More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_B0475 on replicon NC_007952
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007347  Reut_A0929  bacteriocin-processing peptidase  78.87 
 
 
1040 aa  1692    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.247839  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4002  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporter  97.74 
 
 
1018 aa  2029    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0475  bacteriocin-processing peptidase  100 
 
 
1018 aa  2085    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.977404  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3834  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporter  88.7 
 
 
1018 aa  1884    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.823997 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2857  cyclic nucleotide-binding protein  42.92 
 
 
1038 aa  613  9.999999999999999e-175  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.590453  hitchhiker  0.00593059 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3264  cyclic nucleotide-binding protein  42.78 
 
 
1038 aa  611  1e-173  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3519  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporter  41.43 
 
 
1019 aa  602  1.0000000000000001e-171  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0728  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporters  36.64 
 
 
1013 aa  599  1e-170  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.637206  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2680  cyclic nucleotide-binding protein  38.95 
 
 
906 aa  599  1e-170  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3424  cyclic nucleotide-binding protein  39.06 
 
 
906 aa  601  1e-170  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0225  bacteriocin-processing peptidase  37.32 
 
 
908 aa  586  1e-166  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0410  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporter  37.91 
 
 
908 aa  585  1.0000000000000001e-165  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4383  bacteriocin-processing peptidase  43.03 
 
 
1011 aa  572  1e-161  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.443877  normal  0.0633498 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1097  bacteriocin-processing peptidase  36.85 
 
 
1042 aa  532  1e-149  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.610594  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4225  Type I secretion system ATPase, HlyB  34.6 
 
 
865 aa  487  1e-136  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1455  cyclic nucleotide-binding protein  33.45 
 
 
892 aa  476  1e-132  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5423  toxin secretion ABC transporter (ATP-binding and membrane protein)  38.18 
 
 
705 aa  474  1e-132  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.192107 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2265  ABC-type bacteriocin transporter  37.45 
 
 
727 aa  470  1.0000000000000001e-131  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0292  cyclolysin-type secretion composite ATP-binding transmembrane ABC transporter protein  37.76 
 
 
725 aa  468  9.999999999999999e-131  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0404575 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5003  type I secretion system ATPase  36.64 
 
 
728 aa  453  1.0000000000000001e-126  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.19193  normal  0.91049 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4927  toxin secretion ABC transporter protein  35.21 
 
 
731 aa  451  1e-125  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0719  bacteriocin ABC transporter, ATP-binding/permease protein, putative  36.06 
 
 
717 aa  451  1e-125  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00348631  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3076  Type I secretion system ATPase, HlyB  35.15 
 
 
720 aa  452  1e-125  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4165  type I secretion system ATPase  37.04 
 
 
726 aa  452  1e-125  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.143199  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2576  type I secretion system ATPase  36.07 
 
 
750 aa  452  1e-125  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00352017 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5157  type I secretion system ATPase  36.13 
 
 
728 aa  450  1e-125  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.819615 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1970  type I secretion system ATPase  35.88 
 
 
731 aa  449  1.0000000000000001e-124  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.231744  normal  0.591198 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0251  ABC-type bacteriocin transporter  34.72 
 
 
734 aa  444  1e-123  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000911417  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0327  ABC-type bacteriocin transporter  34.72 
 
 
734 aa  446  1e-123  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2998  type I secretion system ATPase  36.26 
 
 
753 aa  441  9.999999999999999e-123  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1082  bacteriocin ABC transporter, ATP-binding/permease protein, putative  34.81 
 
 
738 aa  441  9.999999999999999e-123  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.706831  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2369  type I secretion system ATPase  35.43 
 
 
743 aa  441  9.999999999999999e-123  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0019  type I secretion system ATPase family protein  35.89 
 
 
706 aa  442  9.999999999999999e-123  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0534  bacteriocin-processing peptidase  34.97 
 
 
727 aa  441  9.999999999999999e-123  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0782715  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1188  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporters  29.97 
 
 
1003 aa  439  1e-121  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.229753  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1499  type I secretion system ATPase  38.33 
 
 
720 aa  438  1e-121  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1566  toxin secretion ABC transporter ATP-binding protein  37.73 
 
 
720 aa  438  1e-121  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.206767  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6772  type I secretion system ATPase  35.84 
 
 
712 aa  438  1e-121  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0167  ABC-type bacteriocin transporter family protein  35.86 
 
 
739 aa  433  1e-119  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3578  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporter  33.66 
 
 
1024 aa  431  1e-119  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0545  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporter  34.77 
 
 
1008 aa  430  1e-119  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.782135  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0528  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporter  34.77 
 
 
1008 aa  430  1e-119  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0984  type I secretion system ATPase  39.96 
 
 
700 aa  429  1e-118  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0815075  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2693  type I secretion system ATPase  34.66 
 
 
724 aa  427  1e-118  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1905  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  34.49 
 
 
1000 aa  429  1e-118  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0871226  normal  0.242471 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2316  type I secretion system ATPase  34.66 
 
 
724 aa  427  1e-118  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1837  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporters  29.7 
 
 
1001 aa  427  1e-118  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.548602  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2431  bacteriocin ABC transporter, ATP-binding/permease protein, putative  35.25 
 
 
759 aa  425  1e-117  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.00637775  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4910  ABC transporter related  34.4 
 
