More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_A4528 on replicon NC_007951
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007951  Bxe_A2625  major facilitator superfamily transporter 4- hydroxybenzoate transporter  100 
 
 		 466 aa  914    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000676448  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4528  major facilitator superfamily transporter 4- hydroxybenzoate transporter  100 
 
 		 466 aa  914    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000028085  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0788  major facilitator transporter  38.04 
 
 		 453 aa  289  9e-77  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0717  major facilitator transporter  38.12 
 
 		 453 aa  288  1e-76  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.231958  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0819  major facilitator transporter  37.81 
 
 		 452 aa  288  1e-76  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.138145  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0336  major facilitator transporter  37.81 
 
 		 452 aa  288  1e-76  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3175  4-hydroxybenzoate transporter  38.36 
 
 		 451 aa  288  1e-76  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.902434  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3214  4-hydroxybenzoate transporter  38.36 
 
 		 451 aa  287  2e-76  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3229  4-hydroxybenzoate transporter  38.36 
 
 		 451 aa  287  2e-76  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0700  major facilitator transporter  38.12 
 
 		 453 aa  287  2e-76  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1922  4-hydroxybenzoate transporter  38.36 
 
 		 451 aa  287  2.9999999999999996e-76  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2687  putative 4-hydroxyphenylacetate transporter  38.36 
 
 		 451 aa  287  2.9999999999999996e-76  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2057  4-hydroxyphenylacetate transporter, putative  38.36 
 
 		 451 aa  287  2.9999999999999996e-76  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0855  putative 4-hydroxyphenylacetate transporter  38.36 
 
 		 451 aa  287  2.9999999999999996e-76  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3912  major facilitator transporter  38.04 
 
 		 453 aa  282  7.000000000000001e-75  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2564  major facilitator transporter  37.81 
 
 		 450 aa  279  1e-73  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1396  4-hydroxybenzoate transporter  38.53 
 
 		 579 aa  279  1e-73  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0726  4-hydroxybenzoate transporter  38.84 
 
 		 455 aa  277  3e-73  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4077  4-hydroxybenzoate transporter  36.71 
 
 		 475 aa  263  4.999999999999999e-69  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0892005  normal  0.387821 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2375  major facilitator superfamily MFS_1  40.51 
 
 		 451 aa  263  4.999999999999999e-69  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.661624  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1093  4-hydroxybenzoate transporter  38.37 
 
 		 454 aa  261  2e-68  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.818104 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0051  4-hydroxybenzoate transporter  39.07 
 
 		 452 aa  254  3e-66  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2523  major facilitator superfamily aromatic acid/H(+) symporter  34.91 
 
 		 461 aa  251  3e-65  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.108392 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2507  benzoate transport  35.9 
 
 		 451 aa  249  8e-65  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6376  major facilitator transporter  34.3 
 
 		 449 aa  249  9e-65  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000765522  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4260  putative hydroxybenzoate transporter  36.04 
 
 		 461 aa  245  9.999999999999999e-64  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.932507 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5027  major facilitator transporter  35.43 
 
 		 457 aa  244  1.9999999999999999e-63  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3901  major facilitator superfamily 4- hydroxybenzoate transporter  37.2 
 
 		 454 aa  244  3e-63  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.112817 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5860  major facilitator transporter  38.32 
 
 		 447 aa  244  3.9999999999999997e-63  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2434  major facilitator transporter  33.41 
 
 		 452 aa  240  2.9999999999999997e-62  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0741  major facilitator transporter  32.05 
 
 		 438 aa  240  4e-62  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0470116 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1331  major facilitator transporter  39.44 
 
 		 451 aa  240  4e-62  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.107576  normal  0.12099 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3708  major facilitator superfamily transporter  35.03 
 
 		 441 aa  240  4e-62  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0245193 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4009  major facilitator transporter  36.59 
 
 		 454 aa  239  6.999999999999999e-62  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3370  major facilitator transporter  38.03 
 
 		 453 aa  238  1e-61  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.278479  normal  0.891983 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3271  transporter, major facilitator family  32.96 
 
 		 452 aa  238  2e-61  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.557085 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1885  major facilitator transporter  38.26 
 
 		 453 aa  238  2e-61  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.211239 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0779  major facilitator superfamily MFS_1  37.14 
 
 		 454 aa  238  2e-61  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6040  major facilitator transporter  33.96 
 
 		 449 aa  237  3e-61  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.489761  normal  0.189475 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4149  major facilitator transporter  38.03 
 
 		 453 aa  236  9e-61  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0152976  normal  0.117223 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4217  major facilitator transporter  38.03 
 
 		 453 aa  236  9e-61  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.344742  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2369  4-hydroxybenzoate transporter  34.07 
 
 		 452 aa  232  1e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.708273  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1376  benzoate transport  34.11 
 
 		 448 aa  231  2e-59  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.282947 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2325  4-hydroxybenzoate transporter  33.85 
 
 		 452 aa  231  2e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1029  major facilitator superfamily aromatic acid/H(+) symporter  34.36 
 
 		 452 aa  231  2e-59  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.000542182  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2418  4-hydroxybenzoate transporter  33.85 
 
 		 452 aa  231  3e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.364564  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4347  benzoate transport  34.11 
 
 		 448 aa  230  4e-59  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0793736  normal  0.0224677 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1266  benzoate transport  34.42 
 
 		 448 aa  230  4e-59  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2414  4-hydroxybenzoate transporter  33.63 
 
