107 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_B0318 on replicon NC_007952
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007952  Bxe_B0318  non-heme catalase KatN  100 
 
 
294 aa  600  1e-171  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2044  Catalase  86.21 
 
 
290 aa  514  1e-145  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  1.98818e-07 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47080  Mn-containing catalase  79.86 
 
 
291 aa  487  1e-137  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2788  manganese containing catalase  77.7 
 
 
291 aa  466  1e-130  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5095  catalase  75.61 
 
 
293 aa  454  1e-127  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4409  catalase  74.13 
 
 
303 aa  451  1e-126  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1415  catalase  74.65 
 
 
292 aa  447  1e-125  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.449813  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3129  catalase  75.69 
 
 
290 aa  449  1e-125  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.147017 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1921  catalase  74.65 
 
 
292 aa  447  1e-124  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0512858  hitchhiker  0.000184673 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1863  catalase  74.65 
 
 
292 aa  447  1e-124  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.958813 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1858  catalase  74.65 
 
 
292 aa  447  1e-124  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.724494 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1597  catalase  74.65 
 
 
292 aa  447  1e-124  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.577365 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1436  catalase  74.39 
 
 
293 aa  440  1e-122  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1645  catalase  72.57 
 
 
296 aa  434  1e-120  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3122  Mn-containing catalase  72.22 
 
 
298 aa  424  1e-118  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.393204  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1348  DNA mismatch endonuclease  72.22 
 
 
298 aa  425  1e-118  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.30931  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4798  catalase  72.28 
 
 
300 aa  427  1e-118  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.137059 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2997  Mn-containing catalase  72.22 
 
 
314 aa  424  1e-118  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5520  catalase  70.73 
 
 
308 aa  417  1e-115  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.793802  normal  0.807876 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5251  catalase  67.93 
 
 
301 aa  403  1e-111  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1578  catalase  68.75 
 
 
304 aa  397  1e-110  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6729  catalase  68.75 
 
 
301 aa  397  1e-110  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6253  catalase  68.75 
 
 
304 aa  397  1e-110  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3293  Catalase  50 
 
 
326 aa  253  3e-66  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2921  Catalase  48.7 
 
 
324 aa  249  4e-65  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.370195  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5037  Catalase  48.71 
 
 
310 aa  246  3e-64  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.134226 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2489  non-heme manganese-containing catalase  48.29 
 
 
421 aa  226  5e-58  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1673  catalase  47.74 
 
 
277 aa  207  2e-52  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.849273  normal  0.361845 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1329  Catalase  46.25 
 
 
276 aa  207  2e-52  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.714734  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0376  manganese containing catalase  40.73 
 
 
249 aa  177  2e-43  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.233969 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1620  manganese containing catalase  40.87 
 
 
230 aa  170  3e-41  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00266489 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2781  manganese containing catalase  40.4 
 
 
260 aa  166  4e-40  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3821  manganese containing catalase  40.64 
 
 
230 aa  163  3e-39  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00457633  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3384  catalase  39.6 
 
 
231 aa  162  5e-39  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.000494245  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0288  manganese containing catalase  38.43 
 
 
245 aa  155  1e-36  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0414  manganese containing catalase  40.31 
 
 
203 aa  147  2e-34  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2909  manganese containing catalase  39.41 
 
 
190 aa  147  2e-34  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1016  catalase  42.35 
 
 
228 aa  146  4e-34  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00169796  unclonable  3.43768e-09 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1864  Catalase  37.61 
 
 
224 aa  146  4e-34  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.299932  normal  0.0213876 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1104  Catalase  38.99 
 
 
231 aa  146  5e-34  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  4.26374e-05  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1392  manganese containing catalase  39.41 
 
 
190 aa  145  6e-34  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2189  manganese containing catalase  41.35 
 
 
189 aa  145  1e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03960  Catalase  37.62 
 
 
227 aa  142  5e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00363943  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0656  manganese containing catalase  41 
 
 
189 aa  142  5e-33  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.807783  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4479  cotJC protein  40.31 
 
 
189 aa  142  8e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.163427 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0895  cotJC protein  41 
 
 
189 aa  142  8e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  6.60321e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0766  cotJC protein  40.31 
 
 
189 aa  140  2e-32  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  2.13334e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0714  cotJC protein  40.31 
 
 
189 aa  140  2e-32  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  2.98472e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0857  cotJC protein  40.31 
 
 
189 aa  140  2e-32  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0701  spore coat-associated protein JC  40.31 
 
