More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_B0503 on replicon NC_007952
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007952  Bxe_B0503  putative glycosyltransferase  100 
 
 
363 aa  743    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4049  glycosyl transferase group 1  74.03 
 
 
363 aa  551  1e-155  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2250  putative glycosyltransferase  51.52 
 
 
384 aa  366  1e-100  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6015  glycosyl transferase group 1  52.34 
 
 
384 aa  366  1e-100  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.44691 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3700  glycosyl transferase group 1  50 
 
 
373 aa  331  1e-89  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.24149 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0459  glycosytransferase, putative  27.09 
 
 
350 aa  166  5.9999999999999996e-40  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00630871  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0154  glycosyl transferase, group 1 family protein  36.19 
 
 
360 aa  145  8.000000000000001e-34  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0450  putative polysaccharide biosynthesis protein  31.34 
 
 
365 aa  144  2e-33  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5302  glycosyl transferase group 1  32.52 
 
 
351 aa  127  4.0000000000000003e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6431  glycosyl transferase group 1  29.17 
 
 
380 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.823764 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2441  glycosyl transferase group 1  28.73 
 
 
351 aa  114  3e-24  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.719271  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0253  glycosyl transferase, group 1  26.9 
 
 
358 aa  113  5e-24  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3693  glycosyl transferase, group 1  32.43 
 
 
371 aa  112  1.0000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.419352 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0170  glycosyl transferase, group 1  31.45 
 
 
391 aa  111  2.0000000000000002e-23  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6235  glycosyl transferase group 1  33.46 
 
 
381 aa  110  3e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.93613  normal  0.352956 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5452  glycosyl transferase group 1  37.43 
 
 
438 aa  110  3e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.490154  hitchhiker  0.00474748 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3362  glycosyl transferase, group 1  28.17 
 
 
433 aa  108  1e-22  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0581443 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1977  glycosyl transferase, group 1 family protein  36.26 
 
 
443 aa  106  6e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.26927  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1377  glycosyl transferase, group 1 family protein  36.26 
 
 
443 aa  106  6e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.233611  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1287  glycosyl transferase, group 1 family protein  36.26 
 
 
443 aa  106  6e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3157  glycosyl transferase, group 1 family protein  36.26 
 
 
443 aa  106  6e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0998  glycosyl transferase, group 1 family protein  36.26 
 
 
499 aa  106  7e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3028  glycosyl transferase, group 1 family protein  35.71 
 
 
498 aa  106  7e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.220926  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2262  glycosyl transferase, group 1 family protein  36.26 
 
 
495 aa  106  7e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.333753  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6388  glycosyl transferase group 1  31.53 
 
 
438 aa  105  1e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.570684  normal  0.371052 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5640  glycosyl transferase, group 1  31.85 
 
 
438 aa  105  1e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.172665 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5249  glycosyl transferase group 1  39.6 
 
 
386 aa  104  2e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01600  glycogen synthase  27.02 
 
 
404 aa  103  4e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_874  glycosyl transferase, group 1  37.16 
 
 
405 aa  103  5e-21  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.285682  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2638  glycosyl transferase group 1  34.75 
 
 
367 aa  103  5e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0400002  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0826  glycosyl transferase group 1  40.13 
 
 
350 aa  103  6e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1748  glycosyl transferase group 1  36.46 
 
 
402 aa  103  7e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0115341 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1373  glycosyl transferase, group 1  31.53 
 
 
439 aa  102  8e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6456  glycosyl transferase, group 1  31.53 
 
 
439 aa  102  8e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.338178  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1833  glycosyl transferase group 1  28.81 
 
 
368 aa  102  1e-20  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1668  glycogen synthase  30.67 
 
 
411 aa  102  1e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1181  glycosyl transferase group 1  30.53 
 
 
419 aa  102  1e-20  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2249  glycosyl transferase group 1  36.09 
 
 
423 aa  102  1e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.143292  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4843  glycosyl transferase, group 1  26.6 
 
 
395 aa  101  2e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000641905  normal  0.0482294 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6048  glycosyl transferase group 1  31.21 
 
 
439 aa  101  2e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0604596 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2431  glycosyl transferase, group 1  33.65 
 
 
364 aa  100  3e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.704693  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4390  glycosyl transferase, group 1  34.81 
 
 
419 aa  100  4e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.907942  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1066  glycosyl transferase group 1  28.61 
 
 
368 aa  100  4e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0173089  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4495  glycosyl transferase group 1  25.23 
 
 
394 aa  100  4e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0833  glycosyl transferase group 1  35.23 
 
 
415 aa  100  4e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0562  glycosyltransferase  30 
 
 
416 aa  100  4e-20  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.841887  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1751  glycosyl transferase group 1  34.59 
 
 
453 aa  99.8  6e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1173  glycogen synthase  28.83 
 
 
404 aa  99.4  9e-20  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.0423768 
 
 
-
 
NC_002950  PG1682  glycosyl transferase, group 1 family protein  27.93 
 
 
420 aa  99  1e-19  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.961392 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0058  glycosyl transferase group 1  30.58 
 
