273 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_B0554 on replicon NC_007952
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010676  Bphyt_4127  allantoate amidohydrolase  92.01 
 
 		 413 aa  758    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.638137  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0554  allantoate amidohydrolase  100 
 
 		 413 aa  825    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4610  allantoate amidohydrolase  73.86 
 
 		 414 aa  579  1e-164  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0920058  normal  0.113681 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2555  allantoate amidohydrolase  46.67 
 
 		 403 aa  333  4e-90  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3711  allantoate amidohydrolase  45.95 
 
 		 400 aa  329  7e-89  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7037  allantoate amidohydrolase  47.74 
 
 		 419 aa  323  4e-87  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.611985 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1574  allantoate amidohydrolase  45.95 
 
 		 400 aa  320  1.9999999999999998e-86  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.914199 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0781  allantoate amidohydrolase  37.16 
 
 		 412 aa  227  3e-58  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0027  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  35.54 
 
 		 413 aa  219  7e-56  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.187879 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0970  amidase  37.65 
 
 		 420 aa  213  5.999999999999999e-54  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2865  amidase  37.01 
 
 		 421 aa  207  3e-52  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.129348  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4821  allantoate amidohydrolase  37.44 
 
 		 407 aa  205  1e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0180  allantoate amidohydrolase  34.66 
 
 		 429 aa  205  1e-51  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3345  allantoate amidohydrolase  37.44 
 
 		 407 aa  205  1e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5235  allantoate amidohydrolase  36.7 
 
 		 407 aa  205  2e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.911931  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1622  allantoate amidohydrolase  37.65 
 
 		 418 aa  203  4e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.7496  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4480  N-carbamoyl-L-amino-acid hydrolase  36.27 
 
 		 420 aa  202  6e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0132912  normal  0.010992 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2909  allantoate amidohydrolase  37.19 
 
 		 407 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4170  allantoate amidohydrolase  37.19 
 
 		 407 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4258  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  34.98 
 
 		 412 aa  200  3e-50  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1586  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  35.66 
 
 		 418 aa  197  2.0000000000000003e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.484482  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4022  amidase  35.28 
 
 		 418 aa  197  2.0000000000000003e-49  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5111  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  32.46 
 
 		 447 aa  196  6e-49  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3964  allantoate amidohydrolase  37.16 
 
 		 414 aa  195  1e-48  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.790477  normal  0.0143809 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2091  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  35.65 
 
 		 415 aa  195  1e-48  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.131869  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1931  amidase, hydantoinase/carbamoylase  36.88 
 
 		 415 aa  194  2e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.876695  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3826  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  36.03 
 
 		 420 aa  194  2e-48  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4903  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  36.03 
 
 		 420 aa  194  2e-48  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.810439  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6570  amidase  36.39 
 
 		 429 aa  194  2e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0846344 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0379  amidase, hydantoinase/carbamoylase  36.63 
 
 		 415 aa  194  3e-48  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.480246  normal  0.16493 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4148  amidase  36.03 
 
 		 421 aa  194  3e-48  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3623  allantoate amidohydrolase  35.66 
 
 		 415 aa  192  7e-48  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.90869 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2561  amidase, hydantoinase/carbamoylase  35.8 
 
 		 426 aa  192  7e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3330  amidase, hydantoinase/carbamoylase  34.55 
 
 		 436 aa  192  8e-48  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0660  allantoate amidohydrolase  36.09 
 
 		 425 aa  192  1e-47  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0614  allantoate amidohydrolase  35.82 
 
 		 425 aa  191  2e-47  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1867  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  35.59 
 
 		 413 aa  191  2e-47  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.608993 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3439  allantoate amidohydrolase  35.66 
 
 		 427 aa  191  2e-47  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0973396  normal  0.474352 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0654  allantoate amidohydrolase  35.82 
 
 		 425 aa  190  4e-47  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.385596  normal  0.174957 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6569  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  35.31 
 
 		 426 aa  190  4e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.13575  normal  0.0102447 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1668  allantoate amidohydrolase  34.16 
 
 		 431 aa  189  5.999999999999999e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6654  allantoate amidohydrolase  37.68 
 
 		 426 aa  187  2e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0127692 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2881  allantoate amidohydrolase  33.58 
 
 		 416 aa  188  2e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.138552 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4755  amidase  36.12 
 
 		 419 aa  187  2e-46  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0047  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  34.65 
 
 		 428 aa  187  3e-46  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.21885  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1455  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  36.78 
 
 		 430 aa  186  6e-46  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.597555 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6087  amidase  35.57 
 
 		 429 aa  186  6e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.976805  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1293  amidase  36.78 
 
 		 411 aa  186  7e-46  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.569361  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4042  allantoate amidohydrolase  33.92 
 
 		 411 aa  186  9e-46  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  unclonable  0.00143061  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5723  amidase, hydantoinase/carbamoylase  35.57 
 
 		 523 aa  185  1.0000000000000001e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1342  allantoate amidohydrolase  37.13 
 