 
189 aa  140  2e-32  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000246142  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0803  spore coat-associated protein JC  40.31 
 
 
189 aa  140  2e-32  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  3.03709e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0899  cotJC protein  40.31 
 
 
189 aa  140  2e-32  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.71221e-44 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0967  cotJC protein  40.31 
 
 
189 aa  140  2e-32  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  8.89969e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0716  manganese containing catalase  39.5 
 
 
189 aa  140  2e-32  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  6.21736e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1780  Catalase  36.89 
 
 
205 aa  140  3e-32  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1213  manganese containing catalase  39.22 
 
 
190 aa  140  4e-32  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.645424  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0232  Catalase  37.5 
 
 
200 aa  137  2e-31  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0010197  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2165  Catalase  40.31 
 
 
189 aa  137  3e-31  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.114172  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1600  Catalase  31.11 
 
 
316 aa  135  8e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0440  Catalase  38.46 
 
 
189 aa  134  2e-30  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5296  Catalase  32.54 
 
 
287 aa  132  7e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0565655  normal  0.201236 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1680  Catalase  31.69 
 
 
290 aa  132  9e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.110771 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0517  Catalase  31.4 
 
 
290 aa  132  1e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2836  Catalase  30.83 
 
 
284 aa  131  1e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0774925 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1848  Catalase  33.07 
 
 
301 aa  131  1e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.13214  normal  0.135263 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0886  catalase  32.3 
 
 
302 aa  129  6e-29  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23050  manganese containing catalase  36.98 
 
 
193 aa  127  2e-28  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  2.16085e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1876  manganese containing catalase  29.85 
 
 
292 aa  127  2e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2075  catalase  33.6 
 
 
285 aa  126  3e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.13632 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2898  Catalase  34.75 
 
 
285 aa  127  3e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.808431  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20670  Mn-containing catalase  33.47 
 
 
289 aa  126  5e-28  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0934  spore coat peptide assembly protein CotJC  35.47 
 
 
188 aa  126  5e-28  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0072871  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0606  catalase  34.82 
 
 
297 aa  125  6e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5807  Catalase  34.41 
 
 
275 aa  125  7e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.12571  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0815  Catalase  33.05 
 
 
308 aa  125  9e-28  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.683068  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3002  Catalase  34.25 
 
 
285 aa  124  3e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0705397  normal  0.0852902 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2775  catalase  34.25 
 
 
285 aa  124  3e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.272173  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0221  Catalase  33.06 
 
 
286 aa  122  8e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1068  spore coat protein CotJC  33.99 
 
 
188 aa  122  8e-27  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00620626  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3979  catalase  34.41 
 
 
274 aa  121  1e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.819277  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1821  catalase  32.68 
 
 
295 aa  120  2e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.47568  normal  0.0328704 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1447  manganese containing catalase  31.85 
 
 
270 aa  118  1e-25  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6390  catalase  33.6 
 
 
274 aa  116  4e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1877  Catalase  30.83 
 
 
303 aa  109  6e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1481  manganese containing catalase  29.84 
 
 
184 aa  103  5e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000413774  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11980  Mn-containing catalase  27.4 
 
 
321 aa  89  8e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2882  Mn-containing catalase  26.29 
 
 
308 aa  81.3  2e-14  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2914  catalase, Mn-containing  26.76 
 
 
287 aa  81.3  2e-14  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2123  catalase, Mn-containing  26.79 
 
 
284 aa  81.3  2e-14  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3134  catalase, Mn-containing  26.76 
 
 
284 aa  81.3  2e-14  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2839  manganese containing catalase  26.29 
 
 
287 aa  80.5  3e-14  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3134  catalase, Mn-containing  26.29 
 
 
284 aa  80.5  3e-14  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0681  manganese containing catalase  28.82 
 
 
297 aa  75.5  9e-13  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.400648  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1316  Catalase  25.66 
 
 
294 aa  75.5  1e-12  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0729  manganese containing catalase  29.7 
 
 
298 aa  73.2  5e-12  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    unclonable  1.23231e-11 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4741  manganese containing catalase  27.71 
 
 
307 aa  71.6  1e-11  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00819531 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0952  Catalase  30.39 
 
 
302 aa  71.6  1e-11  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.684232  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1142  manganese containing catalase  28.71 
 
 
298 aa  72  1e-11  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.0584316 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4594  manganese containing catalase  27.71 
 
 
307 aa  70.9  2e-11  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.756991  normal  0.105972 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4224  manganese containing catalase  27.71 
 
 
307 aa  70.1  4e-11  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0292992  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>