More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_B0981 on replicon NC_007952
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007952  Bxe_B0981  phosphoglycerate mutase  100 
 
 
240 aa  479  1e-134  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.632698 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0534  phosphoglyceromutase  45.76 
 
 
248 aa  208  8e-53  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0478  phosphoglyceromutase  46.96 
 
 
249 aa  207  9e-53  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3208  phosphoglyceromutase  46.96 
 
 
249 aa  207  9e-53  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0662  phosphoglyceromutase  46.96 
 
 
249 aa  207  9e-53  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1411  phosphoglyceromutase  46.96 
 
 
249 aa  207  9e-53  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2838  phosphoglyceromutase  46.96 
 
 
249 aa  207  9e-53  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0497  phosphoglyceromutase  46.96 
 
 
249 aa  207  9e-53  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0181  phosphoglyceromutase  46.96 
 
 
249 aa  207  9e-53  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0416  phosphoglyceromutase  46.52 
 
 
250 aa  206  3e-52  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.886094  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6186  phosphoglyceromutase  47.14 
 
 
270 aa  205  4e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2868  phosphoglyceromutase  47.14 
 
 
248 aa  205  4e-52  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.327501 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2243  phosphoglyceromutase  47.75 
 
 
270 aa  205  5e-52  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.545502  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2857  phosphoglyceromutase  47.75 
 
 
270 aa  205  5e-52  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.310958  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00708  phosphoglyceromutase  44.07 
 
 
250 aa  204  1e-51  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0244194  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2887  phosphoglycerate mutase 1 family  44.07 
 
 
250 aa  204  1e-51  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.715971  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00697  hypothetical protein  44.07 
 
 
250 aa  204  1e-51  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0324346  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1288  phosphoglyceromutase  45.34 
 
 
250 aa  204  1e-51  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.600576 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0836  phosphoglyceromutase  44.49 
 
 
250 aa  204  1e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1246  phosphoglyceromutase  44.49 
 
 
250 aa  204  1e-51  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0432438  normal  0.418524 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0809  phosphoglyceromutase  44.07 
 
 
250 aa  204  1e-51  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.794598  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0778  phosphoglyceromutase  44.07 
 
 
250 aa  204  1e-51  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.170676  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0676  phosphoglyceromutase  44.07 
 
 
250 aa  204  1e-51  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.281134  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0857  phosphoglyceromutase  44.07 
 
 
250 aa  204  1e-51  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0211138  normal  0.774364 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0922  phosphoglyceromutase  44.49 
 
 
250 aa  204  1e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.169898 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0266  phosphoglyceromutase  45.65 
 
 
248 aa  204  1e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2907  phosphoglyceromutase  44.07 
 
 
250 aa  204  1e-51  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.314254 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0446  phosphoglyceromutase  47.3 
 
 
270 aa  203  2e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.19692  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0867  phosphoglyceromutase  44.07 
 
 
250 aa  203  2e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.192858  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1258  phosphoglyceromutase  44.92 
 
 
250 aa  203  2e-51  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.202337  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1948  phosphoglyceromutase  46.32 
 
 
229 aa  203  2e-51  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4181  phosphoglyceromutase  45.81 
 
 
248 aa  202  3e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0808  phosphoglyceromutase  44.07 
 
 
250 aa  202  3e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0782  phosphoglyceromutase  43.64 
 
 
250 aa  202  3e-51  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0185649  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2912  phosphoglyceromutase  46.7 
 
 
248 aa  202  3e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0899  phosphoglyceromutase  44.07 
 
 
250 aa  202  3e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3076  phosphoglyceromutase  46.12 
 
 
250 aa  202  4e-51  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2948  phosphoglyceromutase  43.22 
 
 
250 aa  202  4e-51  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2774  phosphoglyceromutase  46.7 
 
 
248 aa  202  4e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1407  phosphoglyceromutase  43.22 
 
 
250 aa  202  4e-51  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2861  phosphoglyceromutase  43.22 
 
 
250 aa  202  4e-51  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.187742  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1697  phosphoglyceromutase  41.23 
 
 
247 aa  201  7e-51  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0146  phosphoglyceromutase  45.78 
 
 
228 aa  201  7e-51  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000652043  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2895  phosphoglyceromutase  44.07 
 
 
250 aa  200  9.999999999999999e-51  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.148167  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1323  phosphoglyceromutase  48 
 
 
232 aa  201  9.999999999999999e-51  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.196226  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0167  phosphoglyceromutase  43.86 
 
 
230 aa  201  9.999999999999999e-51  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000351468  hitchhiker  1.89085e-19 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1612  phosphoglyceromutase  48.65 
 
 
247 aa  199  1.9999999999999998e-50  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0353  phosphoglyceromutase  47.51 
 
 
267 aa  200  1.9999999999999998e-50  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.136198 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1072  phosphoglyceromutase  45.33 
 
 
249 aa  199  1.9999999999999998e-50  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.095004  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0228  phosphoglyceromutase  47.39 
 
 
251 aa  199  3e-50  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00314651 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0209  phosphoglyceromutase  47.39 
 
 
251 aa  199  3e-50  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0780605 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2324  phosphoglycerate mutase 1 family protein  45.05 
 
 
248 aa  199  3.9999999999999996e-50  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00439  phosphoglyceromutase  45.85 
 
