More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_B1227 on replicon NC_007952
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007952  Bxe_B1227  LysR family transcriptional regulator  100 
 
 
312 aa  638    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.207252 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3128  LysR family transcriptional regulator  43.92 
 
 
349 aa  254  1.0000000000000001e-66  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.677462  normal  0.0859375 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3206  LysR family transcriptional regulator  43.54 
 
 
326 aa  253  3e-66  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  unclonable  0.000350263  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3186  LysR family transcriptional regulator  43.92 
 
 
349 aa  253  3e-66  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.651713  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3069  LysR family transcriptional regulator  43.92 
 
 
349 aa  253  3e-66  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1403  LysR family transcriptional regulator  43.54 
 
 
326 aa  253  3e-66  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.000000041163  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0153  LysR family transcriptional regulator  42.57 
 
 
351 aa  252  5.000000000000001e-66  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2347  LysR family transcriptional regulator  42.57 
 
 
351 aa  252  5.000000000000001e-66  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.890874  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0138  LysR family transcriptional regulator  42.57 
 
 
351 aa  252  5.000000000000001e-66  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2270  LysR family transcriptional regulator  42.57 
 
 
351 aa  252  5.000000000000001e-66  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.520231  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0342  LysR family transcriptional regulator  42.57 
 
 
351 aa  252  5.000000000000001e-66  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2811  LysR family transcriptional regulator  42.57 
 
 
351 aa  252  5.000000000000001e-66  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0145  transcriptional regulator  42.57 
 
 
351 aa  252  5.000000000000001e-66  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0124  LysR family transcriptional regulator  42.91 
 
 
351 aa  252  5.000000000000001e-66  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3131  LysR family transcriptional regulator  43.92 
 
 
349 aa  252  6e-66  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.154836  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3147  LysR family transcriptional regulator  43.92 
 
 
349 aa  252  6e-66  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.315246 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1971  LysR family transcriptional regulator  44.04 
 
 
355 aa  252  6e-66  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0397721 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2518  LysR family transcriptional regulator  43.92 
 
 
349 aa  252  6e-66  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6482  LysR family transcriptional regulator  43.92 
 
 
349 aa  252  7e-66  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.833038 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0305  transcriptional regulator, LysR family  43.58 
 
 
367 aa  251  1e-65  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2049  LysR family transcriptional regulator  43.54 
 
 
326 aa  251  1e-65  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.0000000535454  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3167  LysR family transcriptional regulator  43.54 
 
 
326 aa  251  1e-65  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  decreased coverage  0.000000000529291  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3220  LysR family transcriptional regulator  43.54 
 
 
326 aa  251  1e-65  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000114793  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0864  LysR family transcriptional regulator  43.54 
 
 
326 aa  251  1e-65  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000134216  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4420  LysR family transcriptional regulator  43.58 
 
 
367 aa  251  1e-65  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0287989 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1914  LysR family transcriptional regulator  43.54 
 
 
326 aa  251  1e-65  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  decreased coverage  0.00000121317  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0031  LysR family transcriptional regulator  43.58 
 
 
362 aa  250  2e-65  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2557  LysR family transcriptional regulator  42.42 
 
 
327 aa  248  1e-64  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.221386  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2140  transcriptional regulator, LysR family  43.24 
 
 
298 aa  246  2e-64  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2289  transcriptional regulator, LysR family  43.13 
 
 
353 aa  243  1.9999999999999999e-63  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0723  LysR family transcriptional regulator  40.72 
 
 
328 aa  232  8.000000000000001e-60  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.562943 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0706  LysR family transcriptional regulator  40.26 
 
 
328 aa  232  8.000000000000001e-60  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2428  LysR family transcriptional regulator  41.86 
 
 
329 aa  231  1e-59  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.886071  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0826  LysR family transcriptional regulator  41.91 
 
 
327 aa  228  8e-59  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.325124  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0343  LysR family transcriptional regulator  41.91 
 
 
327 aa  228  8e-59  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3919  LysR family transcriptional regulator  41.58 
 
 
327 aa  223  4e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4615  LysR family transcriptional regulator  41.41 
 
 
307 aa  222  7e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0591659 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5689  LysR family transcriptional regulator  41.41 
 
 
307 aa  222  7e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.104917 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3753  LysR family transcriptional regulator  41.41 
 
 
307 aa  222  7e-57  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0796  LysR family transcriptional regulator  40.92 
 
 
325 aa  220  3e-56  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2712  LysR family transcriptional regulator  40.6 
 
 
295 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2690  LysR family transcriptional regulator  39.53 
 
 
295 aa  212  5.999999999999999e-54  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2586  LysR family transcriptional regulator  40.6 
 
 
295 aa  212  7e-54  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2661  LysR family transcriptional regulator  39.53 
 
 
295 aa  211  1e-53  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.583907  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2050  LysR family transcriptional regulator  39.53 
 
 
295 aa  211  1e-53  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0104  LysR family transcriptional regulator  39.93 
 
 
314 aa  210  2e-53  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2696  LysR family transcriptional regulator  42.35 
 
 
288 aa  209  4e-53  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0287  Carbonate dehydratase  38.74 
 
 
305 aa  208  8e-53  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2456  LysR family transcriptional regulator  40.54 
 
