163 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_B0967 on replicon NC_007952
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007952  Bxe_B0967  putative Zn-dependent hydrolase  100 
 
 
266 aa  550  1e-155  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.674922  normal  0.574393 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5790  beta-lactamase domain-containing protein  75.56 
 
 
266 aa  427  1e-119  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.556982 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0379  metallo-beta-lactamase family protein  64.15 
 
 
270 aa  372  1e-102  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.775533  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1218  hypothetical protein  64.15 
 
 
275 aa  372  1e-102  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.404432  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0446  beta-lactamase domain-containing protein  63.77 
 
 
270 aa  371  1e-102  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.596679  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3256  beta-lactamase domain-containing protein  60.77 
 
 
269 aa  338  4e-92  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2976  beta-lactamase domain-containing protein  53.54 
 
 
266 aa  282  4.0000000000000003e-75  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0986  putative Zn-dependent hydrolases including glyoxylases  50.38 
 
 
271 aa  274  1.0000000000000001e-72  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.852691 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0553  putative Zn-dependent hydrolase  49.01 
 
 
276 aa  244  9e-64  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.499931 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3391  putative metallo-beta-lactamase family protein  44.79 
 
 
266 aa  236  2e-61  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41810  Zn-dependent hydrolase  41.56 
 
 
265 aa  214  9e-55  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3218  beta-lactamase domain-containing protein  42.8 
 
 
297 aa  206  2e-52  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.695315  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0627  hypothetical protein  37.05 
 
 
276 aa  167  1e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3407  beta-lactamase domain-containing protein  32 
 
 
262 aa  124  2e-27  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4530  beta-lactamase domain-containing protein  30.04 
 
 
249 aa  82.8  0.000000000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1256  Beta-lactamase-like  27.57 
 
 
253 aa  82.4  0.000000000000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.812248  normal  0.015481 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0597  putative beta-lactamase-like protein  29.79 
 
 
229 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.635497  normal  0.0844301 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5309  beta-lactamase domain-containing protein  31.89 
 
 
308 aa  66.6  0.0000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2298  beta-lactamase domain protein  26.11 
 
 
248 aa  66.2  0.0000000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0579  beta-lactamase domain-containing protein  28.99 
 
 
249 aa  65.9  0.0000000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000409851  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4928  beta-lactamase-like protein  31.35 
 
 
308 aa  65.5  0.0000000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5016  beta-lactamase domain-containing protein  31.35 
 
 
308 aa  65.5  0.0000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.348107  normal  0.730315 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1792  beta-lactamase domain protein  28.26 
 
 
285 aa  65.9  0.0000000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1642  beta-lactamase domain protein  29.61 
 
 
302 aa  64.7  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.526333  normal  0.287941 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1848  beta-lactamase-like protein  32.07 
 
 
278 aa  63.9  0.000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  decreased coverage  0.00738253  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1895  beta-lactamase domain-containing protein  32.07 
 
 
278 aa  63.9  0.000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.142767  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1829  beta-lactamase domain-containing protein  32.07 
 
 
278 aa  63.9  0.000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3238  metallo-beta-lactamase  27.93 
 
 
277 aa  61.6  0.00000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.192264  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2949  beta-lactamase domain-containing protein  29.86 
 
 
304 aa  61.6  0.00000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.161977  normal  0.098851 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0171  beta-lactamase domain-containing protein  25.86 
 
 
269 aa  60.1  0.00000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5130  beta-lactamase domain protein  30.04 
 
 
243 aa  60.1  0.00000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0408  Zn-dependent hydrolase including glyoxylase- like protein  32.24 
 
 
263 aa  60.1  0.00000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1514  beta-lactamase domain-containing protein  31.97 
 
 
284 aa  59.7  0.00000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.394622  normal  0.536803 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2787  beta-lactamase domain-containing protein  29.02 
 
 
305 aa  59.7  0.00000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3769  Beta-lactamase-like  28.48 
 
 
326 aa  58.9  0.00000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1393  beta-lactamase-like  28.04 
 
 
308 aa  58.9  0.00000009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.363509  normal  0.105082 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3592  beta-lactamase domain protein  36.28 
 
 
315 aa  58.9  0.00000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.869389  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0970  putative metal-dependent hydrolase  30.06 
 
 
278 aa  58.2  0.0000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.389974  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1841  beta-lactamase domain protein  27.36 
 
 
284 aa  58.5  0.0000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.933589  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1829  beta-lactamase domain protein  26.72 
 
 
311 aa  58.2  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0164526  normal  0.939049 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5395  beta-lactamase domain protein  27.27 
 
 
305 aa  58.5  0.0000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1138  putative metal-dependent hydrolase  24.89 
 
 
280 aa  58.2  0.0000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3721  Beta-lactamase-like  32.09 
 
 
283 aa  57.4  0.0000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0948  beta-lactamase domain-containing protein  23.85 
 
 
248 aa  57.8  0.0000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.241585 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04445  AttM/AiiB family protein  26.49 
 
 
287 aa  57.4  0.0000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1393  beta-lactamase domain-containing protein  25.88 
 
 
233 aa  57.4  0.0000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2405  beta-lactamase-like  29.76 
 
 
237 aa  55.8  0.0000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.703115  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1394  beta-lactamase domain protein  27.48 
 
 
280 aa  55.8  0.0000007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.238952  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6124  Beta-lactamase-like  29.94 
 