 
366 aa  98.6  1e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.145995  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3727  glycosyl transferase group 1  31.25 
 
 
672 aa  98.6  2e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.121085  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0693  glycosyl transferase, group 1  31.78 
 
 
360 aa  97.8  2e-19  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00441091  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1002  glycosyl transferase, group 1 family protein  36.3 
 
 
405 aa  97.8  3e-19  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00183695  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1303  glycosyl transferase, group 1  29.94 
 
 
408 aa  97.4  3e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5593  glycosyl transferase group 1  34.07 
 
 
440 aa  97.8  3e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.420787 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2815  hypothetical protein  31.06 
 
 
341 aa  97.1  5e-19  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15860  glycogen synthase  30.4 
 
 
397 aa  96.7  5e-19  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.121629  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0978  glycosyl transferase, group 1 family protein  28.21 
 
 
382 aa  96.7  6e-19  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.000355781  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1534  glycosyl transferase, group 1  27.46 
 
 
411 aa  96.3  7e-19  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00818879  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21730  glycogen synthase  30.93 
 
 
404 aa  96.3  7e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0890  glycosyl transferase, group 1  35.21 
 
 
405 aa  95.9  9e-19  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0223562  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3375  glycosyl transferase group 1  34.92 
 
 
399 aa  95.5  1e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.133943  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3250  glycosyl transferase group 1  28.4 
 
 
360 aa  94.7  2e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2913  putative glycosyltransferase  34.25 
 
 
434 aa  95.1  2e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5074  UDP-N-acetylglucosamine  34.21 
 
 
418 aa  94.7  2e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.838773  normal  0.526532 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11690  glycogen synthase  29.66 
 
 
398 aa  94.7  2e-18  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.328537  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7902  glycosyltransferase  30.65 
 
 
406 aa  94.7  2e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2112  glycogen synthase  30.98 
 
 
396 aa  94.7  2e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1717  glycosyl transferase, group 1  29.7 
 
 
426 aa  94.7  2e-18  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.21193  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0847  glycosyl transferase, group 1  35.45 
 
 
370 aa  95.1  2e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.531187 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0212  glycogen synthase  26.52 
 
 
388 aa  94.4  2e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0008  glycosyl transferase group 1  28.16 
 
 
390 aa  94.4  3e-18  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2159  glycosyl transferase group 1  25.62 
 
 
420 aa  94.4  3e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0073  glycosyl transferase, group 1  38.56 
 
 
448 aa  94  3e-18  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0880  glycosyl transferase group 1  32.35 
 
 
376 aa  94.4  3e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0960108 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3803  glycosyl transferase group 1  34.55 
 
 
437 aa  94  4e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4880  glycosyl transferase group 1  34.55 
 
 
437 aa  94  4e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.240257  normal  0.0389994 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1119  glycogen synthase  32.51 
 
 
386 aa  94  4e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.493813  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3101  glycosyltransferase  34.05 
 
 
392 aa  93.6  5e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.325178  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0234  glycosyl transferase group 1  31.32 
 
 
385 aa  93.6  5e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1762  glycosyl transferase, group 1  36.46 
 
 
406 aa  93.6  5e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.379632 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2965  hypothetical protein  30.43 
 
 
342 aa  93.2  6e-18  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4196  glycosyl transferase group 1  33.15 
 
 
366 aa  93.2  6e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1866  Phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  30.33 
 
 
396 aa  93.2  6e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0080  glycosyl transferase group 1  36.59 
 
 
404 aa  93.2  7e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2020  glycosyl transferase group 1  27.99 
 
 
376 aa  92.8  8e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2548  glycosyl transferase, group 1  36.61 
 
 
367 aa  92  1e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.742963  normal  0.196776 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2547  glycosyl transferase group 1  28.37 
 
 
414 aa  92  1e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.148819 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0459  glycosyl transferase group 1  37.02 
 
 
418 aa  92  1e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.391248  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1638  glycosyl transferase group 1  32.4 
 
 
378 aa  92.4  1e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000167998  hitchhiker  0.00440424 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1822  glycogen synthase  30.37 
 
 
398 aa  92.4  1e-17  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.222954 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1426  glycosyl transferase group 1  28.79 
 
 
536 aa  92  1e-17  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2093  glycogen synthase  31.35 
 
 
395 aa  92  1e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5160  glycosyl transferase group 1  31.47 
 
 
800 aa  92.4  1e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.170469  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02589  Glycosyltransferase  27.53 
 
 
403 aa  91.7  2e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.147496  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1419  glycosyl transferase, group 1  28.45 
 
 
365 aa  91.7  2e-17  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3085  glycosyl transferase group 1  36.36 
 
 
409 aa  92  2e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1062  glycosyl transferase group 1  35.98 
 
 
400 aa  91.3  2e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1596  glycosyl transferase, group 1  26.98 
 
 
386 aa  91.3  2e-17  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0869  phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  27.14 
 
 
382 aa  91.3  2e-17  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00000612209  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>