115 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_B1113 on replicon NC_007952
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007953  Bxe_C1116  ABC transporter, periplasmic ligand binding protein  95.35 
 
 
344 aa  675  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1113  hypothetical protein  100 
 
 
344 aa  702  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0994451  normal  0.363021 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1112  ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  52.33 
 
 
352 aa  323  2e-87  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1117  hypothetical protein  52.33 
 
 
355 aa  316  3e-85  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.149156  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0074  protein of unknown function DUF534  51 
 
 
322 aa  311  1e-83  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2828  protein of unknown function DUF534  32.18 
 
 
341 aa  159  5e-38  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  6.7856e-13  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1089  hypothetical protein  31.19 
 
 
324 aa  144  2e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.623165  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14390  putative ABC-type transport protein, periplasmic c  31.75 
 
 
325 aa  144  2e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1277  ABC transporter periplasmic protein  31.75 
 
 
325 aa  144  2e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3067  hypothetical protein  29.79 
 
 
317 aa  144  2e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0867  hypothetical protein  30.8 
 
 
317 aa  144  3e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1211  hypothetical protein  30.72 
 
 
323 aa  143  4e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0959108 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2038  hypothetical protein  32.93 
 
 
324 aa  142  6e-33  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0401201 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1750  protein of unknown function DUF534  31.73 
 
 
322 aa  140  4e-32  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0619  hypothetical protein  28.62 
 
 
321 aa  139  9e-32  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1949  hypothetical protein  31.73 
 
 
322 aa  138  1e-31  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.521982  normal  0.530099 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3723  protein of unknown function DUF534  28.77 
 
 
317 aa  137  2e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1949  protein of unknown function DUF534  31.92 
 
 
323 aa  137  3e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.325569  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1315  hypothetical protein  30 
 
 
322 aa  137  3e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.710416  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0723  protein of unknown function DUF534  30.61 
 
 
332 aa  137  3e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000763859  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4046  protein of unknown function DUF534  28.42 
 
 
317 aa  135  7e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0325  hypothetical protein  26.9 
 
 
337 aa  135  9e-31  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  9.3059e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0821  ABC transporter substrate binding inner membrane protein  32.31 
 
 
319 aa  135  1e-30  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0105624 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002970  ABC transporter substrate-binding protein  27.91 
 
 
321 aa  135  1e-30  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2856  protein of unknown function DUF534  32.45 
 
 
337 aa  134  2e-30  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19990  ABC-type uncharacterized transport system, periplasmic component  28.18 
 
 
325 aa  134  2e-30  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  9.09791e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2867  hypothetical protein  29.08 
 
 
316 aa  132  7e-30  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0736  protein of unknown function DUF534  29.93 
 
 
332 aa  132  9e-30  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.04583e-09 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1974  putative ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  30.82 
 
 
321 aa  130  2e-29  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.350596  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4311  hypothetical protein  29.37 
 
 
323 aa  130  3e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3141  hypothetical protein  30.52 
 
 
344 aa  130  4e-29  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.774643 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4371  hypothetical protein  28.43 
 
 
331 aa  130  4e-29  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1740  putative signal peptide protein  28.57 
 
 
329 aa  129  6e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.324025  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2161  protein of unknown function DUF534  27.38 
 
 
324 aa  129  6e-29  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.321904 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0251  protein of unknown function DUF534  30.71 
 
 
320 aa  129  1e-28  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00303449  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4553  protein of unknown function DUF534  26.9 
 
 
329 aa  127  3e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2053  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein, putative  30.48 
 
 
321 aa  127  3e-28  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0440  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein, putative  30.16 
 
 
323 aa  127  3e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.173038  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0472  hypothetical protein  30.95 
 
 
321 aa  127  3e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.997143 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02940  hypothetical protein  29.69 
 
 
322 aa  127  4e-28  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0687  hypothetical protein  29.29 
 
 
323 aa  127  4e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.695936  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2907  putative ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  29.29 
 
 
323 aa  126  5e-28  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0505  putative ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  29.29 
 
 
323 aa  126  5e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1479  putative ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  29.29 
 
 
323 aa  126  5e-28  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0109  putative ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  29.29 
 
 
323 aa  126  5e-28  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6161  hypothetical protein  30.56 
 
 
321 aa  126  5e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.432237 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1502  protein of unknown function DUF534  28.17 
 
 
326 aa  126  6e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0497356  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0047  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  28.66 
 
 
327 aa  125  8e-28  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1461  protein of unknown function DUF534  28.17 
 
 
326 aa  124  2e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.655823  hitchhiker  7.85059e-07 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2840  hypothetical protein  26.9 
 
 
329 aa  124  2e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00146979  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0522  putative ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  28.93 
 
 
323 aa  125  2e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2218  hypothetical protein  30.16 
 
 
321 aa  124  3e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.792913  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2831  hypothetical protein  30.16 
 
