More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_B0773 on replicon NC_007952
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010623  Bphy_5365  FAD linked oxidase domain-containing protein  77.01 
 
 
464 aa  747    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.874918 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4454  FAD linked oxidase domain protein  91.32 
 
 
462 aa  819    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0421641  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0773  putative FAD/FMN-containing oxidoreductase  100 
 
 
462 aa  943    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.563549  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1506  FAD linked oxidase-like  62.47 
 
 
461 aa  615  1e-175  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.290263  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2767  FAD linked oxidase domain-containing protein  62.91 
 
 
461 aa  613  9.999999999999999e-175  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0847094 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2335  FAD linked oxidase-like  59.6 
 
 
474 aa  579  1e-164  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.822844  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3469  FAD linked oxidase-like protein  59.31 
 
 
463 aa  578  1e-164  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2459  FAD linked oxidase-like  58.91 
 
 
479 aa  580  1e-164  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.6744  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2203  FAD linked oxidase domain protein  58.21 
 
 
479 aa  568  1e-161  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.614292  normal  0.138199 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001560  putative oxidoreductase oxygen dependent FAD-dependent protein  57.27 
 
 
461 aa  570  1e-161  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1992  FAD linked oxidase domain protein  57.33 
 
 
479 aa  561  1e-158  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.918522 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4422  FAD linked oxidase domain-containing protein  57.77 
 
 
479 aa  559  1e-158  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.344156  normal  0.908517 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1606  FAD linked oxidase domain-containing protein  60.09 
 
 
472 aa  556  1e-157  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.935495 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1488  FAD linked oxidase domain-containing protein  56.62 
 
 
461 aa  536  1e-151  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3463  FAD linked oxidase domain protein  58.39 
 
 
465 aa  498  1e-139  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1804  FAD linked oxidase-like  50.66 
 
 
473 aa  479  1e-134  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1025  FAD linked oxidase domain protein  51.97 
 
 
465 aa  459  9.999999999999999e-129  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2737  FAD linked oxidase domain protein  48.24 
 
 
459 aa  421  1e-116  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000391962  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2962  FAD linked oxidase domain protein  47.71 
 
 
465 aa  406  1.0000000000000001e-112  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0158537  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2408  FAD linked oxidase domain protein  46.94 
 
 
469 aa  408  1.0000000000000001e-112  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.359898  decreased coverage  0.00141792 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3377  FAD linked oxidase-like  44.23 
 
 
473 aa  408  1.0000000000000001e-112  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0469731  normal  0.191861 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1762  FAD linked oxidase domain protein  44.47 
 
 
499 aa  378  1e-103  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000896481 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4023  FAD linked oxidase domain protein  44.37 
 
 
602 aa  378  1e-103  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1864  FAD linked oxidase domain protein  44.2 
 
 
458 aa  367  1e-100  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.105212  normal 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4911  FAD linked oxidase domain-containing protein  46.77 
 
 
465 aa  365  1e-100  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1030  FAD linked oxidase domain protein  43.38 
 
 
477 aa  363  4e-99  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2627  FAD linked oxidase domain protein  42.89 
 
 
468 aa  362  6e-99  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0898791  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1926  FAD linked oxidase domain protein  42.92 
 
 
476 aa  359  6e-98  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.47869  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1775  FAD linked oxidase-like protein  44.4 
 
 
463 aa  358  9.999999999999999e-98  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.719303 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2398  FAD linked oxidase domain protein  44.13 
 
 
461 aa  356  5e-97  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.349533  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3657  FAD linked oxidase domain protein  44.77 
 
 
456 aa  354  2e-96  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0260627  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4138  FAD linked oxidase domain protein  41.77 
 
 
470 aa  352  1e-95  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3462  FAD linked oxidase domain protein  43.17 
 
 
477 aa  346  5e-94  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1637  FAD linked oxidase, N-terminal  43.04 
 
 
461 aa  341  2e-92  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0426  FAD linked oxidase-like protein  43.9 
 
 
465 aa  341  2e-92  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1085  FAD linked oxidase-like  39.09 
 
 
478 aa  339  5e-92  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.439426  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4415  FAD linked oxidase, N-terminal  43.4 
 
 
456 aa  334  2e-90  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1360  FAD/FMN-containing dehydrogenase  38.74 
 
 
473 aa  333  5e-90  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00315473  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1407  FAD linked oxidase-like  43.98 
 
 
460 aa  330  2e-89  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5399  FAD linked oxidase domain-containing protein  40.6 
 
 
478 aa  325  8.000000000000001e-88  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11743  oxidoreductase  43.95 
 
 
461 aa  325  8.000000000000001e-88  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0117669  normal  0.752588 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0071  FAD linked oxidase domain protein  43.2 
 
 
466 aa  323  3e-87  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1304  FAD linked oxidase domain protein  42.02 
 
 
456 aa  311  2e-83  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0717469  normal  0.684944 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3750  FAD linked oxidase domain-containing protein  38.01 
 
 
444 aa  300  5e-80  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.589145  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2260  FAD linked oxidase domain protein  39.83 
 
 
466 aa  283  5.000000000000001e-75  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  decreased coverage  0.00839199  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04780  FAD/FMN-dependent dehydrogenase  38.66 
 
 
469 aa  278  1e-73  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.62663  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0060  putative oxidoreductase, oxygen dependent, FAD-dependent protein  35.62 
 
 
465 aa  256  7e-67  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2731  FAD linked oxidase domain-containing protein  36.8 
 
 
472 aa  246  4.9999999999999997e-64  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0114478  normal  0.981249 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3339  FAD linked oxidase domain-containing protein  37.92 
 
 
448 aa  238  1e-61  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.235624  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4344  FAD linked oxidase domain protein  40.27 
 
