40.04 
 
 
481 aa  294  2e-78  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  unclonable  0.000000292967 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2209  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  39.78 
 
 
472 aa  289  8e-77  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2869  RND efflux system outer membrane lipoprotein  38.38 
 
 
480 aa  287  2.9999999999999996e-76  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.451085  normal  0.401715 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2037  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  40.93 
 
 
489 aa  287  2.9999999999999996e-76  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.248346  normal  0.0238408 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2338  efflux ABC transporter outer membrane protein  41.19 
 
 
470 aa  286  4e-76  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0499  RND efflux system outer membrane lipoprotein  38.97 
 
 
485 aa  284  3.0000000000000004e-75  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0545  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  37.5 
 
 
470 aa  283  4.0000000000000003e-75  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.540838  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4088  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  37.92 
 
 
489 aa  283  5.000000000000001e-75  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.947344  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2885  RND efflux system outer membrane lipoprotein  39.78 
 
 
495 aa  283  6.000000000000001e-75  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.183945  normal  0.24109 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1384  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  38.65 
 
 
484 aa  282  8.000000000000001e-75  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.285433 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3444  RND efflux system outer membrane lipoprotein  38.32 
 
 
495 aa  282  8.000000000000001e-75  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.960604 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1164  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  35.45 
 
 
473 aa  281  1e-74  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.0000188172  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4339  RND efflux system outer membrane lipoprotein  38.43 
 
 
484 aa  281  2e-74  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0952934  normal  0.254961 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0549  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  38.26 
 
 
501 aa  280  4e-74  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.569542  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2043  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  39.09 
 
 
477 aa  279  7e-74  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.186335 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4429  RND efflux system outer membrane lipoprotein  38.21 
 
 
484 aa  279  8e-74  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.305214  normal  0.0579633 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1407  RND efflux system outer membrane lipoprotein  37.05 
 
 
488 aa  279  9e-74  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.380774 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0590  copper/silver efflux system outer membrane protein CusC  37.2 
 
 
460 aa  278  1e-73  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.583273  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1024  RND efflux system outer membrane lipoprotein  37.77 
 
 
484 aa  278  1e-73  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.484622  normal  0.130102 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1949  RND efflux system outer membrane lipoprotein  36.42 
 
 
459 aa  278  2e-73  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2283  outer membrane efflux protein  34.74 
 
 
501 aa  278  2e-73  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0628456 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0451  RND efflux system outer membrane lipoprotein  38.63 
 
 
459 aa  277  2e-73  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.841968 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0387  Fis family transcriptional regulator  40.43 
 
 
492 aa  277  3e-73  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0309  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  34.24 
 
 
531 aa  277  3e-73  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3590  RND efflux system outer membrane lipoprotein NodT  37.69 
 
 
491 aa  277  3e-73  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2695  outer membrane efflux protein  37.66 
 
 
512 aa  276  4e-73  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0169  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  37.99 
 
 
493 aa  276  4e-73  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000204876 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0506  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  38.16 
 
 
492 aa  276  8e-73  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1450  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  38.1 
 
 
471 aa  275  9e-73  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2052  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  37.71 
 
 
499 aa  275  1.0000000000000001e-72  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0480  RND efflux system outer membrane lipoprotein  36.84 
 
 
505 aa  274  2.0000000000000002e-72  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0104002 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0516  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  37.53 
 
 
500 aa  275  2.0000000000000002e-72  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0482869  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0590  copper/silver efflux system outer membrane protein CusC  36.76 
 
 
460 aa  273  4.0000000000000004e-72  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0284493  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4833  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  39.21 
 
 
474 aa  273  4.0000000000000004e-72  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.820871  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0653  copper/silver efflux system outer membrane protein CusC  36.76 
 
 
460 aa  273  4.0000000000000004e-72  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.191725  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1951  RND efflux system outer membrane lipoprotein  38.14 
 
 
480 aa  273  7e-72  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1416  RND efflux system outer membrane lipoprotein NodT  38.16 
 
 
469 aa  273  7e-72  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1464  RND efflux system outer membrane lipoprotein  39.32 
 