 
738 aa  426  1e-117  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.948579  normal  0.144734 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1869  ABC transporter related  32.61 
 
 
726 aa  420  1e-116  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1020  Type I secretion system ATPase, HlyB  35.06 
 
 
739 aa  421  1e-116  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.543638 
 
 
-
 
NC_010502  Mrad2831_6494  type I secretion system ATPase  34.16 
 
 
721 aa  423  1e-116  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1659  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporter  32.84 
 
 
1013 aa  419  9.999999999999999e-116  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  unclonable  0.000000123584  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3347  ABC-type bacteriocin transporter  33.85 
 
 
721 aa  418  9.999999999999999e-116  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0880292 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1296  ABC transporter related  32.51 
 
 
730 aa  415  1e-114  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3820  type I secretion system ATPase  34.43 
 
 
741 aa  415  1e-114  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0301354  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21011  ATPase  34.17 
 
 
930 aa  413  1e-114  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.625289 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1958  type I secretion system ATPase  34.48 
 
 
739 aa  415  1e-114  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0884  type I secretion system ATPase  35.2 
 
 
726 aa  412  1e-113  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1446  leukotoxin translocation ATP-binding protein LktB  35.03 
 
 
699 aa  410  1e-113  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0404979  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1224  ATPase  33.56 
 
 
980 aa  411  1e-113  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.25476  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1271  ABC transporter related  32.43 
 
 
737 aa  410  1e-113  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1164  ABC transporter related  34.22 
 
 
716 aa  412  1e-113  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.589518  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0635  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporter  33.43 
 
 
1016 aa  410  1e-113  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  unclonable  0.000920365  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1843  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporters  34.18 
 
 
1012 aa  410  1e-113  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00224426  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4229  ABC transporter related protein  32.83 
 
 
726 aa  412  1e-113  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0558  ABC transporter related  31.3 
 
 
725 aa  412  1e-113  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.463125 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0425  bacteriocin ABC transporter, ATP-binding/permease, putative  34.21 
 
 
721 aa  401  9.999999999999999e-111  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0117  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  35.66 
 
 
1006 aa  402  9.999999999999999e-111  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.152098  n/a   
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3696  type I secretion system ATPase  34.46 
 
 
720 aa  399  1e-109  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.202443 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0217  Type I secretion system ATPase, HlyB  33.19 
 
 
971 aa  398  1e-109  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.349074  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1182  ATPase  34.51 
 
 
982 aa  399  1e-109  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4795  ABC transporter related  31.48 
 
 
741 aa  397  1e-109  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.112132  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1352  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporters  31.66 
 
 
999 aa  398  1e-109  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.897617  normal  0.235 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00861  ABC transporter, multi drug efflux family protein  35.55 
 
 
975 aa  399  1e-109  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.02392 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2527  Type I secretion system ATPase, HlyB  32.83 
 
 
976 aa  395  1e-108  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.76843 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4701  ABC transporter related protein  34.25 
 
 
728 aa  393  1e-108  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0115772  normal  0.281049 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1056  putative toxin secretion transporter  32.26 
 
 
719 aa  390  1e-107  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01291  hypothetical protein  30.45 
 
 
986 aa  390  1e-107  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.838373 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6211  ABC transporter related  33.15 
 
 
714 aa  389  1e-106  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.332953  normal  0.16806 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6407  ABC transporter related  32.86 
 
 
714 aa  386  1e-105  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14311  hypothetical protein  34.37 
 
 
968 aa  383  1e-105  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2002  type I secretion system ATPase  32 
 
 
712 aa  381  1e-104  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5839  ABC transporter related protein  34.94 
 
 
743 aa  381  1e-104  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.348328 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1889  type I secretion system ATPase  32.14 
 
 
712 aa  382  1e-104  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1623  ABC transporter related protein  32.79 
 
 
735 aa  379  1e-103  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.068726  normal  0.025744 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2258  type I secretion system ATPase  31.86 
 
 
712 aa  379  1e-103  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0658  lactococcin g processing and transport ATP-binding protein  32.08 
 
 
760 aa  379  1e-103  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.357384  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3122  ABC transporter related  32.91 
 
 
721 aa  379  1e-103  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.742255  normal 
 
 
-
 
NC_008503  LACR_A02  bacteriocin-processing peptidase  32.83 
 
 
716 aa  375  1e-102  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5329  ABC transporter related  32.28 
 
 
735 aa  372  1e-101  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.580332 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1143  colicin V processing peptidase cysteine peptidase MEROPS family C39  31.35 
 
 
733 aa  373  1e-101  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0865539  normal  0.618932 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0570  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  33.71 
 
 
717 aa  371  1e-101  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0237  bacteriocin-processing peptidase  31.83 
 
 
715 aa  370  1e-100  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.821835  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3807  ABC transporter related  29.43 
 
 
726 aa  367  1e-100  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0349479 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1653  bacteriocin/lantibiotic ABC transporter  31.49 
 
 
722 aa  367  1e-100  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.521591  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0890  ABC transporter related protein  30.63 
 
 
771 aa  369  1e-100  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0075  ABC transporter-like protein protein  30.71 
 
 
722 aa  366  1e-99  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.254201  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3741  ABC transporter related  32.36 
 
 
720 aa  365  2e-99  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0543649  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03510  toxin secretion ABC transporter, ATP-binding subunit/permease protein, putative  31.95 
 
 
724 aa  365  3e-99  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>