 
450 aa  231  3e-59  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.577793 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2149  FAD linked oxidase domain protein  39.1 
 
 
458 aa  224  2e-57  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1883  FAD linked oxidase domain protein  32.33 
 
 
462 aa  217  2.9999999999999998e-55  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000001515  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2025  FAD-binding protein  29.2 
 
 
448 aa  192  9e-48  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2435  oxidoreductase, FAD-binding, putative  31.67 
 
 
471 aa  189  8e-47  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0684957  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3666  FAD linked oxidase domain protein  33.19 
 
 
446 aa  187  3e-46  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.979447  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4161  FAD linked oxidase domain-containing protein  29.7 
 
 
481 aa  185  2.0000000000000003e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.127366 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4534  FAD linked oxidase domain-containing protein  29.91 
 
 
490 aa  181  2e-44  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.021743 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3122  FAD linked oxidase domain protein  34.62 
 
 
449 aa  181  2e-44  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.461384  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1027  FAD/FMN-containing dehydrogenase  31.35 
 
 
436 aa  180  4e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.548155  normal  0.360167 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6811  FAD/FMN-containing dehydrogenase-like protein  32.98 
 
 
596 aa  174  2.9999999999999996e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.154235 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00332  FAD linked oxidase, N-terminal  27.27 
 
 
705 aa  173  5e-42  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0351  FAD linked oxidase domain-containing protein  26.97 
 
 
466 aa  172  1e-41  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1816  FAD linked oxidase domain-containing protein  30.11 
 
 
460 aa  171  3e-41  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0655989  normal  0.012595 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4754  FAD linked oxidase domain protein  30.17 
 
 
467 aa  169  1e-40  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.13941 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3943  FAD linked oxidase domain protein  27.15 
 
 
448 aa  165  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2907  FAD linked oxidase domain protein  32.1 
 
 
470 aa  162  9e-39  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.777851  normal  0.173158 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1448  histidine kinase  31.35 
 
 
487 aa  162  1e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.253596 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0426  FAD-dependent oxidase  26.14 
 
 
444 aa  161  2e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0166645  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_09308  FAD binding domain protein (AFU_orthologue; AFUA_2G00730)  30.82 
 
 
473 aa  161  3e-38  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.898615 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1435  FAD linked oxidase domain-containing protein  28.67 
 
 
462 aa  159  1e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.910534  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1417  FAD linked oxidase-like protein  28.67 
 
 
462 aa  159  1e-37  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1637  FAD linked oxidase domain-containing protein  25.05 
 
 
449 aa  158  2e-37  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3087  FAD linked oxidase-like protein  30.54 
 
 
752 aa  158  2e-37  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0347  FAD linked oxidase-like  30.02 
 
 
459 aa  158  2e-37  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.604176  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0376  FAD linked oxidase domain protein  30.36 
 
 
753 aa  157  3e-37  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.169515  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06290  FAD/FMN-dependent dehydrogenase  30.8 
 
 
734 aa  155  1e-36  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.945102  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05846  FAD binding oxidoreductase, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G14630)  29.28 
 
 
472 aa  155  2e-36  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4892  FAD-dependent oxidase  25.27 
 
 
444 aa  154  2e-36  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.070023  normal  0.492965 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4792  FAD linked oxidase domain-containing protein  29.81 
 
 
462 aa  155  2e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.528841  normal  0.944989 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1767  FAD linked oxidase domain-containing protein  29.16 
 
 
484 aa  154  4e-36  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.778905  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0043  twin-arginine translocation pathway signal  32.72 
 
 
532 aa  153  8e-36  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.162495  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1471  FAD linked oxidase domain-containing protein  28.01 
 
 
462 aa  152  8.999999999999999e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0061  FAD linked oxidase domain protein  30.04 
 
 
474 aa  150  3e-35  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2430  FAD linked oxidase domain protein  30.68 
 
 
459 aa  151  3e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.000620146  normal  0.138472 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0404  putative reticuline oxidase  25.76 
 
 
448 aa  150  3e-35  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.993736  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1131  FAD linked oxidase domain protein  32.1 
 
 
447 aa  150  4e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0926  FAD linked oxidase domain protein  30.67 
 
 
764 aa  149  8e-35  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3376  FAD linked oxidase domain-containing protein  32.1 
 
 
726 aa  149  9e-35  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.082286  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2044  FAD linked oxidase domain-containing protein  28.75 
 
 
490 aa  146  8.000000000000001e-34  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.412161  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7289  FAD linked oxidase domain-containing protein  32.61 
 
 
542 aa  145  1e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0772845  normal  0.274772 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2404  FAD linked oxidase domain protein  32.45 
 
 
495 aa  144  3e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.173158  hitchhiker  0.00629594 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5613  FAD linked oxidase domain-containing protein  29.57 
 
 
445 aa  144  4e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4651  FAD linked oxidase domain-containing protein  29.91 
 
 
462 aa  143  8e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.338628  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2963  FAD binding domain-containing protein  28.45 
 
 
805 aa  143  8e-33  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000276895 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1824  FAD linked oxidase domain protein  32.35 
 
 
439 aa  142  9.999999999999999e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3628  FAD linked oxidase domain protein  31.22 
 
 
451 aa  142  9.999999999999999e-33  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2614  FAD linked oxidase domain-containing protein  28.45 
 
 
805 aa  142  1.9999999999999998e-32  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.258933  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6331  FAD linked oxidase domain protein  30.45 
 
 
480 aa  139  7e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00000929143  hitchhiker  0.000833417 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7882  FAD/FMN-containing dehydrogenase  32.56 
 
 
436 aa  139  1e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0408  putative reticuline oxidase  25.76 
 
 
448 aa  136  6.0000000000000005e-31  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.486233  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>