 
248 aa  199  5e-50  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.418989  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0187  phosphoglyceromutase  46.43 
 
 
247 aa  198  7.999999999999999e-50  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00937723  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0304  phosphoglyceromutase  47.06 
 
 
248 aa  197  1.0000000000000001e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3514  phosphoglycerate mutase 1 family protein  45.98 
 
 
247 aa  197  1.0000000000000001e-49  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0019746 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1309  phosphoglyceromutase  46.85 
 
 
247 aa  197  1.0000000000000001e-49  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0886  phosphoglycerate mutase  46.33 
 
 
293 aa  197  1.0000000000000001e-49  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.344747 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1445  phosphoglyceromutase  44.78 
 
 
227 aa  197  1.0000000000000001e-49  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0868062  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1164  phosphoglyceromutase  42.37 
 
 
250 aa  197  1.0000000000000001e-49  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1264  phosphoglyceromutase  49.34 
 
 
230 aa  197  2.0000000000000003e-49  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.500435  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2442  phosphoglyceromutase  43.86 
 
 
228 aa  196  2.0000000000000003e-49  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2490  phosphoglyceromutase  43.86 
 
 
228 aa  196  2.0000000000000003e-49  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1813  phosphoglyceromutase  47.32 
 
 
247 aa  197  2.0000000000000003e-49  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0772  phosphoglycerate mutase 1 family  45.25 
 
 
601 aa  196  2.0000000000000003e-49  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0601  phosphoglycerate mutase 1 family  43.86 
 
 
229 aa  196  2.0000000000000003e-49  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1653  phosphoglyceromutase  45.22 
 
 
247 aa  196  3e-49  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00239487  normal  0.883975 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0382  phosphoglyceromutase  44.68 
 
 
233 aa  196  3e-49  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.000158112  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0927  phosphoglycerate mutase 1 family protein  45.91 
 
 
250 aa  196  3e-49  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.224068  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0287  phosphoglyceromutase  43.64 
 
 
248 aa  196  3e-49  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0953  phosphoglyceromutase  44.44 
 
 
249 aa  195  4.0000000000000005e-49  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.197373  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04761  phosphoglyceromutase  46.26 
 
 
249 aa  196  4.0000000000000005e-49  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.151884  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1059  phosphoglycerate mutase 1 family  43.3 
 
 
229 aa  195  5.000000000000001e-49  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1653  phosphoglyceromutase  44.59 
 
 
229 aa  195  6e-49  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1450  phosphoglyceromutase  47.98 
 
 
249 aa  194  7e-49  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0421206  normal  0.072339 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0780  phosphoglyceromutase  44.35 
 
 
249 aa  194  8.000000000000001e-49  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1121  phosphoglyceromutase  47.06 
 
 
251 aa  194  1e-48  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0251  phosphoglycerate mutase  46.79 
 
 
436 aa  194  1e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1172  phosphoglyceromutase  44.59 
 
 
230 aa  194  1e-48  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000600648  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1052  phosphoglyceromutase  45.34 
 
 
246 aa  194  1e-48  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0445459  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4103  phosphoglycerate mutase 1 family  46.12 
 
 
247 aa  193  2e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.347525  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2828  phosphoglyceromutase  44.93 
 
 
247 aa  192  3e-48  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0667  phosphoglyceromutase  43.22 
 
 
251 aa  192  4e-48  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000997316  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0036  phosphoglycerate mutase 1 family protein  46.15 
 
 
245 aa  192  5e-48  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.945791  normal  0.827774 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1424  phosphoglycerate mutase 1 family  43.5 
 
 
249 aa  191  6e-48  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0896608  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1198  phosphoglyceromutase  46.26 
 
 
249 aa  191  8e-48  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.111464 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0713  phosphoglycerate mutase  44.74 
 
 
247 aa  191  8e-48  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.390955  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0635  phosphoglyceromutase  45.95 
 
 
249 aa  191  9e-48  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  hitchhiker  0.00161854  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3501  phosphoglycerate mutase 1 family  45.18 
 
 
234 aa  190  1e-47  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0405653  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3858  phosphoglyceromutase  45.95 
 
 
247 aa  191  1e-47  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.744697  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0130  phosphoglyceromutase  41.44 
 
 
248 aa  189  2e-47  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00296259 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0671  phosphoglycerate mutase 1 family  43.42 
 
 
247 aa  190  2e-47  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0251  phosphoglycerate mutase  38.82 
 
 
237 aa  190  2e-47  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06510  phosphoglyceromutase  42.86 
 
 
253 aa  190  2e-47  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.609997  normal  0.628914 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1938  phosphoglyceromutase  42.98 
 
 
247 aa  189  2.9999999999999997e-47  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.90026  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2313  phosphoglyceromutase  42.73 
 
 
245 aa  189  4e-47  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.479703  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2488  phosphoglyceromutase  42.73 
 
 
245 aa  189  4e-47  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.415568  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2509  phosphoglyceromutase  42.73 
 
 
245 aa  189  4e-47  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.805366 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1403  phosphoglycerate mutase 1 family  39.83 
 
 
248 aa  188  5e-47  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0764  phosphoglyceromutase  43.72 
 
 
230 aa  189  5e-47  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.00177418  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>