 		 417 aa  185  1.0000000000000001e-45  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.20068 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00466  N-carbamoyl-L-amino acid amidohydrolase  33.82 
 
 		 411 aa  184  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0561  allantoate amidohydrolase  33.33 
 
 		 411 aa  185  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0554  allantoate amidohydrolase  33.82 
 
 		 411 aa  184  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2632  allantoate amidohydrolase  35.09 
 
 		 429 aa  184  2.0000000000000003e-45  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.610948 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0634  allantoate amidohydrolase  35.27 
 
 		 411 aa  184  2.0000000000000003e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0575  allantoate amidohydrolase  35.27 
 
 		 411 aa  184  2.0000000000000003e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1854  allantoate amidohydrolase  32.6 
 
 		 425 aa  184  2.0000000000000003e-45  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0617  allantoate amidohydrolase  33.66 
 
 		 411 aa  184  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00471  hypothetical protein  33.82 
 
 		 411 aa  184  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0580  allantoate amidohydrolase  35.27 
 
 		 411 aa  184  2.0000000000000003e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.980604  normal  0.280695 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3341  allantoate amidohydrolase  35.41 
 
 		 409 aa  184  2.0000000000000003e-45  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0573  allantoate amidohydrolase  35.27 
 
 		 411 aa  184  2.0000000000000003e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1948  allantoate amidohydrolase  36.63 
 
 		 421 aa  184  3e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.361736  normal  0.810576 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6710  allantoate amidohydrolase  37.44 
 
 		 426 aa  184  3e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.150854  normal  0.55827 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1945  allantoate amidohydrolase  33.67 
 
 		 416 aa  184  3e-45  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3426  allantoate amidohydrolase  37.97 
 
 		 418 aa  183  4.0000000000000006e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6028  amidase  35.8 
 
 		 431 aa  183  4.0000000000000006e-45  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4490  allantoate amidohydrolase  38.36 
 
 		 423 aa  183  5.0000000000000004e-45  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.702219 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0419  allantoate amidohydrolase  35.94 
 
 		 418 aa  183  5.0000000000000004e-45  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0590  allantoate amidohydrolase  33.58 
 
 		 411 aa  183  6e-45  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3097  allantoate amidohydrolase  32.68 
 
 		 411 aa  183  6e-45  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4269  allantoate amidohydrolase  37.97 
 
 		 418 aa  183  6e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4097  allantoate amidohydrolase  37.97 
 
 		 418 aa  183  6e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.850952  normal  0.717406 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5349  allantoate amidohydrolase  36.7 
 
 		 426 aa  182  7e-45  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.223299 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6028  N-carbamoyl-L-amino acid hydrolase  35.27 
 
 		 424 aa  182  7e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1844  allantoate amidohydrolase  34.41 
 
 		 415 aa  182  7e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3463  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  35.98 
 
 		 418 aa  182  9.000000000000001e-45  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4034  allantoate amidohydrolase  35.5 
 
 		 427 aa  182  1e-44  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.319007  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1597  allantoate amidohydrolase  37.19 
 
 		 426 aa  182  1e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6234  allantoate amidohydrolase  37.19 
 
 		 426 aa  182  1e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.535811  normal  0.174767 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1881  amidase hydantoinase/carbamoylase family  34.41 
 
 		 412 aa  181  2e-44  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.85922 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5723  allantoate amidohydrolase  36.7 
 
 		 426 aa  181  2e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1680  allantoate amidohydrolase  33.89 
 
 		 459 aa  180  4e-44  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.363282  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0251  allantoate amidohydrolase  33.89 
 
 		 459 aa  180  4e-44  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6086  amidase  35.44 
 
 		 421 aa  180  4e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.315706 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1769  allantoate amidohydrolase  33.89 
 
 		 471 aa  180  4.999999999999999e-44  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.494309  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2555  amidase  34.79 
 
 		 408 aa  180  4.999999999999999e-44  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3636  allantoate amidohydrolase  35.91 
 
 		 427 aa  179  9e-44  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3896  allantoate amidohydrolase  35.38 
 
 		 412 aa  178  1e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2691  allantoate amidohydrolase  36.54 
 
 		 426 aa  179  1e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1804  allantoate amidohydrolase  35.25 
 
 		 427 aa  178  2e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.58036  normal  0.76978 
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3535  allantoate amidohydrolase  35.73 
 
 		 437 aa  177  2e-43  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3012  allantoate amidohydrolase  36.55 
 
 		 425 aa  178  2e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.980217 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2259  allantoate amidohydrolase  36.36 
 
 		 428 aa  178  2e-43  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1163  allantoate amidohydrolase  34.05 
 
 		 479 aa  178  2e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.146469  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4780  allantoate amidohydrolase  33.5 
 
 		 415 aa  178  2e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.105367 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0629  allantoate amidohydrolase  33.33 
 
 		 414 aa  177  3e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.223457 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1427  allantoate amidohydrolase  36.3 
 
 		 426 aa  177  3e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.841231  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5967  allantoate amidohydrolase  36.45 
 
 		 426 aa  177  4e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.619712 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>