More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_B0760 on replicon NC_007952
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008543  Bcen2424_4266  GntR family transcriptional regulator  65.15 
 
 		 494 aa  639    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.501313  normal  0.325137 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4510  transcriptional regulator  75.82 
 
 		 489 aa  745    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.111052  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1740  GntR family transcriptional regulator  64.74 
 
 		 494 aa  637    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.844969  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4167  transcriptional regulator  64.04 
 
 		 509 aa  636    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.117681  normal  0.924645 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0760  GntR family transcriptional regulator  100 
 
 		 490 aa  988    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.996679  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4441  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  92.24 
 
 		 490 aa  898    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.944559 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4100  GntR family transcriptional regulator  65.15 
 
 		 494 aa  639    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.959861  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3251  transcriptional regulator  65.15 
 
 		 494 aa  640    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3694  GntR family transcriptional regulator  63.64 
 
 		 494 aa  627  1e-178  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.385244  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4324  transcriptional regulator  62.47 
 
 		 495 aa  612  9.999999999999999e-175  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.203783 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3611  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  60.44 
 
 		 485 aa  595  1e-169  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.444902  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3289  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain protein  61.43 
 
 		 485 aa  591  1e-167  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1805  GntR family transcriptional regulator  60.49 
 
 		 504 aa  588  1e-167  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1208  GntR family transcriptional regulator  61.59 
 
 		 574 aa  588  1e-167  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1682  transcriptional regulator  61.66 
 
 		 493 aa  580  1e-164  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1600  GntR family regulatory protein  61.87 
 
 		 493 aa  578  1.0000000000000001e-163  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0192  GntR family regulatory protein  61.66 
 
 		 570 aa  577  1.0000000000000001e-163  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4318  GntR family transcriptional regulator  58.97 
 
 		 504 aa  573  1.0000000000000001e-162  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.632192  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03480  GntR family transcriptional regulator  54 
 
 		 473 aa  478  1e-133  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000000129974 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0346  GntR family transcriptional regulator  52.77 
 
 		 476 aa  468  9.999999999999999e-131  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3202  GntR family transcriptional regulator  44.99 
 
 		 478 aa  428  1e-119  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00416739 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1085  GntR family transcriptional regulator  47.41 
 
 		 475 aa  426  1e-118  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.350273 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3750  GntR family transcriptional regulator  46.63 
 
 		 477 aa  405  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.144993  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2153  transcriptional regulator  46.84 
 
 		 502 aa  405  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0387109 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2013  GntR family transcriptional regulator  46.83 
 
 		 498 aa  408  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1714  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  44.44 
 
 		 488 aa  360  3e-98  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0550689  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1688  GntR family transcriptional regulator  44.38 
 
 		 491 aa  360  3e-98  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.82306  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1641  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  44.7 
 
 		 488 aa  360  4e-98  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.119637  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2233  GntR family transcriptional regulator  44.24 
 
 		 488 aa  353  2.9999999999999997e-96  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.420665  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2172  GntR family transcriptional regulator  38.45 
 
 		 477 aa  313  3.9999999999999997e-84  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1933  GntR family transcriptional regulator  37.47 
 
 		 490 aa  302  1e-80  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.100433  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0136  GntR family transcriptional regulator  42.89 
 
 		 496 aa  300  5e-80  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3892  GntR family transcriptional regulator  37.21 
 
 		 492 aa  286  5e-76  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.179019  normal  0.485504 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5117  transcriptional regulator  37.4 
 
 		 508 aa  286  5.999999999999999e-76  Pseudomonas putida W619  Bacteria  unclonable  0.0000000208159  normal  0.0731219 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5345  transcriptional regulator  39.76 
 
 		 506 aa  286  7e-76  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0493543 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5342  GntR family transcriptional regulator  37.17 
 
 		 509 aa  285  1.0000000000000001e-75  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000722465 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2297  GntR family transcriptional regulator  40.37 
 
 		 501 aa  284  2.0000000000000002e-75  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.35156  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5633  GntR family transcriptional regulator  34.6 
 
 		 517 aa  283  7.000000000000001e-75  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000615538  normal  0.236104 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5251  GntR family transcriptional regulator  37.02 
 
 		 509 aa  281  1e-74  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.519291 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4020  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain protein  34.79 
 
 		 499 aa  280  3e-74  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.703474  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5076  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  38.11 
 
 		 472 aa  280  5e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5056  regulatory protein, GntR  35.04 
 
 		 520 aa  279  9e-74  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  unclonable  0.0000152055  normal  0.949132 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1143  GntR family transcriptional regulator  35.56 
 
 		 496 aa  279  9e-74  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2304  regulatory protein GntR, HTH  34.87 
 
 		 475 aa  278  1e-73  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5504  transcriptional regulator, GntR family  35.57 
 
 		 520 aa  278  2e-73  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5391  transcriptional regulator  37.15 
 
 		 509 aa  278  2e-73  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.253395  normal  0.0145041 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1152  GntR family transcriptional regulator  37.37 
 
 		 492 aa  278  2e-73  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2546  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain protein  38.33 
 
