More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_B0370 on replicon NC_007952
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007952  Bxe_B0370  OmpC family outer membrane porin  100 
 
 
389 aa  792  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.166204  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2546  outer membrane porin  43.53 
 
 
384 aa  285  1e-75  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0263  putative outer membrane porin  43.53 
 
 
384 aa  285  1e-75  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0533  putative outer membrane porin  43.53 
 
 
384 aa  285  1e-75  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.121969  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1374  outer membrane porin  43.53 
 
 
384 aa  285  1e-75  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1294  outer membrane porin  43.53 
 
 
384 aa  285  1e-75  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1286  putative outer membrane porin  43.53 
 
 
384 aa  285  1e-75  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1454  outer membrane porin OpcP  42.79 
 
 
414 aa  285  1e-75  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.176502  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1034  putative outer membrane porin  43.53 
 
 
384 aa  285  1e-75  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1234  outer membrane protein (porin)  42.29 
 
 
384 aa  278  1e-73  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00398986  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4948  porin Gram-negative type  43.68 
 
 
386 aa  278  1e-73  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0530377  normal  0.0846854 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1157  porin  43.04 
 
 
379 aa  278  2e-73  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1699  OmpC family outer membrane porin  43.09 
 
 
386 aa  277  3e-73  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0712335  normal  0.645361 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0393  OmpC family outer membrane porin  40.85 
 
 
386 aa  275  1e-72  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.728955  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0674  porin  42.5 
 
 
381 aa  274  2e-72  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.161927  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1989  porin Gram-negative type  43.46 
 
 
385 aa  273  3e-72  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.508045 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3740  porin  40.79 
 
 
389 aa  272  7e-72  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4628  porin  40.79 
 
 
389 aa  272  7e-72  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4607  porin  41.36 
 
 
384 aa  271  2e-71  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.192363  normal  0.0218853 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5697  porin  41.36 
 
 
384 aa  271  2e-71  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00705206 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5676  porin  40.29 
 
 
389 aa  271  2e-71  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.919602 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1003  porin  42.33 
 
 
383 aa  271  2e-71  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000241018  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3761  porin  41.36 
 
 
384 aa  271  2e-71  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.192618  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0524  porin  43.15 
 
 
374 aa  270  3e-71  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000201406  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4111  outer membrane protein, (porin)  43.75 
 
 
381 aa  270  4e-71  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  5.10275e-08  normal  0.307303 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0963  porin  42.08 
 
 
383 aa  269  7e-71  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000213989  normal  0.474423 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0215  outer membrane porin OpcP  42.86 
 
 
382 aa  269  8e-71  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3080  porin Gram-negative type  41 
 
 
381 aa  268  9e-71  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0910  OmpC family outer membrane porin  41.65 
 
 
381 aa  268  1e-70  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0510287  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4291  porin Gram-negative type  40.94 
 
 
383 aa  267  2e-70  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.407078  normal  0.139177 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2846  outer membrane protein (porin)  40.29 
 
 
383 aa  267  3e-70  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.42536 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5138  porin  40.05 
 
 
396 aa  266  4e-70  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0176797  normal  0.966332 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2395  porin  42.21 
 
 
379 aa  266  5e-70  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0620  OmpC family outer membrane porin  40.94 
 
 
383 aa  266  5e-70  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0145861 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2596  outer membrane protein (porin)  41.85 
 
 
394 aa  266  6e-70  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.121818  normal  0.826149 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4495  porin  40.8 
 
 
384 aa  265  1e-69  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6321  porin  40.91 
 
 
394 aa  264  2e-69  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00119227  normal 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7493  porin  39.23 
 
 
383 aa  263  3e-69  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0254041  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0875  outer membrane insertion C-terminal signal  42.75 
 
 
380 aa  263  4e-69  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.223148  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4037  porin  41.1 
 
 
384 aa  263  4e-69  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.27779  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6772  porin Gram-negative type  41.52 
 
 
377 aa  263  5e-69  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.00264492  normal  0.103826 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6717  porin  40.94 
 
 
382 aa  262  6e-69  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.653963  normal  0.435902 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6482  porin  40.94 
 
 
382 aa  262  6e-69  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0226396  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4328  porin  40.2 
 
 
391 aa  262  6e-69  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.428613  normal  0.0399975 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0863  porin  42.79 
 
 
380 aa  262  9e-69  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  9.49722e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6291  porin  42.09 
 
 
392 aa  261  2e-68  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00384497  normal  0.183754 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3880  porin  40.84 
 
 
384 aa  259  5e-68  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00909398  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2786  OmpC family outer membrane porin  39.85 
 
 
377 aa  259  6e-68  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6406  porin Gram-negative type  41.16 
 
 
381 aa  259  6e-68  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1592  outer membrane porin OpcP  41.75 
 
