More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_B1074 on replicon NC_007952
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007952  Bxe_B1074  ferredoxin-(2Fe-2S)-binding protein  100 
 
 		 120 aa  243  4e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.103168 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5660  ferredoxin  91.09 
 
 		 103 aa  190  5e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.926642 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3640  ferredoxin  73.96 
 
 		 105 aa  156  9e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.533623  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4923  ferredoxin  72.92 
 
 		 100 aa  155  2e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.60613  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4404  ferredoxin  72.92 
 
 		 100 aa  154  3e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.103484 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5307  ferredoxin  69.7 
 
 		 100 aa  151  2.9999999999999998e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.786726  normal  0.0713222 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3387  ferredoxin  69.7 
 
 		 100 aa  151  2.9999999999999998e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.864897  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4980  ferredoxin  69.7 
 
 		 100 aa  151  2.9999999999999998e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.786925  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3428  ferredoxin  63.96 
 
 		 129 aa  149  8.999999999999999e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.883916  normal  0.379266 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0697  ferredoxin  68.69 
 
 		 100 aa  147  4e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.812143  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1820  2Fe-2S iron-sulfur  71.43 
 
 		 96 aa  137  3.9999999999999997e-32  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2159  2Fe-2S iron-sulfur  70.33 
 
 		 96 aa  135  2e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0888  2Fe-2S iron-sulfur  70.33 
 
 		 96 aa  135  2e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.225976  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0798  iron-sulfur cluster-binding protein  70.33 
 
 		 96 aa  135  2e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.156035  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3434  ferredoxin  55.88 
 
 		 110 aa  118  1.9999999999999998e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3652  ferredoxin  56.67 
 
 		 93 aa  114  6e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1286  ferredoxin  63.1 
 
 		 103 aa  102  2e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1368  ferredoxin  53.47 
 
 		 108 aa  102  2e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.996751  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2756  ferredoxin  53.85 
 
 		 111 aa  97.8  4e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.108856 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1389  ferredoxin  51.61 
 
 		 97 aa  96.3  1e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2469  ferredoxin  44.55 
 
 		 117 aa  91.3  4e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.165462  normal  0.348757 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5112  ferredoxin  52.81 
 
 		 108 aa  89.7  1e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.528807  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3824  putative ferredoxin  60 
 
 		 102 aa  88.2  3e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.232359  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2234  ferredoxin  53.09 
 
 		 99 aa  88.6  3e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0280079  hitchhiker  0.000426891 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2765  ferredoxin  47.62 
 
 		 97 aa  78.6  0.00000000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.174551  normal  0.655324 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2255  ferredoxin  47.62 
 
 		 97 aa  78.6  0.00000000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00333  phenol hydroxylase  37.21 
 
 		 89 aa  72  0.000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002101  ferredoxin  37.21 
 
 		 89 aa  72  0.000000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000061516  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4058  oxidoreductase FAD-binding subunit  44.58 
 
 		 383 aa  65.1  0.0000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0362952  normal  0.241879 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0554  ferredoxin (2Fe-2S)  41.57 
 
 		 122 aa  64.7  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.569886  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0537  ferredoxin (2Fe-2S)  41.57 
 
 		 122 aa  64.7  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0025  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  42.35 
 
 		 340 aa  64.3  0.0000000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.775073  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_14071  ferredoxin  39.18 
 
 		 99 aa  63.5  0.0000000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.116031  normal  0.0535794 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0181  (2Fe-2S) ferredoxin  37.08 
 
 		 99 aa  62.8  0.000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0754  ferredoxin (2Fe-2S)  40.74 
 
 		 122 aa  62.8  0.000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1380  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  41.38 
 
 		 363 aa  62.8  0.000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.611376  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2703  ferredoxin  36.05 
 
 		 89 aa  62.4  0.000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000163981  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3903  ferredoxin (2Fe-2S)  43.84 
 
 		 121 aa  62.8  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.832402  normal  0.566054 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0512  ferredoxin (2Fe-2S)  43.59 
 
 		 122 aa  62.4  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0252  CDP-6-deoxy-L-threo-D-glycero-4-hexulose-3- dehydrase reductase, putative  44.71 
 
 		 338 aa  61.6  0.000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  unclonable  0.00410911  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0428  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  44.71 
 
 		 338 aa  61.6  0.000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.0000000504585  hitchhiker  0.000000000664459 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15381  ferredoxin  39.08 
 
 		 99 aa  61.6  0.000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.911769  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15531  ferredoxin  39.08 
 
 		 99 aa  61.6  0.000000004  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.443097  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0529  ferredoxin (2Fe-2S)  39.08 
 
 		 99 aa  61.2  0.000000004  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0163346  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2148  ferredoxin (2Fe-2S)  39.08 
 
 		 99 aa  61.2  0.000000004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.943243  normal  0.214433 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1450  ferredoxin (2Fe-2S)  39.08 
 
 		 99 aa  61.6  0.000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.463453  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0890  (2Fe-2S) ferredoxin  37.08 
 
 		 122 aa  61.2  0.000000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  decreased coverage  0.00054006  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3204  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  39.76 
 
 		 346 aa  61.2  0.000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.968562  normal  0.353056 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2987  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  37.35 
 
