17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_B0299 on replicon NC_007952
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007952  Bxe_B0299  hypothetical protein  100 
 
 
221 aa  456  1e-127  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0153747  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1558  hypothetical protein  50.44 
 
 
224 aa  207  1e-52  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.420062  normal  0.625106 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0790  hypothetical protein  51.55 
 
 
162 aa  152  2.9999999999999998e-36  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2209  hypothetical protein  39.09 
 
 
225 aa  135  5e-31  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2063  hypothetical protein  32.13 
 
 
214 aa  88.6  7e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.336699  normal  0.216808 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0996  CRISPR-associated protein, Csm2 family  32.13 
 
 
220 aa  83.2  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.462721  normal  0.765042 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2149  abortive phage resistance protein  32.18 
 
 
196 aa  80.5  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.744102 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3540  hypothetical protein  29.49 
 
 
211 aa  79.3  0.00000000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1042  hypothetical protein  31.14 
 
 
208 aa  70.5  0.00000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.397197 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7389  hypothetical protein  28 
 
 
219 aa  65.5  0.0000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1567  hypothetical protein  48.72 
 
 
144 aa  62.4  0.000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1293  hypothetical protein  30.2 
 
 
194 aa  56.6  0.0000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.464309  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3792  abortive phage resistance protein-like  29.23 
 
 
198 aa  50.1  0.00003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1919  abortive phage resistance protein-like  29.23 
 
 
198 aa  48.9  0.00006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000352931  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0048  hypothetical protein  40 
 
 
111 aa  45.4  0.0008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12610  hypothetical protein  25.23 
 
 
233 aa  42.4  0.006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11633  hypothetical protein  27.07 
 
 
257 aa  42.4  0.006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.389497  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>