More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_B0617 on replicon NC_007952
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007952  Bxe_B0617  AraC family transcriptional regulator  100 
 
 
273 aa  543  1e-153  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0294699 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4288  transcriptional regulator, AraC family  89.01 
 
 
273 aa  457  9.999999999999999e-129  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.170174 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4452  AraC family transcriptional regulator  67.27 
 
 
275 aa  350  1e-95  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.686924 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4209  transcriptional regulator, AraC family  51.14 
 
 
275 aa  240  2e-62  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0776695  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4319  transcriptional regulator, AraC family  50.97 
 
 
259 aa  232  6e-60  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.15706 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2950  transcriptional regulator, AraC family  48.16 
 
 
268 aa  230  2e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0105763  normal  0.912836 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2692  transcriptional regulator, AraC family  49.26 
 
 
268 aa  227  2e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3557  AraC family transcriptional regulator  46.52 
 
 
269 aa  227  2e-58  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3415  AraC family transcriptional regulator  47.08 
 
 
266 aa  223  3e-57  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0007  AraC family transcriptional regulator  47.46 
 
 
272 aa  222  4e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3066  AraC family transcriptional regulator  50 
 
 
275 aa  221  8e-57  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.324544  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3802  AraC family transcriptional regulator  49.63 
 
 
264 aa  214  9.999999999999999e-55  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00614706 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0040  transcriptional regulator, AraC family  46.99 
 
 
268 aa  213  2.9999999999999995e-54  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.451948  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4705  AraC family transcriptional regulator  51.35 
 
 
264 aa  213  2.9999999999999995e-54  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.974796  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4183  AraC family transcriptional regulator  50.58 
 
 
264 aa  212  7e-54  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.928352  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5480  AraC family transcriptional regulator  51.72 
 
 
264 aa  207  2e-52  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.280485 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3564  AraC family transcriptional regulator  51.72 
 
 
264 aa  207  2e-52  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.682974  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4803  AraC family transcriptional regulator  51.72 
 
 
264 aa  207  2e-52  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0321  transcriptional regulator, AraC family  51.33 
 
 
264 aa  203  2e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.141392  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2371  AraC family transcriptional regulator  51.75 
 
 
263 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0360277  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01763  transcription regulator protein  43.73 
 
 
274 aa  200  1.9999999999999998e-50  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.246898 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0901  AraC family transcriptional regulator  51.34 
 
 
264 aa  195  8.000000000000001e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2143  AraC family transcriptional regulator  51.3 
 
 
266 aa  190  2e-47  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0635753  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1126  AraC family transcriptional regulator  51.3 
 
 
266 aa  189  4e-47  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.209854  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0931  AraC family transcriptional regulator  51.3 
 
 
266 aa  189  4e-47  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.846737  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2007  AraC family transcriptional regulator  51.3 
 
 
266 aa  189  4e-47  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1568  AraC family transcriptional regulator  51.3 
 
 
266 aa  189  4e-47  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0287073  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0228  AraC family transcriptional regulator  51.3 
 
 
266 aa  189  4e-47  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1986  AraC family transcriptional regulator  50.93 
 
 
266 aa  187  1e-46  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5726  transcriptional regulator, AraC family  41.15 
 
 
286 aa  157  3e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3138  AraC family transcriptional regulator  37.07 
 
 
279 aa  154  1e-36  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.606385 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2693  AraC family transcriptional regulator  36.03 
 
 
278 aa  145  5e-34  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2527  AraC family transcriptional regulator  36.03 
 
 
278 aa  145  1e-33  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2594  AraC family transcriptional regulator  36.03 
 
 
278 aa  144  2e-33  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2537  AraC family transcriptional regulator  37.1 
 
 
312 aa  144  2e-33  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1762  AraC/XylS family transcriptional regulator  35.22 
 
 
278 aa  139  4.999999999999999e-32  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1460  AraC family transcriptional regulator  35.22 
 
 
278 aa  139  4.999999999999999e-32  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0236  AraC/XylS family transcriptional regulator  35.25 
 
 
277 aa  139  6e-32  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1568  AraC family transcriptional regulator  35.22 
 
 
278 aa  139  6e-32  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1599  AraC family transcriptional regulator  35.22 
 
 
278 aa  138  7.999999999999999e-32  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000366861  normal  0.399443 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1562  AraC family transcriptional regulator  35.22 
 
 
278 aa  138  7.999999999999999e-32  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001441  L-rhamnose operon transcriptional activator RhaR  33.47 
 
 
275 aa  136  3.0000000000000003e-31  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06279  hypothetical protein  31.42 
 
 
275 aa  133  3e-30  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2781  transcriptional regulator, AraC family  34.82 
 
 
271 aa  133  3e-30  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.109963 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1472  transcriptional regulator, AraC family  31.78 
 
 
269 aa  132  6e-30  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.462639  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3689  AraC family transcriptional regulator  29.17 
 
 
280 aa  130  2.0000000000000002e-29  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0667  AraC family transcriptional regulator  29.55 
 
 
280 aa  130  3e-29  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0698  AraC family transcriptional regulator  29.17 
 
 
280 aa  129  6e-29  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0479  AraC family transcriptional regulator  35.61 
 
 
279 aa  129  6e-29  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00109362 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3367  AraC family transcriptional regulator  30 
 