 		 452 aa  229  5e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2526  4-hydroxybenzoate transporter  33.85 
 
 		 452 aa  228  2e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4944  major facilitator transporter  34.81 
 
 		 456 aa  227  4e-58  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.986503  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS01667  4-hydroxybenzoate transporter  35.73 
 
 		 458 aa  226  5.0000000000000005e-58  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.42633  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4438  benzoate transport  34.87 
 
 		 448 aa  226  7e-58  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00260043 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2913  major facilitator transporter  32.44 
 
 		 454 aa  224  2e-57  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1137  major facilitator transporter  38.01 
 
 		 457 aa  224  3e-57  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0321  4-hydroxybenzoate transporter PcaK  37.8 
 
 		 448 aa  224  3e-57  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.200049  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0259  major facilitator transporter  34.71 
 
 		 449 aa  224  3e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02900  4-hydroxybenzoate transporter PcaK  37.07 
 
 		 448 aa  224  3e-57  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00278203 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4904  major facilitator transporter  35.61 
 
 		 446 aa  224  4e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3243  major facilitator transporter  36.84 
 
 		 448 aa  224  4e-57  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.12624 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4438  major facilitator transporter  37.56 
 
 		 453 aa  223  6e-57  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.456474  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2718  major facilitator superfamily aromatic acid transporter  34.16 
 
 		 445 aa  223  7e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0133806  normal  0.187148 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2097  major facilitator transporter  33.41 
 
 		 459 aa  222  9.999999999999999e-57  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.201063 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3798  major facilitator transporter  32.87 
 
 		 452 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.120406  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6221  major facilitator transporter  36.23 
 
 		 467 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1205  4-hydroxybenzoate transporter  37.67 
 
 		 451 aa  220  3e-56  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0050  4-hydroxybenzoate transporter  37.67 
 
 		 451 aa  220  3e-56  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6623  major facilitator transporter  36.23 
 
 		 467 aa  221  3e-56  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.708037 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1488  4-hydroxybenzoate transporter  37.67 
 
 		 451 aa  220  3e-56  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0061  4-hydroxybenzoate transporter  37.67 
 
 		 451 aa  220  3e-56  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.586422  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6390  major facilitator transporter  36.23 
 
 		 467 aa  221  3e-56  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.536228  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0733  major facilitator transporter  35.04 
 
 		 454 aa  220  3.9999999999999997e-56  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2340  4-hydroxybenzoate transporter  35.44 
 
 		 449 aa  219  7e-56  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.934409  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0354  major facilitator superfamily aromatic acid/H(+) symporter  34.04 
 
 		 465 aa  219  7.999999999999999e-56  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000650677  hitchhiker  0.00000770433 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0072  4-hydroxybenzoate transporter  37.67 
 
 		 451 aa  218  1e-55  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.279221  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1558  4-hydroxybenzoate transporter  37.67 
 
 		 451 aa  219  1e-55  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.787543  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0059  4-hydroxybenzoate transporter  37.67 
 
 		 451 aa  219  1e-55  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6102  major facilitator superfamily MFS_1  34.51 
 
 		 452 aa  218  2e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.224126  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7571  major facilitator transporter  32 
 
 		 450 aa  218  2e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.749151  normal  0.898059 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1016  benzoate transport  34.04 
 
 		 447 aa  216  7e-55  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0402464  hitchhiker  0.0000294981 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2304  major facilitator superfamily aromatic acid transporter  33.57 
 
 		 452 aa  216  7e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.551017 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1996  major facilitator superfamily MFS_1  33.09 
 
 		 485 aa  216  9e-55  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.512683 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02690  4-hydroxybenzoate transporter PcaK  36.21 
 
 		 458 aa  216  9.999999999999999e-55  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4011  protocatechuate (4-hydroxybenzoate) transmembrane transporter  36.32 
 
 		 459 aa  214  3.9999999999999995e-54  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7161  major facilitator transporter  36.24 
 
 		 456 aa  213  7e-54  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2108  major facilitator superfamily transporter  30.63 
 
 		 454 aa  213  7e-54  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0152433  normal  0.3868 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0149  major facilitator superfamily transporter  36.3 
 
 		 441 aa  212  1e-53  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00293447 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0913  general substrate transporter  33.19 
 
 		 465 aa  211  3e-53  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3199  major facilitator transporter  34.42 
 
 		 449 aa  211  3e-53  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.105283  normal  0.0955769 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0937  major facilitator superfamily MFS_1  34.1 
 
 		 448 aa  211  3e-53  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.699917  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4356  major facilitator transporter  34.15 
 
 		 447 aa  210  4e-53  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2603  major facilitator transporter  32.21 
 
 		 461 aa  210  6e-53  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.731275 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3163  major facilitator transporter  32.75 
 
 		 452 aa  209  6e-53  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5481  major facilitator transporter  34.75 
 
 		 468 aa  209  9e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5022  major facilitator transporter  32.51 
 
 		 452 aa  208  1e-52  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31240  Major facilitator superfamily protein  34.51 
 
 		 446 aa  209  1e-52  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6160  major facilitator transporter  32.52 
 
 		 458 aa  207  3e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.730505  normal  0.770759 
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6469  benzoate transport  32.43 
 
 		 460 aa  207  3e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6976  major facilitator transporter  33.04 
 
 		 453 aa  207  3e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4030  DNA-cytosine methyltransferase  32.26 
 
 		 455 aa  207  3e-52  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>