 		 350 aa  60.8  0.000000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.651691  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_15131  ferredoxin  40.51 
 
 		 99 aa  60.8  0.000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2414  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  37.35 
 
 		 350 aa  60.8  0.000000006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0981  ferredoxin (2Fe-2S)  36.96 
 
 		 122 aa  60.5  0.000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000166855  normal  0.987662 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_05261  ferredoxin  37.93 
 
 		 99 aa  60.5  0.000000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0151  putative ferredoxin  34.62 
 
 		 87 aa  60.1  0.000000009  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0245789  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_14011  hypothetical protein  36.26 
 
 		 104 aa  59.7  0.00000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.908602  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0599  ferredoxin  36.26 
 
 		 104 aa  60.1  0.00000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3299  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  37.35 
 
 		 360 aa  60.1  0.00000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.553886  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1293  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  39.76 
 
 		 354 aa  60.1  0.00000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3792  ferredoxin:oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding:oxidoreductase FAD-binding region  40.21 
 
 		 353 aa  59.3  0.00000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000109386  hitchhiker  0.00301341 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0668  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  39.76 
 
 		 343 aa  58.5  0.00000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42100  Ferredoxin:Oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding  39.78 
 
 		 333 aa  58.5  0.00000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.416324  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3306  oxidoreductase FAD-binding subunit  39.18 
 
 		 353 aa  58.5  0.00000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.592709  normal  0.864162 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2542  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  44.3 
 
 		 344 aa  58.5  0.00000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.261713  hitchhiker  0.0000462807 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4192  ferredoxin  37.14 
 
 		 98 aa  58.2  0.00000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3240  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  41.43 
 
 		 342 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.171038 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2793  putative reductase component of monooxygenase  40 
 
 		 365 aa  57.8  0.00000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1507  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  40 
 
 		 365 aa  57.8  0.00000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.338028 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1194  ferredoxin  36.89 
 
 		 101 aa  57.8  0.00000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3163  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  37.65 
 
 		 336 aa  57.8  0.00000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.141012  normal  0.450185 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2722  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  40.96 
 
 		 354 aa  57.4  0.00000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2686  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  37.65 
 
 		 336 aa  57.4  0.00000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.831402  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0916  ferredoxin (2Fe-2S)  41.25 
 
 		 98 aa  57.4  0.00000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0010  ferredoxin  36.47 
 
 		 342 aa  57  0.00000008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.484136 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1828  putative CDP-6-deoxy-delta-3,4- glucoseen reductase  41.03 
 
 		 341 aa  57  0.00000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.125347 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0435  ferredoxin  40.24 
 
 		 89 aa  57  0.00000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0915  ferredoxin (2Fe-2S)  36.71 
 
 		 100 aa  57  0.00000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1593  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  41.43 
 
 		 340 aa  57  0.00000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.324243  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1127  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  36.14 
 
 		 341 aa  56.6  0.0000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.139409  normal  0.1084 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2563  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  40 
 
 		 345 aa  56.2  0.0000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0756  ferredoxin (2Fe-2S)  37.04 
 
 		 99 aa  56.6  0.0000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3550  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  35.79 
 
 		 354 aa  56.2  0.0000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4626  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  35.79 
 
 		 354 aa  56.2  0.0000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4353  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  40.7 
 
 		 331 aa  56.6  0.0000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0654  phenylacetate-CoA oxygenase/reductase, PaaK subunit  37.84 
 
 		 351 aa  56.6  0.0000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2708  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  36.47 
 
 		 337 aa  56.2  0.0000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.102061 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2334  oxidoreductase FAD-binding subunit  42.65 
 
 		 669 aa  57  0.0000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.896317 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1977  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  36.14 
 
 		 357 aa  55.8  0.0000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.102774  normal  0.0121969 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0924  ferredoxin (2Fe-2S), plant  38.96 
 
 		 99 aa  55.5  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30710  Multi-component phenol hydoxylase, reductase subunit; LapP  36.84 
 
 		 353 aa  55.8  0.0000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.431626  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0568  ferredoxin (2Fe-2S)  40 
 
 		 104 aa  55.8  0.0000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0229344  normal  0.149468 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1223  oxidoreductase  36 
 
 		 343 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.256584  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1008  ferredoxin (2Fe-2S)  41.18 
 
 		 94 aa  56.2  0.0000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.418665  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2192  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  34.74 
 
 		 350 aa  56.2  0.0000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.269423  normal  0.977097 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2886  putative phenylacetic acid degradation NADH oxidoreductase  40.85 
 
 		 366 aa  55.8  0.0000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00113682  decreased coverage  0.000127414 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0031  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  40.96 
 
 		 342 aa  56.2  0.0000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2552  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  36.47 
 
 		 336 aa  55.8  0.0000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4862  oxidoreductase FAD-binding subunit  41.3 
 
 		 354 aa  56.2  0.0000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.350242  normal  0.072998 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_17801  ferredoxin  38.96 
 
 		 99 aa  55.5  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.198374  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0279  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  37.35 
 
 		 336 aa  55.5  0.0000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.280982  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2702  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  38.82 
 
 		 349 aa  55.5  0.0000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>