58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_B0146 on replicon NC_007952
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007952  Bxe_B0146  hypothetical protein  100 
 
 		 279 aa  582  1.0000000000000001e-165  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2664  hypothetical protein  43.85 
 
 		 252 aa  99  8e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.945475  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0825  hypothetical protein  41.67 
 
 		 272 aa  94.4  2e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.98901 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4613  hypothetical protein  36.88 
 
 		 277 aa  93.2  4e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000441366 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1523  putative restriction endonuclease  42.19 
 
 		 258 aa  91.7  1e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.74121  normal  0.0967794 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6046  hypothetical protein  36.62 
 
 		 313 aa  90.9  2e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.296494  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0271  putative restriction endonuclease  51.65 
 
 		 268 aa  89.7  5e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.788002  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1267  hypothetical protein  41.22 
 
 		 304 aa  89  7e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1104  hypothetical protein  34.31 
 
 		 345 aa  87.4  2e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1468  hypothetical protein  42.86 
 
 		 304 aa  87.8  2e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.978213  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3243  hypothetical protein  39.06 
 
 		 180 aa  87.4  3e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03602  hypothetical protein  33.1 
 
 		 256 aa  86.7  4e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4706  hypothetical protein  36.72 
 
 		 311 aa  84.3  0.000000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0127144  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1177  restriction endonuclease-like protein  38.28 
 
 		 314 aa  83.2  0.000000000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3983  hypothetical protein  38.76 
 
 		 323 aa  83.6  0.000000000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.612254 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2246  hypothetical protein  38.46 
 
 		 323 aa  82.8  0.000000000000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0492047 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0358  putative restriction endonuclease  33.16 
 
 		 265 aa  82.4  0.000000000000008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4521  hypothetical protein  39.05 
 
 		 328 aa  81.6  0.00000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0501  restriction endonuclease  33.33 
 
 		 295 aa  80.1  0.00000000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0209  hypothetical protein  38.1 
 
 		 315 aa  77  0.0000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.179579  hitchhiker  0.00000108217 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4893  hypothetical protein  34.09 
 
 		 259 aa  76.3  0.0000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1054  hypothetical protein  36.36 
 
 		 375 aa  73.9  0.000000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.09564  n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6007  putative restriction endonuclease  35.11 
 
 		 334 aa  74.3  0.000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3648  hypothetical protein  30.94 
 
 		 265 aa  68.6  0.0000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1360  hypothetical protein  36 
 
 		 298 aa  68.9  0.0000000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2006  hypothetical protein  40.4 
 
 		 253 aa  66.6  0.0000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.398772  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5044  hypothetical protein  28.89 
 
 		 257 aa  65.9  0.0000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.899608 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0490  hypothetical protein  30 
 
 		 260 aa  63.9  0.000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3245  hypothetical protein  34.78 
 
 		 271 aa  62.4  0.000000008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0409  hypothetical protein  32.14 
 
 		 263 aa  62  0.00000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4781  putative restriction endonuclease  30.3 
 
 		 255 aa  60.8  0.00000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0625  hypothetical protein  28.78 
 
 		 282 aa  57.4  0.0000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3520  hypothetical protein  31.01 
 
 		 256 aa  57  0.0000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3867  restriction endonuclease-like  31.58 
 
 		 309 aa  56.2  0.0000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4171  putative restriction endonuclease  32.29 
 
 		 257 aa  56.2  0.0000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.118239  normal  0.3128 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3975  restriction endonuclease-like protein  31.58 
 
 		 309 aa  55.8  0.0000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0062  putative restriction endonuclease  32.18 
 
 		 257 aa  53.9  0.000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3387  hypothetical protein  35.16 
 
 		 262 aa  52.8  0.000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.351588 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1314  restriction endonuclease-like protein  38.67 
 
 		 313 aa  50.8  0.00003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.173564  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8704  restriction endonuclease  32.03 
 
 		 318 aa  50.4  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1724  hypothetical protein  31.53 
 
 		 309 aa  50.1  0.00004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.589368  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3543  hypothetical protein  43.66 
 
 		 462 aa  50.1  0.00004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2247  restriction endonuclease  35.96 
 
 		 304 aa  50.1  0.00004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.426721  normal  0.10352 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1981  hypothetical protein  32.8 
 
 		 266 aa  48.5  0.0001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00131124  normal  0.0212362 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3143  hypothetical protein  35.79 
 
 		 248 aa  48.1  0.0002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1547  restriction endonuclease  36.47 
 
 		 303 aa  47.4  0.0003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.337245  normal  0.907295 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3143  TPR repeat-containing protein  37.14 
 
 		 424 aa  46.6  0.0005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.34299  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1252  restriction endonuclease  30.36 
 
 		 306 aa  46.6  0.0005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0119722  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6652  hypothetical protein  37.33 
 
 		 307 aa  46.2  0.0006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.9585  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0090  hypothetical protein  52.63 
 
 		 59 aa  44.7  0.002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0757  hypothetical protein  35.14 
 
 		 358 aa  43.9  0.003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3262  hypothetical protein  35 
 
 		 297 aa  43.9  0.003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4010  restriction endonuclease-like protein  28.46 
 
 		 315 aa  43.9  0.003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0418  restriction endonuclease-like protein  25.86 
 
 		 263 aa  43.9  0.003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1194  hypothetical protein  32.58 
 
 		 308 aa  43.9  0.003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0191  hypothetical protein  32.58 
 
 		 308 aa  43.9  0.003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.314917 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2980  hypothetical protein  32.58 
 
 		 308 aa  43.1  0.005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4145  hypothetical protein  32.95 
 
 		 314 aa  42.7  0.006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>