 
313 aa  205  7e-52  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.161377  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0065  transcription regulator protein  37.8 
 
 
312 aa  204  1e-51  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0276  LysR family transcriptional regulator  45.04 
 
 
571 aa  204  1e-51  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3361  transcriptional regulator, LysR family  37.46 
 
 
312 aa  201  9.999999999999999e-51  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.955701  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3684  transcriptional regulator, LysR family  36.77 
 
 
312 aa  196  4.0000000000000005e-49  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3570  LysR family transcriptional regulator  37.97 
 
 
310 aa  195  6e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3413  LysR family transcriptional regulator  36.73 
 
 
303 aa  194  1e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5787  transcriptional regulator, LysR family  39.73 
 
 
308 aa  192  5e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4204  LysR family transcriptional regulator  39.06 
 
 
322 aa  190  2e-47  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1347  LysR family transcriptional regulator  35.62 
 
 
312 aa  188  9e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.336134 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2780  transcriptional regulator, LysR family  36.3 
 
 
312 aa  188  1e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.916486  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3497  LysR family transcriptional regulator  32.76 
 
 
309 aa  187  1e-46  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0350832  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1192  LysR family transcriptional regulator  37.5 
 
 
316 aa  188  1e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0000735562  normal  0.361439 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0388  LysR family transcriptional regulator  37.46 
 
 
304 aa  187  2e-46  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1113  LysR family transcriptional regulator  37.67 
 
 
318 aa  187  3e-46  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.293194 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2375  transcriptional regulator, LysR family  37.11 
 
 
301 aa  186  6e-46  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.00507322  normal  0.595951 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1581  LysR family transcriptional regulator  35.62 
 
 
312 aa  185  1.0000000000000001e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.457037  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3585  LysR family transcriptional regulator  35.62 
 
 
312 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0364205  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1450  LysR family transcriptional regulator  35.03 
 
 
313 aa  182  5.0000000000000004e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.135059  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1428  LysR family transcriptional regulator  35.03 
 
 
313 aa  182  5.0000000000000004e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.986267  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0968  LysR family transcriptional regulator  35.03 
 
 
313 aa  182  5.0000000000000004e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1865  LysR family transcriptional regulator  35.03 
 
 
313 aa  182  7e-45  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000631239 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0430  transcriptional regulator, LysR family  37.41 
 
 
293 aa  182  9.000000000000001e-45  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.1625 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47830  transcription regulator pirR  37.76 
 
 
293 aa  181  2e-44  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.850432  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1886  transcriptional regulator, LysR family  37.58 
 
 
299 aa  181  2e-44  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2278  LysR family transcriptional regulator  34.46 
 
 
304 aa  180  2.9999999999999997e-44  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.255279  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31030  Transcriptional regulator, LysR family  35 
 
 
297 aa  179  5.999999999999999e-44  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4595  LysR family transcriptional regulator  35.03 
 
 
313 aa  178  1e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.489457  normal  0.672145 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2624  transcriptional regulator  34.35 
 
 
313 aa  178  1e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0210848  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1371  LysR family transcriptional regulator  34.69 
 
 
313 aa  178  1e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.760659 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1332  LysR family transcriptional regulator  34.69 
 
 
313 aa  178  1e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0601876  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0936  transcriptional regulator  35.25 
 
 
313 aa  177  2e-43  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.434313  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1855  transcriptional regulator  35.25 
 
 
313 aa  177  2e-43  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1679  LysR family transcriptional regulator  35.25 
 
 
313 aa  177  2e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1469  LysR family transcriptional regulator  35.25 
 
 
313 aa  177  2e-43  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0412  LysR family transcriptional regulator  35.25 
 
 
313 aa  177  2e-43  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2760  LysR family transcriptional regulator  37.46 
 
 
319 aa  177  2e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0750  LysR family transcriptional regulator  35.25 
 
 
313 aa  177  2e-43  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.63163  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1701  LysR family transcriptional regulator  35.25 
 
 
313 aa  177  2e-43  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.672113  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01980  LysR family transcriptional regulator  36.77 
 
 
312 aa  177  3e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.445097 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2132  transcriptional regulator, LysR family  36.58 
 
 
298 aa  176  3e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4973  LysR family transcriptional regulator  33.67 
 
 
306 aa  177  3e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0237  putative transcriptional regulator  35.74 
 
 
355 aa  176  4e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1403  LysR family transcriptional regulator  37.04 
 
 
305 aa  176  4e-43  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.34329 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2875  transcriptional regulator, LysR family  32.09 
 
 
307 aa  175  9.999999999999999e-43  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.442056  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1970  LysR family transcriptional regulator  36.54 
 
 
299 aa  174  9.999999999999999e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.330952  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2494  transcriptional regulator, LysR family  32.09 
 
 
307 aa  175  9.999999999999999e-43  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0430  transcriptional regulator, LysR family  36.96 
 
 
312 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.716475 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3757  LysR family transcriptional regulator  32.88 
 
 
306 aa  173  3.9999999999999995e-42  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.196954  normal  0.103625 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1436  LysR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
295 aa  173  3.9999999999999995e-42  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1216  transcriptional regulator, LysR family  35.37 
 
 
315 aa  173  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4606  LysR family transcriptional regulator  32.88 
 
 
306 aa  173  3.9999999999999995e-42  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>