 		 497 aa  277  3e-73  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.474867  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10010  putative transcriptional regulator  35.91 
 
 		 496 aa  276  5e-73  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.287288  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1609  GntR family transcriptional regulator  35.92 
 
 		 569 aa  276  8e-73  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0318445  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2234  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  36.85 
 
 		 497 aa  275  1.0000000000000001e-72  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000463  transcriptional regulator  33.82 
 
 		 467 aa  273  5.000000000000001e-72  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.566945  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0986  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  36.4 
 
 		 495 aa  273  5.000000000000001e-72  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0130  GntR family transcriptional regulator  36.49 
 
 		 490 aa  273  6e-72  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6170  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  39.21 
 
 		 523 aa  273  7e-72  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4139  GntR family transcriptional regulator  34.38 
 
 		 503 aa  272  1e-71  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.5231  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3136  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  35.17 
 
 		 496 aa  270  2.9999999999999997e-71  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5126  GntR family transcriptional regulator  38.33 
 
 		 492 aa  270  2.9999999999999997e-71  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.835239  normal  0.332894 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1925  GntR family transcriptional regulator  38.99 
 
 		 488 aa  269  7e-71  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0569  transcriptional regulator  36.14 
 
 		 499 aa  269  8e-71  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0030  putative transcription regulator protein  38.36 
 
 		 509 aa  268  2e-70  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3668  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain protein  36 
 
 		 472 aa  268  2e-70  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.271515  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3267  transcriptional regulator  38.33 
 
 		 492 aa  267  2.9999999999999995e-70  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3840  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  34.63 
 
 		 499 aa  267  4e-70  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3720  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  37.4 
 
 		 507 aa  266  5.999999999999999e-70  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3397  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain protein  38.54 
 
 		 504 aa  265  1e-69  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3519  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  36.52 
 
 		 471 aa  265  2e-69  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1783  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  36.86 
 
 		 501 aa  264  3e-69  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.26432  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1866  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  37.24 
 
 		 495 aa  264  3e-69  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0423  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  36.19 
 
 		 494 aa  264  3e-69  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4721  GntR family transcriptional regulator  34.71 
 
 		 492 aa  264  3e-69  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.967408  normal  0.610442 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3003  GntR family transcriptional regulator  34.1 
 
 		 487 aa  263  4e-69  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.32  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2224  transcriptional regulator  37.03 
 
 		 510 aa  263  4.999999999999999e-69  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0182275 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0891  transcriptional regulator  36.12 
 
 		 504 aa  263  4.999999999999999e-69  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00132013  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3719  transcriptional regulator  35.65 
 
 		 476 aa  263  6e-69  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5145  transcriptional regulator  37.47 
 
 		 516 aa  263  8e-69  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3365  transcriptional regulator  35.64 
 
 		 503 aa  262  1e-68  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.987625  normal  0.688219 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4307  transcriptional regulator  37.18 
 
 		 488 aa  262  1e-68  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1023  transcriptional regulator  32.56 
 
 		 485 aa  262  1e-68  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.582702 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5427  transcriptional regulator  35.79 
 
 		 490 aa  262  1e-68  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.491975  normal  0.163691 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3105  GntR family transcriptional regulator  33.95 
 
 		 501 aa  261  2e-68  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1217  GntR family transcriptional regulator  33.95 
 
 		 501 aa  261  2e-68  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1480  GntR family transcriptional regulator  40.08 
 
 		 502 aa  260  3e-68  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2795  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  35.7 
 
 		 500 aa  260  3e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.77384  normal  0.599586 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1398  GntR family transcriptional regulator  40.08 
 
 		 502 aa  260  3e-68  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.309369  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0133  GntR family transcriptional regulator  40.08 
 
 		 502 aa  260  3e-68  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0801  regulatory protein GntR, HTH  36.11 
 
 		 508 aa  261  3e-68  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0129569  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0515  GntR family transcriptional regulator  40.08 
 
 		 498 aa  260  4e-68  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5360  GntR family transcriptional regulator  35.76 
 
 		 502 aa  260  4e-68  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.881059  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3006  GntR family transcriptional regulator  35.76 
 
 		 502 aa  260  4e-68  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4910  transcriptional regulator  35.76 
 
 		 502 aa  260  4e-68  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1693  GntR family transcriptional regulator  39.83 
 
 		 502 aa  260  5.0000000000000005e-68  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0988  transcriptional regulator  40.08 
 
 		 502 aa  259  6e-68  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1011  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  32.35 
 
 		 485 aa  259  6e-68  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1334  transcriptional regulator  33.75 
 
 		 501 aa  259  7e-68  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6889  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  34.71 
 
 		 515 aa  259  7e-68  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0343806  normal  0.248624 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4852  transcriptional regulator  35.32 
 
 		 523 aa  259  7e-68  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.791352 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3403  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  36.16 
 
 		 489 aa  259  7e-68  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.335079 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4617  GntR family transcriptional regulator  37.27 
 
 		 516 aa  259  7e-68  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.814489  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0281  GntR family transcriptional regulator  35.43 
 
 		 503 aa  259  8e-68  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>