More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_B0134 on replicon NC_007952
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007952  Bxe_B0134  AraC family transcriptional regulator  100 
 
 
322 aa  663  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5694  AraC family transcriptional regulator  38.23 
 
 
319 aa  213  2e-54  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.730665  normal  0.260224 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4632  AraC family transcriptional regulator  37.62 
 
 
316 aa  209  5e-53  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.569454  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1111  transcriptional regulator, AraC family  35.37 
 
 
312 aa  148  1e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42360  transcriptional regulator, AraC family  32.14 
 
 
318 aa  110  3e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0210  AraC family transcriptional regulator  36.97 
 
 
274 aa  110  3e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.85611 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1537  transcriptional regulator, AraC family  37.27 
 
 
282 aa  110  4e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.164062  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1524  transcriptional regulator, AraC family  28.97 
 
 
301 aa  109  5e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.753144  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29260  putative transcriptional regulator  27.94 
 
 
297 aa  103  3e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1980  AraC family transcriptional regulator  33.68 
 
 
293 aa  102  7e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.949603 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0027  AraC family transcriptional regulator  35.03 
 
 
299 aa  101  1e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.618912  normal  0.0626425 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2469  AraC family transcriptional regulator  35.22 
 
 
361 aa  101  2e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3869  AraC family transcriptional regulator  30.18 
 
 
304 aa  100  3e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3971  putative transcriptional regulator  27.94 
 
 
272 aa  100  3e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.347316  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7015  AraC family transcriptional regulator  30.63 
 
 
306 aa  100  5e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0570551 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5475  transcriptional regulator, AraC family  32.91 
 
 
305 aa  99.4  7e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.59164  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4645  transcriptional regulator, AraC family  46.08 
 
 
112 aa  99  1e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0412729 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4513  transcriptional regulator, AraC family  45.71 
 
 
133 aa  98.6  1e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6349  AraC family transcriptional regulator  30.18 
 
 
306 aa  98.2  2e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0502154  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1480  AraC family transcriptional regulator  30.18 
 
 
306 aa  98.2  2e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.237942  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3417  AraC family transcriptional regulator  35.03 
 
 
299 aa  98.2  2e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.138414  normal  0.441033 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1458  AraC family transcriptional regulator  32.65 
 
 
301 aa  97.4  3e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5215  helix-turn-helix domain-containing protein  26.34 
 
 
331 aa  97.4  3e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6370  AraC family transcriptional regulator  32.65 
 
 
301 aa  97.4  3e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7037  AraC family transcriptional regulator  32.65 
 
 
301 aa  97.4  3e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.283867  normal  0.289972 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2139  helix-turn-helix domain-containing protein  36.57 
 
 
294 aa  96.7  5e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.957349  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5827  AraC family transcriptional regulator  31.71 
 
 
302 aa  95.9  8e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1148  transcriptional regulator, AraC family  31.71 
 
 
309 aa  95.9  8e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5610  AraC family transcriptional regulator  28.31 
 
 
302 aa  95.9  9e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  decreased coverage  0.00190409  normal  0.169642 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2736  AraC family transcriptional regulator  37.21 
 
 
154 aa  95.9  9e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.66637 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6041  transcriptional regulator, AraC family  40.14 
 
 
303 aa  95.1  1e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.331066 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9084  transcriptional regulator AraC family  44.55 
 
 
315 aa  95.5  1e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3129  AraC family transcriptional regulator  37.21 
 
 
299 aa  95.5  1e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5827  helix-turn-helix domain-containing protein  28.7 
 
 
316 aa  94.7  2e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.112164  normal  0.283627 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3583  transcriptional regulator AraC family  42.34 
 
 
293 aa  95.1  2e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4258  AraC family transcriptional regulator  33.14 
 
 
327 aa  93.6  4e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2413  transcriptional regulator, AraC family  32.12 
 
 
322 aa  93.6  4e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.333457  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0932  AraC family transcriptional regulator  42.86 
 
 
291 aa  93.6  4e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1853  transcriptional regulator, AraC family  30.77 
 
 
294 aa  92.8  6e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.801816 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1650  AraC family transcriptional regulator  34.62 
 
 
316 aa  92.8  8e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6135  transcriptional regulator, AraC family  25.48 
 
 
305 aa  91.3  2e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6285  transcriptional regulator, AraC family  36.84 
 
 
287 aa  91.3  2e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.671161  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1549  transcriptional regulator, AraC family  42.06 
 
 
316 aa  91.3  2e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0143415  hitchhiker  0.00302933 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0624  AraC family transcriptional regulator  26.22 
 
 
299 aa  91.3  2e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.401422 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6068  AraC family transcriptional regulator  37.31 
 
 
287 aa  90.9  2e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3921  AraC family transcriptional regulator  32.56 
 
 
311 aa  90.5  3e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.892105 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7634  transcriptional regulator AraC family  31.29 
 
 
304 aa  90.9  3e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.63081  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1041  helix-turn-helix, AraC type:Arac protein, arabinose-binding/dimerisation  42.06 
 
 
291 aa  90.9  3e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.29946 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3740  helix-turn-helix domain-containing protein  38.89 
 
 
301 aa  90.1  4e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.436963  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0810  AraC family transcriptional regulator  33.33 
 