 
510 aa  272  1e-71  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0329  RND efflux system outer membrane lipoprotein  36.86 
 
 
474 aa  272  1e-71  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2146  outer membrane efflux protein OprC  39.32 
 
 
510 aa  272  1e-71  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1842  RND efflux system outer membrane lipoprotein  39.32 
 
 
510 aa  272  1e-71  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0515  outer membrane efflux protein OprC  39.32 
 
 
510 aa  272  1e-71  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2104  RND efflux system outer membrane lipoprotein  39.74 
 
 
510 aa  272  1e-71  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.409236  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0829  outer membrane efflux protein OprC  39.32 
 
 
510 aa  272  1e-71  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0418  outer membrane efflux protein OprC  39.32 
 
 
510 aa  272  1e-71  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3717  RND efflux system outer membrane lipoprotein  38.26 
 
 
477 aa  271  2e-71  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51570  multidrug efflux pump RND-family outer membrane protein  36.72 
 
 
505 aa  270  2.9999999999999997e-71  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0329698  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00533  copper/silver efflux system, outer membrane component  36.62 
 
 
457 aa  269  1e-70  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3057  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  36.62 
 
 
457 aa  269  1e-70  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01890  outer membrane drug efflux lipoprotein  39.26 
 
 
491 aa  268  1e-70  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0642226  normal  0.753424 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3442  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  37.23 
 
 
496 aa  269  1e-70  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.811835  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3074  copper/silver efflux system outer membrane protein CusC  36.62 
 
 
457 aa  269  1e-70  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.127852  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00522  hypothetical protein  36.62 
 
 
457 aa  269  1e-70  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0619  copper/silver efflux system outer membrane protein CusC  36.62 
 
 
457 aa  269  1e-70  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000166732  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2963  putative outer membrane drug efflux lipoprotein  40.65 
 
 
487 aa  269  1e-70  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0259  copper/silver efflux system outer membrane protein CusC  35.13 
 
 
461 aa  268  2e-70  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0811  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  37.74 
 
 
517 aa  267  2.9999999999999995e-70  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000173561 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0908  RND efflux system outer membrane lipoprotein  35.84 
 
 
455 aa  267  4e-70  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0710  RND efflux system outer membrane lipoprotein  35.83 
 
 
515 aa  266  5e-70  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.437206  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3497  RND efflux system outer membrane lipoprotein  37.45 
 
 
470 aa  266  5.999999999999999e-70  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4297  copper/silver efflux system outer membrane protein CusC  35.13 
 
 
461 aa  266  7e-70  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00173675  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0316  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  39.52 
 
 
481 aa  265  8.999999999999999e-70  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.464824  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0321  RND efflux system outer membrane lipoprotein  39.23 
 
 
480 aa  265  1e-69  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.877077 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2527  RND efflux system outer membrane lipoprotein  37.61 
 
 
507 aa  265  1e-69  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.10146 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3256  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  34.49 
 
 
525 aa  265  1e-69  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.865648 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0009  drug efflux lipoprotein  37.88 
 
 
514 aa  265  2e-69  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.347699  normal  0.0645676 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2035  RND efflux system outer membrane lipoprotein  33.19 
 
 
486 aa  265  2e-69  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.152355  normal  0.152355 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2654  RND efflux system outer membrane lipoprotein  37.61 
 
 
507 aa  265  2e-69  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0354944  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4697  RND efflux system outer membrane lipoprotein  40.6 
 
 
513 aa  264  2e-69  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.204697  normal  0.315368 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2064  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  38.88 
 
 
499 aa  263  4.999999999999999e-69  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2254  RND efflux system outer membrane lipoprotein  39.22 
 
 
487 aa  263  6.999999999999999e-69  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2429  RND efflux system outer membrane lipoprotein  37.12 
 
 
467 aa  262  8e-69  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.41681  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2194  RND efflux system outer membrane lipoprotein  35.58 
 
 
518 aa  262  8e-69  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0247365  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2607  RND efflux system outer membrane lipoprotein  37.39 
 
 
507 aa  262  1e-68  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5938  RND efflux system outer membrane lipoprotein  36.76 
 
 
507 aa  262  1e-68  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0183223  normal  0.547092 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>