 
321 aa  124  3e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2842  hypothetical protein  30.16 
 
 
321 aa  124  3e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.838657  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3140  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein, putative  28.93 
 
 
323 aa  123  4e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.226285  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0249  ribose/xylose/arabinose/galactoside ABC-type transporter permease  26.67 
 
 
584 aa  123  6e-27  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2227  hypothetical protein  26.73 
 
 
338 aa  119  5e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00471107  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0657  protein of unknown function DUF534  29.81 
 
 
330 aa  119  6e-26  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.342868  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2078  protein of unknown function/lipoprotein, putative  25.49 
 
 
320 aa  117  2e-25  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  3.17435e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03810  ABC-type uncharacterized transport system, periplasmic component  29.45 
 
 
336 aa  115  8e-25  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2106  hypothetical protein  27.24 
 
 
323 aa  114  2e-24  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.363313  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1712  hypothetical protein  27.51 
 
 
343 aa  114  3e-24  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1473  protein of unknown function DUF534  28.38 
 
 
335 aa  112  6e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1435  ABC transporter, substrate-binding protein  27 
 
 
341 aa  112  7e-24  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.457922 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2494  hypothetical protein  27.24 
 
 
340 aa  111  2e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1599  hypothetical protein  26.62 
 
 
341 aa  111  2e-23  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.164938  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0210  hypothetical protein  27.08 
 
 
320 aa  110  3e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0129991  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1817  hypothetical protein  26.1 
 
 
331 aa  109  6e-23  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00011469  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1947  protein of unknown function DUF534  25.9 
 
 
327 aa  107  4e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.734312  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2365  protein of unknown function DUF534  27.91 
 
 
331 aa  106  6e-22  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00100062  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1711  hypothetical protein  26.69 
 
 
370 aa  106  6e-22  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0258  ABC-type uncharacterized transport system, periplasmic component  23.81 
 
 
347 aa  104  2e-21  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  1.82856e-10  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2646  protein of unknown function DUF534  28.87 
 
 
329 aa  105  2e-21  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1569  hypothetical protein  28.52 
 
 
270 aa  103  3e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2584  protein of unknown function DUF534  27.65 
 
 
322 aa  103  6e-21  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  3.78214e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1155  ABC transporter substrate-binding protein  27.24 
 
 
333 aa  102  1e-20  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  1.38162e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1598  hypothetical protein  26.71 
 
 
349 aa  101  2e-20  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.108913  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2364  protein of unknown function DUF534  25.24 
 
 
328 aa  101  2e-20  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000124724  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1434  ABC transporter, substrate-binding protein  26.62 
 
 
349 aa  101  2e-20  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.681297 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0026  hypothetical protein  25.57 
 
 
328 aa  98.6  1e-19  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.35198  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0042  protein of unknown function DUF534  25 
 
 
322 aa  99  1e-19  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.920382  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0205  protein of unknown function DUF534  25.19 
 
 
298 aa  97.8  2e-19  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1189  hypothetical protein  24.48 
 
 
334 aa  97.4  3e-19  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.00418408  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1098  hypothetical protein  25.61 
 
 
313 aa  97.4  3e-19  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0511  protein of unknown function DUF534  24.1 
 
 
329 aa  96.3  7e-19  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0079  ABC-type uncharacterized transport system, periplasmic component  24.14 
 
 
334 aa  92.8  8e-18  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.0035536  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0747  protein of unknown function DUF534  26.37 
 
 
319 aa  87  4e-16  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  unclonable  2.99763e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0267  ABC-type uncharacterized transport system, periplasmic component  23.79 
 
 
359 aa  80.5  4e-14  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0239321  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1505  hypothetical protein  24.33 
 
 
640 aa  80.1  5e-14  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2289  hypothetical protein  26.47 
 
 
320 aa  78.2  2e-13  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1746  hypothetical protein  24.3 
 
 
324 aa  73.2  7e-12  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.227035 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1230  hypothetical protein  25.46 
 
 
320 aa  72.8  8e-12  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2884  hypothetical protein  22.22 
 
 
365 aa  71.2  2e-11  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2388  protein of unknown function DUF534  25.45 
 
 
326 aa  70.9  3e-11  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.382961  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1481  hypothetical protein  27.99 
 
 
336 aa  70.1  5e-11  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1052  hypothetical protein  23.82 
 
 
354 aa  69.7  6e-11  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0655813  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3978  hypothetical protein  25.18 
 
 
328 aa  69.7  7e-11  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.890464  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6424  hypothetical protein  24.37 
 
 
329 aa  67.4  3e-10  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.680283  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2818  putative ABC-type uncharacterized transport system, periplasmic component  23.27 
 
 
326 aa  67.8  3e-10  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0708  protein of unknown function DUF534  23.32 
 
 
315 aa  67.4  4e-10  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>