 
276 aa  128  1.0000000000000001e-28  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3537  AraC family transcriptional regulator  30 
 
 
276 aa  128  1.0000000000000001e-28  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1187  transcriptional regulator, AraC-family  28.68 
 
 
278 aa  127  2.0000000000000002e-28  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0586  AraC family transcriptional regulator  29.62 
 
 
276 aa  127  3e-28  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0688  transcriptional regulator, AraC family  29.17 
 
 
280 aa  126  3e-28  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1357  transcriptional regulator, AraC family  33.06 
 
 
277 aa  126  5e-28  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.193095  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1212  transcriptional regulator, AraC-family  26.47 
 
 
280 aa  125  7e-28  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1549  transcriptional regulator, AraC family  34.44 
 
 
311 aa  123  4e-27  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00923391  normal  0.0459445 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0693  AraC family transcriptional regulator  27.31 
 
 
276 aa  122  9e-27  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2165  AraC family transcriptional regulator  31.43 
 
 
277 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1049  AraC family transcriptional regulator  35.89 
 
 
276 aa  119  3.9999999999999996e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000110999  normal  0.626735 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0091  AraC family transcriptional regulator  35.66 
 
 
278 aa  118  9e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3439  AraC family transcriptional regulator  32.79 
 
 
282 aa  118  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5342  AraC family transcriptional regulator  31.92 
 
 
276 aa  118  9.999999999999999e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.975436  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2300  AraC family transcriptional regulator  28.24 
 
 
274 aa  118  9.999999999999999e-26  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.457981  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0973  AraC family transcriptional regulator  34.56 
 
 
300 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.000577914  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0766  AraC/XylS family transcriptional regulator  28.57 
 
 
273 aa  117  1.9999999999999998e-25  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2935  transcriptional regulator, AraC family  35.6 
 
 
276 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000000465121  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05420  putative transcriptional regulator  31.54 
 
 
264 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2324  AraC family transcriptional regulator  32.39 
 
 
282 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0805  AraC family transcriptional regulator  36.4 
 
 
275 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000161693  normal  0.19096 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0719  transcriptional regulator, AraC family  31.02 
 
 
281 aa  116  3e-25  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0320  AraC family transcriptional regulator  30.77 
 
 
281 aa  116  3e-25  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.996721  hitchhiker  0.0000353353 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1056  AraC family transcriptional regulator  33.21 
 
 
306 aa  116  5e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000221071  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0618  AraC family transcriptional regulator  32.85 
 
 
306 aa  115  6e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0105124  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1097  AraC family transcriptional regulator  32.85 
 
 
306 aa  115  6e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0000000022105  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0516  putative transcriptional regulator  31.7 
 
 
264 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1688  AraC family transcriptional regulator  32.26 
 
 
280 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0033  transcriptional regulator, AraC family  29.92 
 
 
281 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2453  AraC family transcriptional regulator  32.23 
 
 
279 aa  114  2.0000000000000002e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  unclonable  0.00000000000537916  normal  0.591211 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1047  transcriptional regulator, AraC family  32.81 
 
 
273 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.859066 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3327  AraC family transcriptional regulator  34.52 
 
 
279 aa  113  3e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.414693  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0977  AraC family transcriptional regulator  34.07 
 
 
300 aa  113  4.0000000000000004e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00000786642  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2855  AraC family substrate binding transcriptional regulator  29.12 
 
 
280 aa  112  5e-24  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.222069  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2497  AraC family transcriptional regulator  32.39 
 
 
260 aa  112  7.000000000000001e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.190674  normal  0.610858 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2388  AraC family transcriptional regulator  32.48 
 
 
278 aa  112  9e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.262251  unclonable  0.0000340178 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2442  AraC family transcriptional regulator  33.6 
 
 
278 aa  112  9e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.314191 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1509  transcriptional regulator AraC family  33.6 
 
 
284 aa  111  1.0000000000000001e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2505  transcriptional regulator, AraC family  28.4 
 
 
277 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.470919  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2206  AraC family transcriptional regulator  33.69 
 
 
303 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000287978  normal  0.709471 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1477  transcriptional regulator, AraC family  31.89 
 
 
278 aa  110  2.0000000000000002e-23  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.000537918  unclonable  0.00000296813 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2434  AraC family transcriptional regulator  33.73 
 
 
273 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4782  negative transcriptional regulator of cel operon  29.64 
 
 
271 aa  110  3e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0663748  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7070  transcriptional regulator AraC family  32.09 
 
 
283 aa  109  4.0000000000000004e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4856  negative transcriptional regulator of cel operon  30.04 
 
 
271 aa  109  5e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2462  AraC family transcriptional regulator  30.42 
 
 
267 aa  109  6e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.177963  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2237  putative transcriptional regulator  33.94 
 
 
278 aa  108  8.000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2552  transcriptional regulator, AraC family  32.97 
 
 
288 aa  108  1e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.974489  normal  0.68822 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3801  transcriptional regulator, AraC family  31.02 
 
 
278 aa  108  1e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3402  AraC protein, arabinose-binding/dimerisation  34.78 
 
 
281 aa  107  2e-22  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1801  AraC family transcriptional regulator  28.57 
 
 
278 aa  107  2e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>