 
328 aa  55.8  0.0000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0903  beta-lactamase domain-containing protein  28.74 
 
 
235 aa  55.5  0.0000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2373  beta-lactamase domain protein  22.45 
 
 
269 aa  54.7  0.000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0752798  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2001  beta-lactamase domain protein  27.37 
 
 
306 aa  55.1  0.000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3268  beta-lactamase domain-containing protein  35.4 
 
 
318 aa  54.7  0.000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.629137 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3174  metallo-beta-lactamase family protein  24.89 
 
 
250 aa  54.7  0.000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0580046  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2162  beta-lactamase domain-containing protein  27.07 
 
 
266 aa  54.3  0.000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.353123  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3620  beta-lactamase domain protein  27.08 
 
 
326 aa  54.3  0.000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0090  beta-lactamase domain-containing protein  28.19 
 
 
198 aa  54.3  0.000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1508  Beta-lactamase-like  24.78 
 
 
296 aa  53.5  0.000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.265007  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1803  Beta-lactamase-like  25.29 
 
 
261 aa  53.9  0.000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2457  beta-lactamase domain-containing protein  29.75 
 
 
307 aa  53.9  0.000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.047493 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6125  beta-lactamase domain protein  25.47 
 
 
332 aa  53.1  0.000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.396338  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3861  beta-lactamase domain protein  29.56 
 
 
284 aa  53.1  0.000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0799  hypothetical protein  30.38 
 
 
309 aa  52.8  0.000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1029  beta-lactamase-like protein  31.37 
 
 
282 aa  52.8  0.000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.605254  hitchhiker  0.000133815 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3259  metallo-beta-lactamase family protein  24.44 
 
 
250 aa  51.6  0.00001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0731029  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3232  metallo-beta-lactamase family protein  24.44 
 
 
250 aa  51.6  0.00001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000796102  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4124  Beta-lactamase-like  26.55 
 
 
299 aa  52  0.00001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3514  metallo-beta-lactamase family protein  24.44 
 
 
250 aa  51.6  0.00001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3474  metallo-beta-lactamase family protein  24.44 
 
 
250 aa  51.6  0.00001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3466  beta-lactamase domain protein  31.11 
 
 
314 aa  52  0.00001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3778  beta-lactamase domain protein  29.49 
 
 
284 aa  51.6  0.00001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3518  beta-lactamase domain-containing protein  27.44 
 
 
335 aa  51.6  0.00001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.139544 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1608  hypothetical protein  42.25 
 
 
191 aa  51.2  0.00001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.8911  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1019  beta-lactamase domain protein  26.29 
 
 
284 aa  51.2  0.00002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.130366  normal  0.713499 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3458  metallo-beta-lactamase family protein  25.91 
 
 
250 aa  50.8  0.00002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0113378  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3166  beta-lactamase domain-containing protein  24.89 
 
 
250 aa  51.2  0.00002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.256521  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07316  conserved hypothetical protein  21.88 
 
 
294 aa  50.4  0.00003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.000551538  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1790  metallo-beta-lactamase family protein  24 
 
 
250 aa  50.4  0.00003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3476  beta-lactamase-like  25.37 
 
 
321 aa  50.4  0.00003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.907089  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5820  beta-lactamase domain-containing protein  25.65 
 
 
317 aa  50.4  0.00003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0920097 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5354  beta-lactamase domain-containing protein  29.21 
 
 
322 aa  50.1  0.00003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0789115 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3180  beta-lactamase domain protein  24.57 
 
 
248 aa  50.1  0.00004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4804  hypothetical protein  26.48 
 
 
282 aa  50.1  0.00004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3466  metallo-beta-lactamase family protein  24 
 
 
250 aa  49.7  0.00005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.285318  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3579  beta-lactamase domain-containing protein  29.35 
 
 
273 aa  49.3  0.00006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00371126  normal  0.263297 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0612  beta-lactamase domain protein  28.32 
 
 
305 aa  49.7  0.00006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0733  beta-lactamase domain protein  26.35 
 
 
235 aa  49.3  0.00007  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0039  beta-lactamase-like protein  25.15 
 
 
287 aa  48.9  0.00008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0855  beta-lactamase domain protein  25.62 
 
 
324 aa  48.9  0.00009  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2842  Beta-lactamase-like  27.37 
 
 
311 aa  48.5  0.0001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.577034 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1654  Zn-dependent hydrolase  26.41 
 
 
238 aa  48.5  0.0001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.82204  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2354  beta-lactamase domain-containing protein  27.03 
 
 
306 aa  48.1  0.0001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.186414 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1580  beta-lactamase domain protein  29.41 
 
 
302 aa  48.1  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.500793 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1331  metallo-beta-lactamase family protein  22.17 
 
 
248 aa  48.1  0.0002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0319201  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3043  beta-lactamase-like protein  25.49 
 
 
266 aa  47  0.0003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4708  beta-lactamase domain-containing protein  25.29 
 
 
276 aa  47.4  0.0003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3849  beta-lactamase domain-containing protein  26.63 
 
 
281 aa  47  0.0003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3353  beta-lactamase domain protein  29.27 
 
 
332 aa  47  0.0003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.289767  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6643  beta-lactamase domain-containing protein  27.01 
 
 
310 aa  47.4  0.0003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5891  beta-lactamase domain-containing protein  29.63 
 
 
301 aa  46.6  0.0004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.213957  normal  0.126369 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>