 
379 aa  258  1e-67  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000753079  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1228  OmpC family outer membrane porin  39.95 
 
 
387 aa  258  1e-67  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.208027 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2703  porin Gram-negative type  41.08 
 
 
372 aa  258  1e-67  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2943  outer membrane porin  42.89 
 
 
379 aa  258  1e-67  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  4.14234e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1957  putative outer membrane porin  42.64 
 
 
379 aa  257  2e-67  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3009  outer membrane porin  42.64 
 
 
379 aa  257  2e-67  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.205234  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2089  outer membrane porin, putative  42.64 
 
 
379 aa  257  2e-67  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3043  outer membrane protein  42.64 
 
 
379 aa  257  3e-67  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  3.37977e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3798  porin  40.7 
 
 
375 aa  255  8e-67  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0973702 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1546  outer membrane protein (porin)  41.31 
 
 
403 aa  255  1e-66  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.836623 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0667  OmpC family outer membrane porin  40.35 
 
 
389 aa  255  1e-66  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  9.90839e-05  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4039  porin  40.84 
 
 
384 aa  254  1e-66  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.784778  normal  0.473466 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2108  porin signal peptide protein  42.13 
 
 
381 aa  254  2e-66  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0434327  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6314  porin  41.71 
 
 
377 aa  253  5e-66  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3561  outer membrane porin  39.7 
 
 
386 aa  252  8e-66  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1342  putative outer membrane porin  39.7 
 
 
386 aa  252  8e-66  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2562  outer membrane porin, putative  39.7 
 
 
386 aa  252  8e-66  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.98462  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3536  outer membrane porin  39.7 
 
 
386 aa  252  8e-66  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3221  putative outer membrane porin  39.7 
 
 
386 aa  252  8e-66  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3555  outer membrane porin  40.2 
 
 
436 aa  252  1e-65  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.525449  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1107  outer membrane porin OpcP  39.7 
 
 
436 aa  251  1e-65  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1250  OmpC family outer membrane porin  41.04 
 
 
376 aa  251  2e-65  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.748402  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2385  outer membrane protein (porin)  40.45 
 
 
375 aa  251  2e-65  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0849  OmpC family outer membrane porin  40.67 
 
 
384 aa  250  3e-65  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0153062  normal  0.0195066 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4327  porin  40.57 
 
 
380 aa  250  3e-65  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.872591 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0483  putative outer membrane porin  39.45 
 
 
386 aa  248  9e-65  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3723  porin  39.95 
 
 
375 aa  248  1e-64  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0948757 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4640  porin  39.95 
 
 
375 aa  248  1e-64  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1962  OmpC family outer membrane porin  39.56 
 
 
391 aa  248  1e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.350651  normal  0.328983 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4039  porin  40.57 
 
 
379 aa  247  2e-64  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0993774  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4385  outer membrane protein, (porin)  38.02 
 
 
380 aa  247  3e-64  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4283  porin  41.48 
 
 
380 aa  247  3e-64  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0748908  normal  0.344647 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0285  outer membrane protein (porin)  39.09 
 
 
367 aa  247  3e-64  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0477  porin  39.04 
 
 
385 aa  246  5e-64  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3194  porin  39.28 
 
 
380 aa  246  7e-64  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.809666  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0452  porin  38.79 
 
 
385 aa  246  7e-64  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.14543  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2847  porin  38.56 
 
 
389 aa  245  9e-64  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3460  OmpC family outer membrane porin  38.88 
 
 
383 aa  245  1e-63  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.460184 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3742  porin  39.28 
 
 
380 aa  244  1e-63  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.40751  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1679  outer membrane protein (porin)  42.03 
 
 
380 aa  245  1e-63  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.537554  normal  0.868597 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4216  porin  39.79 
 
 
380 aa  244  2e-63  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.951814  normal  0.390513 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0061  OmpC family outer membrane porin  39.45 
 
 
379 aa  244  2e-63  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2478  outer membrane protein (porin)  41.59 
 
 
385 aa  244  3e-63  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.917959 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1237  porin  39.32 
 
 
394 aa  243  5e-63  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6595  porin  39.32 
 
 
394 aa  243  5e-63  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.924404  normal  0.0790344 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6199  porin  39.32 
 
 
394 aa  243  5e-63  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.687747  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS02026  porin signal peptide protein  40.99 
 
 
382 aa  242  6e-63  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.555277 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3151  outer membrane protein (porin)  38.89 
 
 
370 aa  242  8e-63  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.185486  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4204  porin  38.72 
 
 
471 aa  242  8e-63  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.152026  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0388  OmpC family outer membrane porin  36.82 
 
 
384 aa  241  1e-62  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.62464  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4838  porin  36.68 
 
 
385 aa  241  1e-62  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000248162  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>