39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_B0298 on replicon NC_007952
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007952  Bxe_B0298  putative phage resistance protein  100 
 
 
422 aa  870    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.066915  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0741  putative phage resistance protein  53.49 
 
 
417 aa  466  9.999999999999999e-131  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.333006  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1557  hypothetical protein  51.69 
 
 
422 aa  404  1e-111  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.662923  normal  0.436276 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2208  hypothetical protein  43.09 
 
 
422 aa  341  1e-92  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0995  RloA protein  38.82 
 
 
425 aa  276  7e-73  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.559073  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0050  hypothetical protein  33.88 
 
 
451 aa  235  1.0000000000000001e-60  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12600  hypothetical protein  32.48 
 
 
435 aa  234  2.0000000000000002e-60  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2064  hypothetical protein  35.32 
 
 
421 aa  234  2.0000000000000002e-60  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.906065  normal  0.239178 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11638  abortive infection protein, putative  35.8 
 
 
438 aa  233  5e-60  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1294  hypothetical protein  34.04 
 
 
456 aa  224  2e-57  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0903  hypothetical protein  34.31 
 
 
429 aa  219  6e-56  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2148  hypothetical protein  33.41 
 
 
431 aa  215  9.999999999999999e-55  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.61865 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2870  hypothetical protein  36.09 
 
 
435 aa  213  5.999999999999999e-54  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.716536  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7388  hypothetical protein  32.07 
 
 
440 aa  209  7e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0079  abortive infection protein, putative  33.87 
 
 
433 aa  207  2e-52  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3541  ATPase-like protein  33.1 
 
 
426 aa  206  7e-52  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4361  hypothetical protein  30.34 
 
 
465 aa  189  5.999999999999999e-47  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.77847 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1041  ATPase-like  32.27 
 
 
447 aa  185  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.417137 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3302  hypothetical protein  31.72 
 
 
428 aa  156  8e-37  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3791  abortive phage resistance protein-like  28.19 
 
 
448 aa  149  1.0000000000000001e-34  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.618475  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1920  abortive phage resistance protein-like  27.96 
 
 
448 aa  148  2.0000000000000003e-34  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.0000340563  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1784  ATPase-like protein  29.16 
 
 
459 aa  143  6e-33  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00463649  normal  0.498848 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2132  abortive infection protein, putative  27.59 
 
 
432 aa  129  1.0000000000000001e-28  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.903649  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1899  abortive infection protein, internal deletion  28.27 
 
 
394 aa  128  2.0000000000000002e-28  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.136383  normal  0.598011 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1074  abortive phage resistance protein-like protein  28.04 
 
 
456 aa  120  7e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.960814  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1948  abortive phage resistance protein-like protein  23.86 
 
 
454 aa  118  1.9999999999999998e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3852  abortive infection protein  25.78 
 
 
394 aa  107  3e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000425466 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1616  abortive infection protein, internal deletion  24.94 
 
 
400 aa  97.1  6e-19  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.0255755 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0054  abortive infection protein  23.39 
 
 
407 aa  89  2e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4229  abortive infection protein  25.68 
 
 
405 aa  86.3  8e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0493  abortive infection protein  22.81 
 
 
407 aa  84.7  0.000000000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2991  abortive infection protein  21.82 
 
 
380 aa  75.1  0.000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0164345  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2166  AAA ATPase  28.12 
 
 
445 aa  73.2  0.000000000008  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000280978  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3995  abortive infection protein, internal deletion  22.3 
 
 
388 aa  70.9  0.00000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.988083  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1118  SMC domain-containing protein  23.78 
 
 
368 aa  68.2  0.0000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.266234  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2014  hypothetical protein  20.05 
 
 
449 aa  54.7  0.000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.000219997  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0733  hypothetical protein  25 
 
 
437 aa  47  0.0007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00594005  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1573  SMC domain-containing protein  32.52 
 
 
373 aa  43.5  0.006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0501523  normal  0.47865 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4680  hypothetical protein  27.82 
 
 
458 aa  43.1  0.009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.105377  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>