 
306 aa  89.7  5e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0345  AraC family transcriptional regulator  32.56 
 
 
311 aa  89.7  6e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0829  AraC family transcriptional regulator  32.56 
 
 
311 aa  89.7  6e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0210284  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1213  transcriptional regulator, AraC family  42.06 
 
 
291 aa  89.4  7e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3976  helix-turn-helix domain-containing protein  28.28 
 
 
336 aa  89.4  8e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5332  AraC family transcriptional regulator  41.67 
 
 
301 aa  89.4  8e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1207  putative transcriptional regulator  41.88 
 
 
293 aa  89.4  8e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0798  AraC family transcriptional regulator  31.98 
 
 
311 aa  88.6  1e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6717  transcriptional regulator, AraC family  36.72 
 
 
296 aa  88.6  1e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.121518  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13470  AraC family transcriptional regulator  41.03 
 
 
293 aa  88.2  2e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0899227  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1543  transcriptional regulator, AraC family  33.33 
 
 
300 aa  87.8  2e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2379  AraC family transcriptional regulator  26.84 
 
 
304 aa  88.2  2e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0538221  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2274  AraC family transcriptional regulator  37.33 
 
 
307 aa  88.2  2e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.348217  normal  0.470943 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2932  transcriptional regulator, AraC family  31.63 
 
 
293 aa  87.8  2e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4587  AraC family transcriptional regulator  42.59 
 
 
291 aa  87.4  3e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.213128  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0758  AraC family transcriptional regulator  35.04 
 
 
299 aa  87.8  3e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2401  transcriptional regulator, AraC family  40.54 
 
 
202 aa  87  4e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3482  AraC family transcriptional regulator  34.03 
 
 
299 aa  87  4e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.675068  normal  0.589184 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1268  transcriptional regulator, AraC family  31.85 
 
 
300 aa  86.7  5e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3361  helix-turn-helix domain-containing protein  45.92 
 
 
160 aa  86.7  5e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4464  helix-turn-helix domain-containing protein  43.81 
 
 
291 aa  86.7  5e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5804  AraC family transcriptional regulator  34.59 
 
 
305 aa  86.7  6e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2326  transcriptional regulator, AraC family  32.37 
 
 
295 aa  85.9  8e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0937352 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2986  transcriptional regulator, AraC family  43 
 
 
148 aa  85.9  8e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1365  AraC family transcriptional regulator  28.28 
 
 
353 aa  85.9  8e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.122979  normal  0.036458 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0540  transcriptional regulator, AraC family  42.42 
 
 
289 aa  85.9  8e-16  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.516999  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4605  AraC family transcriptional regulator  42.86 
 
 
291 aa  85.5  1e-15  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0574  AraC family transcriptional regulator  32.69 
 
 
311 aa  85.5  1e-15  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0798057  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0517  helix-turn-helix domain-containing protein  40.19 
 
 
180 aa  84.7  2e-15  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.970363 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4871  AraC family transcriptional regulator  33.78 
 
 
308 aa  84.3  2e-15  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.412804  normal  0.401729 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6955  transcriptional regulator, AraC family  31.36 
 
 
346 aa  85.1  2e-15  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.737934  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0082  transcriptional regulator, AraC family  35.56 
 
 
292 aa  84.7  2e-15  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.628575  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3628  transcriptional regulator, AraC family  42.55 
 
 
156 aa  84  3e-15  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3475  helix-turn-helix domain-containing protein  31.65 
 
 
292 aa  84  3e-15  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2507  transcriptional regulator, AraC family  30.14 
 
 
291 aa  84  3e-15  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0583  AraC family transcriptional regulator  30.41 
 
 
312 aa  84.3  3e-15  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.98908  normal  0.54842 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0516  PAS sensor protein  40.82 
 
 
255 aa  83.6  4e-15  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0859  AraC family transcriptional regulator  44.23 
 
 
291 aa  83.6  4e-15  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.775109  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4732  helix-turn-helix domain-containing protein  31.43 
 
 
293 aa  83.2  5e-15  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0052536 
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4172  AraC family transcriptional regulator  32.41 
 
 
295 aa  83.2  5e-15  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0833223  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4744  transcriptional regulator, AraC family  42 
 
 
157 aa  83.2  5e-15  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.235772  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0085  transcriptional regulator, AraC family  29.01 
 
 
296 aa  83.2  6e-15  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0195711 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2883  AraC family transcriptional regulator  27.31 
 
 
307 aa  82.8  8e-15  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.858803 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3977  helix-turn-helix domain-containing protein  30.65 
 
 
301 aa  82.4  9e-15  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4441  transcriptional regulator, AraC family  35.53 
 
 
300 aa  82.4  9e-15  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.440571  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0315  transcriptional regulator, AraC family  41 
 
 
168 aa  82  1e-14  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3238  AraC family transcriptional regulator  40.74 
 
 
290 aa  82  1e-14  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.996927 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2413  AraC family transcriptional regulator  31.21 
 
 
305 aa  82  1e-14  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4074  helix-turn-helix domain-containing protein  35.53 
 
 
300 aa  82.4  1e-14  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0479  AraC family transcriptional regulator  32.26 
 
 
279 aa  82  1e-14  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00109362 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2890  transcriptional regulator, AraC family  39.13 
 
 
300 aa  81.6  1e-14  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.178075  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>